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采用蛋白质组学技术筛选鼻咽癌细胞的甲基化沉默基因 被引量:1
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作者 张文静 易斌 +7 位作者 易红 张鹏飞 李茂玉 李萃 阮林 陈主初 李建玲 肖志强 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第4期410-417,共8页
为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-T... 为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质.然后采用Westernblotting和RT-PCR检测差异蛋白质nm23-H1在药物处理与未处理5-8F细胞中的表达水平,采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测nm23-H1基因在药物处理与未处理5-8F细胞中的甲基化水平.建立了5-aza-2-dC处理与未处理5-8F细胞蛋白质的2-DE图谱,识别了49个差异表达的蛋白质点,鉴定了33个差异表达的蛋白质,其中包括nm23-H1在内的15个蛋白质在5-aza-2-dC处理后的5-8F细胞中表达上调,而18个蛋白质表达下调.Westernblotting和RT-PCR结果显示,nm23-H1在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后表达上调,MS-PCR结果显示,在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后nm23-H1基因甲基化水平下降,结果证实,nm23-H1基因是5-8F细胞中的甲基化沉默基因.15个5-aza-2-dC处理后表达上调的基因可能是5-8F细胞中的甲基化沉默基因,为筛选鼻咽癌甲基化失活基因提供了科学依据. 展开更多
关键词 鼻咽癌 甲基沉默基因 蛋白质组学 甲基特异PCR NM23-H1
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低氧通过HIF-1α介导Hepcidin mRNA的去甲基化修饰促进高原红细胞增多症的分子机制研究
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作者 白洁 黄河 +2 位作者 张莲 浩光东 万玛草 《河北医学》 CAS 2024年第8期1250-1255,共6页
目的:探讨HIF-1α和Hepcidin在高原红细胞增多症致病机制中的作用。方法:招募和测定高原红细胞增多症(HAE组)和同一高海拔地区健康个体(HH组),以及出生于同一高海拔地区并在超过2年的时间段居住于低海拔地区的健康个体(LH组)外周血血红... 目的:探讨HIF-1α和Hepcidin在高原红细胞增多症致病机制中的作用。方法:招募和测定高原红细胞增多症(HAE组)和同一高海拔地区健康个体(HH组),以及出生于同一高海拔地区并在超过2年的时间段居住于低海拔地区的健康个体(LH组)外周血血红蛋白浓度[Hb]、血红蛋白质量(Hbmass)、血容量和外周血O_(2)饱和度(SpO_(2))。ELISA法测定上述个体外周血清HIF-1α和Hepcidin的水平。体外低氧诱导HepG2细胞,实验分组为Control组和Hypoxia组,测定细胞中HIF-1α和Hepcidin mRNA和蛋白质表达水平。m6A含量分析、RNA免疫共沉淀法(RIP)、双荧光素酶报告基因分析法,mRNA稳定性分析法深入探讨HIF-1α对Hepcidin mRNA的m6A去甲基化修饰的分子机制。结果:与LH组相比,HH组[Hb]、Hbmass水平和血容量升高,SpO_(2)降低;与HH组相比,HAE组[Hb]、Hbmass水平和血容量升高,SpO_(2)降低(P<0.05)。与Control组相比,Hypoxia组HIF-1αmRNA和蛋白质相对表达水平升高,Hepcidin mRNA和蛋白质相对表达水平降低(P<0.05)。与Control组相比,Hypoxia组HepG2细胞的m6A(%)水平降低(P<0.05)。mRNA稳定性分析HepG2细胞中Hepcidin mRNA水平,与Control组相比,Hypoxia组Hepcidin mRNA相对表达水平降低(P<0.05)。双荧光素酶报告基因分析结果显示,与共转染了Hepcidin 3'-UTR和shRNA NT组的HepG2细胞相比,共转染了Hepcidin 3'-UTR和HIF-1αshRNA组的HepG2细胞相对荧光素酶活性升高(P<0.05)。RIP结果显示,与IgG组相比,FTO Ab组Hepcidin 3'-UTR富集水平升高(P<0.05)。结论:低氧上调HIF-1α介导Hepcidin mRNA的去甲基化修饰参与高原红细胞增多症疾病进展。 展开更多
关键词 高原红细胞增多症 缺氧诱导因子-1Α 铁调素 m6A RNA去甲基修饰
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食管鳞癌组织中TIG1基因甲基化及其mRNA表达的研究 被引量:4
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作者 童强 刘晓波 +5 位作者 罗和生 李胜保 余宗涛 张吉才 高波 蒙建超 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2278-2282,共5页
目的:探讨他扎罗汀诱导基因1(tazarotene-induced gene-1,TIG1)基因甲基化及表达与食管鳞癌发生、发展的关系。方法:采用甲基化特异性PCR检测43例食管鳞癌组织、20例癌旁组织和15例正常组织中TIG1基因甲基化状态;实时荧光定量PCR法法检... 目的:探讨他扎罗汀诱导基因1(tazarotene-induced gene-1,TIG1)基因甲基化及表达与食管鳞癌发生、发展的关系。方法:采用甲基化特异性PCR检测43例食管鳞癌组织、20例癌旁组织和15例正常组织中TIG1基因甲基化状态;实时荧光定量PCR法法检测TIG1 mRNA的表达。结果:食管鳞癌组织TIG1基因启动子甲基化率为25.6%(11/43),癌旁组织5.0%(1/20),正常组织中未检测到其甲基化,差异有统计学意义(P<0.05);其甲基化水平与患者性别、年龄、肿瘤生长部位和分化程度无关(P>0.05),但与患者TNM分期(P<0.01)及淋巴结转移(P<0.05)有关。鳞癌组织TIG1 mRNA显著低于癌旁组织(P<0.05)及正常组织(P<0.01),甲基化组织TIGI mRNA表达显著低于非甲基化组织(P<0.01)。结论:甲基化可能是食管鳞癌中TIG1基因失活的重要机制,与患者病理分期及淋巴结转移有关。 展开更多
