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病原微生物宏基因二代测序对指导老年人社区获得性肺炎治疗的价值
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作者 施晓琪 田澜 +2 位作者 吴佳宝 宋婉婷 陈丽敏 《中华老年医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期429-432,共4页
目的探讨病原微生物宏基因二代测序(mNGS)对指导老年人社区获得性肺炎治疗的价值。方法回顾性分析2020年10月至2021年12月福建医科大学附属协和医院呼吸内科收治的45例老年社区获得性肺炎患者的临床资料,所有患者均接受病原体常规方法及... 目的探讨病原微生物宏基因二代测序(mNGS)对指导老年人社区获得性肺炎治疗的价值。方法回顾性分析2020年10月至2021年12月福建医科大学附属协和医院呼吸内科收治的45例老年社区获得性肺炎患者的临床资料,所有患者均接受病原体常规方法及mNGS检测,分析患者病原学检测结果及抗感染方案调整依据、病情转归,按照肺炎严重指数(PSI)分为低危组(PSI 1~3级)30例、中高危组(PSI4~5级)15例,比较两组间治疗方案调整依据。结果本研究中,mNGS检出率为91.1%(41/45),常规方法检出率为60.0%(27/45),检出率差异Kappa值为0.311,具有统计学意义(P=0.001)。mNGS和常规方法均阳性病例仅24例,其中2例病原体完全一致、13例部分一致、9例完全不一致。26例按mNGS或mNGS十常规检测结果调整抗感染方案,21例治疗有效;而19例按常规检测结果调整方案或经验性治疗未调整方案的患者均治疗有效。此外,在中高危组患者(PSI4~5级)中,依据mNGS结果调整治疗方案的患者所占比例更高[80.0%(12/15)比20.0%(3/15),χ^(2)=4.555、P=0.033];而未调整治疗或按常规结果治疗有效组主要为低危患者。结论mNGS可作为老年人社区获得性肺炎病原学检测的有效补充手段,对指导老年社区获得性肺炎患者尤其中高危组(PSI4~5级)有一定指导意义. 展开更多
关键词 肺炎 社区获得性感染 病原微生物宏基因二代测序 治疗
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宏基因二代测序对颅内动脉瘤患者术后颅内感染病原微生物的诊断价值及相关因素分析 被引量:1
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作者 李辉 李万群 +2 位作者 张璐 王欣丽 韩敬哲 《中国实用神经疾病杂志》 2024年第1期70-74,共5页
目的分析宏基因二代测序(mNGS)对颅内动脉瘤患者术后颅内感染病原微生物的诊断价值及影响因素。方法选取2021-01—2022-12哈励逊国际和平医院收治的60例颅内动脉瘤术后颅内感染患者为感染组,进行m NGS检测及细菌培养,比较两者对术后颅... 目的分析宏基因二代测序(mNGS)对颅内动脉瘤患者术后颅内感染病原微生物的诊断价值及影响因素。方法选取2021-01—2022-12哈励逊国际和平医院收治的60例颅内动脉瘤术后颅内感染患者为感染组,进行m NGS检测及细菌培养,比较两者对术后颅内感染病原微生物的检出率。纳入同期颅内动脉瘤术后未发生颅内感染患者63例为非感染组,收集一般资料,采用Logistic回归分析影响颅内动脉瘤患者术后颅内感染的因素,建立预测模型,绘制ROC曲线评估模型的预测效果。结果60例颅内动脉瘤术后颅内感染患者中mNGS检出病原微生物患者50例,检出率83.00%;细菌培养检出病原微生物患者36例,检出率60.00%,mNGS对病原微生物患者的检出率高于细菌培养(P<0.05)。Logistic多因素回归分析显示,糖尿病、手术时间≥4 h、术中出血量≥100 mL、动脉瘤破裂、脑脊液漏、置管时间≥7 d及术后未使用抗菌药物是颅内动脉瘤术后颅内感染的影响因素(P<0.05)。ROC曲线指标Prob的灵敏度84.00%,特异度67.00%,曲线下面积(AUC)为0.820。结论mNGS对颅内动脉瘤患者术后颅内感染病原微生物的诊断价值较高,糖尿病、手术时间、术中出血量、动脉瘤破裂、脑脊液漏、置管时间及术后使用抗菌药物与颅内动脉瘤术后颅内感染有关,以上述因素构建的预测模型对颅内感染的预测有指导作用。 展开更多
关键词 颅内动脉瘤 颅内感染 基因 诊断价值 危险因素
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宏基因组二代测序及病原微生物芯片辅助诊断起搏器导丝处皮肤破溃感染一例
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作者 李欣昱 刘莹莹 +1 位作者 王禹川 林连君 《中华老年多器官疾病杂志》 2023年第4期290-291,共2页
