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江西省高安市两株汉城病毒分离鉴定及全基因组序列分析
被引量:
3
1
作者
刘师文
张艳妮
+5 位作者
肖芳
周珺
刘晓庆
熊英
吴杨博文
龚甜
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期102-107,共6页
目的对2021年江西省高安市采集的鼠肺样本进行肾综合征出血热汉坦病毒分离鉴定及全基因组序列进行分析。方法采用Vero-E6细胞分离肾综合征出血热汉坦病毒,采用实时荧光RT-PCR法和直接免疫荧光法对分离株进行鉴定,采用高通量测序技术对...
目的对2021年江西省高安市采集的鼠肺样本进行肾综合征出血热汉坦病毒分离鉴定及全基因组序列进行分析。方法采用Vero-E6细胞分离肾综合征出血热汉坦病毒,采用实时荧光RT-PCR法和直接免疫荧光法对分离株进行鉴定,采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,采用CLC、MEGA7.0等软件对基因组序列进行分析。结果从褐家鼠和罗赛鼠各分离到1株汉城病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV),分别命名为GAW30/2021、GAW50/2021。2株分离株的3个基因片段大小相同,每个基因编码区长度一致。分离株S、M、L基因分别含1773、3651、6530个核苷酸,分别编码429、1133、2151个氨基酸。2株分离株3个基因核苷酸序列同源性分别为99.7%、99.0%、99.4%、氨基酸序列同源性分别为99.8%、99.7%、99.9%。2株分离株与国内外SEOV参考株全基因组核苷酸同源性为84.3%~94.9%,氨基酸同源性为96.1%~99.8%,在系统进化树上独立分枝。2株分离株与SEOV疫苗株基因组氨基酸同源性为97.6%~99.1%;核蛋白和糖蛋白免疫表位氨基酸序列与疫苗株一致。结论首次在江西省高安市鼠肺样本中分离到2株SEOV变异株,目前疫苗对变异株仍具有保护力。
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关键词
汉城
病毒
病毒分离与鉴定
全基因组序列
疫苗
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职称材料
乌鸡一株A亚群禽白血病病毒的分离鉴定与全基因组序列分析
被引量:
4
2
作者
高延利
李敏
+5 位作者
陆乔娥
石梦雅
王威威
李秋红
邓乔木
韦平
《广西畜牧兽医》
2020年第3期114-117,共4页
为了解广西地区某乌鸡养殖场中是否存在禽白血病病毒(ALV)感染,将从该养殖场中无菌采集的抗凝血分离的血浆接种DF-1细胞进行病毒分离,并采用ELISA和PCR扩增的方法对细胞培养物分别进行检测,成功分离鉴定出一株A亚群禽白血病病毒(ALV-A)...
为了解广西地区某乌鸡养殖场中是否存在禽白血病病毒(ALV)感染,将从该养殖场中无菌采集的抗凝血分离的血浆接种DF-1细胞进行病毒分离,并采用ELISA和PCR扩增的方法对细胞培养物分别进行检测,成功分离鉴定出一株A亚群禽白血病病毒(ALV-A),命名为GX18LZA01株。测序结果显示GX18LZA01株前病毒基因组DNA序列全长7 561bp。遗传演化分析显示,GX18LZA01与10株国内外A亚群参考毒株同处一个大的分支,核苷酸(nt)相似性为91. 8%~96. 6%,其中与SDAU09C1参考株相似性最高(96. 6%);进一步对其gp85基因的分析发现,它与A亚群参考毒株也同处一个大的分支(nt:87. 9%~97. 8%),与全基因组分析的结果一致。本研究结果表明,乌鸡存在A亚群ALV感染,gp85基因可以替代全基因组作为其分子流行病学和系统发育研究的最佳选择。
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关键词
乌鸡
A亚群禽白血病
病毒
病毒分离与鉴定
全基因组序列分析
gp85基因
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职称材料
一例鸡传染性法氏囊病毒新型变异株的分离与鉴定
3
作者
邹潍力
黄添祥
+2 位作者
欧阳志良
温蕾
张险朋
《畜牧兽医科技信息》
2022年第7期22-25,共4页
通过对临床诊断中发现疑似鸡传染性法氏囊病的病料接种SPF鸡胚进行培养,采用RT-PCR方法对培养的尿囊液进行扩增并对扩增片段进行测序分析。结果为鸡胚培养液扩增出674bp的鸡传染性法氏囊病毒的VP2基因片段,测序结果分析显示分离的毒株...
