基于GEO数据库探讨阿尔茨海默病和骨质疏松的共病机制及潜在中药预测

目的:利用生物信息学方法,获取阿尔茨海默病(Alzheimer Disease,AD)与骨质疏松症(osteoporosis,OP)的差异基因和相关通路,并对其进行预测。方法:通过GEO数据库中的基因芯片数据,以AD-OP为研究对象,筛选出AD-OP患者的差异基因、蛋白相互作用网络,采用CytoHubba插件鉴定Hub基因,MCODE插件对与AD-OP发病密切相关的功能模块进行聚类分析,利用TRRUST数据库预测共同差异表达基因的转录因子。通过GO功能及KEGG通路,明确其作用机制,并利用验证组中的差异表达基因来验证上述研究结果。最后利用Coremine Medical数据库预测对关键基因具有显著调控作用的中药。结果:从GEO数据库获得AD-OP差异表达基因31个,导入STRING数据库进行检索得到27个节点和54条边组。MCODE插件聚类分析并挖掘2个疾病相关功能模块,CytoHubba插件在关联网络数据中查找25个hub基因并将其上传到GeneMANIA数据库中,得出ACTR1A、DCTN1、ARPC1B、CTTN等与核心基因最密切的基因,再用GO注释及KEGG通路分析上述基因。富集分析结果得出,多种神经退行性疾病的通路和p53信号通路等通路对AD-OP的发病至关重要。经TRRUST分析获得TP53、RELA、NFKB1以上3个主要的转录因子,还有MGP、CARM1、BCL2L1、BCL2、AXIN2、ACACA、UBE2C、PTP4A1、PTEN受转录因子调控的基因。采用COREMINE预测关键基因和通路,结果显示紫草、郁金、姜黄和黄精是治疗AD-OP的核心中药。结论:本研究明确了AD-OP的核心基因及基因所富集的通路,探讨了AD-OP主要涉及的生物学过程,并采用验证数据集验证了Hub基因,为AD-OP治疗的新靶点选择提供了支撑,预测了针对核心基因的治疗中药,为治疗AD-OP的治疗和研究提供了依据。

前庭性偏头痛与良性阵发性位置性眩晕的鉴别和共病机制

前庭性偏头痛(vestibular migraine,VM)和良性阵发性位置性眩晕(benign paroxysmal positional vertigo,BPPV)是临床最常见的两类发作性眩晕疾病,临床症状有相似性。不典型的VM与BPPV难以鉴别,可以通过临床表现、前庭功能检查、影像检查及生物标志物等多方面进行区分。相似的诱发因素、内耳血管痉挛、炎症反应、遗传因素等可能会导致VM与BPPV共存。因此,需综合分析VM与BPPV的区别和联系,避免误诊、漏诊,从而为患者提供更加精准的诊疗方案。

骨质疏松症、膝骨关节炎与2型糖尿病的共病机制

目的依托疾病数据库探讨骨质疏松症、膝骨关节炎与2型糖尿病的共病机制。方法通过数据库(GeneCards、DrugBank、TTD、OMIM)、分析平台(VENNY、STRING、Metascape)及Cytoscape软件对骨质疏松症、膝骨关节炎及2型糖尿病的相关靶点进行分析筛选,并进行基因本体论(Gene Ontology,GO)生物过程以及京都基因和基因组途径百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果通过数据库筛选去重后获得与骨质疏松症、膝骨关节炎、2型糖尿病相关靶点分别为445、448、10035个,映射出交集靶点113个,以Degree≥70筛选出核心靶点9个:白介素-6(interleakin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosisfactor,TNF)、白介素-1β(interleakin-6,IL-1β)、胰岛素样生长因子-1(insulin-like growth factor-1,IGF-1)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白蛋白(albumin,ALB)、丝氨酸/苏氨酸激酶(threonine kinase1,AKT1)、分泌性磷蛋白1(secretory phosphoprotein 1,SPP1)、连环蛋白B1(catenin beta 1,CTNNB1)。将这9个核心靶点导入Metascape进行富集分析,获得9个GO生物过程富集结果,包括细胞发育、细胞增殖、神经炎症反应、胶质生成及脂质转运调节等生物过程,及4条KEGG通路,包括人巨细胞病毒感染、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、焦点粘连、MAPK信号通路。结论骨质疏松症、膝骨关节炎与2型糖尿病3种疾病存在密切联系的分子机制,本研究为探索药物同时干预3种疾病的靶点机制提供参考价值。

