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基于序列疏水值震荡的折叠速率预测 被引量:1
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作者 胡睿 史小红 李晋惠 《生物信息学》 2013年第2期86-90,共5页
蛋白质折叠速率的正确预测对理解蛋白质的折叠机理非常重要。本文从伪氨基酸组成的方法出发,提出利用序列疏水值震荡的方法来提取蛋白质氨基酸的序列顺序信息,建立线性回归模型进行折叠速率预测。该方法不需要蛋白质的任何二级结构、三... 蛋白质折叠速率的正确预测对理解蛋白质的折叠机理非常重要。本文从伪氨基酸组成的方法出发,提出利用序列疏水值震荡的方法来提取蛋白质氨基酸的序列顺序信息,建立线性回归模型进行折叠速率预测。该方法不需要蛋白质的任何二级结构、三级结构信息或结构类信息,可直接从序列对蛋白质折叠速率进行预测。对含有62个蛋白质的数据集,经过Jack-knife交互检验验证,相关系数达到0.804,表示折叠速率预测值与实验值有很好的相关性,说明了氨基酸序列信息对蛋白质折叠速率影响重要。同其他方法相比,本文的方法具有计算简单,输入参数少等特点。 展开更多
关键词 蛋白质折叠 折叠速率 疏水值震荡 伪氨基酸组成 回归分析
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结构片断法计算离子型表面活性剂的HLB值 被引量:5
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作者 杨运泉 李远喜 +1 位作者 童刚生 李国龙 《精细化工》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期449-453,共5页
运用结构片断法计算离子型表面活性剂的疏水值logP,并将疏水值概念引入Davies基团贡献法以代替该模型中亲油基的基团数,从而建立了计算离子型表面活性剂HLB值的新模型为:HLB=7+∑亲水基基团数-∑疏水基logP。通过与文献列举的17个不同... 运用结构片断法计算离子型表面活性剂的疏水值logP,并将疏水值概念引入Davies基团贡献法以代替该模型中亲油基的基团数,从而建立了计算离子型表面活性剂HLB值的新模型为:HLB=7+∑亲水基基团数-∑疏水基logP。通过与文献列举的17个不同系列离子型表面活性剂的HLB值对照表明,该新模型的计算值与文献值的平均相对偏差为1.68%。采用非线性方法拟合了烷基硫酸钠,烷基磺酸钠和烷基三甲基溴化铵3类典型离子型表面活性剂的CMC和HLB的关系,并得到了其关联方程,拟合结果表明,由新模型得到的关联方程其复相关系数R2>0.988。 展开更多
关键词 离子型表面活性剂 HLB CMC 结构片断法 疏水值logP 基团贡献法
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热处理对大豆分离蛋白可食性膜性能和结构的影响 被引量:11
3
作者 马丹 张超 +3 位作者 马越 赵晓燕 岳喜庆 雷安亮 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第1期102-104,共3页
研究热处理对大豆分离蛋白膜性能和结构的影响,90℃热处理后制得的大豆分离蛋白膜呈现出最佳机械性能和阻隔性能。同时研究热处理后蛋白的结构变化,包括二硫键数量、疏水值和二级结构。结果显示:二硫键和α-螺旋含量与膜机械和阻隔性能... 研究热处理对大豆分离蛋白膜性能和结构的影响,90℃热处理后制得的大豆分离蛋白膜呈现出最佳机械性能和阻隔性能。同时研究热处理后蛋白的结构变化,包括二硫键数量、疏水值和二级结构。结果显示:二硫键和α-螺旋含量与膜机械和阻隔性能呈现正相关性,而疏水值与膜机械和阻隔性能呈现负相关性。 展开更多
关键词 大豆分离蛋白 可食性膜 热处理 二硫键 疏水值
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大孔树脂吸附分离蚕蛹ACE抑制肽的研究 被引量:5
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作者 李勇 黄先智 +2 位作者 阚建全 何锦 张海娜 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第16期281-284,288,共5页
为了找出大孔树脂纯化蚕蛹ACE抑制肽的方法。比较了5种大孔树脂在纯化蚕蛹ACE抑制肽时的吸附率和解吸率,得出DA201-C分离蚕蛹ACE抑制肽的效果最好。再进一步考察上样流速、上样浓度、分级洗脱等对DA201-C大孔树脂吸附及分离效果的影响... 为了找出大孔树脂纯化蚕蛹ACE抑制肽的方法。比较了5种大孔树脂在纯化蚕蛹ACE抑制肽时的吸附率和解吸率,得出DA201-C分离蚕蛹ACE抑制肽的效果最好。再进一步考察上样流速、上样浓度、分级洗脱等对DA201-C大孔树脂吸附及分离效果的影响。最终结果为75%乙醇洗脱下的多肽的ACE抑制率最高,其IC50为0.632mg/mL,并且发现疏水性与ACE抑制率呈正相关。 展开更多
