期刊文献+
共找到25篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
整合分析多组学数据筛选疾病靶点的精准医学策略 被引量:17
1
作者 谢兵兵 杨亚东 +1 位作者 丁楠 方向东 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期655-663,共9页
随着高通量测序技术的不断发展与完善,对于不同层次和类型的生物组学数据的获取及分析方法也日趋成熟与完善。基于单组学数据的疾病研究已经发现了诸多新的疾病相关因子,而整合多组学数据研究疾病靶点的工作方兴未艾。生命体是一个复杂... 随着高通量测序技术的不断发展与完善,对于不同层次和类型的生物组学数据的获取及分析方法也日趋成熟与完善。基于单组学数据的疾病研究已经发现了诸多新的疾病相关因子,而整合多组学数据研究疾病靶点的工作方兴未艾。生命体是一个复杂的调控系统,疾病的发生与发展涉及基因变异、表观遗传改变、基因表达异常以及信号通路紊乱等诸多层次的复杂调控机制,利用单一组学数据分析致病因子的局限性愈发显著。通过对多种层次和来源的高通量组学数据的整合分析,系统地研究临床发病机理、确定最佳疾病靶点已经成为精准医学研究的重要发展方向,将为疾病研究提供新的思路,并对疾病的早期诊断、个体化治疗和指导用药等提供新的理论依据。本文详细介绍了基因组、转录组和表观组等系统组学研究在疾病靶点筛选方面出现的新技术手段和研究进展,并对它们之间的整合分析新策略和优势进行了讨论。 展开更多
关键词 基因组 转录组 表观遗传组 整合分析 疾病靶点
下载PDF
我国疾病靶点研究最新进展 被引量:2
2
作者 江振洲 刘晓昕 +7 位作者 周旺 段志诚 俞沁玮 罗岚 原梓乔 丁萍萍 杨婷婷 张陆勇 《药学进展》 CAS 2015年第5期335-350,共16页
主要通过对中国学者2013—2014年间在国内外发表的相关论文进行查阅和整理,分类综述我国在神经退行性疾病、抑郁症、心脑血管疾病、代谢性疾病、感染性疾病、肿瘤、自身免疫性疾病等各种重大疾病靶点研究方面的最新进展。
关键词 疾病靶点 神经退行性疾病 抑郁症 心脑血管疾病 代谢性疾病 感染性疾病 肿瘤 免疫性疾病
原文传递
M通道与神经精神疾病和心血管疾病研究进展
3
作者 彭锦强(综述) 刘育(审校) 《微循环学杂志》 2024年第2期95-101,共7页
M通道是电压门控钾通道Kv7家族的重要组成部分,主要分布在神经系统和血管系统中。M通道介导M电流(Im),稳定细胞膜电位和抑制异常放电,在调节神经元兴奋性和血管张力方面发挥重要作用。研究显示,M通道功能异常与神经精神疾病和心血管疾... M通道是电压门控钾通道Kv7家族的重要组成部分,主要分布在神经系统和血管系统中。M通道介导M电流(Im),稳定细胞膜电位和抑制异常放电,在调节神经元兴奋性和血管张力方面发挥重要作用。研究显示,M通道功能异常与神经精神疾病和心血管疾病存在密切关系,是药物治疗的关键靶点。本文对M通道在不同组织中结构异质性和功能进行概述,并综述其在癫痫、阿尔茨海默病、抑郁症、高血压、冠状动脉疾病、肺动脉高压等神经精神疾病和心血管疾病发生发展中的作用,为疾病治疗提供新视角和靶点。 展开更多
关键词 M通道 神经元 血管张力 疾病靶点
下载PDF
基于专利数据挖掘与网络药理学探讨大血藤抗高脂血症的作用机制
4
作者 张晓晓 战秀俊 +4 位作者 李晓格 姜其宝 张庆瑞 贾丽 姜苗苗 《天津中医药》 CAS 2024年第5期649-658,共10页
[目的]采用数据挖掘和网络药理学初步探讨大血藤治疗高脂血症的可能作用机制。[方法]借助PubMed和CNKI检索“大血藤化学成分”或“红藤成分”进行资料收集和化合物筛选,用Origin Pro 2021软件对涉及中药的功效类别等进行频数分析,用SPSS... [目的]采用数据挖掘和网络药理学初步探讨大血藤治疗高脂血症的可能作用机制。[方法]借助PubMed和CNKI检索“大血藤化学成分”或“红藤成分”进行资料收集和化合物筛选,用Origin Pro 2021软件对涉及中药的功效类别等进行频数分析,用SPSS Modeler 18.0软件进行关联规则分析和聚类分析。利用Swiss ADME平台来预测候选化合物的吸收度和类药性的相关参数。采用Swiss Target Prediction平台来收集预测到的所有靶点,以“hyperlipidemia”“dyslipidemia”等为关键词检索Genegards、Drug Bank Database等数据库中高脂血症的潜在靶点,通过Uniprot数据库去重和校正靶点名称,取活性成分和高脂血症靶点交集,进而运用Cytoscape 3.8.0软件来进行网络可视化并筛选核心靶点基因。