肝细胞癌与抑郁症的miRNA-mRNA网络共病机制研究

目的 基于miRNA-mRNA网络探讨肝细胞癌和抑郁症的共病机制。方法 (1)在GEO数据库中获取与肝细胞癌和抑郁症相关的miRNA微阵列数据;利用在线工具GEO2R分别分析两个数据集的差异表达miRNA(DE-miRNA),然后取交集。在TargetScan、miRDB、miRPathDB和miRWalk数据库中预测各个DE-miRNA的靶基因,然后取交集。(2)利用DAVID数据库对DE-miRNA靶基因进行功能富集分析及通路富集分析,并筛选出风险通路。(3)利用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建DE-miRNA靶基因的蛋白-蛋白相互作用网络,然后筛选中枢基因及关键基因。(4)利用Microsoft Excel软件及Cytoscape 3.9.1软件构建DE-miRNA-mRNA-风险通路可视化网络。(5)利用GEPIA2数据库进行中枢基因在肝细胞癌中的表达分析及生存分析。结果 (1)肝细胞癌和抑郁症共同表达的上调DE-miRNA为miR-1290、miR-3156-5p,下调DE-miRNA为miR-575、miR-6737-3p,四者对789个靶基因进行调控。(2)DE-miRNA靶基因参与的生物功能与免疫、炎症、血管生成、神经元信号传导等相关。共筛选出15条风险通路,包括丝裂原活化蛋白激酶信号通路、磷脂酰基醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、轴突引导、催产素信号通路、神经营养素信号通路等。(3)共获得10个中枢基因,分别为BRCA1、NOTCH1、PTEN、EGFR、ATRX、ERCC4、RAD51B、EME1、RMI1、XRCC2。将富集在风险通路上的3个中枢基因作为关键基因。(4)构建的DE-miRNA-mRNA-风险通路网络包含了10对DE-miRNA-中枢基因组合,以及13个DE-miRNA-关键基因-风险通路组合。(5)与正常组相比,BRCA1、PTEN、ATRX、ERCC4、RAD51B、EME1、RMI1、XRCC2在肝细胞癌组中呈高表达,NOTCH1、EGFR在肝细胞癌组中呈低表达(P<0.01)。BRCA1、EME1、RMI1、XRCC2与肝细胞癌患者的生存率有关(P<0.05)。结论 miR-1290、miR-3156-5p、miR-575、miR-6737-3p可能是肝细胞癌和抑郁症共同的调控因子,其通过作用于多个靶基因从而调控炎症反应、肿瘤免疫反应、神经传导等途径,进一步参与肝细胞癌和抑郁症的发生、发展。此外,BACR1、EME1、RMI1、XRCC2这4个靶基因与肝细胞癌患者的预后密切相关。

高压氧治疗缺血性脑血管病机制的研究进展

脑血管病是严重危害人类健康的一组疾病．致死率和致残率都很高，给社会造成巨大的经济负担，在世界范围内，脑血管病是引起死亡的第2位原因。流行病学调查结果表明．我国脑血管病的年发病率为219／10万。近代医学和新技术研究认为，不论何种脑血管疾病均存在以脑缺血为基础的脑循环和代谢障碍等一系列脑缺血一缺氧性生化连锁反应．最终导致脑血管异常。组织缺氧是局灶性脑缺血发生细胞损伤的一个主要原因。由于缺氧在缺血性细胞死亡中的重要作用，脑缺血后恢复足够的氧供成为脑组织恢复的一个关键因素。高压氧能明显地增加机体对氧的摄取和利用，使血氧含量增加，

他汀类药物导致的肌病及其致病机制研究进展

他汀类药物是羟甲戊二酰辅酶A还原酶抑制剂,主要应用于高血脂及心血管系统疾病,是临床上应用最广泛的降血脂药物。近年来他汀类药物的副作用受到越来越多的关注,其作用机制的研究正逐渐成为研究热点。本文主要对他汀类药物导致横纹肌相关疾病的致病机制做一综述。

槐杞黄颗粒延缓慢性肾脏病机制

慢性肾脏病（chronic kidney disease，CKD）已成为全球性危害公众健康的常见病和多发病［1］。近年来，槐杞黄颗粒在临床上广泛应用于肿瘤［2~4］、哮喘［5］及小儿反复发作的呼吸道感染［6］等免疫相关性疾病的治疗，并逐渐出现辅助治疗小儿原发性肾病综合征（primary nephrotic syndrome，PNS）的报道［7~10］。基于其良好的疗效，国内许多学者开展了研究，观察其在治疗成人肾脏病上是否也有同样的良效。

末端病发病机制的国内外研究现状

末端病是指肌腱、韧带、关节囊纤维层在骨上附着部分发生劳损性变性而引起的疾患,末端病的发病部位多发生在四肢关节部位,如常见的有网球肘、肩袖损伤、肌腱炎、跳跃膝、跟痛症等。末端病的发病率在运动员中较高,

糖尿病合并肝病机制研究及中药干预

糖代谢紊乱是糖尿病（diabetes mellitus，DM）发生、发展的关键，葡萄糖体内平衡的调节对维持正常的糖代谢至关重要。肝脏是通过糖原合成和分解代谢来调节葡萄糖体内平衡的重要器官，

对比剂肾病发病机制及预防策略研究进展

对比剂肾病（contrast induced nephropathy,CIN）是应用碘对比剂所致的重要并发症,是医源获得性肾衰竭的第三大常见原因,占全部病例的11%,其病死率高达14%[1]。随着接受冠脉诊疗术患者的不断增加,将有更多患者不可避免地应用碘对比剂。本文就近年来在CIN的发病机制及预防策略方面的进展作一介绍。

糖尿病肾病机制的研究进展

2型糖尿病（type2diabetes，T2D）是最常见的内分泌代谢病，而糖尿病肾病（diabeticnephropa—thy，DN）是糖尿病患者最主要的微血管病变之一。