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基于尿液代谢组学和生物网络分析整合策略研究益肾固络合剂治疗慢性肾小球肾炎作用机制
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作者 卞振华 张文明 +4 位作者 唐静月 胡敏敏 陈晓伟 袁晓航 陆兔林 《世界中医药》 CAS 2023年第20期2904-2912,共9页
目的:基于尿液代谢组学和生物网络分析整合策略研究益肾固络合剂治疗慢性肾小球肾炎(CGN)的关键代谢途径和潜在靶点。方法:建立阳离子化牛血清白蛋白(C-BSA)诱导的CGN大鼠模型,采用超高效液相色谱-质谱联用(UPLC-MS)代谢组学筛选益肾固... 目的:基于尿液代谢组学和生物网络分析整合策略研究益肾固络合剂治疗慢性肾小球肾炎(CGN)的关键代谢途径和潜在靶点。方法:建立阳离子化牛血清白蛋白(C-BSA)诱导的CGN大鼠模型,采用超高效液相色谱-质谱联用(UPLC-MS)代谢组学筛选益肾固络合剂治疗CGN的尿液内源性代谢标志物和代谢途径。整合生物网络分析工具对益肾固络合剂调节的生物标志物进行网络分析,挖掘益肾固络合剂治疗CGN的生物功能和潜在靶点。结果:基于尿液代谢组学技术筛选出花生四烯酸等20个益肾固络合剂治疗CGN的内源性代谢标志物。对益肾固络合剂调控的关键内源性代谢物生物网络分析结果表明,花生四烯酸代谢是益肾固络合剂发挥治疗CGN作用的潜在关键通路,其代谢途径上的细胞色素P4504A11(CYP4A11)等10个靶点为益肾固络合剂治疗CGN的潜在靶点。结论:本研究初步揭示了益肾固络合剂治疗CGN的作用机制,为益肾固络合剂临床推广应用提供科学理论依据。 展开更多
关键词 益肾固络合剂 慢性肾小球肾炎 生物标志物 代谢通路 作用机制 尿液代谢组学 生物网络分析 花生四烯酸代谢
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中药治疗心房纤颤研究进展及人参皂苷治疗心房纤颤的生物分子网络分析 被引量:6
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作者 朱宝琛 张菀桐 +3 位作者 陆洋 白洁 李鹏跃 杜守颖 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期2769-2774,共6页
心房纤颤(atrial fibrillation,AF)为临床中最常见的心律失常之一,目前化学药对AF的治疗方法较少且副作用明显,中医药与化学药的联用有望提高疗效并减少副作用。对中药治疗AF的研究进展进行综述,并根据文献检索结果,对中药治疗AF的常用... 心房纤颤(atrial fibrillation,AF)为临床中最常见的心律失常之一,目前化学药对AF的治疗方法较少且副作用明显,中医药与化学药的联用有望提高疗效并减少副作用。对中药治疗AF的研究进展进行综述,并根据文献检索结果,对中药治疗AF的常用药材人参中人参皂苷的入血成分进行生物分子网络分析,探讨其治疗AF的可能作用机制。通过靶点检索、网络构建及GO生物进程的分析,推测人参皂苷的入血成分治疗AF的作用机制可能与调控细胞凋亡、细胞膜钾离子流动等相关。 展开更多
关键词 心房纤颤 人参皂苷 生物分子网络分析 入血成分 细胞凋亡
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基于血浆代谢组学和网络分析研究柴归颗粒的抗抑郁作用机制 被引量:7
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作者 黄德华 王力文 +5 位作者 宫文霞 田俊生 高晓霞 秦雪梅 杜冠华 周玉枝 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1420-1428,共9页
本研究整合代谢组学和生物网络分析工具从生物代谢网络角度系统分析柴归颗粒的抗抑郁作用机制。建立慢性不可预见性轻度应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)抑郁大鼠模型,采用基于LC-MS的血浆代谢组学发现柴归颗粒抗抑郁作用... 本研究整合代谢组学和生物网络分析工具从生物代谢网络角度系统分析柴归颗粒的抗抑郁作用机制。建立慢性不可预见性轻度应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)抑郁大鼠模型,采用基于LC-MS的血浆代谢组学发现柴归颗粒抗抑郁作用的关键代谢物和代谢途径。整合生物网络分析工具对柴归颗粒调节的关键代谢物进行网络分析,聚焦关键代谢通路,挖掘柴归颗粒抗抑郁作用的潜在靶点。结果显示与对照组相比,模型组大鼠血浆中20个代谢物含量有显著差异(P<0.05),柴归颗粒能显著回调二十二碳三烯酸、3-羟基丁酸、4-羟基苯甲醛、鹅去氧胆酸、胆酸、L-谷氨酰胺、乙醇酸、亚油基肉碱、L-酪氨酸、N-乙酰缬氨酸、棕榈酰肉碱和花生四烯酸等12种代谢物。对柴归颗粒调控的关键代谢物进一步网络分析表明花生四烯酸代谢可能是柴归颗粒发挥抗抑郁作用的重要通路,花生四烯酸代谢途径上的CYP2B6、CYP2E1、CYP2C9、CYP2C8、PLA2G6、PTGS2、ALOX15B、PTGS1、ALOX12和ALOX5等10个蛋白为柴归颗粒发挥抗抑郁作用的潜在靶点。本文涉及的动物实验操作均遵循山西大学动物伦理委员会的规定并通过动物实验伦理审查(批号:SXULL2020028)。 展开更多
关键词 柴归颗粒 慢性不可预见性轻度应激抑郁 血浆代谢组学 生物网络分析 花生四烯酸代谢
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Network Pharmacology-based Analysis on the Molecular Biological Mechanisms of Xin Hui Tong Formula in Coronary Heart Disease Treatment 被引量:4