通过DAVID 6.8数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测交集靶点作用机制,并绘制气泡图等进行可视化。[结果]通过数据挖掘对大血藤的用药配伍规律进行分析,结果显示性味以温性、寒性和苦味、辛味为主,归经方面以肝、脾为主,配伍以当归、甘草、红花等关联密切,研究结果与中药治疗高脂血症用药规律一致。中药-化合物-靶点网络包含了43个活性成分和相应靶点133个,关键靶点涉及类视黄酸受体α(RXRA)、信号转导及转录激活蛋白3(STAT3)、90 kDa热休克蛋白αA1(HSP90AA1)、蛋白激酶Bα(AKT1)、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、雌激素受体1(ESR1)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)A、核受体亚家族3C组成员1(NR3C1)等。GO功能富集分析得到条目437个(P<0.01),KEGG通路富集分析筛选得到57条信号通路(P<0.05)。[结论]大血藤可以通过多个活性成分干预血脂异常中的多个靶点、多个环节,从多维、系统的层面参与调控血脂代谢和高脂血症的发生发展过程,为大血藤的进一步开发利用提供理论基础。 展开更多
关键词 数据挖掘 网络药理学 大血藤 高脂血症 疾病-网络 作用机制
下载PDF
基于网络药理学的多奈哌齐联合丁苯酞治疗阿尔茨海默病的机制研究
5
作者 王慧娟 叶端玲 +1 位作者 许云腾 许文勇 《海南医学》 CAS 2024年第4期564-569,共6页
目的研究多奈哌齐联合丁苯酞治疗阿尔茨海默病(AD)的疗效与潜在作用机制。方法采用网络药理学方法,利用疾病及药物数据库中获取AD和丁苯酞、多奈哌齐的作用靶点,将其导入到STRING11.0数据库中,得到潜在作用靶点的PPI网络图,并结合Cytosc... 目的研究多奈哌齐联合丁苯酞治疗阿尔茨海默病(AD)的疗效与潜在作用机制。方法采用网络药理学方法,利用疾病及药物数据库中获取AD和丁苯酞、多奈哌齐的作用靶点,将其导入到STRING11.0数据库中,得到潜在作用靶点的PPI网络图,并结合Cytoscape3.8.1软件和cytoHubba插件筛选排名前10的核心基因,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,以深入研究多奈哌齐联合丁苯酞在治疗AD中的潜在作用机制。结果共获得联合药物靶点249个;1236个疾病基因靶点,获得77个药物-疾病交集靶点,排名前10的Hub基因为IL1B、PTGS2、STAT3、EGFR、MMP9、CCL2、IGF1、GSK3B、JAK2、ICAM1。GO富集和KEGG富集分析发现,这些靶点主通过抗炎、抗氧化应激、调节受体活性,改善神经信号传递、调节酶活性、保护血脑屏障、逆转突触可塑性、抑制神经细胞凋亡等多种途径来达到协同多奈哌齐有效治疗AD。结论多奈哌齐联合丁苯酞有效治疗AD的主要机制包括协同作用以及通过更多作用靶点和信号通路来实现抗炎、抗氧化应激、改善血管储备功能、抑制细胞凋亡等多重机制。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 丁苯酞 多奈哌齐 网络药理学 药物 疾病基因 潜在作用机制
下载PDF
基于系统药理学探索中药生脉饮有效成分的药理作用机制
6
作者 王锻 杨红 《临床医学研究与实践》 2024年第13期44-47,共4页
目的基于系统药理学方法探究中药生脉饮活性成分、靶点及疾病之间的复杂关系。方法在中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库,以口服生物利用度(OB)(人参和五味子OB≥60%,麦冬OB≥45%)和类药性(DL)≥0.1筛选生脉饮的活性成分、预测... 目的基于系统药理学方法探究中药生脉饮活性成分、靶点及疾病之间的复杂关系。方法在中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库,以口服生物利用度(OB)(人参和五味子OB≥60%,麦冬OB≥45%)和类药性(DL)≥0.1筛选生脉饮的活性成分、预测作用靶点,构建活性成分-靶点-疾病网络。结果筛选出活性成分17个,其中人参11个成分,麦冬2个成分,五味子4个成分。共获得靶点79个,靶点作用的疾病13种。网络图中活性成分和靶点共有176条边相连,即平均每个活性成分对应约10.3个靶点,平均每个靶点与4.6个活性成分相关联。靶点和疾病共235条边相连。结论本研究直观地构建了生脉饮活性成分、靶点蛋白和疾病的相互作用,从而揭示生脉饮在多种临床疾病中的功效,为进一步研究生脉饮作用机制提供理论依据。 展开更多
