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基于“药物→疾病”逆向分析策略运用生物标签研究模式分析杜仲叶治疗血液疾病的作用机制及物质基础
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作者 张帅男 魏明星 +1 位作者 唐文雅 李煦照 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2024年第4期424-430,共7页
目的基于“药物→疾病”逆向分析策略运用生物标签研究模式分析杜仲叶治疗血液疾病的潜能、作用机制及物质基础。方法运用蛋白质组学和代谢组学探索杜仲叶干预血清样本的生物标签,再运用生物信息学拓扑分析其治疗血液疾病的潜能、作用... 目的基于“药物→疾病”逆向分析策略运用生物标签研究模式分析杜仲叶治疗血液疾病的潜能、作用机制及物质基础。方法运用蛋白质组学和代谢组学探索杜仲叶干预血清样本的生物标签,再运用生物信息学拓扑分析其治疗血液疾病的潜能、作用机制和物质基础。结果6个差异表达蛋白质和6个差异表达代谢物参与了3个显著调节通路,这些内源性靶点可以作为潜在生物标签。通过生物信息学数据库的分析,杜仲叶的治疗潜能可能涉及白细胞障碍、血小板病、白血病和贫血。杜仲叶的65个化学成分可能成为其治疗血液疾病的物质基础。结论生物标签研究模式揭示了杜仲叶治疗血液疾病的潜能、作用机制及物质基础。可为后续将杜仲叶开发成保健食品,甚至成为药物提供重要的参考依据。 展开更多
关键词 生物标签研究模式 杜仲叶 血液疾病 作用机制 物质基础
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基于生物标签研究模式运用组学和生物信息学定位杜仲叶治疗脊髓疾病的潜能、作用机制及物质基础 被引量:3
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作者 张帅男 李煦照 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第4期157-161,I0039,共6页
目的基于生物标签研究模式运用组学和生物信息学定位杜仲叶治疗脊髓疾病的潜能、作用机制及物质基础。方法蛋白质组学和代谢组学被用于探索杜仲叶干预脊髓组织的生物标签,并在此基础上运用生物信息学对其治疗潜能、作用机制和物质基础... 目的基于生物标签研究模式运用组学和生物信息学定位杜仲叶治疗脊髓疾病的潜能、作用机制及物质基础。方法蛋白质组学和代谢组学被用于探索杜仲叶干预脊髓组织的生物标签,并在此基础上运用生物信息学对其治疗潜能、作用机制和物质基础进行拓扑分析。结果26个差异表达蛋白质和7个差异表达代谢物参与了15个显著调节通路,可以作为潜在生物标签。通过生物信息学数据库的分析,杜仲叶的治疗潜能可能涉及了肌萎缩性脊髓侧索硬化症、脊髓损伤及脊髓小脑共济失调。相关作用机制可能涉及了凋亡、炎症、氧化应激等病理过程。杜仲叶的13个化学成分可能成为其治疗这3种脊髓疾病的共同物质基础。结论基于生物标签研究模式,组学和生物信息学可以用于定位杜仲叶治疗脊髓疾病的潜能、作用机制及物质基础。这可以为杜仲叶后续的研究及临床治疗谱的明确提供重要的参考依据。 展开更多
关键词 杜仲叶 脊髓疾病 生物标签研究模式 作用机制 物质基础
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生物标签的探索:中药药性研究的新模式 被引量:9
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作者 李煦照 朱魁元 张帅男 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2019年第1期14-18,共5页
中药药性研究在中药研究领域中处于核心与基础的地位。近年来,随着组学技术与生物信息学在该领域中的应用,一个新的概念——"生物标签"应运而生。生物标签是指可以表征药物作用(活性与毒性)及机制的内源性靶点,包括代谢物靶... 中药药性研究在中药研究领域中处于核心与基础的地位。近年来,随着组学技术与生物信息学在该领域中的应用,一个新的概念——"生物标签"应运而生。生物标签是指可以表征药物作用(活性与毒性)及机制的内源性靶点,包括代谢物靶点、蛋白质靶点及基因靶点等。近年来,以生物标签为切入点的中药药性研究体系已逐步建立和完善。在此,本文对近年来的相关文献进行收集整理,分析总结生物标签在中药药性研究中的运用情况。生物标签可以用于表征中药的活性与毒性,为中药的安全使用及其应用范围的扩展提供了重要的参考依据。 展开更多
关键词 中药药性 生物标签 组学技术生 物信息学技术
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基于生物标签模式分析防己的治疗潜能及物质基础 被引量:1
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作者 黄华进 李红美 +1 位作者 张帅男 李煦照 《山东化工》 CAS 2022年第4期134-137,共4页
目的:基于生物标签模式预测防己主要有效成分的治疗潜能和作用机制。方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)预测防己的化学成分,并通过防己的相关文献分析。在Pubchem中下载防己有效成分的2D结构,然后使用数据库(SwissTargetPrediction)预测防... 目的:基于生物标签模式预测防己主要有效成分的治疗潜能和作用机制。方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)预测防己的化学成分,并通过防己的相关文献分析。在Pubchem中下载防己有效成分的2D结构,然后使用数据库(SwissTargetPrediction)预测防己的每个成分靶点。使用Cytoscape3.6.1建构“药物-成分-靶点-通路”网络。结果:筛选出8个活性成分、56个潜在靶点、96种相关疾病。结论:防己在肿瘤、神经系统、类风湿等疾病的治疗方面具有多成分、多靶点及多途径协同作用的特点,通过生物标签模式分析防己有效成分及作用机制,并为进一步开发防己新功能提供研究基础。 展开更多
关键词 生物标签模式 防己 靶点、通路 治疗潜能 物质基础
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利用小肽控制的基于蛋白质内含子非层析标签制备重组蛋白(英文)
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作者 施长华 孟清 Wood D W 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期202-208,共7页
基于蛋白质内含子的蛋白质纯化自我断裂标签已经被广泛使用超过15年之久.但这一系统体内表达过程的提前断裂一直是限制这一技术广泛应用的瓶颈,特别是在需要高温表达和长表达周期的真核表达系统中.本研究介绍了一种利用小肽控制的基于... 基于蛋白质内含子的蛋白质纯化自我断裂标签已经被广泛使用超过15年之久.但这一系统体内表达过程的提前断裂一直是限制这一技术广泛应用的瓶颈,特别是在需要高温表达和长表达周期的真核表达系统中.本研究介绍了一种利用小肽控制的基于蛋白质内含子和非层析标签ELP(elastin-like polypeptide)的自我断裂系统.在这一系统中,蛋白质内含子的体内外活性严格受到其结构互补小肽控制.在体内表达不含有互补小肽时,蛋白质内含子不具有活性;而在体外添加结构互补小肽,蛋白质内含子结构恢复并发生C端断裂反应释放目的蛋白.由于非层析标签ELP的引入,因此整个纯化过程可以简单地通过几步机械沉淀完成.此外,这一系统反应pH、小肽与前体蛋白之间的摩尔比及断裂速率也一并进行了系统的研究. 展开更多