起搏器囊袋感染是心脏植入装置术后感染类型之一,若不及时处理,会造成血行感染及感染性心内膜炎。尤其对于高龄患者,一旦怀疑起搏器植入感染,亟需引起重视。精准快速的病原学结果对于辅助诊断及调整抗感染方案具有重要意义。本文对1例... 起搏器囊袋感染是心脏植入装置术后感染类型之一,若不及时处理,会造成血行感染及感染性心内膜炎。尤其对于高龄患者,一旦怀疑起搏器植入感染,亟需引起重视。精准快速的病原学结果对于辅助诊断及调整抗感染方案具有重要意义。本文对1例应用宏基因组二代测序技术及病原微生物芯片辅助病原学诊断起搏器导丝处皮肤破溃感染病例进行报道,为临床特殊病原体感染的诊疗提供参考。 展开更多
关键词 老年人 起搏器囊袋感染 基因 芯片
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支气管肺泡灌洗液宏基因二代测序技术在重症肺炎患儿病原学检测中的应用价值
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作者 娜迪热·海如拉 再乃甫·乃比江 +1 位作者 马志华 阿布来提·阿不都哈尔 《中国临床医生杂志》 2024年第9期1096-1099,共4页
目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因二代测序(mNGS)技术在重症肺炎(SP)患儿病原学检测中的应用价值。方法回顾选取2021年1月至2023年12月新疆医科大学第一附属医院收治的99例SP患儿为研究对象,收集患儿BALF标本并用mNGS与传统检测方... 目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因二代测序(mNGS)技术在重症肺炎(SP)患儿病原学检测中的应用价值。方法回顾选取2021年1月至2023年12月新疆医科大学第一附属医院收治的99例SP患儿为研究对象,收集患儿BALF标本并用mNGS与传统检测方法检测病原体,分析mNGS与传统检测方法病原体检出率、病原体分布情况,对比不同mNGS检出结果患儿治疗预后。结果99例受试患儿中mNGS检出病原体阳性85例(85.86%),传统检测方法检出阳性61例(61.62%),两种方法诊断一致性较高(kappa值=0.079,P=0.335);mNGS对细菌、真菌及病毒检出率均高于传统检测方法(P<0.05);mNGS对合并2种及≥3种病原体感染的检出率也高于传统检测方法(P<0.05)。mNGS法共检出病原体158株,传统检测方法共检出病原体86株。结论mNGS检测能提高重症肺炎患儿病原体检出率,尤其对于多重感染检出率更高,对指导临床用药和提高疗效具有较高应用价值。 展开更多
关键词 重症肺炎 肺泡灌洗液 基因 病原
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基于宏基因组二代测序的ICU感染性疾病患者病原体分布
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作者 吴越 卓惠长 +5 位作者 杨火保 陈存荣 尤彦菁 李红艳 王庆 林峰 《福建医科大学学报》 2024年第1期44-51,共8页
目的基于宏基因组二代测序(mNGS)数据,分析重症监护室(ICU)感染性疾病患者的病原体分布情况,为临床抗感染治疗提供依据。方法回顾性分析7所综合性三甲医院ICU感染性疾病标本的mNGS报告结果,探讨ICU病原体分布情况。结果收集1083份感染... 目的基于宏基因组二代测序(mNGS)数据,分析重症监护室(ICU)感染性疾病患者的病原体分布情况,为临床抗感染治疗提供依据。方法回顾性分析7所综合性三甲医院ICU感染性疾病标本的mNGS报告结果,探讨ICU病原体分布情况。结果收集1083份感染性疾病标本的mNGS报告,总体检出率为85.50%。病原体种类172种,病原体例数1334例,检出的细菌的种类和数量最多,其次为病毒。革兰阴性菌例数(60.29%)较革兰阳性菌(39.71%)多,检出数前3位的革兰阴性菌为肺炎克雷伯菌(114例,22.75%)、鲍曼不动杆菌(78例,15.57%)和铜绿假单胞菌(66例,13.17%);革兰阳性菌为屎肠球菌(68例,20.61%)、纹带棒状杆菌(46例,13.94%)和金黄色葡萄球菌(31例,9.39%)。检出数前3位的真菌为白色念珠菌(79例,40.51%)、耶氏肺孢子菌(32例,16.41%)和近平滑念珠菌(16例,8.21%)。DNA病毒为主要的检出病毒,检出数前3位为巨细胞病毒(71例,27.52%)、人疱疹病毒1型(62例,24.03%)和EB病毒(57例,22.09%);RNA病毒中检出数前3位为HpgV病毒(13例,43.33%)、人冠状病毒229E型(4例,13.33%)、鼻病毒(3例,10.00%)和人冠状病毒HKU1型(3例,10.00%)。在不典型病原体中,鹦鹉热衣原体检出率最高(11例,55.00%)。结论革兰阴性菌是ICU感染性疾病患者的主要病原体,其次为病毒。动态监测ICU病原体分布情况有助于制定合理有效的抗感染治疗策略。 展开更多
关键词 基因 重症监护室 病原体分布
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宏基因二代测序技术对胸内淋巴结结核的诊断价值 被引量:1