关键词 生脉饮 系统药理学 活性成分 活性成分--疾病网络
下载PDF
基于药物-靶点-疾病关联网络的丹参-降香药对治疗缺血性脑卒中的作用机制探究及候选中药识别
7
作者 高家璇 丁彦蕊 《生物医学工程学杂志》 EI CAS 北大核心 2023年第4期762-769,共8页
丹参-降香药对治疗缺血性脑卒中(IS)疗效比较显著,研究丹参-降香药对治疗IS的作用机制是发现对IS有疗效候选中药(TCM)的有效途径。传统药理学方法难以从系统角度全面分析丹参-降香治疗IS的效应物质并解释其作用机制。本研究基于药物-靶... 丹参-降香药对治疗缺血性脑卒中(IS)疗效比较显著,研究丹参-降香药对治疗IS的作用机制是发现对IS有疗效候选中药(TCM)的有效途径。传统药理学方法难以从系统角度全面分析丹参-降香治疗IS的效应物质并解释其作用机制。本研究基于药物-靶点-症候-疾病关联网络,利用复杂网络理论进行系统的研究。在利用丹参、降香及IS的关联信息构建蛋白质-蛋白质相互作用网络和“药对-药效成分-靶点-IS”网络的基础上,分析不同网络拓扑特征并基于多个中心性指标识别出降香中的福诺尼汀以及丹参中的隐丹参酮和丹参酮IIA为药效成分;前列腺素G/H合酶2、视黄酸受体RXR-α、钠通道蛋白5型亚基α、前列腺素G/H合酶1和β-2肾上腺素能受体为核心靶蛋白。进一步,提出一种基于TCM症候筛选IS候选药物的方法,利用“药对-TCM症候-症候群-中风”网络发现关键TCM症候和症候群。结果表明,蒲黄、三棱和泽兰3味中药可能是对IS具有潜在治疗作用的候选中药,为治疗IS的药物开发提供了理论参考。 展开更多
关键词 药物--症候-疾病关联网络 丹参-降香药对 缺血性脑卒中 作用机制 候选中药
原文传递
基于网络药理学和分子对接技术探讨糖网明目颗粒治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
8
作者 王芳 王誉程 +5 位作者 ODURO Patrick Kwabena 仝婉昱 冷玲 黎瑞巧 王启隆 刘二伟 《天津中医药》 CAS 2023年第1期95-103,共9页
[目的]通过网络药理学和分子对接技术研究糖网明目颗粒治疗糖尿病视网膜病变(DR)的潜在分子机制,为糖网明目颗粒防治DR新药研发提供方向。[方法]在中药系统药理分析平台(TCMSP)检索糖网明目颗粒组成药物的化学成分信息,通过PharmMapper... [目的]通过网络药理学和分子对接技术研究糖网明目颗粒治疗糖尿病视网膜病变(DR)的潜在分子机制,为糖网明目颗粒防治DR新药研发提供方向。[方法]在中药系统药理分析平台(TCMSP)检索糖网明目颗粒组成药物的化学成分信息,通过PharmMapper服务器,Disgenet和GeneCards数据库建立活性成分靶点数据库和DR靶基因数据库,进行靶点匹配获取药物-疾病共同靶点。随后构建PPI网络图,并筛选核心靶点,构建中药-活性成分-核心靶点网络图。用R-4.1.1对药物-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析。最后使用AutoDock软件进行分子对接分析,并用Pymol和Discovery Studio软件将结果可视化。在此基础上通过体外细胞实验对上述结果进行验证。[结果]本文筛选得到糖网明目颗粒-DR共同靶点62个;GO富集分析确定了226个项目,KEGG通路富集筛选得到163条信号通路,主要有糖尿病并发症中的晚期糖基化产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、FoxO信号通路等多种途径。分子对接结果显示糖网明目颗粒的有效成分木犀草素、表儿茶素及花生四烯酸等能与靶蛋白骨形态发生蛋白2(BMP2)、表皮生长因子受体(EGFR)和纤维连接蛋白1(FN1)等形成较为稳定的分子结合。在高糖诱导的人视网膜母瘤细胞Y79中,糖网明目颗粒能够抑制EGFR和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)14的蛋白表达。[结论]本研究初步探讨了糖网明目颗粒治疗DR的作用机制,结果表明糖网明目颗粒治疗DR具有多成分,多靶点,多途径协同发挥药效的特点,为后续深入研发提供指导与部分依据。 展开更多
