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甲基化特异性PCR联合结合重亚硫酸盐限制性内切酶法在胃癌抑癌基因甲基化检测中的应用
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作者 胡世莲 程昭栋 +3 位作者 孙玉蓓 徐维平 沈干 孔祥勇 《中国临床保健杂志》 CAS 2010年第2期113-116,F0003,共5页
目的探讨甲基化特异性PCR(MSP)方法检测胃癌组织中抑癌基因甲基化的准确性,联合应用MSP方法与结合重亚硫酸盐限制性内切酶法(COBRA)检测抑癌基因甲基化状态的意义。方法采用MSP检测胃癌组织抑癌基因Runx3启动子区甲基化的状态,随后再采... 目的探讨甲基化特异性PCR(MSP)方法检测胃癌组织中抑癌基因甲基化的准确性,联合应用MSP方法与结合重亚硫酸盐限制性内切酶法(COBRA)检测抑癌基因甲基化状态的意义。方法采用MSP检测胃癌组织抑癌基因Runx3启动子区甲基化的状态,随后再采用COBRA检测胃癌组织标本的甲基化状态。分析两种方法检测结果的关系。结果经MSP方法检测54例肿瘤组织中共有30例标本发生Runx3基因启动子区异常甲基化,甲基化阳性率为55.6%。经COBRA方法检测54例肿瘤组织中有27例出现酶切条带即存在甲基化,甲基化阳性率为50.0%。经COBRA方法检测,在MSP方法检测的30例阳性标本中有3例未出现酶切条带即为假阳性。在MSP方法检测Runx3基因甲基化阴性的24例标本中,经COBRA方法检测,Runx3基因甲基化阴性的标本亦为24例。两种检测方法检测结果的阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。结论甲基化特异性PCR方法在检测胃癌抑癌基因甲基化状态的研究中具有较高的灵敏度,COBRA方法可以检测出MSP方法中的假阳性标本,联合应用两种方法检测胃癌组织中抑癌基因的甲基化状态会使实验结果更可靠、准确。 展开更多
关键词 胃肿瘤 DNA甲基 聚合反应 基因 肿瘤抑制 限制性内切图谱法
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逆转录聚合酶链反应检测Ⅲ型登革病毒的敏感性和特异性研究
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作者 李刚 王飞 +2 位作者 郭日波 柯伟民 廖育煌 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 1993年第3期235-237,共3页
本文应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,检测Ⅲ型登革病毒基因。所设计引物在E基因组,引物2位于核苷酸序列的1139~1158位,引物1位于1453~1471位,反应产物为333bp,内含1个HindⅢ限制性内切酶位点,酶切后有128 bp和199 bp两个片段。... 本文应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,检测Ⅲ型登革病毒基因。所设计引物在E基因组,引物2位于核苷酸序列的1139~1158位,引物1位于1453~1471位,反应产物为333bp,内含1个HindⅢ限制性内切酶位点,酶切后有128 bp和199 bp两个片段。产物在含溴化乙锭的2%琼脂糖中电泳。采用RT-PCR法可测出少至5个半数组织细胞培养感染量(TCID_so)的病毒RNA。 展开更多
关键词 逆转录聚合反应 登革病毒 特异研究 E基因 组织细胞培养 引物 敏感 限制性内切 RNA
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基因甲基化聚合酶链反应检测体系的优化
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作者 揣征然 黄庆 +1 位作者 黄君富 府伟灵 《检验医学与临床》 CAS 2014年第21期2945-2946,2949,共3页
目的优化甲基化敏感限制性内切酶的聚合酶链反应(PCR)检测体系。方法用甲基化敏感限制性内切酶-PCR技术对10例健康未孕女性的RASSF1A基因进行甲基化检测,并对反应的缓冲体系进行优化。结果未经纯化的酶切产物直接进行PCR时,PCR反应特异... 目的优化甲基化敏感限制性内切酶的聚合酶链反应(PCR)检测体系。方法用甲基化敏感限制性内切酶-PCR技术对10例健康未孕女性的RASSF1A基因进行甲基化检测,并对反应的缓冲体系进行优化。结果未经纯化的酶切产物直接进行PCR时,PCR反应特异性降低,出现众多非特异PCR产物;纯化酶切产物或用PCR缓冲液替代酶切缓冲液后,PCR反应特异性变高。结论酶切缓冲液可影响后续PCR反应的特异性,采取纯化措施或以PCR缓冲液替代酶切缓冲液能够有效提高后续PCR特异性,首选PCR缓冲液替代更为简便。 展开更多
