病原体靶向测序技术在疑似肺部感染患者中的应用价值分析

目的 探讨病原体靶向测序(tNGS)技术在疑似肺部感染患者中的应用价值。方法 回顾性分析2021年1月-2023年7月湖北省第三人民医院呼吸与危重症医学科收治的80例疑似肺部感染患者的临床资料,所有患者均行支气管肺泡灌洗液(BALF)tNGS及常规病原学检测。分析患者人口学特征,比较t NGS与常规方法检测的病原体分布结果,并比较确诊肺部单一感染者与混合感染者的临床资料。结果 80例中,74例确诊感染。大部分感染者存在基础疾病,以慢性心脏疾病(42.5%)、慢性呼吸系统疾病(35.0%)和糖尿病(20.0%)为主。t NGS检测结果致35例患者(43.8%)的治疗策略改变。共检出45种病原体,其中tNGS检出病原体169株,常规方法检出病原体63株;两者联合检测出的病原体以细菌较多。tNGS检出的病原体株数排序:细菌>病毒>真菌>非典型病原体>人结核分枝杆菌。常规方法检出的病原体株数排序:真菌>病毒>细菌>非典型病原体>人结核分枝杆菌。两种方法检测结果的一致性较差(Kappa值0.172,P=0.020)。t NGS检出病原菌阳性比例及在细菌、病毒、非典型病原体的阳性检出率均明显高于常规方法(P<0.05),但在真菌、人结核分枝杆菌的阳性检出率与常规方法比较差异无统计学意义(P>0.05)。以临床诊断为金标准,tNGS检测的敏感度明显高于常规方法(P=0.026),而两者特异度比较差异无统计学意义(P>0.05)。在74例确诊肺部感染者中,6例无明确的病原体,单一感染者23例,混合感染者45例。在混合感染者中,常见的组合是细菌-病毒混合感染(12/45,26.7%)。混合感染者的病死率和住院天数均明显高于或长于单一感染者(P<0.05);两者性别、年龄、基础疾病、白细胞计数、中性粒细胞百分比等差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 tNGS技术较常规方法的病原体检测敏感度高,尤其对细菌、病毒、非典型病原体及少见病原体更为敏感。此技术有利于识别混合感染,可作为临床常规病原学检测方法的补充。

肺泡灌洗液tNGS技术在下呼吸道感染患者中的应用

目的探讨肺泡灌洗液多重靶向扩增-高通量测序法(targeted next-generation sequencing,tNGS)技术在下呼吸道感染患者中的应用效果。方法选取2022年1月—2023年5月于广东省连州市人民医院住院的176例下呼吸道感染患者为研究对象,所有患者均接受肺泡灌洗液tNGS检测、灌洗液细菌培养、灌洗液结核分枝杆菌及利福平耐药检测(Xpert)、灌洗液半乳甘露聚糖检测(曲霉抗原,glactomannan,GM试验)、灌洗液真菌培养。比较5种检测方法对不同病原体的检出率,分析肺泡灌洗液tNGS检测下不同病原体分布特点,并对肺泡灌洗液tNGS检测和灌洗液细菌培养检测一致性分析。结果肺泡灌洗液tNGS检出率为92.05%,高于灌洗液细菌培养检测的22.16%,Xpert检测的9.09%,GM试验的16.48%以及灌洗液真菌培养的8.52%,差异有统计学意义(P<0.05)。球菌中检出率前3位为肺炎链球菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌;杆菌中检出率前3位为流感嗜血杆菌、溶血嗜血杆菌、大肠埃希菌;真菌主要为白念珠菌和肺孢子菌;其他病原体主要为结核分枝杆菌;在常见呼吸道病毒中,疱疹病毒较为常见,其次为甲型流感病毒和鼻病毒;肺泡灌洗液tNGS检测和灌洗液细菌培养结果、灌洗液真菌培养存在一致性偏差。结论肺泡灌洗液tNGS检测技术可提高下呼吸道感染病原体检出率,该检测方式可作为下呼吸道感染病原体检测的有效检测方法,为临床治疗提供指导。