关键词 糖网明目颗粒 糖尿病视网膜病变 网络药理学 分子对接 疾病-网络
下载PDF
基于网络药理学研究六味地黄丸治疗腰椎间盘退变作用机制 被引量:1
9
作者 冯帅华 徐无忌 +4 位作者 仇湘中 吴官保 张信成 谢芳 廖建晖 《陕西中医》 CAS 2022年第9期1301-1304,共4页
目的:通过网络药理学方法预测六味地黄丸治疗腰椎间盘退变的作用机制。方法:应用TCMSP、Gene Cards、OMIM数据库检索,取交集后得到六味地黄丸与腰椎间盘退变的共同作用靶点。构建共同靶点蛋白互作网络及共同靶点的互作网络图,并对共同... 目的:通过网络药理学方法预测六味地黄丸治疗腰椎间盘退变的作用机制。方法:应用TCMSP、Gene Cards、OMIM数据库检索,取交集后得到六味地黄丸与腰椎间盘退变的共同作用靶点。构建共同靶点蛋白互作网络及共同靶点的互作网络图,并对共同作用靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:共筛选出六味地黄丸有效成分69个,作用靶点102个,腰椎间盘退变疾病靶点990个,取交集后获得共同作用靶点30个,出现频次较高的有MAPK8、ESR1、IL-6、VEGFA等。GO分析显示,以上共同作用靶点主要参与组蛋白去乙酰化、细胞凋亡、细胞基因转录、整合素结合等细胞生物过程。KEGG富集结果显示,共同作用靶点富集的信号通路中与腰椎间盘退变相关的主要有细胞凋亡相关信号通路、TNF、HIF-1等信号通路。结论:六味地黄丸通过MAPK8、ESR1、IL-6、VEGFA等靶点干预腰椎间盘退变,涉及组蛋白去乙酰化、细胞凋亡、细胞基因转录、整合素结合等分子功能,作用机制可能与细胞凋亡、TNF、HIF-1等信号通路相关。 展开更多
关键词 腰椎间盘退变 六味地黄丸 网络药理学 疾病靶点 信号通路
下载PDF
Sirt1基因的研究进展 被引量:4
10
作者 陈婷婷 胡云龙 +3 位作者 刘兵 王晓冬 郭德银 靳广毅 《中国医药导报》 CAS 2015年第36期45-48,52,共5页
Sirtuins家族成员之一,Sirt1(Sirtuin type1)是依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+),在体内与多种组蛋白和非组蛋白为底物,通过去乙酰化作用来调节其活性的一种组蛋白脱乙酰酶。广泛参与调控哺乳动物细胞寿命的信号及糖代谢、胰岛素分泌... Sirtuins家族成员之一,Sirt1(Sirtuin type1)是依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+),在体内与多种组蛋白和非组蛋白为底物,通过去乙酰化作用来调节其活性的一种组蛋白脱乙酰酶。广泛参与调控哺乳动物细胞寿命的信号及糖代谢、胰岛素分泌等多条代谢通路,对代谢综合征、细胞凋亡、心血管疾病和神经退行性疾病等发挥重要的作用。Sirt1可作为治疗不同疾病的靶点逐渐被人们所重视。 展开更多
关键词 SIRT1 去乙酰化酶 疾病靶点
下载PDF
基于网络药理学探讨黄芪对胰腺癌的作用机制 被引量:5
11
作者 王一休 薛伟杰 +8 位作者 刘鹏 胡维昱 李坤 刘奎 杨晨宇 解宇威 徐翔宇 朱呈瞻 曹景玉 《精准医学杂志》 2019年第6期518-523,共6页
目的 运用网络药理学,探讨黄芪抗胰腺癌的主要活性成分及作用靶点,并预测作用机制及对免疫微环境的影响。方法 通过TCMSP数据库筛选黄芪的主要活性成分,并通过GeneCards和OMIM数据库收集胰腺癌疾病靶点,利用Cytoscape软件构建疾病-药物... 目的 运用网络药理学,探讨黄芪抗胰腺癌的主要活性成分及作用靶点,并预测作用机制及对免疫微环境的影响。方法 通过TCMSP数据库筛选黄芪的主要活性成分,并通过GeneCards和OMIM数据库收集胰腺癌疾病靶点,利用Cytoscape软件构建疾病-药物-靶点网络图。通过String数据库绘制蛋白相互作用网络并筛选出核心靶点,通过Human Protein Atlas和PROGgeneV2数据库对核心靶点进行蛋白表达及TCGA生存分析,进一步通过TIMER数据库分析核心靶点与肿瘤免疫细胞浸润的关系。最后利用Metascape、Bioconductor平台和R语言进行GO分子功能分析和KEGG通路分析。结果 筛选共得到黄芪20种活性成分,作用于胰腺癌56个靶点。在胰腺癌中,核心靶点Caspase3和MYC高表达组患者预后明显差于低表达组(P<0.05),同时,Caspase3和MYC会影响肿瘤免疫细胞在胰腺癌中的浸润情况。分子功能和通路分析结果表明黄芪作用的靶点主要与癌症的调控、细胞凋亡、对类固醇激素的反应、对无机物和有机物的反应等生物过程相关,黄芪通过调节PI3K-AKT、Erb、MAPK等通路来影响胰腺癌的发展。结论 黄芪对胰腺癌的治疗作用体现了中药多组分、多靶点的特点,为进一步探究其抗胰腺癌的作用机制提供了依据。 展开更多