关键词 食管肿瘤 甲基 他扎罗汀诱导基因-1 甲基特异性PCR
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温化蠲痹方作用于鸟嘌呤释放蛋白1影响微小RNA-146a对胶原诱导性关节炎大鼠外周血单个核细胞DNA甲基化调控作用研究 被引量:2
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作者 刘喜德 冯莹莹 +6 位作者 蔡龙 周红娟 王珊珊 叶丽红 王云卿 杜静 郑琳琳 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2019年第1期10-14,共5页
目的:研究鸟嘌呤释放蛋白1(RASGRP1)在中药温化蠲痹方影响微小RNA-146a(miRNA-146a)对胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠外周血单个核细胞(PBMC)DNA甲基化调控中的作用,探讨温化蠲痹方治疗CIA作用机制。方法:随机将健康雌性Wistar大鼠分为造模... 目的:研究鸟嘌呤释放蛋白1(RASGRP1)在中药温化蠲痹方影响微小RNA-146a(miRNA-146a)对胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠外周血单个核细胞(PBMC)DNA甲基化调控中的作用,探讨温化蠲痹方治疗CIA作用机制。方法:随机将健康雌性Wistar大鼠分为造模组和正常对照组(n=10,正常组),造模组在大鼠尾根部注射牛Ⅱ型胶原乳剂,建立胶原诱导性关节炎模型。30只造模成功大鼠随机分组如下:模型组(n=10)、甲氨蝶呤组(n=10,MTX组)及中药温化蠲痹方组(n=10,中药组)。中药组大鼠按22.9 g/(kg·d)灌胃中药温化蠲痹方,模型组给予生理盐水灌胃,两组大鼠都是每天1次,MTX组灌胃MTX混悬液(0.78 mg/kg),每周1次,共观察30 d。采用容积法(排水体积)评价足趾肿胀度。给药结束后,对正常组、模型组PBMC细胞培养,模型组加入ras-MARKs阻断剂,阻断剂①SB230580、阻断剂②PD98059、阻断剂③SP600125,模型组加中药,正常组转染miRNA-146a,模型组转染反义miRNA-146a。采用实时定量PCR法检测miRNA-146a、DNMTs(DNMT1、DNMT3a、DNMT3b)表达水平,Western Blot检测RASGRP1表达。结果:(1)与正常组比较,模型组大鼠足趾肿胀明显,差异有统计学意义(P<0.01);与模型组比较,中药组和MTX组大鼠足趾肿胀明显减轻,差异有统计学意义(P<0.01);MTX组与中药组比较,大鼠足趾肿胀差异无统计学意义(P>0.05);与治疗前比较,中药组和MTX组大鼠足趾肿胀减轻,差异有统计学意义(P<0.01)。(2)体内实验:与正常组比较,模型组大鼠外周血RASGRP1表达升高,差异有统计学意义(P<0.01)。与模型组比较,中药组、MTX组RASGRP1表达降低,差异有统计学意义(P<0.01)。中药组、MTX组之间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。体外实验:与正常组比较,模型组、正常转染miRNA-146a组PBMC RASGRP1表达升高,差异有统计学意义(P<0.01)。与模型组比较,模型加中药组、模型转染反义miRNA-146a组RASGRP1表达降低,差异有统计学意义(P<0.01)。与模型组比较,模型加阻断剂①组、加阻断剂②组、加阻断剂③组PBMC RASGRP1表达降低,差异有统计学意义(P<0.01)。(3)相关性分析:模型组、模型加阻②、③、加中药组、转染miRNA-146a组、转染反义miRNA-146a组大鼠PBMC miRNA-146a表达水平与DNMT1、DNMT3a、DNMT3b呈显著负相关。结论:温化蠲痹方可能作用于RASGRP1影响ras-MARKs通路,发挥对微小RNA-146a调控CIA大鼠PBMC DNA甲基化作用,是其治疗胶原诱导性关节炎作用机制之一。 展开更多
关键词 胶原诱导性关节炎 外周血单个核细胞 DNA甲基转移酶 miRNA-146a RASGRP1 蠲痹方
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5-氮杂-2'-脱氧胞苷对食管鳞癌ECa109细胞增殖及TIG1基因表达与甲基化状态的影响 被引量:2
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作者 刘晓波 高子夜 +2 位作者 金曙 李胜保 童强 《现代肿瘤医学》 CAS 2014年第3期512-516,共5页
目的:探讨5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxy-cytidine,5-aza-CdR)对食管鳞癌细胞株ECa109增殖抑制作用,以及对ECa109中TIG1基因甲基化状态及其mRNA表达的影响。方法:实验组分别使用10、20、50、100μmol/L的5-aza-CdR处理ECa... 目的:探讨5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxy-cytidine,5-aza-CdR)对食管鳞癌细胞株ECa109增殖抑制作用,以及对ECa109中TIG1基因甲基化状态及其mRNA表达的影响。方法:实验组分别使用10、20、50、100μmol/L的5-aza-CdR处理ECa109细胞,对照组用不添加5-aza-CdR培养基培养;采用MTT法检测两组细胞生存率的变化;MSP检测TIG1基因的甲基化状态;RT-PCR法检测TIG1基因mRNA表达水平。