关键词 限制性内切缓冲液 聚合反应缓冲液 基因甲基检测
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限制性内切酶结合竞争聚合酶链反应定量检测在多药耐药基因甲基化状态中的应用 被引量:1
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作者 朱燕 武淑兰 +1 位作者 屈晨雪 卜定方 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期409-411,共3页
目的建立定量检测多药耐药基因(MDR1)甲基化状态的方法。方法在MDR1基因启动子区含甲基化位点的-102~+186bp片段间设计1条正义引物和2条反义引物,采用不同的反义引物,经3次聚合酶链反应(PCR)获得较目的片段缺失30bp的竞争内标DNA片段,... 目的建立定量检测多药耐药基因(MDR1)甲基化状态的方法。方法在MDR1基因启动子区含甲基化位点的-102~+186bp片段间设计1条正义引物和2条反义引物,采用不同的反义引物,经3次聚合酶链反应(PCR)获得较目的片段缺失30bp的竞争内标DNA片段,以Pbluescriptsk+为载体构建竞争内标DNA质粒;待检基因组DNA经甲基化敏感的限制性内切酶HpaⅡ消化后与竞争内标DNA竞争扩增MDR1基因;PCR产物经琼脂糖凝胶电泳和凝胶成像分析仪扫描,目的片段量等于反应体系中竞争内标量乘以目的片段与竞争内标片段的光密度比值,HpaⅡ酶切与未经酶切标本所得目的片段量的比值为甲基化率。结果倍比稀释的基因组DNA与最佳量竞争内标共扩增MDR1基因启动子区目的片段,两扩增产物量的比值与基因组DNA量呈显著正相关,相关系数r=0.992,P<0.001。结论本方法用于MDR1基因甲基化定量检测,操作相对简单,定量准确可靠,适用于临床研究中大量样本检测。 展开更多
关键词 多药耐药基因 限制性内切 甲基状态 定量检测 竞争 聚合反应(PCR) 基因组DNA 基因启动子区 琼脂糖凝胶电泳 MDR1基因 DNA片段 DNA质粒 PCR产物 基因甲基 载体构建 反应体系 扩增产物 相关系数 样本检测 临床研究
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初诊和复发急性髓性白血病p15、p16基因甲基化研究
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作者 朱传升 徐文伟 +2 位作者 刘冬梅 王焱 毕可红 《山东医药》 CAS 北大核心 2005年第16期4-5,共2页
目的探讨急性髓性白血病(AL)p15、p16、p18、p19基因失活的发生率及与疾病发生、发展、预后的关系。方法用聚合酶链反应(PCR)方法扩增46例患者的p15、p16、p18、p19基因外显子1和外显子2,再用限制性内切酶-PCR方法检测基因甲基化。结果4... 目的探讨急性髓性白血病(AL)p15、p16、p18、p19基因失活的发生率及与疾病发生、发展、预后的关系。方法用聚合酶链反应(PCR)方法扩增46例患者的p15、p16、p18、p19基因外显子1和外显子2,再用限制性内切酶-PCR方法检测基因甲基化。结果46例患者中,急性淋巴细胞白血病(ALL)19例,11例p15基因失活,10例p16基因失活;急性非淋巴细胞白血病(ANLL)27例,9例p15基因失活,18例p16基因失活;均以甲基化失活为主。所有病例均无p18、p19基因失活。结论在AL发生、发展过程中,p15、p16基因失活主要是由于p15、p16基因甲基化所致。 展开更多
关键词 白血病 P15 甲基研究 聚合反应(PCR) 非淋巴细胞白血病 P16基因失活 淋巴细胞白血病 p16基因甲基 P16基因失活 复发 初诊 基因外显子1 限制性内切 PCR方法 甲基失活 p18 p19 疾病发生 外显子2
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甲基化敏感限制酶结合定量PCR检测DNA甲基化方法的建立与应用 被引量:4
6
作者 黄朝晖 吴玉玉 +5 位作者 华东 胡瑜 王丰 程之红 余坚 杜祥 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期263-265,共3页