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作者 齐齐 蔡青山 +2 位作者 陈园园 周丽红 周建英 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第S01期4-8,共5页
目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,m NGS)在胸内淋巴结结核中的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,搜集2020年12月至2023年9月浙江省中西医结合医院结核病诊疗中心收治的122例疑似胸内淋巴结结核... 目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,m NGS)在胸内淋巴结结核中的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,搜集2020年12月至2023年9月浙江省中西医结合医院结核病诊疗中心收治的122例疑似胸内淋巴结结核患者临床资料,所有患者均行支气管内超声引导下经支气管针吸活检术(endobronchial ultrasound-guided transbronchial needle aspiration,EBUS-TBNA)。穿刺标本同时进行mNGS、Gene Xpert MTB/RIF(简称“Xpert”)、PCR-荧光探针法(简称“RT-PCR”)、RNA恒温扩增荧光实时检测技术(简称“TB-SAT”)、BACTEC MGIT 960分枝杆菌全自动快速液体培养(简称“MGIT 960”)和涂片抗酸染色(简称“涂片”),比较6种方法对胸内淋巴结结核的诊断效能。结果:根据诊断标准,122例疑似患者中,最终89例诊断为胸内淋巴结结核,33例为非胸内淋巴结结核患者。以综合诊断结果为参照标准,m NGS对胸内淋巴结结核诊断的敏感度为89.9%(95%CI:81.7%~95.3%)、特异度为87.9%(95%CI:71.8%~96.6%)、准确率为89.3%(95%CI:82.5%~94.2%),AUC值为0.889(95%CI:0.819~0.939),明显高于Xpert、RT-PCR、TB-SAT、MGIT 960和涂片对胸内淋巴结结核检测的敏感度(68.5%、61.8%、33.7%、49.4%和11.2%)、特异度(93.9%、97.0%、97.0%、100.0%和100.0%)、准确率(75.4%、71.3%、50.8%、63.1%和35.2%)和AUC(0.812、0.794、0.747、0.653和0.556)。结论:m NGS检测对胸内淋巴结结核具有较高的临床诊断价值,尤其在其他结核病相关检测均阴性时,该技术可给临床诊断提供重要参考,但与传统的病原学检测手段相比较,特异度仍偏低,尤其在鉴别疾病良恶性时,需结合病理结果进行综合分析。 展开更多
关键词 基因 结核 胸内淋巴结 诊断技术和方法 对比研究
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宏基因组二代测序在下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液中的病原学诊断价值 被引量:1
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作者 程长昆 姜长舟 《安徽医学》 2024年第3期326-330,共5页
目的 比较下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中病原菌的宏基因组二代测序(mNGS)和常规培养检测结果,分析mNGS检出阳性的影响因素和临床意义。方法 回顾性分析2020年4月至2023年3月安庆市望江县医院的130例下呼吸道感染患者的BALF... 目的 比较下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中病原菌的宏基因组二代测序(mNGS)和常规培养检测结果,分析mNGS检出阳性的影响因素和临床意义。方法 回顾性分析2020年4月至2023年3月安庆市望江县医院的130例下呼吸道感染患者的BALF样本,进行mNGS和常规培养检测,比较2种方法的阳性率、病原体分布和一致性,分析mNGS检出阳性与患者临床指标和预后的关系。结果 mNGS检出阳性率为76.9%,常规培养检测阳性率为43.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS能够检测出更多种类的病原菌,主要为革兰阴性杆菌、真菌和非典型病原体。mNGS与常规培养检测结果在细菌、真菌和非典型病原体方面具有中等一致性,在病毒和寄生虫方面具有较低一致性。mNGS检出阳性与患者年龄、基础疾病、外周血白细胞和C反应蛋白等因素相关,是影响mNGS检出阳性的危险因素。结论 mNGS在下呼吸道感染患者BALF中的病原学诊断优于常规培养检测,能检测出更多和更广的病原菌,有助于下呼吸道感染患者临床合理用药和改善患者预后。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 支气管肺泡灌洗液 基因 病原学诊断
