血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度对早产患者预测价值分析

目的 分析血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度对早产患者的预测价值。方法 随机选择2019年1-12月在该院产科病区产检的孕产妇480例,其中450例随访至分娩,将其中40例自发性早产的孕产妇作为早产组,410例足月产孕产妇作为健康组。比较健康组、早产组、早产组不同孕周者的血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化水平。分析健康组、早产组的临床数据,采用Logistic回归分析早产的风险因素,绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度对早产的预测价值。结果 与健康组比较,早产组血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度明显增高(P<0.05);与早产组34~<37周妊娠期女性相比,孕周28~<34周妊娠期女性血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度明显增高(P<0.05);与健康组比较,早产组产次≥2次、妊娠期被动吸烟、阴道胎儿纤维连接蛋白(fFN)阳性、家庭平均月收入<1 000元的比例明显增加(P<0.05),宫颈长度明显缩短(P<0.05);Logistic回归分析结果显示,产次≥2次、妊娠期被动吸烟、宫颈长度短、阴道fFN阳性、家庭平均月收入<1 000元、血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度高均是早产的主要风险因素(P<0.05);ROC曲线分析结果表明,血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度预测早产的曲线下面积为0.868(95%CI:0.834~0.898),最佳截断值为51.43%,灵敏度、特异度、准确度分别为82.50%、84.63%、84.44%。结论 血清Wnt4基因启动子区的DNA甲基化程度高对于早产具有一定的临床预测价值。

粪便中SDC2、SEPT9基因甲基化在结直肠癌筛查、早期诊断中的意义分析

目的 本研究对人粪便中的SDC2、SEPT9基因甲基化情况进行探讨,分析其在结直肠癌筛查、早期诊断中的意义。方法 随机选取25例结直肠癌患者作为结直肠癌组,20例结直肠腺瘤患者作为结直肠腺瘤组,15例结直肠正常者作为正常对照组。分别从三组研究对象粪便中提取DNA,检测DNA纯度,采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术分析SDC2、SEPT9基因甲基化状态。观察SDC2、SEPT9基因甲基化检测结果,比较三组粪便中SDC2、SEPT9基因甲基化检出率。结果 结直肠癌组粪便中SDC2基因甲基化检出率为76.00%,高于正常对照组的13.33%,差异具有统计学意义(P<0.05);结直肠腺瘤组粪便中SDC2基因甲基化检出率为80.00%,高于正常对照组的13.33%,差异具有统计学意义(P<0.05);结直肠癌组与结直肠腺瘤组粪便中SDC2基因甲基化检出率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结直肠癌组、结直肠腺瘤组、正常对照组粪便中SEPT9基因甲基化检出率分别为16.00%(4/25)、5.00%(1/20)、0(0/15),比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 粪便中SDC2基因甲基化程度有利于筛查、早期诊断结直肠癌,对于癌前病变更好地发现、追踪。因此,粪便中SDC2基因甲基化程度是一个重要的分子指标,使结直肠癌的筛查、诊断更加便利、无创、快捷;SEPT9基因的甲基化状态敏感性较低,检测发现的可能性较小,因此仍需要增加样本数量,多角度开展研究,从而保证研究的真实性、可靠性。