启动子CpG岛高甲基化是抑癌基因失活的重要机制之一,对于肿瘤的早期诊断、分子分型、预后判断等均具有较大的价值。目前较常用的DNA甲基化检测技术是基于亚硫酸氢盐处理的甲基化特异PCR方法(MSP),但该技术需使用强碱对DNA进行处理... 启动子CpG岛高甲基化是抑癌基因失活的重要机制之一,对于肿瘤的早期诊断、分子分型、预后判断等均具有较大的价值。目前较常用的DNA甲基化检测技术是基于亚硫酸氢盐处理的甲基化特异PCR方法(MSP),但该技术需使用强碱对DNA进行处理,导致绝大多数DNA分子发生断链。限制性内切酶广泛应用于DNA甲基化分析,其中甲基化敏感性限制内切酶(MSRE)只能切割非甲基化的靶位点; 展开更多
关键词 DNA甲基 定量PCR检测 应用 甲基特异PCR方法 限制 启动子CpG岛 限制性内切 甲基敏感
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H19差异甲基化位点MSRE-qPCR分析识别精子DNA新方法的可行性探究
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作者 贾琳娜 王小怡 +1 位作者 王博 郭大玮 《中国性科学》 2017年第1期154-157,共4页
目的:研究位于H19转录起始点-3390 bp的HhaI位点是否为差异甲基化位点,为精子DNA识别提供新依据。方法:从51份血样和20份精子样本提取基因组DNA,每个样本分别在同一反应体系中进行甲基化敏感酶HhaI消化和荧光定量PCR反应(MSRE-qPCR),扩... 目的:研究位于H19转录起始点-3390 bp的HhaI位点是否为差异甲基化位点,为精子DNA识别提供新依据。方法:从51份血样和20份精子样本提取基因组DNA,每个样本分别在同一反应体系中进行甲基化敏感酶HhaI消化和荧光定量PCR反应(MSRE-qPCR),扩增包含上述HhaI位点的114 bp片段。得到每个样本酶切前后的Ct值,用2^(-△△Ct)计算各样本酶切前后模板DNA相对表达量,将其作为DNA甲基化水平。结果:51份血样中该HhaI位点甲基化水平为(44.4±23.8)%,20份精子DNA甲基化水平为(120.5±52.5)%,差异有统计学意义(P<0.001)。结论:甲基化水平高于94%可识别精子DNA,H19差异甲基化区114 bp序列的MSRE-qPCR分析为精子DNA的识别提供了一种新方法。 展开更多
关键词 H19差异甲基 甲基敏感限制性内切 实时定量PCR 精子DNA
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食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛甲基化的意义 被引量:4
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作者 田子强 刘俊峰 +3 位作者 李勇 李保庆 王福顺 曹富民 《实用癌症杂志》 2005年第2期123-125,137,共4页
目的研究食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛甲基化与其mRNA表达的关系。方法选取4种食管癌细胞系OE21,OE19,OE33和TE7,经重亚硫酸钠处理后,采用限制性酶切图谱分析(COBRA)和逆转录聚合酶链反应(RTPCR)技术,在DNA甲基转移酶抑制剂5氮2’脱氧胞... 目的研究食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛甲基化与其mRNA表达的关系。方法选取4种食管癌细胞系OE21,OE19,OE33和TE7,经重亚硫酸钠处理后,采用限制性酶切图谱分析(COBRA)和逆转录聚合酶链反应(RTPCR)技术,在DNA甲基转移酶抑制剂5氮2’脱氧胞苷(5azaCdR)处理前后,对其MT-3基因CpG岛的甲基化情况及mRNA的表达情况进行对比研究。结果4种食管癌细胞系的MT-3基因均存在不同程度的CpG岛超甲基化。经5azaCdR处理后,超甲基化状态解除,mRNA的表达水平也较处理前明显提高(P=0.002)。结论食管癌细胞系中MT-3基因CpG岛的超甲基化可抑制其mRNA表达。当其超甲基化解除后,MT3基因的mRNA表达水平也会相应升高。 展开更多
关键词 食管癌细胞系 CPG岛甲基 3基因 mRNA表达 逆转录聚合反应 5-AZA-CDR 甲基转移抑制剂 图谱分析 甲基状态 亚硫酸钠 脱氧胞苷 对比研究 表达情况 不同程度 限制性 DNA 解除 水平
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MSRE-PCR法检测卵巢癌组织中OPCML基因甲基化