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宏基因组二代测序早期检测脓毒症病原体的临床应用进展
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作者 王黎(综述) 丁艳辉 +2 位作者 曹子鋆 薛建江 王晓亮(审校) 《现代医药卫生》 2024年第18期3197-3201,3206,共6页
脓毒症患者存活率低、死亡率高、预后差,早期识别其病原体尤为关键。宏基因组二代测序(mNGS)能实现无偏倚检测临床样本中的所有微生物,对早期发现脓毒症病原微生物较传统培养技术等更灵敏、准确、高效。随着二代测序技术的不断发展,mNG... 脓毒症患者存活率低、死亡率高、预后差,早期识别其病原体尤为关键。宏基因组二代测序(mNGS)能实现无偏倚检测临床样本中的所有微生物,对早期发现脓毒症病原微生物较传统培养技术等更灵敏、准确、高效。随着二代测序技术的不断发展,mNGS在诊断脓毒症方面的临床应用价值将进一步提高,该文就mNGS在脓毒症早期诊断中的优势、临床应用及进展、挑战与展望进行综述。 展开更多
关键词 基因 脓毒症 病原微生物 早期检 综述
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支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的应用
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作者 邢国强 王方艳 +6 位作者 殷德平 王良 赵娜 栾兆吉 侯玉涛 王萍 薛玉文 《中国医药科学》 2024年第13期186-189,共4页
目的探讨支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的应用。方法选取淄博市第一医院2020年1月至2022年1月收治的80例肺部感染患者作为研究对象,通过病历号数字表抽签法将患者分为观察组(n=40)和对照组(n=40)。患者均接受... 目的探讨支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的应用。方法选取淄博市第一医院2020年1月至2022年1月收治的80例肺部感染患者作为研究对象,通过病历号数字表抽签法将患者分为观察组(n=40)和对照组(n=40)。患者均接受支气管肺泡灌洗液检查,观察组在此基础上给予肺泡灌洗液二代宏基因测序检查。比较两组患者的支气管肺泡灌洗液病原菌分布情况、病原菌检出率以及治疗后的临床指标。结果本次80例肺部感染患者的肺泡灌洗液中共分离并获得96株病原菌。其中革兰氏阳性菌总共20株,占20.83%,其中以肺炎链球菌和金色葡萄球菌为主;革兰阴性菌总共72株,占75.00%,主要以鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和流感嗜血杆菌为主;真菌总共3株,占3.12%,以白色念珠菌为主;对照组40例患者,通过常规病原菌检测结果检出阳性28例,占70.00%;观察组40例患者,通过二代宏基因测序结果检出阳性37例,占92.50%,相较于对照组,观察组检出率显著更高(P<0.05);相较于对照组,观察组患者30 d内和90 d内病死率均显著更低(P<0.05)。结论支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的运用价值高,可有效提高检出率,可帮助临床上给予对应治疗。 展开更多
关键词 支气管 肺泡灌洗液 基因 肺部感染
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脑脊液宏基因组二代测序在小儿神经外科术后颅内细菌感染诊断中的应用
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作者 谢岷 司道林 +2 位作者 何剑 邓小鹿 王霞 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期475-481,共7页
目的探讨脑脊液宏基因组二代测序(mNGS)技术在小儿神经外科术后颅内细菌感染诊断中的应用。方法分析2020年1月1日—2023年8月31日在中南大学某医院儿童重症监护病房住院的神经外科手术后符合颅内细菌感染诊断标准(包括临床诊断及确诊)... 目的探讨脑脊液宏基因组二代测序(mNGS)技术在小儿神经外科术后颅内细菌感染诊断中的应用。方法分析2020年1月1日—2023年8月31日在中南大学某医院儿童重症监护病房住院的神经外科手术后符合颅内细菌感染诊断标准(包括临床诊断及确诊)病例的临床资料,2021年10月起,在经验性使用抗颅内感染药物前送检脑脊液培养和mNGS检测。对脑脊液mNGS结果阴性病例,结合脑脊液培养结果及临床资料,不进行或尽早停用经验性抗颅内感染治疗并追踪随访。结果共纳入43例病例,其中临床诊断组38例,病原学诊断组5例。