结果:5-aza-CdR可以显著抑制ECa109的生长,实验组细胞生存率显著低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01)。实验组同种药物浓度,作用时间延长,生存率显著降低,差异有统计学意义(P<0.01);同一作用时间,随着药物浓度增加,细胞生存率降低,差异有统计学意义(P<0.01)。对照组ECa109细胞TIG1基因处于高甲基化状态,经过10μmol/L及20μmol/L的5-aza-CdR处理细胞株120h后,TIG1基因的甲基化部分解除。对照组ECa109细胞中无TIG1 mRNA表达,采用10μmol/L及20μmol/L浓度药物处理72、120、168h后细胞株中TIG1 mRNA恢复表达,且20μmol/L处理组细胞较10μmol/L组TIG1 mRNA表达增强。结论:5-aza-CdR可以抑制ECa109细胞生长,且具有剂量及时间依赖性;ECa109中TIG1基因甲基化阳性,其mRNA的表达缺失;经5-aza-CdR干预后可使TIG1基因发生去甲基化修饰,恢复表达,去甲基化修饰具有时间及剂量依赖效应。 展开更多
关键词 食管鳞癌 ECA109细胞 他扎罗汀诱导基因-1 5-氮杂-2'-脱氧胞苷 甲基
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弥漫大B细胞淋巴瘤中TMS1基因启动子甲基化异常的研究
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作者 吴晓宁 陆锦标 《交通医学》 2010年第5期488-489,492,共3页
目的:研究弥漫大B细胞淋巴瘤中甲基化诱导沉默基因1(TMS1)基因启动子甲基化及其与弥漫大B细胞淋巴瘤不同细胞起源类型之间的相关性。方法:应用免疫组织化学方法检测40例弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织中CD10、Bcl6和MUM1的表达,并进一... 目的:研究弥漫大B细胞淋巴瘤中甲基化诱导沉默基因1(TMS1)基因启动子甲基化及其与弥漫大B细胞淋巴瘤不同细胞起源类型之间的相关性。方法:应用免疫组织化学方法检测40例弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织中CD10、Bcl6和MUM1的表达,并进一步区分生发中心与非生发中心B细胞起源类型;甲基化特异性PCR技术检测TMS1基因启动子甲基化状态。结果:弥漫大B细胞淋巴瘤40例中,生发中心B细胞起源16例,非生发中心B细胞起源24例。弥漫大B细胞淋巴瘤14例中存在TSM1/ASC基因异常甲基化,其中生发中心B细胞起源2例(12.5%),非生发中心B细胞起源12例(50.0%),两者阳性率比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论:TSM1基因启动子甲基化在弥漫大B细胞淋巴瘤中常见,且对非生发中心B细胞起源发生进展更为重要。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 甲基化诱导沉默基因1 脱氧核糖核酸甲基 甲基特异性聚合酶链反应
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HMGB1/GADD45A介导急性移植物抗宿主病患者CD4^+T细胞STAT3启动子的去甲基化 被引量:2
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作者 徐雅靖 杨晶 +5 位作者 张媛媛 刘恩伊 彭捷 陈旭 陈方平 彭敏源 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期937-944,共8页
目的:研究急性移植物抗宿主病(acute graft-versus-host disease,a GVHD)患者CD4+T细胞中STAT3基因启动子DNA病理性低甲基化的分子调控机制。方法:收集行同胞全相合异基因造血干细胞移植的42例患者的血液样本。采用实时定量PCR和Wester... 目的:研究急性移植物抗宿主病(acute graft-versus-host disease,a GVHD)患者CD4+T细胞中STAT3基因启动子DNA病理性低甲基化的分子调控机制。方法:收集行同胞全相合异基因造血干细胞移植的42例患者的血液样本。采用实时定量PCR和Western印迹检测各组患者生长阻滞与DNA损伤诱导蛋白45A(growth arrest and DNA damage-inducible protein 45 alpha,GADD45A)的表达水平,免疫共沉淀检测各组患者高迁移率族蛋白1(high mobility group box-1 protein,HMGB1)与GADD45A的结合水平,染色质免疫共沉淀检测各组患者HMGB1和GADD45A与STAT3启动子的结合水平;正常CD4+T细胞中过表达HMGB1及干扰GADD45A表达后用Western印迹检测STAT3表达水平,亚硫酸盐测序检测STAT3启动子区DNA甲基化水平。结果:与未发生a GVHD患者比较,a GVHD患者外周血CD4+T细胞中GADD45A表达水平明显升高;HMGB1与GADD45A的结合显著增加;HMGB1,GADD45A与STAT3启动子的结合水平均明显升高,且STAT3启动子区HMGB1,GADD45A结合水平与其DNA甲基化水平呈高度负相关(分别r=0.719,r=0.840;P<0.01)。与单纯过表达HMGB1相比,正常CD4+T细胞中过表达HMGB1叠加干扰GADD45A表达后STAT3表达明显降低,STAT3启动子DNA甲基化水平明显升高。结论:CD4+T细胞中HMGB1和GADD45A表达升高是异基因造血干细胞移植后患者STAT3启动子DNA低甲基化,STAT3高表达,进而诱发a GVHD的重要因素。 展开更多
关键词 急性移植物抗宿主病 DNA甲基 高迁移率族蛋白1 生长阻滞与DNA损伤诱导蛋白45A STAT3
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SND1通过识别TINCR的甲基化位点促进瘢痕疙瘩成纤维细胞的生长 被引量:2