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作者 周峰 曹兴建 +2 位作者 马敏 刘曼华 陶国华 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期427-429,共3页
目的建立甲基化敏感性限制性内切酶-PCR(MSRE-PCR)法检测OPCML基因,探讨其在卵巢癌中的意义。方法用亚硫酸氢钠修饰测序法检测5例卵巢癌组织及正常卵巢组织中OPCML基因甲基化,分别用MSRE-PCR和巢式甲基化特异性PCR(MSP)检测组织DNA中OP... 目的建立甲基化敏感性限制性内切酶-PCR(MSRE-PCR)法检测OPCML基因,探讨其在卵巢癌中的意义。方法用亚硫酸氢钠修饰测序法检测5例卵巢癌组织及正常卵巢组织中OPCML基因甲基化,分别用MSRE-PCR和巢式甲基化特异性PCR(MSP)检测组织DNA中OPCML基因甲基化发生率。结果 DNA序列中存在6个Bsh1236I酶切位点,酶切24 h能完全消化非甲基化DNA,MSRE-PCR和巢式MSP检测卵巢癌组织中OPCML基因甲基化发生率分别为86.7%和84.4%,正常卵巢组织两法均阴性。结论 MSRE-PCR检测卵巢癌组织OPCML基因甲基化发生率与巢式MSP相比没有显著性差异,是一种操作简便、敏感的甲基化检测方法。 展开更多
关键词 甲基敏感限制性内切 聚合反应 结合鸦片样物质的细胞黏附分子基因 卵巢癌
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革兰阳性菌肽聚糖对人嗜碱性粒细胞中TLR_3、TLR_9 mRNA的上调作用 被引量:3
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作者 侯一峰 何韶衡 《汕头大学医学院学报》 2005年第2期74-76,共3页
目的:探讨Toll样受体(TLR)的配体肽聚糖(PGN)、聚肌苷酸_聚胞苷酸(PolyI_C)、脂多糖(LPS)和含有去甲基化的寡核苷酸序列(CpGDNA)对嗜碱性粒细胞中TLR2~4和TLR9mRNA表达的调节作用。方法:用实时定量_逆转录聚合酶链反应检测PGN、PolyI_C... 目的:探讨Toll样受体(TLR)的配体肽聚糖(PGN)、聚肌苷酸_聚胞苷酸(PolyI_C)、脂多糖(LPS)和含有去甲基化的寡核苷酸序列(CpGDNA)对嗜碱性粒细胞中TLR2~4和TLR9mRNA表达的调节作用。方法:用实时定量_逆转录聚合酶链反应检测PGN、PolyI_C、LPS和CpGDNA刺激人嗜碱性粒细胞系(KU812)后,TLR2~4和TLR9mRNA表达的变化。结果:PGN刺激KU812细胞后,TLR3和TLR9mRNA的表达与未刺激组比有统计学意义(P<0.05);而PolyI_C、LPS和CpGDNA刺激KU812细胞后,细胞中TLR2~4和TLR9的mRNA与未刺激组比无统计学意义(P>0.05)。结论:革兰阳性菌的感染可能增加人嗜碱性粒细胞对病毒或其它细菌感染的敏感性。 展开更多
关键词 嗜碱粒细胞 TLR9 革兰阳 肽聚糖 上调作用 聚肌苷酸-聚胞苷酸 脂多糖(LPS) 聚合反应检测 mRNA表达 Toll样受体 核苷酸序列 甲基 调节作用 实时定量 粒细胞系 细菌感染 PGN CpG DNA 统计学 逆转录 IPS 敏感
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脆性X综合征FMRl基因CpG岛的甲基化程度分析 被引量:1
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作者 吴鼎文 竺智伟 +2 位作者 赵正言 曲一平 杨建滨 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期60-63,共4页