脑脊液常规及生化指标两组间比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。临床诊断组38例病例中,2020年1月—2021年9月10例临床诊断病例(对照组),临床诊断颅内感染后接受经验性抗菌药物治疗;2021年10月—2023年8月28例临床诊断颅内感染病例(干预组)mNGS病原学和脑脊液培养均阴性,16例病例未进行经验性抗颅内感染治疗,另12例在mNGS回报阴性后结合临床资料及时停止经验性抗颅内感染治疗,追踪随访28例病例均无细菌性脑膜炎发生,入颅抗菌药物平均使用时间[0(0,4)d]低于对照组10例临床诊断病例抗菌药物平均使用时间[8(7,11)d,P<0.05]。结论脑脊液mNGS可以提高神经外科术后颅内细菌感染病例病原学检出率,mNGS检测结果有助于指导神经外科术后颅内细菌感染临床诊断病例抗菌药物的合理使用。 展开更多
关键词 基因 中枢神经系统感染 神经外科 儿童
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宏基因组学第二代测序技术与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的比较
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作者 刘庆 《大医生》 2023年第11期98-100,共3页
目的研究宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的价值,为临床提供参考。方法选取百色市人民医院2021年9月至2022年10月收治的170例支气管扩张症患者为研究对象进行回顾性分析,根据检测方法不... 目的研究宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的价值,为临床提供参考。方法选取百色市人民医院2021年9月至2022年10月收治的170例支气管扩张症患者为研究对象进行回顾性分析,根据检测方法不同分为mNGS组(65例)和实验室培养组(105例)。根据患者自我选择用药情况将需调整抗生素使用的43例患者分为mNGS1组(22例)、传统培养组(12例)及经验组(9例)。收集其经纤维支气管镜防污染-肺泡灌洗液的常规微生物检查结果,分离培养检查结果及临床宏基因学组检测结果等临床资料,比较实验室培养与mNGS检测阳性率及不同用药状态下患者转归情况。结果mNGS检测阳性率高于实验室培养(P<0.05)。mNGS1组患者平均住院时间短于传统培养组、经验组,mNGS1组患者白细胞计数、中性粒细胞计数、C反应蛋白及白细胞介素-6水平低于传统培养组、经验组(P<0.05)。结论mNGS在支气管扩张病原学诊断中具有一定优势,诊断阳性率更高,对患者经验用药具有一定帮助,能够缩短住院时间,降低炎症因子水平,值得临床应用。 展开更多
关键词 基因组学第技术 实验室微生物培养 支气管扩张 诊断
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宏基因二代测序技术在社区获得性肺炎病原体检测中的应用进展
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作者 廖毓香 朱水泉(综述) 伍桂雄(审校) 《检验医学与临床》 CAS 2024年第14期2131-2134,2144,共5页
社区获得性肺炎(CAP)是常见的感染性疾病之一。其流行病学特征因宿主和免疫状况而异,病原谱也随着时间和空间分布而迁移。准确及快速识别病原体,开展精准治疗,是提高该病治愈率的关键。常规检测方法包括培养法、抗体及抗原检测、聚合酶... 社区获得性肺炎(CAP)是常见的感染性疾病之一。其流行病学特征因宿主和免疫状况而异,病原谱也随着时间和空间分布而迁移。准确及快速识别病原体,开展精准治疗,是提高该病治愈率的关键。常规检测方法包括培养法、抗体及抗原检测、聚合酶链反应(PCR)等,但均具有识别缓慢、检出率低等缺陷,从而延误临床治疗时机。宏基因二代测序技术(mNGS)主要通过核酸提取、PCR扩增、文库构建等步骤对标本中所有微生物进行测序,同时利用大量的生物分析鉴定出病原体。与常规检测方法不同,mNGS具有迅速识别、全方位覆盖、灵敏度高等优点,在临床诊断中逐渐被选用。如今,mNGS已在CAP的诊疗中占据着越来越重要的地位,特别是在一些少见及新型病原微生物的检测上,并对特殊人群的病原体检出也具有一定的优势。然而,mNGS作为一种新型检测手段仍存在一些不足之处,例如,检测结果判读无统一的标准、结果受患者遗传物质影响较大、检测成本高等。将来可通过改进检测前标本的预处理、降低检测成本、简化检测后的结果判读对该技术进行优化,以便全面推广mNGS在临床中应用。 展开更多
关键词 社区获得性肺炎 基因技术 聚合酶链反应 临床应用 病原
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宏基因组二代测序在重症肺炎病原学诊断中的价值