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作者 秦高平 孙要文 +4 位作者 郭亚东 李建武 程亮 韩峰 宋勇 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1068-1076,共9页
目的探讨葡萄球菌核酸酶结构域蛋白1(SND1)与组织分化诱导非编码RNA(TINCR)的相互作用及其对TINCR表达水平和瘢痕疙瘩生长的影响。方法收集2016年6月-2018年5月在陕西省人民医院接受治疗的Ⅱ、Ⅲ度烧伤患者的瘢痕疙瘩组织样本(n=27)。... 目的探讨葡萄球菌核酸酶结构域蛋白1(SND1)与组织分化诱导非编码RNA(TINCR)的相互作用及其对TINCR表达水平和瘢痕疙瘩生长的影响。方法收集2016年6月-2018年5月在陕西省人民医院接受治疗的Ⅱ、Ⅲ度烧伤患者的瘢痕疙瘩组织样本(n=27)。运用生物信息学方法预测TINCR序列中的RNA甲基化位点;培养人原代正常皮肤成纤维细胞(HFs)和瘢痕疙瘩成纤维细胞(KFs),设置HFs组和KFs组。取对数生长期KFs,设置:(1)对照组、空载组及甲基转移酶样蛋白3(METTL3)过表达组;(2)对照组和3-脱氮基腺苷(DAA)组;(3)对照组、SND1重组蛋白组及SND1重组蛋白+DAA组。采用实时定量PCR(RT-qPCR)检测HFs和KFs中TINCR的相对表达水平,甲基化RNA免疫沉淀技术(MeRIP)联合RT-qPCR检测TINCR的甲基化水平,Western blotting检测SND1和METTL3蛋白的相对表达水平,放线菌素D处理联合RT-qPCR检测TINCR残留水平,CCK-8法和克隆形成实验检测细胞增殖能力。取18只BALB/c裸鼠,构建瘢痕疙瘩异种移植模型,随机分为瘢痕疙瘩组、瘢痕疙瘩+SND1重组蛋白组及瘢痕疙瘩+SND1重组蛋白+DAA组,每组6只,采用HE染色观察瘢痕疙瘩组织生长情况,免疫组化染色和Western blotting检测SND1在瘢痕疙瘩组织中的表达水平。结果TINCR第三外显子含有7个潜在的RNA甲基化位点。与HFs相比,KFs中TINCR相对表达水平(5.43±0.35 vs.1.00±0.11,P<0.01)和甲基化水平(19.73%±1.56%vs.10.25%±1.13%,P<0.01)均明显升高,SND1和METTL3蛋白相对表达水平明显增高(P<0.01),甲基化的TINCR与SND1和METTL3均有结合。与空载组相比,METTL3过表达可促进METTL3 mRNA和蛋白的表达(mRNA:6.03±0.55 vs.1.09±0.09,P<0.01;蛋白:4.33±0.35 vs.0.96±0.08,P<0.01)、增高TINCR甲基化水平(32.89%±2.88%vs.19.04%±1.72%,P<0.01)和相对表达水平(4.65±0.32 vs.1.00±0.10,P<0.01)。与对照组相比,DAA处理可降低TINCR的稳定性[(8.50±1.13)h vs.(12.90±1.41)h,P<0.001]和甲基化水平(7.43%±0.55%vs.18.88%±1.76%,P<0.01),抑制KFs的活力和克隆形成能力(P<0.01)。与对照组相比,SND1重组蛋白处理可增加TINCR的稳定性[(23.95±1.25)h vs.(13.10±1.33)h,P<0.01]、细胞活力和克隆形成能力(P<0.01),但对TINCR甲基化水平(20.15%±1.74%vs.19.04%±1.77%,P>0.05)无明显影响;DAA处理可消除SND1重组蛋白对TINCR稳定性[(12.00±1.21)h vs.(23.95±1.44)h,P<0.01]、细胞活力和克隆形成能力的影响(P<0.01)。与瘢痕疙瘩组相比,瘢痕疙瘩+SND1重组蛋白组真皮层有大量成纤维细胞和胶原纤维,瘢痕疙瘩组织中SND1阳性细胞百分比(63.43%±3.32%vs.21.16%±4.67%,P<0.01)和蛋白相对表达水平(2.54±0.13 vs.1.00±0.10,P<0.01)明显增高;而经DAA处理后,瘢痕疙瘩组织中有大量疏松的胶原纤维,SND1阳性细胞百分比(38.52%±6.88%vs.63.43%±3.32%,P<0.01)和蛋白表达水平(1.07±0.09 vs.2.54±0.13,P<0.01)明显降低。结论KFs中TINCR呈高甲基化水平,SND1可识别并结合TINCR的甲基化位点,增强TINCR的稳定性,促进TINCR介导的瘢痕疙瘩生长。 展开更多
关键词 组织分诱导非编码RNA 葡萄球菌核酸酶结构域蛋白1 RNA甲基 RNA稳定性 细胞增殖 成纤维细胞 瘢痕疙瘩
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顺铂诱导的急性肾损伤中肾脏组织m^(6)A甲基化水平的变化 被引量:1
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作者 沈剑箫 王万鹏 +4 位作者 邵兴华 吴晶魁 李舒 车霞静 倪兆慧 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1602-1611,共10页
目的·探讨N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)甲基化修饰在顺铂诱导的小鼠急性肾损伤进程中的作用。方法·选择4只C57bL/6小鼠,尾静脉注射顺铂(20 mg/kg)诱导急性肾损伤(损伤组);另取4只C57bL/6小鼠,尾静脉注射等量生... 目的·探讨N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)甲基化修饰在顺铂诱导的小鼠急性肾损伤进程中的作用。方法·选择4只C57bL/6小鼠,尾静脉注射顺铂(20 mg/kg)诱导急性肾损伤(损伤组);另取4只C57bL/6小鼠,尾静脉注射等量生理盐水(对照组)。检测2组小鼠血清肌酐及血尿素氮水平变化,观察小鼠肾脏组织切片中病理损伤情况,评估模型是否成功。进一步运用甲基化RNA免疫共沉淀技术(methylatedRNAimmunoprecipitation,MeRIP)与RNA测序技术分别检测2组小鼠肾脏组织中m^(6)A甲基化水平与RNA表达变化。运用基因本体论及京都基因和基因组数据库进行结果可视化和综合研究,并将RNA测序技术所得转录组数据与MeRIP技术检测所得表观遗传数据联合分析,寻找参与顺铂诱导急性肾损伤病理变化过程的候选基因。结果·顺铂可诱导小鼠血清肌酐与血尿素氮水平显著升高。光学显微镜观察肾组织发现广泛的肾小管空泡变性,上皮细胞剥脱,肾小管坏死,提示造模成功。MeRIP检测发现损伤组与对照组小鼠肾脏中共有2227个基因含有2981个差异化表达的m^(6)A甲基化位点(表达变化倍数≥2且P<0.05),这些基因主要富集于代谢及细胞死亡通路。表达差异化m6A甲基化位点的基因与RNA差异化表达基因的联合分析发现1002个表达趋势相同的基因,如纤维蛋白原α链、溶质载体12家族成员1和甲肝病毒细胞受体1等。结论·顺铂可诱导肾脏组织中基因mRNA上m^(6)A甲基化位点的甲基化水平变化,促进急性肾损伤进程。 展开更多