目的建立用甲基化敏感性限制性内切酶定量聚合酶链反应(methylation-sensitiverestrictionenzymes-basedquantitativePCR,MSRE-qPCR)分析FMRl基因CpG岛甲基化程度的方法,并探讨其对脆性X综合征的诊断价值。方法以常规PCR初筛存在FMR... 目的建立用甲基化敏感性限制性内切酶定量聚合酶链反应(methylation-sensitiverestrictionenzymes-basedquantitativePCR,MSRE-qPCR)分析FMRl基因CpG岛甲基化程度的方法,并探讨其对脆性X综合征的诊断价值。方法以常规PCR初筛存在FMRl基因5。(CGG)n异常扩增的30例智力低下男童和20名母亲作为研究对象,用EagI酶消化DNA样品,针对FMRl基因CpG岛设计引物,定量PCR扩增EagI酶切前、后DNA,用2△△Ct法计算CpG岛甲基化程度;以Southern印迹杂交确诊的3例患儿和正常体检男、女各30例DNA样品为质控样本,从而建立优化的MSRE-qPCR方法。结果确立了正常甲基化、部分异常甲基化、全甲基化的区间值,并明确30例常规PCR初筛异常患儿中3例存在部分甲基化,27例为全甲基化,其中3例经Southern印迹杂交验证;13例母亲处于正常甲基化,7例存在异常甲基化。结论MSRE-qPCR可以对FMRl基因CpG岛的甲基化程度进行快速可靠分析,为脆性x综合征的分子诊断提供新的策略。 展开更多
关键词 X综合征 甲基化敏感性限制性内切酶定量聚合酶链反应 FMR1基因 CPG岛 甲基
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腺瘤性结肠息肉病基因甲基化在肝细胞癌分子诊断中的价值 被引量:1
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作者 胡瑜 华东 +5 位作者 程之红 吴玉玉 谢其根 王琼瑶 余坚 黄朝晖 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期924-929,共6页
目的:建立甲基化敏感性限制性内切酶-定量PCR(methylation-sensitive restriction enzyme-quantitative PCR,MSRE-qPCR)方法,并应用该方法探讨血浆腺瘤性结肠息肉病(adenomatous polyposis coli,APC)基因甲基化检测在肝细胞癌(hepatocel... 目的:建立甲基化敏感性限制性内切酶-定量PCR(methylation-sensitive restriction enzyme-quantitative PCR,MSRE-qPCR)方法,并应用该方法探讨血浆腺瘤性结肠息肉病(adenomatous polyposis coli,APC)基因甲基化检测在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)诊断中的应用价值。方法:用HhaⅠ消化DNA样品,qPCR技术评估酶切效率,建立优化的MSRE-qPCR方法。用MSRE-qPCR法检测45例肝组织(20例HCC及其相应匹配的非癌组织和5例正常肝组织)中APC甲基化水平;应用亚硫酸氢盐测序PCR(bisulfi te sequencing PCR,BSP)对MSRE-qPCR检测结果进行验证,并与甲基化特异性PCR(methylation-specifi c PCR,MSP)检测方法比较。运用MSRE-qPCR技术检测72例HCC、37例肝良性病变和41例健康志愿者血浆标本的APC甲基化状态。结果:建立的MSRE-qPCR方法可定量检测低至1%的APC甲基化片段。MSRE-qPCR和MSP检测结果均显示,HCC组织中APC基因发生高频率甲基化。MSRE-qPCR检测结果经BSP验证准确无误,且与MSP检测结果具有较好的一致性(Kappa=0.955,P<0.0001)。HCC患者血浆APC甲基化水平高于肝良性病变及健康志愿者(P<0.0001)。血浆APC甲基化分析与血清甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)联合检测可提高HCC诊断效率。结论:MSRE-qPCR可定量检测APC甲基化水平。血浆APC甲基化分析对于HCC的非侵入性诊断具有重要价值。 展开更多
关键词 肝细胞 DNA甲基 血浆 分子诊断技术 聚合反应 限制性内切 基因 腺瘤结肠息肉病
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血浆Ras相关区域家族蛋白1A基因甲基化在肝细胞癌分子诊断中的价值 被引量:5
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作者 费伯健 黄朝晖 +3 位作者 华东 胡瑜 程之红 余坚 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期742-747,共6页