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作者 谭炼 徐宇东 +5 位作者 闻郑峰 黄娟 袁瑶 冯波 刘立申 胡东军 《浙江医学》 CAS 2024年第9期954-956,960,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)对重症肺炎患者病原学诊断的价值。方法选择2021年5月至2023年5月宁波市泌尿肾病医院收治的60例重症肺炎患者。收集肺泡灌洗液5~10 mL分别行常规检测与m NGS检测。比较mNGS检测与常规检测病原微生物阳性... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)对重症肺炎患者病原学诊断的价值。方法选择2021年5月至2023年5月宁波市泌尿肾病医院收治的60例重症肺炎患者。收集肺泡灌洗液5~10 mL分别行常规检测与m NGS检测。比较mNGS检测与常规检测病原微生物阳性率。结果mNGS检测病原微生物阳性率为81.67%,显著高于常规检测的58.33%(P=0.002)。mNGS检测细菌阳性率为53.33%,显著高于常规检测的35.00%(P=0.005);检测真菌阳性率为36.67%,显著高于常规检测的20.00%(P=0.005);检测病毒阳性率为21.67%,显著高于常规检测的8.33%(P=0.011)。结论mNGS对重症肺炎病原学诊断阳性率较高,具有临床意义。 展开更多
关键词 基因 重症肺炎 病原 诊断价值
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宏基因组二代测序在儿童重症监护病房重症感染性疾病病原体诊断中的应用价值
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作者 莫连芹 黄栋 +2 位作者 潘飞飞 娄磊 成小蓉 《中国医药》 2024年第11期1697-1701,共5页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童重症监护病房(PICU)重症感染性疾病病原体诊断中的应用价值。方法选取2021年10月至2023年7月贵州省人民医院PICU收治的考虑重症感染送检微生物培养及mNGS检查的86例患儿为研究对象进行回顾性分析,... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童重症监护病房(PICU)重症感染性疾病病原体诊断中的应用价值。方法选取2021年10月至2023年7月贵州省人民医院PICU收治的考虑重症感染送检微生物培养及mNGS检查的86例患儿为研究对象进行回顾性分析,共送检113份标本。比较mNGS与微生物培养法病原体检出率的差异及病原学特征。结果86例患儿共采集113份标本送检,mNGS的病原体总检出率高于微生物培养法[68.1%(77/113)比23.9%(27/113)],差异有统计学意义(P<0.05)。在外周血、痰液、脑脊液标本方面,mNGS的病原体检出率均高于微生物培养法[65.0%(26/40)比25.0%(10/40)、97.1%(34/35)比28.6%(10/35)、37.5%(9/24)比12.5%(3/24)](均P<0.05)。mNGS最常见检出的感染类型为混合感染26.5%(30/113),其次是细菌感染20.4%(23/113)和病毒感染17.7%(20/113)。微生物培养法最常见检出的感染类型为细菌感染17.7%(20/113),其次为真菌感染4.4%(5/113)。mNGS混合感染和病毒感染检出率均高于微生物培养法,差异均有统计学意义(均P<0.05)。mNGS对1种病原体、2种病原体、3种及以上病原体、1类(类数指细菌、真菌、病毒、其他4种分类)病原体、2类病原体检出率均高于微生物培养法,差异均有统计学意义(均P<0.05)。31.4%(27/86)的患儿根据mNGS结果调整治疗并获益。结论mNGS在PICU重症感染性疾病病原体诊断中比微生物培养法有更高的检出率,且对混合感染、病毒感染有明显优势,可作为微生物培养法的补充,指导临床治疗。 展开更多
关键词 儿童重症监护病房 基因 重症感染性疾病 病原 儿童
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经宏基因组二代测序确诊的支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染2例报告并文献复习
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作者 李娟 王倩 +1 位作者 黄国虹 宋雅君 《广西医学》 CAS 2024年第8期1278-1281,共4页
