利用NCBI相关资源电子定位基因的方法和实践

介绍了在NCBI上与电子定位基因有关的主要生物信息学资源,以人胰核糖核酸酶基因为例,探讨了运用生物信息学在NCBI中电子定位基因的几种方法。

肝细胞癌中差异表达EST的生物信息学分析和功能预测

目的 采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌中差异表达表达序列标签 (expressionsequencetag ,EST)的全长、ORF、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能 ,指导实验研究。方法 应用多种生物学软件进行分析。结果 获得两条新基因的全长序列 ,和RACE方法、测序获得的结果一致 ;两条EST分别定位于 2p13～ 15、3p14 ;高表达EST主要表达于肿瘤组织 ,低表达EST主要表达于正常组织 ;高表达基因所编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装 ,低表达编码蛋白质和机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关。结论 采用生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因。