关键词 大孔树脂 DA201-C ACE抑制肽 疏水值
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葡萄酒中农药残留的调查研究 被引量:13
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作者 薛洁 张敬 +1 位作者 梁萌萌 孙志伟 《酿酒科技》 北大核心 2014年第7期4-8,共5页
研究利用GC-MS检测方法,分析了28个葡萄酒样品中的农药残留量。结果表明,所测样品中农残总量均未超过欧盟对葡萄酒中各农残最大残留量的规定;白葡萄酒农残均值为0.359 mg/L,红葡萄酒(不含有机葡萄)农残均值为0.622 mg/L,有机葡萄酒中农... 研究利用GC-MS检测方法,分析了28个葡萄酒样品中的农药残留量。结果表明,所测样品中农残总量均未超过欧盟对葡萄酒中各农残最大残留量的规定;白葡萄酒农残均值为0.359 mg/L,红葡萄酒(不含有机葡萄)农残均值为0.622 mg/L,有机葡萄酒中农残低于10μg/L;在模拟酿造试验中发现,农药的残留率与其疏水值有关,疏水值最小的甲霜灵的残留率最大,因此,酵母泥中有大量的农药沉积而导致残留量明显增加。酒精发酵后,酵母对部分农药进行了降解或吸附作用而使部分农药残留量下降。 展开更多
关键词 葡萄酒 农药残留 疏水值 分析检测
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不同结构类蛋白质序列中的关联特性 被引量:7
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作者 黄敏 沈晖 肖奕 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期755-759,共5页
采用功率谱的方法对不同结构类蛋白质序列进行了研究。结论为 :从统计平均的角度看 ,蛋白质序列并不是一种毫无规律的随机序列 ,它们存在着明显的关联 ,而且不同结构类蛋白质序列具有与它们的结构类相对应的不同的关联特性。
关键词 蛋白质序列 结构类 功率谱 疏水值 关联特性
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连续小波变换在蛋白质结构预测中的应用 被引量:1
7
作者 邱建丁 梁汝萍 +1 位作者 邹小勇 莫金垣 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期59-61,共3页
将代码为3pgal蛋白质的氨基酸序列映射为疏水值序列,在合适的尺度下,通过连续小波变换方法可对其非规则二级结构进行预测,准确率为83.3%。从PDBsum数据库中随机抽取100个蛋白质作为测试对象,经本法处理后,1 853个非规则二级结构中有1 ... 将代码为3pgal蛋白质的氨基酸序列映射为疏水值序列,在合适的尺度下,通过连续小波变换方法可对其非规则二级结构进行预测,准确率为83.3%。从PDBsum数据库中随机抽取100个蛋白质作为测试对象,经本法处理后,1 853个非规则二级结构中有1 424个能被准确预测到,平均预测准确率为76.8%。结果表明:该法可较好地预测蛋白质的非规则二级结构,具有极大的发展前景。 展开更多
关键词 蛋白质 结构预测 连续小波变换 氨基酸序列 非规则二级结构 疏水值序列
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一种运用灰色预测模型预测蛋白质一级结构的方法
8
作者 张彦海 谢菊芳 +1 位作者 金祥瑞 唐强 《武汉科技学院学报》 2004年第5期76-78,共3页
将氨基酸残基的疏水值与氨基酸残基一一对应,得到代表氨基酸残基序列的疏水值序列,再对此疏水值序列运用灰色预测模型预测未知的氨基酸残基疏水值,从而达到间接预测氨基酸残基的目的。
关键词 灰色预测 蛋白质结预测 疏水值
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卵清蛋白的棕榈酸化修饰及其对免疫反应的影响
9
作者 张义浜 陈智峰 马晓英 《生物技术通讯》 CAS 2020年第5期537-541,共5页
目的:以卵清蛋白(OVA)为模型抗原蛋白,考察其体外棕榈酸化修饰对免疫反应的影响。方法:根据OVA与棕榈酸N-羟基琥珀酰亚胺酯的不同摩尔比进行投料反应,同时比较不同pH条件对反应产物的影响,并采用SDSPAGE、圆二色谱和表面疏水值测定等技... 目的:以卵清蛋白(OVA)为模型抗原蛋白,考察其体外棕榈酸化修饰对免疫反应的影响。方法:根据OVA与棕榈酸N-羟基琥珀酰亚胺酯的不同摩尔比进行投料反应,同时比较不同pH条件对反应产物的影响,并采用SDSPAGE、圆二色谱和表面疏水值测定等技术和方法进行表征;修饰产物再经体外释放分析和体内免疫研究,比较和判断OVA的棕榈酸修饰及其接种方式(皮下或肌肉注射)对免疫动物血清中特异性抗体产生及滴度水平的影响。结果:OVA在pH6的磷酸缓冲液中进行棕榈酸修饰所得产物的表面疏水值最高,且二级结构无明显改变,可提高未修饰OVA免疫动物血清特异性抗体的浓度,与接种方式无关。结论:体外棕榈酸修饰可以改变抗原蛋白的疏水性,增强免疫效果,有助于减少疫苗抗原和佐剂的使用量。 展开更多