目的总结经宏基因组二代测序(mNGS)确诊的支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染的病原学特点、临床特征和治疗要点。方法回顾性分析2例经mNGS确诊的支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染患者的临床资料,并结合文献总结该病的病原学特点、临床特征和治... 目的总结经宏基因组二代测序(mNGS)确诊的支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染的病原学特点、临床特征和治疗要点。方法回顾性分析2例经mNGS确诊的支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染患者的临床资料,并结合文献总结该病的病原学特点、临床特征和治疗要点。结果2例支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染患者均存在咳嗽咳痰、可伴咯血的症状,查体可闻及肺部音,胸部CT提示肺部斑片影、胸膜增厚、支气管扩张,其中1例合并2型糖尿病、高血压,1例合并冠心病,且2例均合并甲状腺功能减退。2例患者初始经验性抗感染药物为头孢曲松钠,采用气管抽吸物mNGS确诊其菌株分型为脓肿诺卡菌后改用甲氧苄啶-磺胺甲恶唑(复方磺胺甲恶唑片)治疗,均好转出院。结论支气管扩张合并脓肿诺卡菌感染缺乏临床特异性,且病原菌培养周期长,容易造成漏诊而延误诊治。mNGS可帮助临床医师快速明确脓肿诺卡菌诊断,磺胺类药物为首选治疗药物,该类患者预后相对较好。 展开更多
关键词 诺卡菌 肺部感染 支气管扩张 基因 病例报告
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宏基因组二代测序技术在血液病患者合并感染诊疗中的应用
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作者 封韬 付堃 +2 位作者 张智慧 芦小单 高鹏 《长春师范大学学报》 2024年第4期87-91,共5页
探讨宏基因组二代测序(mNGS)在血液病合并感染诊疗中的临床应用价值。对比分析2021年8月至2022年12月吉林省人民医院血液科血液病合并感染患者的传统病原体检测结果与mNGS检测结果,探讨mNGS在血液病合并感染时诊疗的优势及临床应用价值... 探讨宏基因组二代测序(mNGS)在血液病合并感染诊疗中的临床应用价值。对比分析2021年8月至2022年12月吉林省人民医院血液科血液病合并感染患者的传统病原体检测结果与mNGS检测结果,探讨mNGS在血液病合并感染时诊疗的优势及临床应用价值。共纳入患者20例,经mNGS检测,16例呈阳性,包括细菌感染3例、真菌感染1例、病毒感染4例,两种以上感染8例;4例呈阴性。mNGS病原体检出率和检出种类显著高于传统检测方法。根据mNGS检测结果调整临床用药后,治疗效果良好。与传统病原体检测方法相比,mNGS对血液病合并感染具有较高的检出率,检出更全面,显著提高了患者的生存率及生活质量,对于临床用药具有指导意义。研究结果表明病原宏基因组二代测序可为该类感染提供病原学证据以辅助血液病合并感染的治疗。 展开更多
关键词 基因 血液病 感染 传统检方法
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宏基因组二代测序技术辅助诊断中枢神经系统贝氏柯克斯体感染性血管炎1例
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作者 蔡衍珊 刘子凡 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期628-630,共3页
Q热是由贝氏柯克斯体感染引起的人畜共患病,临床表现多样且无特异性,贝氏柯克斯体颅内感染罕见,经常被误诊和漏诊,导致部分患者预后不佳。此文报告1例宏基因组二代测序(mNGS)技术辅助诊断的中枢神经系统贝氏柯克斯体颅内感染性血管炎病... Q热是由贝氏柯克斯体感染引起的人畜共患病,临床表现多样且无特异性,贝氏柯克斯体颅内感染罕见,经常被误诊和漏诊,导致部分患者预后不佳。此文报告1例宏基因组二代测序(mNGS)技术辅助诊断的中枢神经系统贝氏柯克斯体颅内感染性血管炎病例,提示mNGS技术在Q热快速诊断中起到重要作用,通过早期诊断,精准治疗,明显改善患者预后。在此基础上回顾国内外相关文献,总结贝氏柯克斯体颅内感染的临床表现和诊治经验,供国内外同行参考。 展开更多
关键词 Q热 贝氏柯克斯体 感染性血管炎 基因 mNGS
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宏基因组二代测序诊断高毒力肺炎克雷伯杆菌所致肝脓肿并发眼内炎1例
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作者 王立峰 蒋贵宇 +1 位作者 李青松 李永宁 《中国急救复苏与灾害医学杂志》 2024年第8期1113-1116,共4页
高毒力肺炎克雷伯杆菌(hvKp)是肺炎克雷伯杆菌的一个变种,与传统的肺炎克雷伯杆菌相比,它具有更高的侵袭性和毒性。hvKp能够导致多种严重的感染,如肝脓肿,并可能通过血流播散到身体其他部位,如眼内,导致眼内炎。hvKp在亚洲常见,尤其是... 高毒力肺炎克雷伯杆菌(hvKp)是肺炎克雷伯杆菌的一个变种,与传统的肺炎克雷伯杆菌相比,它具有更高的侵袭性和毒性。hvKp能够导致多种严重的感染,如肝脓肿,并可能通过血流播散到身体其他部位,如眼内,导致眼内炎。hvKp在亚洲常见,尤其是与糖尿病患者的感染有关。hvKp毒性与其特定的基因型和毒力因子有关,这使得其感染难以治疗,需要及时的医疗干预。本文通过宏基因组二代测序(mNGS)确诊hvKp所致肝脓病肿并发眼内炎1例,与传统病原学诊断相比,mNGS可有效降低治疗时间及费用。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯杆菌 肝脓肿 内源性眼内炎 基因