老年女性结直肠癌分子标记物和通路与临床病理特征的相关性研究

背景和目的结直肠癌具有明显异质性,其发病通常来自一系列遗传事件和表观遗传学事件的不同组合。越来越多证据支持根据微卫星不稳定(MSI)情况、Cp G岛甲基化表型、体细胞BRAF及KRAS基因突变情况将结直肠癌分为不同亚型。例如,与微卫星稳定或MSI程度低的结直肠癌患者相比,MSI程度高的患者近侧结肠癌更常见,伴高级别分化和临床分期较晚,且淋巴转移更常见;Cp G岛甲基化程度高者与高龄患者、近侧结肠癌、肿瘤低分化及MSI程度高相关。KRAS突变(特别是密码子12和13突变)者,更常见于Cp G岛甲基化程度低伴微卫星稳定或MSI程度低以及BRAF突变阴性的结直肠癌。本研究目的在于利用人口基数为爱荷华州女性的健康调查的大样本研究(n=41 836),验证结直肠癌患者临床病理特征及生存时间与分子分型之间的相关性。方法从已建档的732例结直肠肿瘤患者取样并评估其特征,区分微卫星稳定或微卫星不稳定性程度的高低、Cp G岛甲基化程度高低或Cp G岛甲基化表型阴性以及BRAF和/或KRAS突变状态。563(77%)例肿瘤患者中收集到信息标记物数据,分别归纳为下列整合通路。经典型(微卫星稳定、Cp G岛甲基化表型阴性、BRAF突变阴性以及KRAS突变阴性,n=170);替换型(微卫星稳定、Cp G岛甲基化表型程度低、BRAF突变为阴性并KRAS突变阳性,n=58);锯齿型(任何程度的微卫星不稳定、Cp G岛甲基化程度高、BRAF突变为阳性并KRAS突变阴性,n=142);未分类型(n=193)。多变量Cox比例风险回归模型用于评估指标间的相关性。结果患者平均年龄(P=0.03)、肿瘤部位(P=0.0001)和分级(P=0.0001)与整合路径显著相关。结直肠癌患者死亡率与经典路径、替换路径和锯齿型路径并无明显相关性,而与未分类路径下面的亚型(微卫星稳定或微卫星不稳定性程度低、Cp G岛甲基化阴性、BRAF突变阴性、KRAS突变阳性)有关(n=96,与经典型路径相比较,RR=1.76,95%CI:1.07~2.89)。结论结直肠癌患者临床病理特征与分子分型之间存在明显相关性。这些分子变化特征如何影响预后还需要进一步研究。

MS_(3)RNA在小鼠胚胎癌细胞中特异表达的可能机理

MS_(3) RNA是小鼠胚胎癌细胞特异RNA。为了阐明MS_(3)基因在未分化细胞中特异表达的机理,我们应该首先确定此特异表达是在哪一级水平上被调控的。Naveh-Many等(1981)指出积极进行转录的基因一般是甲基化程度不足的。由于MS_(3)基因有一个中等重复的家族,因此如果MS_(3)基因的调控主要在转录水平上进行,我们应该发现MS_(3)基因的甲基化程度在分化细胞及未分化细胞之间有明显差别,于是用测定甲基化程度的一组酶HpaⅡ和Msp1水介代表分化细胞的TDM_(1)及代表未分化细胞的F_(9)的高分子量DNA,然后用MS_(3) cDNA作探针分析MS_(3)基因区的甲基化程度。在可用MS_(3) cDNA探查到的范围内,MS_(3)基因区的甲基化程度在TDM_(1)及F_(9)细胞中未见明显不同。对这一结果可有四种不同解释:1.MS_(3)基因家族中除少数成员外其余绝大部分成员在未分化细胞中是不转录的,在分化细胞中则全部不转录:2.MS_(3)基因家族的绝大部分成员在未分化细胞以及在分化细胞中都是转录的;3.虽然MS_(3)基因家族中的绝大部分成员都是不转录的,但个别成员在未分化细胞以及分化细胞中都是转录的;4.由于MS_(3) cDNA只能探查MS_(3)基因的分端区域,可能此区域的甲基化程度与MS_(3)基因的转录水平无关。为了区别这些可能性,我们检查了F_(9)细胞及TDM_(1)细胞中的核RNA,发现在这二种细胞核内都存在若数量几乎相等的大量MS_(3)基因转录物。因此我们推断,MS_(3)基因家族中至少有一部分成员,很可能是大部分成员,不论在未分化细胞还是在分化细胞中都是转录的。在色分化细胞的细胞质中不能探查到MS_(3)RNA的原因可能在于MS_(3)基因在转录后水平上的调控,即在已分化细胞的核内缺乏加工MSRNA前体的能力或缺乏把成热的MS_(3) RNA从细胞核输送到细胞质中去的能力。

粪便DNA测试对确定大肠癌很有希望

测试粪便DNA的甲基化变化可能是筛查结肠直肠癌的一项有用的方法。这项新的研究表明，在确定结肠直肠癌的患者中，一种称作SFRP2基因的甲基化程度的灵敏度达到了90%。