一种有效的复杂疾病基因定位的检测法(英文)

连锁不平衡 (LD)应用于某些复杂疾病基因的定位 .近年来发展了许多LD定位方法 .除TDT外 ,大多数LD定位方法须先假定无人群混和 .人群混合可增大在疾病基因定位时犯I类错误的机率 ,产生无效结果 .此方法利用LD来检测标记位点和疾病敏感位点 (DSL)的连锁 (有连锁不平衡 )和相关 (有连锁 ) .分析时采用不相关样本 ,已知其父母基因型和至少父母之一为杂合子 ,再将随机样本依基因型不同分类 ,然后对来自不同类的数据应用有力的统计方法进行单独和联合分析 .此LD定位法不仅适用于患病和正常个体 ,而且有效消除据父母基因型分类的样本定位时人群混合的影响 .分析结果和模拟结果也表明此方法解决了在检测标记位点和疾病敏感位点之间的连锁和相关时人群混和的问题 .但与TDT比 ,此法在检测的位点为DSL时更能有效和充分地利用矫正数据 .检测位点不是DSL时 ,此法和TDT法可相互补充更有效地检测连锁的DSL .

单体型分析:复杂疾病基因定位的新希望

对复杂疾病如2型糖尿病、精神分裂症和原发性高血压进行基因定位是后基因组学的主要挑战之一.单核苷酸多态（single nucleotide polymerphisms, SNPs）作为遗传标记（SNP少见等位基因频率＞0.1在基因组内大约每600 Kb出现一次）,因为其在人类基因内分布更为广泛和密集、低突变率和更加便于高通量检测,因而在关联研究较微卫星（Microsatellite）应用更加广泛.

青少年特发性脊柱侧弯疾病基因定位研究进展

青少年特发性脊柱侧弯（adolescent idiopathic scoliosis，AIS）的确切病因尚不清楚，既往大量研究集中在骨骼、神经、肌肉和椎间盘等因素的致病机制方面。但并未找出确切病因。目前的一些研究揭示AIS具有家族聚集性，认为AIS具有遗传因素。具有几种遗传模式，包括多基因遗传模式，常染色体显性遗传模式和X连锁显性遗传模式。并且对AIS疾病基因进行了定位研究，现综述如下。

以Lewontin连锁不平衡定位疾病基因(英文)

Lewontin连锁不平衡公式是定位疾病基因最好的方法之一 ( Q代表基因重组率 ,t代表自从基因突变以来经历的世代数 )。研究证明 :在疾病基因比率高的情况下 ,Lewontin连锁不平衡公式仍然通用 ,而其他类似方法则不通用 ;Lewontin连锁不平衡公式略加修正后 ,通用于显性、隐性、共显性及超显性遗传 ;以Lewontin公式为基础 ,推导出在有重复突变情况下仍然通用的公式 ,基于这些优越性 ,Lewontin公式应受到重视和发展 。

免疫性疾病

9920448 Athabascan 语的土著美洲人的严重联合免疫缺陷疾病基因定位于10号染色体短臂上/Li L Y//Am J Hum Genet.-1998,62(1).-136～144 哈医图9920449 血管中心的免疫增生性损害(1级)1例[日]/大河原蚕荣//日胸疾会志.-1997,35(6).-726 冀医情9920450

全基因组关联分析在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征中的研究进展

阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)是遗传因素与环境因素共同作用的一种复杂的多基因遗传病。近年来, 已有多个研究从基因层面探讨OSAHS致病机制, 全基因组关联分析(genome-wide association studies, GWAS)作为复杂疾病基因定位研究的技术方法已广泛应用于识别与疾病相关的基因变异位点, 本文就OSAHS领域相关GWAS研究作一综述。

X-连锁肾上腺脑白质营养不良的分子诊断方法研究

x-连锁肾上腺脑白质营养不良（X-linked adrenoleukodystrophy，X-ALD）是过氧化物酶体病的一种，由ABCD1基因突变所致，该疾病基因定位于Xq28，其成熟mRNA长约3700bp，编码1个含745个氨基酸残基的蛋白质，称为ABCD1蛋白。自ALD的致病基因被定位克隆以来，至今国际上已报告了900余种ABCD1基因突变（www．X-aid．n1），其中错义突变占60％。笔者于2006年7月至11月分别对6个X-ALD家系进行基因突变分析，现报告如下。

核主成分logistic回归模型在非线性关联分析中的应用

目的将核主成分分析(KPCA)与logistic回归模型相结合,提出一种核主成分logistic(KPCA-based logis-tic)回归模型,用于复杂疾病基因定位的非线性关联分析。方法针对病例对照研究设计的关联分析,对候选基因区域内的单核苷酸多肽性(SNPs)进行核主成分分析,以核主成分为自变量构建logistic回归模型,并对GAW16类风湿关节炎数据中PTPN22和RNF186两个基因区域进行分析,以验证KPCA-based logistic回归模型的有效性和实用性。结果对PTPN22和RNF186两个基因区域的分析结果显示,KPCA-based logistic回归模型既能够检测出单点检验所能发现的区域(PTPN22),也能检测出单点检验所不能发现的区域(RNF186)。结论 KPCA-based logistic回归模型是一种有效的非线性关联分析方法,能够发现更多的易感区域。