目的:建立一种可检测微量DNA标本中DNA甲基化的甲基化敏感性限制性内切酶-定量PCR(methylation-sensitive restriction enzymes-based quantitative PCR,MSRE-qPCR)方法,并运用该技术探讨血浆Ras相关区域家族蛋白1A(Ras association dom... 目的:建立一种可检测微量DNA标本中DNA甲基化的甲基化敏感性限制性内切酶-定量PCR(methylation-sensitive restriction enzymes-based quantitative PCR,MSRE-qPCR)方法,并运用该技术探讨血浆Ras相关区域家族蛋白1A(Ras association domain family1A,RASSF1A)基因甲基化检测在肝细胞癌(hepatocellutar carcinoma,HCC)非侵入性诊断中的价值。方法:用MSRE HhaⅠ消化DNA样品,再用qPCR技术分析酶切结果,建立检测RASSF1A基因甲基化的MSRE-qPCR方法。以45例肝组织(20对HCC患者手术切除肿瘤标本及匹配非癌组织和5例正常肝)为材料,测试该方法的应用价值;运用亚硫酸氢盐测序PCR(bisulf ite sequencing PCR,BSP)技术进行进一步验证,并与甲基化特异性PCR(methylation specif ic PCR,MSP)方法相比较。再运用该技术检测150例血浆标本(包括72例HCC患者、37例肝硬化或慢性肝炎等良性病变患者和41例健康对照)的RASSF1A基因甲基化状态,并分析其与HCC患者临床病理参数的关系。结果:MSRE-qPCR法可定量检测低至1%以下的RASSF1A甲基化片段。20例HCC组织中有14例(70%)发生RASSF1A高甲基化,对应非癌组织中RASSF1A甲基化阳性率为25%,而5例正常肝组织均为阴性。MSRE-qPCR结果经BSP验证无误,且与MSP检测结果具有较好的一致性。HCC患者血浆RASSF1A甲基化阳性率(47/72,65.3%)显著高于健康对照(1/41,2.4%)和肝良性病变组(3/37,8.1%),差异均有统计学意义(P<0.0001)。联合检测血浆RASSF1A甲基化与血清AFP可显著提高HCC诊断效率。结论:建立的MSRE-qPCR方法要求样本少、操作简便、成本低廉,可定量检测RASSF1A基因甲基化水平。血浆RASSF1A甲基化分析对于HCC的非侵入性诊断具有重要价值。 展开更多
关键词 肝细胞 DNA甲基 血浆 分子诊断技术 聚合反应 限制性内切 Ras相关区域家族蛋白1A
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亲代MTHFR基因677C/T多态性与子代非综合征性唇腭裂的相关性 被引量:7
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作者 王苏梅 王建华 +5 位作者 于建春 魏斌 王克华 刘锦云 董云玲 吕雪梅 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期464-467,共4页
目的探讨山东地区亲代亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因677C/T多态性与子代发生非综合征性唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联。方法应用聚合酶... 目的探讨山东地区亲代亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因677C/T多态性与子代发生非综合征性唇腭裂(nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联。方法应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性分析技术(polymerasechainreaction—restrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)对2006年8月至2008年8月在齐鲁医院治疗的89对NSCL/P患者亲代和64对健康查体儿童亲代的MTHFR基因677C/T多态性进行检测。结果患者母亲与正常儿童母亲的T等位基因频率分别为65.73%和46.09%,C等位基因频率分别为34.27%和53.91%,其构成比差异有统计学意义(x2=13.663,P〈O.01);携带T等位基因的母亲子代患NSCL/P的风险为未携带T等位基因的母亲子代的2.243倍(95%CI:1.408~3.572)。患者的父亲与正常儿童父亲的T等位基因频率分别为62.92%和55.47%;C等位基因频率分别为37.08%和44.53%,其构成比差异无统计学意义(Y。=2.222,P〉0.05);病例组和对照组后代可能为纯合突变胎儿的机率分别为43%和29%(P〉0.05)。结论山东地区母亲的MTHFR基因677C/T突变对后代NSCL/P的发生有重要的影响;父亲的MTHFR基因677C/T突变则可能不是子代患NSCL/P的风险因素。 展开更多