关键词 N^(6)-甲基腺嘌呤甲基 顺铂诱导急性肾损伤 纤维蛋白原α链 溶质载体12家族成员1 甲肝病毒细胞受体1
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组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D调控H9c2细胞中HIF-1α/VEGF通路(英文) 被引量:1
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作者 王燕 刘淑宝 +1 位作者 张文菁 朱冰梅 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期190-196,共7页
组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D(histone-lysine N-methyltransferase 2D,KMT2D)作为主要的组蛋白3第4位赖氨酸(H3K4)甲基转移酶,在调控胚胎发育、组织分化、代谢和肿瘤抑制方面发挥重要作用。在小鼠体内,敲除Kmt2d会导致严重的心脏发育缺陷... 组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D(histone-lysine N-methyltransferase 2D,KMT2D)作为主要的组蛋白3第4位赖氨酸(H3K4)甲基转移酶,在调控胚胎发育、组织分化、代谢和肿瘤抑制方面发挥重要作用。在小鼠体内,敲除Kmt2d会导致严重的心脏发育缺陷最终造成胚胎期死亡。低氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor 1α,HIF-1α)作为调节细胞应对低氧的关键转录因子,能够调控多种下游基因转录。有相关研究揭示,表观遗传调控者能够调节HIF-1α的稳定性和活性。同样,作为表观遗传调控者的组蛋白甲基转移酶KMT2D是否参与低氧条件下HIF-1α对下游基因的调控,目前仍未知。在本研究中,观察在Kmt2d正常或缺乏的情况下,心肌细胞H9c2对低氧环境的应答反应。结果显示,与常氧条件相比,低氧状态下HIF-1α、组蛋白乙酰化酶P300、KMT2D及其介导的H3K4一甲基化(H3K4 mono-methylation,H3K4me1)的蛋白质水平增加(P<0.05);HIF-1α下游基因血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,Vegf)的mRNA表达水平明显上调(P<0.01)。染色质免疫共沉淀实验(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP-qPCR)检测结果显示,H3K4me1和组蛋白3第27位赖氨酸乙酰化(histone 3 lysine 27 acetylation,H3K27ac)在Vegf基因启动子区域的结合丰度明显增加(P<0.05)。低氧条件下沉默Kmt2d之后,H3K4me1蛋白水平和Vegf的mRNA表达下降(P<0.05)。本研究表明,低氧条件下KMT2D参与调控HIF-1α和下游基因Vegf的表达。 展开更多
关键词 组蛋白赖氨酸甲基转移酶2D 组蛋白H3K4一甲基 低氧 低氧诱导因子-1α/血管内皮生长因子
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启动子甲基化调控胰腺癌他扎罗汀诱导基因1表达的研究 被引量:1
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作者 李娜 李会琴 +1 位作者 董文杰 吴欣爱 《中华全科医学》 2018年第8期1233-1236,共4页
目的研究他扎罗汀诱导基因1(tazarotene-induced gene-1,TIG1)在胰腺癌中的表达情况及启动子在胰腺癌细胞中的甲基化状态。方法收集67组胰腺癌和对应癌旁组织,用SP法进行TIG1蛋白检查并分析TIG1在癌、癌旁组织的表达差异。培养胰腺癌细... 目的研究他扎罗汀诱导基因1(tazarotene-induced gene-1,TIG1)在胰腺癌中的表达情况及启动子在胰腺癌细胞中的甲基化状态。方法收集67组胰腺癌和对应癌旁组织,用SP法进行TIG1蛋白检查并分析TIG1在癌、癌旁组织的表达差异。培养胰腺癌细胞株PANC1、Bx PC3和SW1990,提取细胞总DNA,甲基化修饰后亚硫酸盐测序PCR(BSP)分析启动子Cp G岛甲基化状态;筛选细胞总RNA,用实时定量PCR(real-time PCR)依次测各细胞株、经5-杂氮-2-脱氧胞嘧啶(5-aza-d C)干预前后TIG1 mRNA的表达差异。结果 TIG1在癌组织中的表达低于癌旁组织(P<0.05)。TIG1的表达与胰腺癌的大小、分期无相关性,但与部位存在相关性(P<0.05)。TIG1在Bx PC3和SW1990细胞中存在高甲基化状态,分别为(92±2)%和(86±2)%,在PANC1细胞甲基化率为(40±2)%。TIG1甲基化的Bx PC3和SW1990细胞经5-aza-d C处理后TIG1表达明显上调(P<0.05),而甲基化的PANC1细胞经同样处理后TIG1的表达变化不明显。结论癌组织中TIG1的表达显著低于癌旁组织。不同部位胰腺癌TIG1的表达存在差异。TIG1基因在Bx PC3和SW1990胰腺癌细胞中的低表达与甲基化有关。TIG1基因甲基化可能是调控胰腺癌细胞TIG1表达的重要分子机制之一。 展开更多
关键词 胰腺癌 他扎罗汀诱导基因1 甲基 5-杂氮-2-脱氧胞嘧啶
