黄瓜花叶病毒番茄蕨叶分离物外壳蛋白基因的克隆和序列分析

在北京延庆的番茄上分离到1株黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)分离物CMV-YQ,该分离物在番茄上造成严重的蕨叶、矮化,在烟草上表现花叶、矮化和畸形,表现出很强的致病性。根据黄瓜花叶病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的保守序列设计引物,利用RT-PCR技术对其CP基因片段进行了扩增并克隆,获得了含该基因全长657 bp的cDNA片段。序列测定与比较分析结果表明,北京地区造成番茄蕨叶的CMV分离物CP基因片段核酸序列与GenBank上CMV亚组Ⅰ其他分离物同源性高达90%～99%,属于CMV亚组Ⅰ。该分离物与分离于我国芭蕉的另一亚组Ⅰ分离物GB同源性为94.37%,两分离物之间存在寄主适应性变异。

杨凌番茄黄化曲叶病毒外壳蛋白基因的克隆与其核心序列分析

以陕西杨凌番茄生产基地感病(TYLCV症状)番茄植株为材料,分离得到杨凌番茄黄化曲叶病毒分离物,命名为TYLCV-Yl(GenBank序列号:KC293824,未公布);克隆该病毒外壳蛋白全基因序列CP及其核心序列tCP;分析核心序列tCP的特征、进化特征;运用DNAMAN多重比较了该病毒外壳蛋白序列与其他18个TYLCV-CP核苷酸序列并且构建了基于CP基因核苷酸序列的进化树。结果表明:获得杨凌番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-Yl)分离物,确定杨凌番茄黄化曲叶病毒源;获得TYLCV-YlCP全基因序列核心序列tCP,为基于CP抗TYLCV奠定基础;tCP核心序列非常保守,长度为419bp,编码137个氨基酸,其中在79～97个氨基酸之间具有1个跨膜结构;基于CP基因构建的进化树可将番茄黄化曲叶病毒分为3个亚组:TYLCV亚组Ⅰ,TYLCV亚组Ⅱ,TYLCV亚组Ⅲ,其中杨凌番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-Yl)属于TYLCV亚组Ⅰ。