基于国际疾病分类的心血管疾病亚型的基因组学研究

目的:基于国际疾病分类(International Classification of Diseases,ICD)第10版(ICD-10),通过分子流行病学的方法探索心血管疾病(cardiovascular diseases,CVD)主要亚型分类的分子生物学依据。方法:研究所采用的表型数据和基因型数据均来源于英国生物样本库(UK Biobank,UKB)。共纳入年龄在40~69岁的380083个样本,其中对照组是没有任何心血管疾病(不具有以字母I开头的ICD-10代码)的246437个样本,心血管疾病五大亚型分别为:(1)缺血性心脏病(ischaemic heart diseases,IHD);(2)肺源性心脏病和肺循环疾病(pulmonary heart disease and diseases of pulmonary circulation,PHD);(3)脑血管疾病(cerebrovascular diseases,CRB);(4)动脉、小动脉和毛细血管疾病(diseases of arteries,arterioles and capillaries,AAC);(5)静脉、淋巴管和淋巴结疾病,不可归类在他处者(diseases of veins,lymphatic vessels and lymph nodes,not elsewhere classified,VLL)。本研究首先对五大亚型分别进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS);然后,基于GWAS分析结果对五大亚型两两之间进行连锁不平衡回归分析(linkage disequilibrium score regression,LDSC)来计算亚型之间的遗传相关性;最后,对每一对亚型进行孟德尔随机化分析(Mendelian randomizatoin,MR)来评估亚型之间的因果联系。结果:GWAS研究新发现28个显著性基因位点。LDSC分析显示IHD分别和VLL(P=2.52×10-7)、PHD(P=3.77×10-3)、AAC(P=4.90×10-3)这3个亚型具有显著的遗传相关性。MR分析显示IHD对VLL(P=7.40×10-5)和AAC(P=1.50×10-3)这两个疾病的风险增加有正向因果关系,而反向因果皆不成立。结论:通过分子流行病学的方法,本研究发现基于ICD-10分类的一部分心血管疾病亚型之间存在遗传相关性和因果关联,对新版ICD标准的制定提供依据。

基于BERT-TextCNN的临床试验疾病亚型识别研究

【目的】面向复杂疾病临床试验招募的需求,提出一种基于BERT-TextCNN的临床试验疾病亚型识别方法,辅助识别复杂疾病特定亚型的受试人群。【方法】将临床试验疾病亚型识别问题转化为单标签分类问题,应用基于BERT-TextCNN的单标签分类模型进行分类,以卒中为例在临床试验数据集(ClinicalTrials.gov)上开展实验验证。【结果】基于LP法的BERT-TextCNN模型性能最佳,加权宏平均F1值为0.9053,可以有效判定一项卒中临床试验可纳入卒中亚型受试者情况。【局限】缺乏在其他单病种上的可行性研究,以及在外部数据集上的有效性验证。【结论】本文方法可以有效解决从纳入标准中准确识别复杂疾病亚型的问题。

基于西医疾病亚型对留学生开展以辨证论治为中心的中医基础理论教学

非中国传统文化基础教育背景的留学生在学习以辨证论治为中心的中医课程时,容易对中医产生疑问,甚至认为以症状为中心的中医个体化诊疗体系是故弄玄虚。以症状为中心,尝试将西医的疾病亚型与中医的辨证论治相对应,同时利用以问题为导向的教学法(problem-based learning,PBL)对留学生开展中医教学,有利于激发留学生学习中医的兴趣,促进留学生深入理解中医理论,使中西医结合教学更具可行性。此教学法同样适用于"西学中"的教育。

基于多源数据融合的复杂疾病建模方法研究

复杂疾病(如癌症)严重危害人类身体健康,其发生和发展往往是多因素共同作用的结果,如何清楚地认识疾病的内在致病机理是当前研究的重点内容.目前,随着高通量技术的发展,大量的生物数据涌现,因此,以数据为驱动,通过对生物系统的多源数据融合来实现复杂疾病的建模成为了一个新的研究热点.由于生物系统的多源数据往往在数据分布、尺度和格式等方面存在巨大差异,这使得如何有效地融合数据成为建模过程中的重点.本文从多源数据融合的角度,分别对疾病亚型识别、疾病相关模块挖掘和样本特异性疾病相关标志物识别3个方面对人类复杂疾病的建模方法进行讨论,力图为研究人员在人类复杂疾病的数据建模方面提供建议.

399例胆管癌患者中医证候分布研究

目的 探讨胆管癌(CCA)中医证候及其在疾病亚型、TNM分期分布特点。方法 收集399例CCA患者中医证候信息,使用多元数理统计方法进行数据分析。结果 CCA患者中医证型以脾虚痰湿证[92例(23.1%)]、脾阳虚衰证[91例(22.8%)]、痰毒瘀结证[73例(18.3%)]为主。肝内胆管癌(ICC)胆汁瘀滞证占比低于肝外胆管癌(ECC),脾阳虚衰证占比高于ECC(P<0.01)。TNM分期Ⅲ、Ⅳ期脾虚痰湿证占比低于Ⅰ和Ⅱ期(P<0.01),脾阳虚衰证占比高于Ⅱ期(P<0.01),Ⅳ期胆郁痰扰证占比高于Ⅰ期(P<0.01),胆汁瘀滞证占比低于Ⅰ期(P<0.01)。男性、吸烟、饮酒患者脾虚痰湿证占比较高,女性及既往肝胆病病史患者脾阳虚衰证占比较高,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 CCA中医证候以脾虚痰湿证最常见。ECC多见胆汁瘀滞证,ICC多见脾阳虚衰证。Ⅰ、Ⅱ期多见脾虚痰湿证,Ⅲ、Ⅳ期多见脾阳虚衰证;Ⅰ期多见胆汁瘀滞证,Ⅳ期多见胆郁痰扰证。

不同临床分型与分期的肌萎缩侧索硬化症患者中医证候特征研究

目的:观察肌萎缩侧索硬化症(ALS)患者不同临床分型与分期的中医证候特征。方法:采用回顾性研究方法,收集530例ALS患者的临床资料,分析不同临床分型与分期患者的中医证候分布特征。结果:ALS患者以经典型、延髓型为主,中医证候以脾肾亏虚、肝肾亏虚、脾胃亏虚居多。经典型、延髓型、连枷腿综合征ALS患者中,脾肾亏虚证候患者占比均超过50%。ALS早期(Ⅰ期、Ⅱa期),痰湿阻滞、气虚血瘀、中焦湿热证候患者比例较高;中晚期(Ⅱb期后),脾肾亏虚、肝肾亏虚、脾胃亏虚证候患者占比逐渐增多。结论:脾肾不足或肝肾不足证候贯穿于ALS全程,疾病早期在虚证基础上伴有痰湿、瘀血、湿热等病理因素存在,晚期肝、脾、肾亏虚更严重。温肾健脾为治疗ALS的基本大法,同时应根据患者的临床分型及分期辨证施治。