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青黄散联合健脾补肾方对骨髓增生异常综合征患者HDAC1基因去甲基化的影响 被引量:5
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作者 高飞 许勇钢 +3 位作者 王洪志 王德秀 朱千赜 麻柔 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期810-815,共6页
目的探讨青黄散联合健脾补肾方提高骨髓增生异常综合征(MDS)患者外周血红蛋白机制。方法选择2016年2月-2018年2月在中国中医科学院西苑医院及首都医科大学附属北京中医医院血液科就诊的30例MDS患者,采用青黄散联合健脾补肾方治疗6个月... 目的探讨青黄散联合健脾补肾方提高骨髓增生异常综合征(MDS)患者外周血红蛋白机制。方法选择2016年2月-2018年2月在中国中医科学院西苑医院及首都医科大学附属北京中医医院血液科就诊的30例MDS患者,采用青黄散联合健脾补肾方治疗6个月。采用血细胞分析仪检测患者治疗前后血常规,亚硝酸氢盐测序法(BSP)检测治疗前后骨髓HDAC1基因甲基化变化,Real-time PCR检测治疗前后HDAC1 mRNA及缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA变化,采用自身前后对照的方法比较治疗前后上述指标的差异。结果治疗前MDS骨髓标本中,HDAC1基因启动子区CpG1、CpG5、CpG12、CpG23位点呈高甲基化,分别为58.67%、85.67%、63.89%、71.63%,治疗后,上述HDAC1基因启动子区4个甲基化位点呈低甲基化状态,分别为0.67%、0、1.33%、1.33%;治疗后HDAC1 mRNA相对表达量较治疗前增加了4.9倍(P<0.01),HIF-1αmRNA相对表达量较治疗前增加了7.5倍(P<0.05)。结论青黄散联合健脾补肾方可通过降低HDAC1基因高甲基化增加下游HIF-1αmRNA表达,发挥提高外周血红蛋白作用。 展开更多
关键词 青黄散 健脾补肾方 骨髓增生异常综合征 HDAC1基因 甲基 缺氧诱导因子-1αmRNA
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BNIP3基因促细胞凋亡研究新进展 被引量:3
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作者 邓茜 李志平 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期807-811,共5页
分子靶向治疗将成为未来肿瘤治疗的主导方向。BNIP3作为一种促凋亡基因,其在恶性肿瘤中发挥出的积极促凋亡作用早已引起国内外肿瘤研究学者的广泛关注,尤其是在BNIP3的分子结构、作用机制(尤其是促细胞凋亡的最新进展)、临床实践和应用... 分子靶向治疗将成为未来肿瘤治疗的主导方向。BNIP3作为一种促凋亡基因,其在恶性肿瘤中发挥出的积极促凋亡作用早已引起国内外肿瘤研究学者的广泛关注,尤其是在BNIP3的分子结构、作用机制(尤其是促细胞凋亡的最新进展)、临床实践和应用前景方面。BNIP3基因在缺氧条件下可诱导细胞发生程序性死亡,即细胞凋亡。BNIP3促细胞凋亡线粒体途径根据有否caspase的参与而具有不同的作用机制。此外,BNIP3还可诱导细胞自噬。BNIP3基因甲基化后表达沉默可导致肿瘤细胞耐受缺氧,对放疗和化疗产生抵抗。BNIP3核内转移可使细胞逃避凋亡。BNIP3促细胞凋亡介导的肿瘤治疗研究已获得了成效。BNIP3有望成为一种新型的靶向治疗基因,在未来的肿瘤综合治疗中发挥积极的作用。 展开更多
关键词 肿瘤 基因 BNIP3 缺氧诱导因子1 细胞凋亡 甲基
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白藜芦醇抑制K562细胞增殖过程中WT1基因表达及其甲基化水平的变化 被引量:2
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作者 汪丽佩 赵燕娜 高瑞兰 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期245-246,共2页
白藜芦醇(resveratr01)可抑制多种肿瘤细胞增殖、诱导凋亡,但确切机制仍不清楚。WT1基因是一种“泛白血病”标志,其表达水平与白血病预后及造血细胞分化程度呈负相关。
关键词 WT1基因表达 甲基水平 白藜芦醇 K562细胞 增殖过程 肿瘤细胞增殖 细胞分程度 诱导凋亡
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DNA甲基化和缺氧对食管癌细胞中B细胞淋巴瘤/白血病-2/腺病毒E1B19000相互作用蛋白3基因表达的影响
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作者 张洪典 陈传贵 +1 位作者 马钊 于振涛 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期2465-2468,共4页
目的 观察DNA甲基化及缺氧与沉默缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)对食管癌细胞中B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2)/腺病毒E1B 19 000相互作用蛋白3(BNIP3)基因表达的影响.方法 收集食管癌细胞株KE4、Kyse-140、Caes-17和TE-7,采用逆转录-... 目的 观察DNA甲基化及缺氧与沉默缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)对食管癌细胞中B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2)/腺病毒E1B 19 000相互作用蛋白3(BNIP3)基因表达的影响.