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利用特定基因监测小规模畜禽保种群遗传多样性变化的研究
1
作者
张萌萌
兰露莎
+5 位作者
陈业
朱穆真
李文婷
袁文燕
全裕军
吴克亮
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2016年第7期16-22,共7页
利用计算机模拟技术,观测特定基因在小规模畜禽保种群体中基因频率的变化,进而探讨畜禽保种群体遗传多样性的变化规律,为畜禽品种资源特定的种质特性保护提供科学依据和理论支持。运用Fotran90程序模拟重建Buri经典果蝇实验的保种过程,...
利用计算机模拟技术,观测特定基因在小规模畜禽保种群体中基因频率的变化,进而探讨畜禽保种群体遗传多样性的变化规律,为畜禽品种资源特定的种质特性保护提供科学依据和理论支持。运用Fotran90程序模拟重建Buri经典果蝇实验的保种过程,以基因频率、F-statistics和杂合度为度量指标,观测特定基因在保种世代推进过程中保种群体内和群体间遗传多样性的变化;随后,通过OMPG(one-migration-per-generation)原则研究迁移对畜禽保种群体遗传多样性的维持效应。结果发现,保种群体的遗传多样性总体趋势随保种世代的延长而逐代降低,具体表现群体分化程度加剧:Fst,Fit从初始世代0.0421,0.0011,上升到19世代的0.3885,0.3305,上升幅度高达89.16%和99.67%;杂合度降低:群体hi,hs从初始世代0.4994,0.4790下降到19世代0.3347,0.3057,下降幅度达32.98%和36.18%;而后利用OMPG原则操作保种群体,群体分化程度减弱:Fst,Fit从操作OMPG原则后初始世代0.3667,0.3504,下降到19世代的0.2341,0.1944,下降幅度达36.16%和44.52%;杂合度回升:群体hi,hs从操作OMPG原则后初始世代的0.3248,0.3166,上升到19世代的0.4025,0.3826,回升幅度分别达23.92%和20.84%。结论遗传漂变效应导致群体内遗传多样性丢失,OMPG原则输入效应可抵消小保种群体的遗传衰退,维持保种群体遗传多样性的稳定性。
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关键词
计算机模拟
遗传多样性
保种
畜禽品种种质资源
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职称材料
题名
利用特定基因监测小规模畜禽保种群遗传多样性变化的研究
1
作者
张萌萌
兰露莎
陈业
朱穆真
李文婷
袁文燕
全裕军
吴克亮
机构
中国农业大学动物科技学院
贵州医科大学实验动物中心
西南大学荣昌校区
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2016年第7期16-22,共7页
文摘
利用计算机模拟技术,观测特定基因在小规模畜禽保种群体中基因频率的变化,进而探讨畜禽保种群体遗传多样性的变化规律,为畜禽品种资源特定的种质特性保护提供科学依据和理论支持。运用Fotran90程序模拟重建Buri经典果蝇实验的保种过程,以基因频率、F-statistics和杂合度为度量指标,观测特定基因在保种世代推进过程中保种群体内和群体间遗传多样性的变化;随后,通过OMPG(one-migration-per-generation)原则研究迁移对畜禽保种群体遗传多样性的维持效应。结果发现,保种群体的遗传多样性总体趋势随保种世代的延长而逐代降低,具体表现群体分化程度加剧:Fst,Fit从初始世代0.0421,0.0011,上升到19世代的0.3885,0.3305,上升幅度高达89.16%和99.67%;杂合度降低:群体hi,hs从初始世代0.4994,0.4790下降到19世代0.3347,0.3057,下降幅度达32.98%和36.18%;而后利用OMPG原则操作保种群体,群体分化程度减弱:Fst,Fit从操作OMPG原则后初始世代0.3667,0.3504,下降到19世代的0.2341,0.1944,下降幅度达36.16%和44.52%;杂合度回升:群体hi,hs从操作OMPG原则后初始世代的0.3248,0.3166,上升到19世代的0.4025,0.3826,回升幅度分别达23.92%和20.84%。结论遗传漂变效应导致群体内遗传多样性丢失,OMPG原则输入效应可抵消小保种群体的遗传衰退,维持保种群体遗传多样性的稳定性。
关键词
计算机模拟
遗传多样性
保种
畜禽品种种质资源
Keywords
computer simulation
genetic diversity
conservation
livestock germplasm resources
分类号
S814.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
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1
利用特定基因监测小规模畜禽保种群遗传多样性变化的研究
张萌萌
兰露莎
陈业
朱穆真
李文婷
袁文燕
全裕军
吴克亮
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2016
0
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