通过对临床诊断中发现疑似鸡传染性法氏囊病的病料接种SPF鸡胚进行培养,采用RT-PCR方法对培养的尿囊液进行扩增并对扩增片段进行测序分析。结果为鸡胚培养液扩增出674bp的鸡传染性法氏囊病毒的VP2基因片段,测序结果分析显示分离的毒株属于新型变异株分支,与新型变异参考株(SHG358和SHG19)的同源性较高,为98.5~98.7%,与美国早期变异株Variant E的同源性仅为94.8%,与经典毒株、超强毒株和弱毒株同源性在91.3%~92.8%。结果表明该病例感染了鸡传染性法氏囊病毒新型变异株,提示现有的部分商品化疫苗已不能有效预防鸡传染性法氏囊病毒新型变异株,为广东地区传染性法氏囊病的防控提供参考。
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关键词
鸡传染性法氏囊
病毒
VP2基因
病毒分离与鉴定
RT-PCR
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职称材料
脊髓灰质炎病毒引起心肌炎6例报告
4
作者
肖淑芳
郇淑英
+2 位作者
刘雪芹
焦艳玲
苏德全
《黑龙江医学》
1995年第2期5-5,共1页
关键词
脊髓灰质炎
病毒
血清中和抗体
心肌炎患者
病毒
性心
型特异性抗体
黑龙江省
起心
病毒分离与鉴定
病毒
分离
培养
补体结合抗体
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职称材料
猪瘟病毒实验室诊断技术研究
5
作者
李雪
康路
《饲料博览》
CAS
2021年第3期89-90,共2页
猪瘟主要是一种由猪瘟病毒引发的高度传染性疾病,该病死亡率极高,类型较多,诊断困难,一旦诊治不及时,容易导致生猪的群体性死亡,对生猪养殖的危害极大。本文通过对猪瘟病毒分离与鉴定实验室诊断技术的分析,为生猪养殖业猪瘟疫病的诊断...
猪瘟主要是一种由猪瘟病毒引发的高度传染性疾病,该病死亡率极高,类型较多,诊断困难,一旦诊治不及时,容易导致生猪的群体性死亡,对生猪养殖的危害极大。本文通过对猪瘟病毒分离与鉴定实验室诊断技术的分析,为生猪养殖业猪瘟疫病的诊断提供参考,以确保猪瘟疫病防治工作的有效性。
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关键词
疫病防治工作
猪瘟
病毒
生猪养殖业
猪瘟疫
传染性疾病
实验室诊断技术
病毒分离与鉴定
群体性
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职称材料
一株新型云南牛环状病毒的分离鉴定
被引量:
1
6
作者
杨振兴
李占鸿
+5 位作者
廖德芳
高翔
胡忠燕
谢佳芮
李华春
杨恒
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期1957-1970,共14页
【目的】为加深云南省动物虫媒病毒多样性的认知。【方法】在云南省景洪市设立哨兵牛,定期采血接种细胞进行虫媒病毒的分离;通过RT-PCR、电镜观察与基因组琼脂糖凝胶电泳对分离病毒进行初步鉴定;扩增分离病毒的基因节段2(Seg-2)与基因节...