方法 收集食管癌细胞株KE4、Kyse-140、Caes-17和TE-7,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和Western blot分别检测BNIP3 mRNA和蛋白表达水平,甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测BNIP3启动子区甲基化状态.MIC-101乏氧培养系统模拟肿瘤缺氧微环境,实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)和Western blot检测缺氧(1%O2)、常氧及小干扰RNA(siRNA)沉默HIF-1α后Caes-17细胞中BNIP3mRNA和蛋白表达水平.结果 BNIP3在KE4和Caes-17细胞中表达水平均较高,而在TE-7和Kyse-140细胞中表达较低;同时MSP结果显示,在TE-7和Kyse-140细胞中BNIP3启动子区发生了明显的甲基化,经5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)处理2个细胞株后,BNIP3启动子区甲基化状态得到了逆转,同时其表达水平显著升高.缺氧条件下,Caes-17细胞中BNIP3 mRNA (4.35±0.20)和蛋白(1.23±0.04)的表达水平较常氧时(BNIP3 mRNA:1.07 ±0.12,BNIP3蛋白:0.28 ±0.03)显著升高(P<0.05),siRNA转染Caes-17细胞后能显著下调HIF-1α的表达(抑制率为90%),并导致BNIP3基因的表达(BNIP3 mRNA:1.12 ±0.14,BNIP3蛋白:0.34±0.03)受到明显的抑制.结论 BNIP3基因启动子区甲基化是导致其在食管癌细胞中表达较弱的重要原因之一,甲基化酶抑制剂可逆转BNIP3的甲基化状态重新恢复其表达;缺氧能使HIF-1α蛋白的表达升高,同时上调BNIP3的表达水平. 展开更多
关键词 食管 B细胞淋巴瘤/白血病-2/腺病毒E1B 19 000相互作用蛋白3 甲基 缺氧 缺氧诱导因子-1Α RNA干扰
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血清和糖皮质激素诱导激酶1甲基化在复发性流产患者中的表达水平及价值研究 被引量:3
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作者 周丽霞 何淑贞 曹金如 《中国妇幼保健》 CAS 2018年第20期4718-4720,共3页
目的探讨血清和糖皮质激素诱导激酶1(SGK1)甲基化在复发性流产患者中的表达水平及价值,为复发性流产的治疗和预防提供理论依据。方法选取2015年1-12月东莞市第三人民医院收治的自然流产患者(自然流产组,100例)及复发性流产患者(复发性... 目的探讨血清和糖皮质激素诱导激酶1(SGK1)甲基化在复发性流产患者中的表达水平及价值,为复发性流产的治疗和预防提供理论依据。方法选取2015年1-12月东莞市第三人民医院收治的自然流产患者(自然流产组,100例)及复发性流产患者(复发性流产组,100例)作为研究对象,另取选取同期在该院行人工流产术的150例患者为人工流产组。3组患者入院后次日早晨空腹抽取静脉血5 ml,采用3730XL测序仪对其SGK1-rs9402571基因进行测定,分析SGK1甲基化在复发性流产患者中的表达水平及价值。结果人工流产组、自然流产组与复发性流产组SGK1-rs9402571基因中GT比较差异无统计学意义(P>0.05);自然流产组SGK1-rs9402571基因中GG高于人工流产组与复发性流产组(P<0.05);人工流产组SGK1-rs9402571基因中TT高于自然流产组与复发性流产组(P<0.05);人工流产组、自然流产组与复发性流产组SGK1-rs9402571基因频率比较差异无统计学意义(P>0.05)。复发性流产组、自然流产组SGK1 DNA甲基化水平与人工流产组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论 SGK1 DNA甲基化水平增高有可能是导致复发性流产的原因。 展开更多
关键词 血清和糖皮质诱导激酶1 甲基 复发性流产 表达
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SOCS1和SOCS3低甲基化对川崎病Th1/Th2细胞失衡的影响 被引量:4
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作者 王国兵 李成荣 +2 位作者 杨军 温鹏强 贾实磊 《中华风湿病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期732-737,共6页
目的 探讨SOCS1和SOCS3低甲基化对川崎病Th1/Th2细胞失衡的影响.方法 急性期川崎病患儿36例,健康同年龄对照组16名.酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血浆白细胞介素(IL)-6蛋白浓度;实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测CD4+T细胞SOCS1... 目的 探讨SOCS1和SOCS3低甲基化对川崎病Th1/Th2细胞失衡的影响.方法 急性期川崎病患儿36例,健康同年龄对照组16名.酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血浆白细胞介素(IL)-6蛋白浓度;实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测CD4+T细胞SOCS1、SOCS3、T-bet、干扰素(IFN)-γ、GATA3、IL-4基因mRNA表达;流式细胞术检测外周血Th1/Th2细胞比例和CD4+T细胞磷酸化STAT3(pSTAT3)蛋白平均荧光强度(MFI);甲基化特异性定量PCR(MethySYBR PCR)检测CD4+T细胞SOCSl基因外显子2、SOCS3基因5'端非翻译区(5'-UTR)3个可能的STAT3结合位点CpG岛甲基化水平.采用t检验进行统计分析.结果 ①急性期川崎病患儿血浆IL-6浓度[分别为(51.8±16.3)pg/ml和(8.6±2.0)pg/ml]、CD4+T细胞pSTAT3 MH水平[分别为(52±14)和(10±4)]显著上调(P<0.05).其中川崎病合并冠状动脉损伤组(川崎病-CAL+)IL-6和pSTAT3 MFI水平均明显高于无冠状动脉损伤组[IL-6为(87.2±27.4)pg/ml与(36.2±12.8)pg/ml,P<0.05;pSTAT3 MFI为(75±15)和(42±11),P<0.05].