关键词 黄芪 胰腺肿瘤 网络药理学 药效 疾病靶点 信号传导 维恩图 GO分析 KEGG分析 药物疗法 计算机辅助
下载PDF
基于网络药理学的苏叶黄连汤治疗慢性肾衰竭机制研究 被引量:3
12
作者 王泽鹏 张法荣 《山东中医药大学学报》 2021年第2期209-216,共8页
目的:采用网络药理学方法对苏叶黄连汤治疗慢性肾衰竭(CRF)的物质基础和作用机制进行探析。方法:运用网络数据库对苏叶黄连汤有效成分及其靶点和CRF疾病靶点进行筛选搜集。利用Cytoscape 3.7.2软件,构建中药成分-靶点网络。利用网络数... 目的:采用网络药理学方法对苏叶黄连汤治疗慢性肾衰竭(CRF)的物质基础和作用机制进行探析。方法:运用网络数据库对苏叶黄连汤有效成分及其靶点和CRF疾病靶点进行筛选搜集。利用Cytoscape 3.7.2软件,构建中药成分-靶点网络。利用网络数据库构建苏叶黄连汤治疗CRF的蛋白质相互作用(PPI)网络,并拓扑分析出核心靶点。最后对“药物-疾病”交集靶点进行富集分析。结果:苏叶黄连汤包含26个有效成分,对应靶点484个;核心靶点涉及表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、72 kDAIV型胶原酶(MMP2)、雄激素受体(AR);主要生物学过程及通路有:血管平滑肌细胞增殖的正调控、溶血磷脂通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产物及受体(AGE-RAGE)信号通路等,共7条通路,其中聚集在血管平滑肌细胞增殖正调控通路的靶点最多。结论:苏叶黄连汤治疗CRF的机制复杂,可能主要通过对血管平滑肌细胞增殖的正调控来实现治疗目的,也提示该通路是未来研究苏叶黄连汤治疗CRF的重要方向。 展开更多
关键词 苏叶黄连汤 网络药理学 慢性肾衰竭 有效成分 作用通路 疾病靶点 血管平滑肌细胞增殖
下载PDF
基于网络药理学的茵陈蒿汤“异病同治”研究 被引量:20
13
作者 蔡菲菲 李晓燕 +4 位作者 董姝 魏滨 季青 陈启龙 苏式兵 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第9期1507-1514,共8页
目的:采用网络药理学的方法,预测茵陈蒿汤的药物活性成分、效应靶点及潜在疾病,探讨该方治疗不同疾病湿热证"异病同治"的分子机制。方法:通过TCMSP、TCM Database@Taiwan、Drug Bank等多个数掘库,查找茵陈蒿汤中药物的成分、... 目的:采用网络药理学的方法,预测茵陈蒿汤的药物活性成分、效应靶点及潜在疾病,探讨该方治疗不同疾病湿热证"异病同治"的分子机制。方法:通过TCMSP、TCM Database@Taiwan、Drug Bank等多个数掘库,查找茵陈蒿汤中药物的成分、靶点和相关疾病信息,运用Cytoscape软件构建中药成分-靶点-疾病网络模型,并分析网络的拓扑结构,通过DAVID网站对茵陈蒿汤作用的生物学过程和KEGG通路进行富集分析。结果:共查找到茵陈蒿汤中大黄、栀子和茵陈三味药的272种化学成分,口服生物利用度(OB)≥30%和类药性指数(DL)≥0.18,并能够找到对应靶点的活性成分有33种,对应216个靶点蛋白与308种疾病,大于节点平均度的有81种疾病。与茵陈蒿汤相关的前三个生物学过程为对有机物质的反应、对细胞增殖的调节和对细胞凋亡的调控。显著富集的前三个KEGG通路为癌症通路、前列腺癌及胰腺癌。结论:本文基于网络药理学分析方法对茵陈蒿汤有了整体性的认识,有助于阐明茵陈蒿汤的组效关系,揭示其对于湿热证异病同治的作用机制,以及发现新的潜在临床适应症。 展开更多
关键词 茵陈蒿汤 湿热证 异病同治 网络药理学 中药成分--疾病网络
下载PDF
基于网络药理学探讨荷丹片治疗高脂血症的作用机制 被引量:4
14
作者 姚明鹤 闫海峰 +2 位作者 王静 徐宗佩 李玉红 《天津中医药大学学报》 CAS 2021年第6期783-789,共7页