关键词 卵清蛋白 棕榈酸化 蛋白修饰 表面疏水值 免疫原性
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用信息论方法对遗传密码简并性的考察——密码子信息与氨基酸的关系
10
作者 李隽群 《黔西南民族师范高等专科学校学报》 1997年第4期57-60,56,共5页
简并性是遗传密码的基本特性之一,它对降低因DNA的突变而引起的翻译误差、保持物种的稳定性具有更重要的生物学意义.本文从信息论的视角考察密码的简并性,论证它的普遍性和必然性,探讨其与氨基酸结构,疏水特性等之间的关系,以进一步认... 简并性是遗传密码的基本特性之一,它对降低因DNA的突变而引起的翻译误差、保持物种的稳定性具有更重要的生物学意义.本文从信息论的视角考察密码的简并性,论证它的普遍性和必然性,探讨其与氨基酸结构,疏水特性等之间的关系,以进一步认识密码子简并的本质和规律. 展开更多
关键词 信息论方法 密码子信息 遗传密码 简并性 信息量 信息 氨基酸 疏水值 DNA
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Optimal Evacuation Scheme Based on Dam-Break Flood Numerical Simulation 被引量:2
11
作者 王晓玲 孙蕊蕊 +1 位作者 周正印 黄凌 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2011年第6期424-430,共7页
The optimal evacuation scheme is studied based on the dam-break flood numerical simulation. A three- dimensional dam-break mathematical model combined with the volume of fluid (VOF) method is adopted. According to t... The optimal evacuation scheme is studied based on the dam-break flood numerical simulation. A three- dimensional dam-break mathematical model combined with the volume of fluid (VOF) method is adopted. According to the hydraulic information obtained from numerical simulation and selecting principles of evacuation emergency scheme, evacuation route analysis model is proposed, which consists of the road right model and random degree model. The road right model is used to calculate the consumption time in roads, and the random degree model is used to judge whether the roads are blocked. Then the shortest evacuation route is obtained based on Dijstra algorithm. Gongming Reservoir located in Shenzhen is taken as a case to study. The results show that industrial area I is flooded at 2 500 s, and after 5 500 s, most of industrial area II is submerged. The Hushan, Loucun Forest and Chaishan are not flooded around industrial area I and II. Based on the above analysis, the optimal evacuation scheme is determined. 展开更多
关键词 three-dimensional dam-break numerical model volume of fluid method evacuation route analysis model evacuation scheme
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