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作者 WU Hua-Ying ZHANG Chen +5 位作者 WANG Zhao-Hua ZHANG Shi-Ying LI Jing LI Feng HUANG Hui-Yong LI Liang 《Digital Chinese Medicine》 2019年第2期86-96,共11页
Objective To investigate the potential molecular mechanism of Xin Hui Tong Formula (XHTF) in the treatment of coronary heart disease (CHD) by using network pharmacology and bioinformatics. Methods The targets network ... Objective To investigate the potential molecular mechanism of Xin Hui Tong Formula (XHTF) in the treatment of coronary heart disease (CHD) by using network pharmacology and bioinformatics. Methods The targets network of CHD was constructed through Therapeutic Targets Database (TTD) and Drugbank database;The XHTF pharmacodynamic molecule-targets network and the XHTF pharmacodynamic molecule-CHD targets network were explored by the traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform (TCMSP). And the multi-targets mechanism and molecular regulation network of XHTF in the treatment of CHD were explored from multiple perspectives by Gene Ontology (GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) database pathway enrichment analysis. Results A total of 88 CHD targets were screened out through the Therapeutic Targets and the Drugbank database. 393 compounds and corresponding 205 drug targets of XHTF were retrieved from TCMSP. A total of 13 known targets directly related to the development of CHD were retrieved from the disease-related databases: TP53, MAPK14, NFKB1, HSPA5, PLG, PTGS2, ADRB1, NOS2, CYP3A4, GRIA2, CYP2A6, GRIA1, PTGS1. XHTF also contained 118 drug targets that directly interact with CHD targets. GO enrichment analysis showed that the biological processes of 13 direct targets proteins were found to be mainly enriched in response to drug, cellular response to biotic stimulus, long-chain fatty acid metabolic process, fatty acid metabolic process and regulation of blood pressure. KEGG pathway enrichment analysis found that XHTF participated in the CHD pathological process mainly through retrograde endocannabinoid signaling, regulation of lipolysis in adipocytes, cAMP signaling pathway, chemical carcinogenesis and other pathways. Conclusions XHTF plays a role in the treatment of CHD through multiple targets and multiple pathways, and provides a scientific basis for the theory of "virtual standard" in the treatment of CHD. 展开更多
关键词 Xin Hui Tong Formula (XHTF) Coronary heart disease Network pharmacology Network analysis BIOINFORMATICS
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