【目的】为加深云南省动物虫媒病毒多样性的认知。【方法】在云南省景洪市设立哨兵牛,定期采血接种细胞进行虫媒病毒的分离;通过RT-PCR、电镜观察与基因组琼脂糖凝胶电泳对分离病毒进行初步鉴定;扩增分离病毒的基因节段2(Seg-2)与基因节段3(Seg-3)全长序列进行分析与系统发生树的构建,明确病毒的分类地位;通过qRT-PCR与血清中和试验对病毒在动物上的感染进行回溯分析。【结果】2019年7月,从哨兵牛上采集的血液中分离到1株可在BHK-21细胞上引起细胞病变的病毒;电镜下观察,病毒粒子呈球形,直径约70 nm;琼脂糖凝胶电泳显示病毒基因组由双链RNA组成,呈现“3-3-3”的带型特征。分离毒株的Seg-2编码环状病毒属病毒保守的T2蛋白,与Mobuck virus具有最近的亲缘关系,核酸与氨基酸序列相似度分别为72.8%与84.0%;分离毒株的Seg-3编码决定环状病毒属病毒血清型的OC1蛋白,与Mobuck virus的核酸与氨基酸序列相似度仅为60.2%与56.5%;在T2与OC1蛋白构建的系统发生树上,分离毒株形成独立于Mobuck virus的进化分支。对哨兵牛血液中的病毒核酸与血清中和抗体回溯分析结果显示,从病毒感染哨兵动物至监测期结束的17周内,动物血液中均可检测到病毒核酸;动物感染病毒1周后,开始产生特异性中和抗体,随后上升至最高水平(抗体效价1:226),至监测期结束,中和抗体仍维持在较高水平(抗体效价1:113)。【结论】本研究首次报道了1种新型Mobuck virus在云南省哨兵牛上的分离与感染特性。研究结果丰富了对我国环状病毒属病毒的认知,为开展病毒的诊断、流行病学与致病性研究奠定了基础。
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关键词
环状
病毒
属
病毒
Mobuck
病毒
病毒分离与鉴定
进化分析
感染动态分析
原文传递
什么是禽流感
7
作者
为民
《山西老年》
2004年第3期48-48,共1页
关键词
禽流感
病毒
人类流感
病毒
高致病性
流感疫情
病毒分离与鉴定
动物疫病
禽流行性感冒
呼吸道上皮细胞
流行病学调查
无害化处理
原文传递
题名
江西省高安市两株汉城病毒分离鉴定及全基因组序列分析
被引量:
3
1
作者
刘师文
张艳妮
肖芳
周珺
刘晓庆
熊英
吴杨博文
龚甜
机构
江西省疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期102-107,共6页
基金
江西省科技计划项目重点研发计划(No.20202BBGL73052、No.20203BBG73055)。
文摘
目的对2021年江西省高安市采集的鼠肺样本进行肾综合征出血热汉坦病毒分离鉴定及全基因组序列进行分析。方法采用Vero-E6细胞分离肾综合征出血热汉坦病毒,采用实时荧光RT-PCR法和直接免疫荧光法对分离株进行鉴定,采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,采用CLC、MEGA7.0等软件对基因组序列进行分析。结果从褐家鼠和罗赛鼠各分离到1株汉城病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV),分别命名为GAW30/2021、GAW50/2021。2株分离株的3个基因片段大小相同,每个基因编码区长度一致。分离株S、M、L基因分别含1773、3651、6530个核苷酸,分别编码429、1133、2151个氨基酸。2株分离株3个基因核苷酸序列同源性分别为99.7%、99.0%、99.4%、氨基酸序列同源性分别为99.8%、99.7%、99.9%。2株分离株与国内外SEOV参考株全基因组核苷酸同源性为84.3%~94.9%,氨基酸同源性为96.1%~99.8%,在系统进化树上独立分枝。2株分离株与SEOV疫苗株基因组氨基酸同源性为97.6%~99.1%;核蛋白和糖蛋白免疫表位氨基酸序列与疫苗株一致。结论首次在江西省高安市鼠肺样本中分离到2株SEOV变异株,目前疫苗对变异株仍具有保护力。
关键词
汉城
病毒
病毒分离与鉴定
全基因组序列
疫苗
Keywords
Seoul orthohantavirus
virus isolation and identification
complete genome sequence
vaccine
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