关键词 非综合征唇腭裂 甲基四氢叶酸还原 677C/T多态 聚合反应-限制性内切片段长度多态
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山东地区非综合征性唇腭裂患者MTHFR基因C677T的多态性研究 被引量:19
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作者 王苏梅 王建华 +2 位作者 贾颐舫 卢丹 杨丹彤 《中国优生与遗传杂志》 2011年第2期40-42,共3页
目的探讨山东地区亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T的多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法运用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP),对2006年8月至2008年8月曾在齐鲁医院治疗的来自山东地区NSCL/... 目的探讨山东地区亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T的多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法运用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP),对2006年8月至2008年8月曾在齐鲁医院治疗的来自山东地区NSCL/P患儿35例和健康查体的正常儿童51例MTHFR基因的C677T基因型检测分析。结果患者组与对照组的基因型构成比有统计学意义(χ2=8.770,P=0.0121)。对T分析,计算得到携带T等位基因的儿童患非综合征性唇腭裂的危险性是不携带T等位基因儿童的2.568倍(OR=2.568,95%CI:1.324-4.979)。TT突变纯合子患非综合征性唇腭裂的危险性是非TT纯合子的3.095倍(OR=6.088,95%CI:1.240-7.722)。结论 MTHFRC677T的T等位基因可能是山东地区非综合征性唇腭裂的遗传风险因子。 展开更多
关键词 非综合征唇腭裂 甲基四氢叶酸还原基因C677T多态 聚合反应-限制性内切片段长度多态
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TaqMan探针实时PCR检测人MTHFR基因C677T多态性方法的建立 被引量:4
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作者 王苏梅 王克华 +5 位作者 魏斌 于建春 盖凌 董云玲 吕雪梅 刘锦云 《中国优生与遗传杂志》 2012年第9期11-14,共4页
目的建立TaqMan探针实时PCR检测人MTHFR基因C677T多态性的方法。方法设计一对MTHFR基因C677T多态位点的引物及TaqMan探针,采用TaqMan探针实时PCR扩增SNP分型方法检测唇腭裂患者及其父母共100人的MTHFR基因C677T多态性,与常规PCR-RFLP方... 目的建立TaqMan探针实时PCR检测人MTHFR基因C677T多态性的方法。方法设计一对MTHFR基因C677T多态位点的引物及TaqMan探针,采用TaqMan探针实时PCR扩增SNP分型方法检测唇腭裂患者及其父母共100人的MTHFR基因C677T多态性,与常规PCR-RFLP方法进行一致率比较,并对其特异性、敏感性和重复性以及成本-效益等进行评价,同时对部分实时PCR产物样本进行测序验证。结果运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对MTHFR基因C677T多态性检测结果准确,特异性好,与常规PCR-RFLP方法结果具有高度一致性,Kappa=0.922>0.75(P=0.000);检测灵敏度可达2×103拷贝;重复性好、高通量、无污染、安全性好;随机样品TaqMan探针分型结果与测序结果完全一致。结论成功建立了TaqMan探针实时PCR检测人MTHFR基因C677T多态性的方法;此方法是常规临床诊断及大规模群体研究的良好平台。 展开更多
关键词 TAQMAN探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态 甲基四氢叶酸还原 C677T突变 聚合反应-限制性内切片段长度多态 非综合征唇腭裂