②急性期川崎病患儿Th1、Th2细胞比例及相关因子(T-bet、IFN-γ、GATA3和IL-4)表达明显增高(P<0.05),Th1/Th2比值低于健康对照组(P<0.05).其中川崎病-CAL+组Th1、Th2细胞比例及相关因子表达水平高于川崎病-GAL-组(P<0.05),而Th1/Th2比值则略低于后者(P<0.05).③急性期川崎病患儿CD4+T细胞SOCS1和SOCS3 mRNA水平显著高于同年龄对照组(P<0.05),其中川崎病-CAL+组 SOCS1和SOCS3 mRNA表达低于川崎病-CAL-组(P<0.05);健康对照组SOCS1基因外显子2、SOCS3基因5'-UTR区第3个STAT3结合位点的CpG岛完全去甲基化,急性期川崎病患儿呈低甲基化状态(P<0.05),其中川崎病-CAL+组去甲基化水平明显低于川崎病-CAL组(P<0.05);各组SOCS3基因5'-UTR区第1、2个STAT3结合位点CpG岛均处于完全去甲基化状态(P>0.05).结论 SOCS1和SOCS3基因低甲基化所致表达相对不足可能是川崎病Th1/Th2细胞失衡的因素之一. 展开更多
关键词 黏膜皮肤淋巴结综合征 T淋巴细胞 辅助诱导 甲基 SOCS1 SOCS3
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疏肝健脾活血方对肝纤维化大鼠肝组织HIF-1α蛋白及VEGF mRNA表达的影响 被引量:14
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作者 夏雪皎 林庚庭 +1 位作者 滕飞 张俊杰 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期1357-1360,共4页
目的:应用二甲基亚硝胺(DMN)建立肝纤维化大鼠模型,动态观察疏肝健脾活血方对肝纤维化大鼠肝组织中HIF-1α蛋白、VEGF m RNA表达的影响,探讨疏肝健脾活血方抗肝纤维化的作用机制。方法:90只大鼠随机分为正常2、4、6周组,模型2、4、6周组... 目的:应用二甲基亚硝胺(DMN)建立肝纤维化大鼠模型,动态观察疏肝健脾活血方对肝纤维化大鼠肝组织中HIF-1α蛋白、VEGF m RNA表达的影响,探讨疏肝健脾活血方抗肝纤维化的作用机制。方法:90只大鼠随机分为正常2、4、6周组,模型2、4、6周组,中药2、4、6周组,共9组,每组10只。采用DMN腹腔注射建立肝纤维化大鼠模型,同时中药各组给予疏肝健脾活血方灌胃。观察各组大鼠肝纤维化病理形态学改变,Westernblot法检测肝组织HIF-1α蛋白,RT-PCR法检测肝组织VEGF m RNA表达情况。结果:与正常各组同期比较,模型各组及中药各组大鼠肝组织HIF-1α蛋白、VEGF m RNA表达量均增高(P<0.01,P<0.05);与模型各组同期比较,中药4、6周组肝组织HIF-1α蛋白、VEGF m RNA表达量均降低(P<0.05,P<0.01)。结论:疏肝健脾活血方可减轻肝脏纤维化程度;降低肝组织HIF-1α蛋白、VEGF m RNA表达量,可能是其抗肝纤维化作用机制之一。 展开更多
关键词 疏肝健脾活血方 甲基亚硝胺 肝纤维 缺氧诱导因子-1Α 血管内皮生长因子
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HIF1α通过启动ALKBH5调控整合素蛋白αν表达的机制研究 被引量:1
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作者 周丽颖 张宇迪 +1 位作者 王丽 王树玉 《中华生殖与避孕杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期371-380,共10页
目的探索缺氧诱导因子1α(hypoxia inducible factor 1α,HIF1α)启动N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)去甲基化酶ALKBH5改善子宫内膜容受性分子标志物整合素蛋白αν(integrinαν,ITGAV)表达的内在机制。方法利用人子宫内膜癌Ishi... 目的探索缺氧诱导因子1α(hypoxia inducible factor 1α,HIF1α)启动N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)去甲基化酶ALKBH5改善子宫内膜容受性分子标志物整合素蛋白αν(integrinαν,ITGAV)表达的内在机制。方法利用人子宫内膜癌Ishikawa细胞,低氧以及干扰HIF1α条件下实时荧光定量PCR(real time quantity PCR,RT-PCR)或Western blotting检测ALKBH5的表达;过表达或干扰ALKBH5表达后,RT-PCR或Western blotting检测对ITGAV基因和蛋白表达的影响;荧光素酶报告基因系统分析miR-136-5p靶向ITGAV mRNA表达;RNA pull-down分析及m6A甲基化检测ALKBH5与miR-136-5p竞争性结合ITGAV mRNA上甲基化位点序列。结果低氧条件下HIF1α时间依赖性促进ALKBH5蛋白在Ishikawa细胞中的表达。过表达ALKBH5后,ITGAV的表达水平升高(P<0.001),Ishikawa细胞增殖能力增强(P<0.001);ALKBH5敲除后,ITGAV的表达水平降低(P<0.001),Ishikawa细胞的增殖能力下降(P=0.019)。miR-136-5p靶向调节ITGAV mRNA后,ITGAV mRNA(P=0.007)和蛋白表达水平(P=0.015)下调。miR-136-5p靶向调节ITGAV的序列与ALKBH5所识别的甲基化位点所在序列重叠,两者在调控ITGAV mRNA上存在竞争性。结论HIF1α通过调控ALKBH5,竞争性地结合miR-136-5p所靶向的ITGAV mRNA上特定序列,精细化调节ITGAV的表达,改善子宫内膜容受性。 展开更多
关键词 子宫内膜容受性 缺氧诱导因子1Α ALKBH5 N6-甲基腺苷甲基 整合素蛋白αν
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