R512.8 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
乌鸡一株A亚群禽白血病病毒的分离鉴定与全基因组序列分析
被引量:
4
2
作者
高延利
李敏
陆乔娥
石梦雅
王威威
李秋红
邓乔木
韦平
机构
广西大学养禽与禽病研究所
出处
《广西畜牧兽医》
2020年第3期114-117,共4页
基金
2017广西科技重大专项(桂科AA17204057)
国家现代农业产业技术体系广西肉鸡产业创新团队建设专项(nycytxgxcxtd-19-03)。
文摘
为了解广西地区某乌鸡养殖场中是否存在禽白血病病毒(ALV)感染,将从该养殖场中无菌采集的抗凝血分离的血浆接种DF-1细胞进行病毒分离,并采用ELISA和PCR扩增的方法对细胞培养物分别进行检测,成功分离鉴定出一株A亚群禽白血病病毒(ALV-A),命名为GX18LZA01株。测序结果显示GX18LZA01株前病毒基因组DNA序列全长7 561bp。遗传演化分析显示,GX18LZA01与10株国内外A亚群参考毒株同处一个大的分支,核苷酸(nt)相似性为91. 8%~96. 6%,其中与SDAU09C1参考株相似性最高(96. 6%);进一步对其gp85基因的分析发现,它与A亚群参考毒株也同处一个大的分支(nt:87. 9%~97. 8%),与全基因组分析的结果一致。本研究结果表明,乌鸡存在A亚群ALV感染,gp85基因可以替代全基因组作为其分子流行病学和系统发育研究的最佳选择。
关键词
乌鸡
A亚群禽白血病
病毒
病毒分离与鉴定
全基因组序列分析
gp85基因
分类号
S858.315.3 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
一例鸡传染性法氏囊病毒新型变异株的分离与鉴定
3
作者
邹潍力
黄添祥
欧阳志良
温蕾
张险朋
机构
东莞市动物疫病预防控制中心
东莞市厚街镇农业技术服务中心
出处
《畜牧兽医科技信息》
2022年第7期22-25,共4页
文摘
通过对临床诊断中发现疑似鸡传染性法氏囊病的病料接种SPF鸡胚进行培养,采用RT-PCR方法对培养的尿囊液进行扩增并对扩增片段进行测序分析。结果为鸡胚培养液扩增出674bp的鸡传染性法氏囊病毒的VP2基因片段,测序结果分析显示分离的毒株属于新型变异株分支,与新型变异参考株(SHG358和SHG19)的同源性较高,为98.5~98.7%,与美国早期变异株Variant E的同源性仅为94.8%,与经典毒株、超强毒株和弱毒株同源性在91.3%~92.8%。结果表明该病例感染了鸡传染性法氏囊病毒新型变异株,提示现有的部分商品化疫苗已不能有效预防鸡传染性法氏囊病毒新型变异株,为广东地区传染性法氏囊病的防控提供参考。
关键词
鸡传染性法氏囊
病毒
VP2基因
病毒分离与鉴定
RT-PCR
分类号
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
脊髓灰质炎病毒引起心肌炎6例报告
4
作者
肖淑芳
郇淑英
刘雪芹
焦艳玲
苏德全
机构
黑龙江省医院
黑龙江省卫生防疫站
讷河市卫生防疫站
出处
《黑龙江医学》
1995年第2期5-5,共1页
关键词
脊髓灰质炎
病毒
血清中和抗体
心肌炎患者
病毒
性心
型特异性抗体
黑龙江省
起心
病毒分离与鉴定
病毒
分离
培养
补体结合抗体
分类号
R542.21 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
猪瘟病毒实验室诊断技术研究
5
作者
李雪
康路
机构
盘锦市大洼区现代农业发展中心
盘锦市大洼区动物卫生监督所
出处
《饲料博览》
CAS
2021年第3期89-90,共2页
文摘
猪瘟主要是一种由猪瘟病毒引发的高度传染性疾病,该病死亡率极高,类型较多,诊断困难,一旦诊治不及时,容易导致生猪的群体性死亡,对生猪养殖的危害极大。本文通过对猪瘟病毒分离与鉴定实验室诊断技术的分析,为生猪养殖业猪瘟疫病的诊断提供参考,以确保猪瘟疫病防治工作的有效性。
关键词
疫病防治工作
猪瘟
病毒
生猪养殖业
猪瘟疫
传染性疾病
实验室诊断技术
病毒分离与鉴定
群体性
分类号
S851.33 [农业科学—预防兽医学]
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职称材料
题名
一株新型云南牛环状病毒的分离鉴定
被引量:
1
6
作者
杨振兴
李占鸿
廖德芳
高翔
胡忠燕