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山东地区非综合征性唇腭裂患者MTHFR基因C677T的多态性研究 被引量:1
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作者 王苏梅 王建华 +2 位作者 贾颐舫 卢丹 杨丹彤 《中国优生与遗传杂志》 2011年第5期6-8,共3页
目的探讨山东地区亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T的多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法运用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP),对2006年8月至2008年8月曾在齐鲁医院治疗的来自山东地区NSCL/... 目的探讨山东地区亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T的多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法运用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP),对2006年8月至2008年8月曾在齐鲁医院治疗的来自山东地区NSCL/P患儿35例和健康查体的正常儿童51例MTHFR基因的C677T基因型检测分析。结果患者组与对照组的基因型构成比有统计学意义(χ2=8.770,P=0.0121)。对T分析,计算得到携带T等位基因的儿童患非综合征性唇腭裂的危险性是不携带T等位基因儿童的2.568倍(OR=2.568,95%CI:1.324-4.979)。TT突变纯合子患非综合征性唇腭裂的危险性是非TT纯合子的3.095倍(OR=6.088,95%CI:1.240-7.722)。结论 MTHFRC677T的T等位基因可能是山东地区非综合征性唇腭裂的遗传风险因子。 展开更多
关键词 非综合征唇腭裂 甲基四氢叶酸还原基因C677T多态 聚合反应-限制性内切片段长度多态
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中国麻疹野病毒基因型快速诊断方法的建立 被引量:9
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作者 周剑惠 陈超 +13 位作者 刘桂艳 许强 张燕 朱贞 张运祥 田鑫 曹凤瑞 宋和 徐羽迪 王兆南 于瑞兰 徐力 中山哲夫 许文波 《中国计划免疫》 2004年第6期366-370,共5页
研究建立了一种适用于中国现流行麻疹野病毒基因型的基因型别筛查、定型的分析方法 ,即逆转录 聚合酶链反应 限制性内切酶片段长度多态性分析 (RT PCR RFLP)。首先对RT PCR方法的敏感性和特异性进行了实验证明 ,对 1 1株麻疹病毒提取... 研究建立了一种适用于中国现流行麻疹野病毒基因型的基因型别筛查、定型的分析方法 ,即逆转录 聚合酶链反应 限制性内切酶片段长度多态性分析 (RT PCR RFLP)。首先对RT PCR方法的敏感性和特异性进行了实验证明 ,对 1 1株麻疹病毒提取核糖核酸 (RNA) ,逆转录套式PCR扩增后全部出现阳性特异条带。在同样的反应条件下 ,扩增 6种不同基因型麻疹病毒 9株 ,同时又扩增其它非麻疹病毒。结果 9株 6种基因型麻疹病毒RT PCR均呈现阳性条带 ,说明本研究采用的RT PCR方法敏感。而非麻疹病毒RT PCR结果为阴性 ,均未见阳性条带 ,说明该RT PCR方法特异。根据H1 和H2 基因型麻疹病毒分别被不同的限制性内切酶SalⅠ和BamHⅠ切割成不同大小的基因片段 ,建立RFLP快速基因定型方法。之后 ,对建立的RFLP方法的特异性和敏感性进行了实验证明。利用该方法对吉林省连续两年分离到的 9株麻疹野病毒 [已经过中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家麻疹实验室脱氧核糖核酸 (DNA)序列分析证实为H1 基因型 ]进行验证 ,结果均为H1 基因型麻疹病毒 ,证实该PCR RFLP结果与序列分析结果一致 ,也说明该方法敏感。同时 ,又对 7种不同基因型麻疹病毒应用PCR RFLP方法进行实验 ,结果只有H1 和H2 基因型麻疹病毒被限制性内切酶SalⅠ和BamH? 展开更多
关键词 麻疹病毒 逆转录-聚合反应 限制性内切片段长度多态分析 电泳 序列分析 敏感 特异
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