[目的]旨在通过网络药理学方法探究荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制。[方法]在中药系统药理学数据库(TCMSP)和中医药百科全书(ETCM)数据库中检索得到荷丹片中5味药材类药成分与作用靶点,借助Uniprot数据库查询靶点对应基因,在DisGeNE... [目的]旨在通过网络药理学方法探究荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制。[方法]在中药系统药理学数据库(TCMSP)和中医药百科全书(ETCM)数据库中检索得到荷丹片中5味药材类药成分与作用靶点,借助Uniprot数据库查询靶点对应基因,在DisGeNET数据库搜索得到高脂血症的疾病靶点。利用STRING数据平台构建活性组分-作用靶点和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)的网络图,采用Cytoscape软件构建“中药-活性成分-疾病-靶点”网络,利用DAVID生物信息学资源对相关靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析。[结果]从荷丹片中共筛选出61个活性化合物,对应于281个类药活性成分作用靶点,231个疾病靶点与高脂血症密切相关,其中20个疾病靶点与药物作用靶点重叠,为荷丹片治疗高脂血症具有重要意义的作用靶点。中药-活性成分-疾病-靶点可视化网络图推测发挥调节血脂作用的中药主要是丹参、山楂、补骨脂,其中关键的化合物为Ergosterol、Guercetol、Corylinal等,关键的作用靶点为PTGS1、ADRB2、F2、PPARG等。GO富集分析表明,荷丹片主要参与调节氧化还原酶活性、脂质结合、离子结合、信号转导活性、核酸结合转录因子活性、脂质代谢过程、单一有机体代谢过程、小分子代谢过程、细胞增殖等生命过程。KEGG通路富集分析结果表明,荷丹片通过调节含血清素的神经突触、PPAR信号通路、药物代谢细胞色素P450、花生四烯酸代谢、亚油酸的新陈代谢等多种途径在高脂血症中发挥药理作用。[结论]本研究揭示了荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制,体现了中药复方多成分、多途径、多靶点协同作用的特点,为进一步研究荷丹片治疗高脂血症的机理提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 荷丹片 高脂血症 网络药理学 疾病-网络 作用机制
下载PDF
基于网络药理学探讨桂枝茯苓丸治疗子宫内膜异位症的作用机制 被引量:10
15
作者 闫菲 史云 +6 位作者 赵琦 王晓梅 高焕鹏 徐可 王亦姝 韩福国 刘清飞 《世界中医药》 CAS 2022年第1期55-61,共7页
目的:运用网络药理学研究方法探讨中医经典名方桂枝茯苓丸治疗子宫内膜异位症(EMS)的作用机制。方法:在TCMSP、BATMAN-TCM、TCMID中筛选桂枝茯苓丸的成分和靶点;并通过OMIM、GeneCards数据库检索EMS相关靶点;取交集后得到桂枝茯苓丸和... 目的:运用网络药理学研究方法探讨中医经典名方桂枝茯苓丸治疗子宫内膜异位症(EMS)的作用机制。方法:在TCMSP、BATMAN-TCM、TCMID中筛选桂枝茯苓丸的成分和靶点;并通过OMIM、GeneCards数据库检索EMS相关靶点;取交集后得到桂枝茯苓丸和子宫内膜异位症的共同靶点,利用Cytoscape 3.6.1构建化合物-靶点-疾病作用图;使用STRING网站完成蛋白质-蛋白质相互作用分析,通过David数据库完成基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共筛选出桂枝茯苓丸82个成分和962个预测靶点,子宫内膜异位症靶点1158个;通过比对桂枝茯苓丸和EMS共同靶点,筛选出246个潜在基因;这些共同靶点涉及对化学物质反应、分子功能调节、信号受体结合等生物过程;生物学通路包括TNF、PI3K/AKT和MAPK信号通路等。结论:桂枝茯苓丸可能通过抑制血管生成、抗炎等途径对EMS产生治疗作用。 展开更多
关键词 网络药理学 桂枝茯苓丸 子宫内膜异位症 成分--疾病
下载PDF
基于网络药理学和分子对接技术探讨驱痛散治疗急性腰扭伤的作用机制 被引量:1
16
作者 王君 《中医研究》 2022年第7期80-87,共8页