谢佳芮
李华春
杨恒
机构
云南省畜牧兽医科学院
景洪市动物疫病预防控制中心
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期1957-1970,共14页
基金
国家自然科学基金(31760744)
公益性行业(农业)科研专项(201303035)
+1 种基金
国家重点研发计划(2017YFC1200505)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才培养项目(2017HB055)。
文摘
【目的】为加深云南省动物虫媒病毒多样性的认知。【方法】在云南省景洪市设立哨兵牛,定期采血接种细胞进行虫媒病毒的分离;通过RT-PCR、电镜观察与基因组琼脂糖凝胶电泳对分离病毒进行初步鉴定;扩增分离病毒的基因节段2(Seg-2)与基因节段3(Seg-3)全长序列进行分析与系统发生树的构建,明确病毒的分类地位;通过qRT-PCR与血清中和试验对病毒在动物上的感染进行回溯分析。【结果】2019年7月,从哨兵牛上采集的血液中分离到1株可在BHK-21细胞上引起细胞病变的病毒;电镜下观察,病毒粒子呈球形,直径约70 nm;琼脂糖凝胶电泳显示病毒基因组由双链RNA组成,呈现“3-3-3”的带型特征。分离毒株的Seg-2编码环状病毒属病毒保守的T2蛋白,与Mobuck virus具有最近的亲缘关系,核酸与氨基酸序列相似度分别为72.8%与84.0%;分离毒株的Seg-3编码决定环状病毒属病毒血清型的OC1蛋白,与Mobuck virus的核酸与氨基酸序列相似度仅为60.2%与56.5%;在T2与OC1蛋白构建的系统发生树上,分离毒株形成独立于Mobuck virus的进化分支。对哨兵牛血液中的病毒核酸与血清中和抗体回溯分析结果显示,从病毒感染哨兵动物至监测期结束的17周内,动物血液中均可检测到病毒核酸;动物感染病毒1周后,开始产生特异性中和抗体,随后上升至最高水平(抗体效价1:226),至监测期结束,中和抗体仍维持在较高水平(抗体效价1:113)。【结论】本研究首次报道了1种新型Mobuck virus在云南省哨兵牛上的分离与感染特性。研究结果丰富了对我国环状病毒属病毒的认知,为开展病毒的诊断、流行病学与致病性研究奠定了基础。
关键词
环状
病毒
属
病毒
Mobuck
病毒
病毒分离与鉴定
进化分析
感染动态分析
Keywords
Orbivirus
Mobuck virus
virus isolation and identification
phylogenetic analysis
infection kinetics
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
什么是禽流感
7
作者
为民
出处
《山西老年》
2004年第3期48-48,共1页
关键词
禽流感
病毒
人类流感
病毒
高致病性
流感疫情
病毒分离与鉴定
动物疫病
禽流行性感冒
呼吸道上皮细胞
流行病学调查
无害化处理
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江西省高安市两株汉城病毒分离鉴定及全基因组序列分析
刘师文
张艳妮
肖芳
周珺
刘晓庆
熊英
吴杨博文
龚甜
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
下载PDF
职称材料
2
乌鸡一株A亚群禽白血病病毒的分离鉴定与全基因组序列分析
高延利
李敏
陆乔娥
石梦雅
王威威
李秋红
邓乔木
韦平
《广西畜牧兽医》
2020
4
下载PDF
职称材料
3
一例鸡传染性法氏囊病毒新型变异株的分离与鉴定
邹潍力
黄添祥
欧阳志良
温蕾
张险朋
《畜牧兽医科技信息》
2022
0
下载PDF
职称材料
4
脊髓灰质炎病毒引起心肌炎6例报告
肖淑芳
郇淑英
刘雪芹
焦艳玲
苏德全
《黑龙江医学》
1995
0
下载PDF
职称材料
5
猪瘟病毒实验室诊断技术研究
李雪
康路
《饲料博览》
CAS
2021
0
下载PDF
职称材料
6
一株新型云南牛环状病毒的分离鉴定
杨振兴
李占鸿
廖德芳
高翔
胡忠燕
谢佳芮
李华春
杨恒
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
7
什么是禽流感
为民
《山西老年》
2004
0
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