关键词 小肽 蛋白质内含子 非层析标签生物分离 蛋白质纯化 标签纯化
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蛋白质组学在阿尔采末病中的研究进展
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作者 刘斌 王晓良 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期11-16,共6页
蛋白质组学是基因组时代产生的一门重要学科,是从整体水平对蛋白质的综合分析。阿尔采末病(A lzheimer's d isease,AD)是常见而复杂的神经退行性疾病之一。应用蛋白质组学对AD进行研究,不仅可在蛋白质水平上揭示疾病的本质,还有助... 蛋白质组学是基因组时代产生的一门重要学科,是从整体水平对蛋白质的综合分析。阿尔采末病(A lzheimer's d isease,AD)是常见而复杂的神经退行性疾病之一。应用蛋白质组学对AD进行研究,不仅可在蛋白质水平上揭示疾病的本质,还有助于全面探讨AD的病理机制,建立诊断标准,发现药物治疗靶点。本文从病理机制(特别是蛋白质翻译后修饰)、发现临床生物标签及治疗药物三个方面,对蛋白质组学在AD中的研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 蛋白质组学 阿尔采末病 翻译后修饰 生物标签 药物研发
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Influences of ore formation on biomarkers in the Kupferschiefer from the Lubin mine, Poland 被引量:2
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作者 孙玉壮 陈建平 +2 位作者 林明月 孟志强 张洪建 《Chinese Journal Of Geochemistry》 EI CAS 2005年第2期101-107,共7页
Molecular biomarkers are the important maturity parameters for sedimentary organic matter. They have also been widely used for determining the maturity of organic matter in ore deposits. However, during the study of o... Molecular biomarkers are the important maturity parameters for sedimentary organic matter. They have also been widely used for determining the maturity of organic matter in ore deposits. However, during the study of organic matter in the Kupferschiefer from the Lubin mine, it had been found that the biomarkers were influenced by sulfide formation. In order to probe into the degree of influence on biomarkers, seven samples collected from a Kupferschiefer section from the Lubin mine were analyzed by various geochemical methods. The results indicated that in the samples with higher copper contents, the values of biomarkers are lower than in the samples with lower copper contents. In highly mineralized samples, hydrogen donation for thermochemical sulfate reduction (TSR) occurred in alkylated phenanthrenes and naphthalenes, leading to the decrease of 12 biomarker parameters during the Kupferschiefer mineralization. 展开更多
关键词 分子生物标签 甲基菲指数 矿石信息 卢布林沉积矿 波兰
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Biodynamic Practices, Eco-label Wines and Millennial Consumers
8
作者 Michael McCullough Eivis Qenani Neal MacDougall 《Journal of Agricultural Science and Technology(A)》 2012年第12期1364-1372,共9页
Abstract: The objective of this study was to provide insights on the motivations behind the decision of biodynamic producers in the United States to shift to biodynamic practices in the vineyard and winemaking proces... Abstract: The objective of this study was to provide insights on the motivations behind the decision of biodynamic producers in the United States to shift to biodynamic practices in the vineyard and winemaking process. The second objective of the study was to evaluate the perceptions of the consumers regarding eco-label wines, with a direct focus on the attitudes of millennial generation. Two surveys, one directed to biodynamic producers in the United States