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨驱痛散治疗急性腰扭伤的作用机制。方法:使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)得到药物的活性成分和作用靶点,利用人类基因数据库(Genecards)获得与药物有关疾病的靶点信息,结合该信息利用在线韦恩... 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨驱痛散治疗急性腰扭伤的作用机制。方法:使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)得到药物的活性成分和作用靶点,利用人类基因数据库(Genecards)获得与药物有关疾病的靶点信息,结合该信息利用在线韦恩图获得药物-疾病的韦恩图和共同基因,运用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分和靶点基因网络,利用Bisogenet和CytoNCA插件以度值(DC)>61和介度中心数(BC)>600为筛选条件筛选构建蛋白相互作用(PPI)网络获取核心靶标,运用ClueGO插件,显著性筛选P<0.01对靶点进行生物过程和通路富集分析。经AutoDock Vina进行分子对接预测。结果:共探索出驱痛散的有效活性成分145种,潜在靶点238个,急性腰扭伤疾病靶点10866个,得到共同靶点230个。核心成分为槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、芦荟大黄素等。这些共同作用靶点主要富集于894个生物过程和131条信号通路上,涉及磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、FoxO信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Toll样受体信号通路(Toll信号通路)。分子对接提示成分与靶点之间活性结合度较高。结论:驱痛散通过多成分、多靶点、多通路相互作用治疗急性腰扭伤,其机制可能为通过抑制炎症因子的表达从而发挥抗炎作用。 展开更多
关键词 急性腰扭伤 驱痛散 网络药理学 成分--疾病 机制研究
下载PDF
基于网络药理学和分子对接研究艾叶治疗原发性痛经的分子机制 被引量:4
17
作者 陈海军 李盛村 姜方琦 《中国药师》 CAS 2021年第10期1804-1810,共7页
目的:采用网络药理学研究艾叶干预原发性痛经的潜在靶点和机制。方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)筛选有效化合物,经美国国立卫生研究院(NIH)的开放化学数据库(PubChem)和预测分子亲脂性和水溶性程序ALOGPS 2.1确定,并预... 目的:采用网络药理学研究艾叶干预原发性痛经的潜在靶点和机制。方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)筛选有效化合物,经美国国立卫生研究院(NIH)的开放化学数据库(PubChem)和预测分子亲脂性和水溶性程序ALOGPS 2.1确定,并预测艾叶作用靶点;通过DisGeNET、NCBI-Gene、DrugBank和GeneCards数据库收集原发性痛经靶点。通过功能性蛋白关联网络(String)和可视化网络软件(Cytoscaoe3.6)筛选出交集基因中的核心基因以及确定信号通路。结果:通过分子式预测艾叶的化合物作用靶点有442个。此外,4个数据库共收集到351个靶点,这两个靶点集相交集的靶点有66个。通过软件Cytoscape3.6筛选出丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、前列腺素-内过氧化物合酶(PTGS2)、血管内皮生长因子(VEGFA)等5个靶标蛋白核心基因,并构建药物-化合物-靶点-疾病网络图。在String数据库中显示艾叶与原发性痛经之间的信号通路有114条,最显著的通路集中在亚油酸代谢(hsa00591)、花生四烯酸代谢(hsa00590)、甾体激素生物合成(hsa00140)和卵巢甾体生成(hsa04913)信号通路。使用分子对接软件Autodock对5个核心靶点与9个化合物之间做分子对接,发现9个化合物中有8个化合物能和5个核心靶点有良好的对接。最后通过三维分子软件PyMOL计算靶点-化合物之间的作用关系。结论:该研究通过网络数据库及计算机分析验证初步发现艾叶干预原发性痛经的活性成分,为进一步深入验证和药物开发提供理论依据。 展开更多
关键词 艾叶 原发性痛经 网络药理学 药物-化合物--疾病 分子对接
下载PDF