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宏基因组二代测序在脓毒症病原学诊断中的应用研究
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作者 田妮 李水霞 《现代医药卫生》 2024年第21期3651-3657,共7页
目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在脓毒症病原学诊断中的诊断价值。方法回顾性分析2021年9月至2023年9月内蒙古科技大学包头医学院第二附属医院重症医学科收治的72例脓毒症患者,并根据mNGS检测结果将其分为mNGS阳性组(56例)和mNGS... 目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在脓毒症病原学诊断中的诊断价值。方法回顾性分析2021年9月至2023年9月内蒙古科技大学包头医学院第二附属医院重症医学科收治的72例脓毒症患者,并根据mNGS检测结果将其分为mNGS阳性组(56例)和mNGS阴性组(16例)。比较2组临床资料,分析血培养及mNGS技术的检出率、检测时间,以及抗生素对病原体检出率的影响等。结果mNGS阳性组、mNGS阴性组临床资料[C-反应蛋白(CRP)水平除外]比较,差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS检出率[77.78%(56/72)]高于血培养检出率[38.89%(28/72)],差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS检测时间为(2.11±0.46)d,显著短于血培养的(5.39±1.34)d,差异有统计学意义(P<0.05)。血培养及mNGS检测方法一致性中等(Kappa=0.412,P<0.01)。在入科前使用抗生素的54例患者中,mNGS检出率显著高于血培养,差异有统计学意义(P<0.001)。在入科前未使用抗生素的18例患者中,2种检测方法的检出率比较,差异无统计学意义(P=0.687)。CRP水平是mNGS阳性检出率的影响因素(P=0.015,OR=1.024,95%CI:1.005~1.044)。治疗期间换用抗生素患者28 d预后情况与未换用抗生素患者比较,差异无统计学意义(P=0.963)。结论mNGS技术对脓毒症患者病原体的检测能力优于血培养,且耗时短,可检测出罕见病原体,可为早期靶向抗感染治疗提供参考意见,而且,CRP可作为选择mNGS检测的指标之一。 展开更多
关键词 脓毒血症 基因 预后 病原
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宏基因组二代测序在肺部感染患者病原体检测中的价值
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作者 戴新刚 《系统医学》 2024年第5期34-37,共4页
目的探讨宏基因组二代测序(Metagenomics Next-generation Sequencing,mNGS)用于临床检测肺部感染患者病原体的诊断价值。方法选取2022年1—12月溧阳市中医医院呼吸科收治的70例疑似肺部感染患者作为研究对象,全部患者均行mNGS检测及痰... 目的探讨宏基因组二代测序(Metagenomics Next-generation Sequencing,mNGS)用于临床检测肺部感染患者病原体的诊断价值。方法选取2022年1—12月溧阳市中医医院呼吸科收治的70例疑似肺部感染患者作为研究对象,全部患者均行mNGS检测及痰培养,以细菌培养结果为金标准,比较mNGS检测及痰培养的病原体检出率。结果经细菌培养结果显示,70例疑似肺部感染患者中,50例确诊肺部感染疾病,20例未感染,mNGS灵敏度(100.00%)、特异度(95.00%)及准确度(98.57%)明显高于痰培养,差异有统计学意义(χ^(2)=40.000、8.167、52.071,P均<0.05)。经细菌培养结果显示,总计检出铜绿假单胞菌18例、肺炎链球菌12例、曲霉菌8例、结核分歧杆菌6例、非结核分歧杆菌6例,经mNGS检出病原体概率为高于痰培养检出率,但组间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论mNGS技术可有效规避传统痰培养的假阴性问题,以此诊断肺部感染患者的病原体种类准确率高。 展开更多
关键词 基因 肺部感染 病原体检 价值
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