and the other to a group of Californian wine consumers were distributed during spring and fall of 2010. Findings from the first survey reveal that biodynamic producers are engaged in biodynamic practices out of socially motivated reasons rather than economic factors. Results from the consumer survey suggest a generally uninformed generation of consumers about eco-label wines and particularly about the practices associated with these products. This lack of information heavily influences their behavioral decisions and attitudes and points out to the critical need for consumer education. 展开更多
关键词 Eco-label wine biodynamic wine biodynamic practices millennial consumers Chi-square tests total word count:4 555.
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追风伞化学成分与药理作用的研究进展及治疗潜能的预测分析 被引量:8
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作者 李煦照 张帅男 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期708-711,共4页
追风伞是报春花科植物狭叶落地梅的干燥全草,具有祛风活络,活血止痛的功效。现代药理研究表明,其具有抗风湿、保肝及降糖作用。文章对追风伞的化学成分及药理作用的主要相关文献进行综述,并基于生物标签(biolabel)研究模式,运用生物信... 追风伞是报春花科植物狭叶落地梅的干燥全草,具有祛风活络,活血止痛的功效。现代药理研究表明,其具有抗风湿、保肝及降糖作用。文章对追风伞的化学成分及药理作用的主要相关文献进行综述,并基于生物标签(biolabel)研究模式,运用生物信息学对其治疗潜能进行预测分析,为追风伞的质量评价以及应用开发提供参考。 展开更多
关键词 追风伞 化学成分 药理作用 生物标签 生物信息学 治疗潜能
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Aqueous self-assembly and surface-functionalized nanodots for live cell imaging and labeling
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作者 Mei-Lang Kung Pei-Ying Lin +1 位作者 Chiung-Wen Hsieh Shuchen Hsieh 《Nano Research》 SCIE EI CAS CSCD 2014年第8期1164-1176,共13页
Nanoparticles have enormous potential for bioimaging and biolabeling applications, in which conventional organically based fluorescent labels degrade and fail to provide long-term tracking. Thus, the development of ap... Nanoparticles have enormous potential for bioimaging and biolabeling applications, in which conventional organically based fluorescent labels degrade and fail to provide long-term tracking. Thus, the development of approaches to make fluorescent probes water soluble and label cells efficient is desirable for most biological applications. Here, we report on the fabrication and charac- terization of self-assembled nanodots (SANDs) from 3-aminopropyltriethoxysilane (APTES) as a probe for protein labeling. We show that fluorescent SAND probes exhibit both bright photoluminescence and biocompatibility in an aqueous environment. Selective in vitro imaging using protein and carbohydrate labeling of hepatoma cell lines are demonstrated using biocompatible SANDs conjugated with avidin and galactose, respectively. Cytotoxicity tests show that conjugated SAND particles have negligible effects on cell proliferation. Unlike other synthetic systems that require multistep treatments to achieve robust surface functionalization and to develop flexible bioconjugation strategies, our results demonstrate the versatility of this one-step SAND fabrication method for creating multicolor fluorescent probes with the tailored functionalities, effident emission, as well as excellent biocompatibility, required for broad biological use. 展开更多
关键词 atomic force microscop HYDROPHILICITY molecular imaging SELF-ASSEMBLY SILANE
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