基于系统药理学探索女贞子有效成分的药理作用机制 被引量:9
18
作者 王锻 白旭光 +5 位作者 戴旖旎 黄晶晶 张雪竹 王瑜 贺勇毅 马晓莹 《临床医学研究与实践》 2017年第19期4-6,共3页
目的通过系统药理学方法预测中药女贞子的活性成分和作用靶点及相关疾病。方法利用系统药理学方法,构建女贞子分子数据库,以口服生物利用度和类药性作为评估标准筛选出女贞子的活性成分,通过预测活性成分的作用靶点构建活性成分―靶点... 目的通过系统药理学方法预测中药女贞子的活性成分和作用靶点及相关疾病。方法利用系统药理学方法,构建女贞子分子数据库,以口服生物利用度和类药性作为评估标准筛选出女贞子的活性成分,通过预测活性成分的作用靶点构建活性成分―靶点―疾病网络。结果筛选女贞子活性分子118个,构建了由6个候选化合物分子和30个作用靶点、30个靶点主要作用的16种疾病关系组成的活性成分―靶点―疾病网络,疾病多涉及心血管疾病、神经系统疾病、肿瘤、精神障碍、免疫系统疾病、呼吸道疾病、血液系统疾病、内分泌系统疾病等。结论本研究通过采用系统药理学方法对女贞子进行活性成分筛选和靶点预测,构建了活性成分―靶点―疾病网络图,系统地分析阐释了药物、靶点、疾病之间的联系,为进一步深入研究女贞子的作用机制提供了精确的靶点基础。 展开更多
关键词 女贞子 系统药理学 活性成分预测 活性成分―疾病网络
下载PDF
基于网络药理学的四物汤主要成分与作用机制关联分析 被引量:5
19
作者 江华娟 李杰 +3 位作者 何瑶 陈其艳 王琳 傅超美 《中药与临床》 2019年第5期20-27,共8页
目的:建立四物汤"成分-靶点-通路-疾病"作用网络,探讨四物汤多成分、多层次、多靶点作用机制。方法:基于中药网络药理学技术平台、蛋白数据库和String数据库,分别获取四物汤中化学成分及其对应靶点、疾病,构建"成分-靶点... 目的:建立四物汤"成分-靶点-通路-疾病"作用网络,探讨四物汤多成分、多层次、多靶点作用机制。方法:基于中药网络药理学技术平台、蛋白数据库和String数据库,分别获取四物汤中化学成分及其对应靶点、疾病,构建"成分-靶点"、"疾病-靶点"相互作用网络和"成分-靶点-通路"网络,通过String数据库对靶点进行基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:从四物汤中获得20个候选化合物,涉及153个靶点、15个中枢(hub)靶点、262种疾病,靶点蛋白涉及酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1、雄激素受体、微管相关蛋白τ、钠依赖性5-羟色胺转运体、钠依赖性去甲肾上腺素转运体等,KEGG信号涉及氮代谢、肿瘤、雌激素和卵巢类固醇生成等多种生物过程114条通路,关联疾病以肿瘤、免疫性疾病和神经系统疾病为主。结论:构建了四物汤中20个化合物"成分-靶点-通路-疾病"之间的关联,一定程度上揭示了四物汤多成分、多靶点的复杂作用机制,为四物汤的物质基础和作用机理深入研究提供思路,并为其拓展临床应用奠定理论基础。 展开更多
关键词 四物汤 网络药理学 作用机制 “成分-通路-疾病
下载PDF
基于系统药理学探索中药玉屏风口服液有效成分的作用机制 被引量:1
20
作者 王锻 白旭光 +5 位作者 戴旖旎 黄晶晶 王瑜 张雪竹 马晓莹 贺勇毅 《临床医学研究与实践》 2018年第19期114-115,共2页
目的通过系统药理学方法预测中药玉屏风口服液的活性成分和作用靶点及相关疾病。方法利用系统药理学方法构建玉屏风分子数据库,采用口服生物利用度与类药性评估筛选玉屏风的活性成分,通过预测活性成分的作用靶点构建活性成分-靶点-疾病... 目的通过系统药理学方法预测中药玉屏风口服液的活性成分和作用靶点及相关疾病。方法利用系统药理学方法构建玉屏风分子数据库,采用口服生物利用度与类药性评估筛选玉屏风的活性成分,通过预测活性成分的作用靶点构建活性成分-靶点-疾病网络。结果筛选玉屏风活性分子298个,构建了8个候选化合物分子、48个作用靶点、11种疾病关系,得到活性成分-靶点-疾病网络;疾病多涉及免疫系统疾病、营养和代谢疾病、心血管疾病、皮肤和结缔组织疾病、消化和内分泌系统疾病、神经系统疾病、肿瘤等。结论通过构建玉屏风分子-靶点-疾病网络图,可系统性阐释药物成分、靶点、疾病之间的联系,为深入研究玉屏风药理作用机制提供了精确的靶点基础。 展开更多
关键词 玉屏风口服液 系统药理学 活性成分预测 活性成分--疾病网络
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部