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土壤病毒生态学研究方法 被引量:6
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作者 韩丽丽 于丹婷 贺纪正 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1749-1756,共8页
病毒是地球上最丰富的生物实体,每克土壤中可包含数以亿计的病毒,它不仅影响土壤中其它微生物的群落组成、土壤元素的生物地球化学循环,还会影响土壤微生物的物种进化,甚至影响植物、动物和人体健康。目前人们对土壤中病毒的种类及丰度... 病毒是地球上最丰富的生物实体,每克土壤中可包含数以亿计的病毒,它不仅影响土壤中其它微生物的群落组成、土壤元素的生物地球化学循环,还会影响土壤微生物的物种进化,甚至影响植物、动物和人体健康。目前人们对土壤中病毒的种类及丰度、分布特征以及功能引起的生态环境效应还知之甚少。在概述病毒生态学研究方法的基础上,对土壤病毒的提取、纯化、定量及分子生态学方法等基本流程进行了比较分析,以期建立一套快速简便、高效稳定的适用于土壤病毒研究的方法,并用于研究土壤病毒的多样性及分布特征,探讨病毒在环境中的生存和传播机制,为土壤病毒的防控及开发利用提供支撑。 展开更多
关键词 土壤病毒 病毒生态 病毒组学 分子生物学方法
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环境介质中病毒生态的研究 被引量:2
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作者 王德铭 《应用生态学报》 CAS CSCD 1990年第3期277-286,共10页
病毒是许多人及重要经济动、植物病患的病原。一些病毒在环境中可因条件不同而生存数小时到数月,并在水、气、士中迁移达若干公里。现有的污水处理方法对病毒,特别是肠道病毒效果欠佳,土地处置原污泥以及污水灌溉的水果和蔬菜能传播人... 病毒是许多人及重要经济动、植物病患的病原。一些病毒在环境中可因条件不同而生存数小时到数月,并在水、气、士中迁移达若干公里。现有的污水处理方法对病毒,特别是肠道病毒效果欠佳,土地处置原污泥以及污水灌溉的水果和蔬菜能传播人肠道病毒。即使小至一个组织培养的感染剂量(病毒)也可引起人的疾病,因此对环境介质中,特别是饮水和食物中的少量病毒的去除也是重要的。现有的指示物不能确切地指示粪便污染,更不能充分反映人肠道病毒的污染。大肠菌噬菌体在地表水、地下水和污水中比人肠道病毒更呈持久性,还有许多适于选择分析技术特有性能,因此很可能在一定条件下用它作人肠道病毒的指示物。作者对我国今后需要开展的研究提出了建议。 展开更多
关键词 病毒生态 环境介质
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流感病毒变异规律的一些新发现及其在流感监测和生态学研究中的应用 被引量:2
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作者 郭元吉 王敏 +1 位作者 王平 朱既明 《医学研究杂志》 1990年第8期18-18,共1页
通过近10年的研究,在流感病毒生态学研究方面取得了一些重要的研究成果。填补了我国在这方面的空白。在国际上首先从猪中分离到丙型流感病毒,并通过基因分析,证实了丙型流感病毒在猪群中也能发生抗原性漂移甚至基因重组;并证实在猪群中... 通过近10年的研究,在流感病毒生态学研究方面取得了一些重要的研究成果。填补了我国在这方面的空白。在国际上首先从猪中分离到丙型流感病毒,并通过基因分析,证实了丙型流感病毒在猪群中也能发生抗原性漂移甚至基因重组;并证实在猪群中有乙型流感病毒抗体的存在且至今猪群中仍含有甲<sub>2</sub>型(H<sub>2</sub>N<sub>2</sub>)流感病毒抗体。在国内,首次从猪中分离到人甲1<sub>型</sub>(H<sub>1</sub>N<sub>1</sub>)流感病毒。 展开更多
关键词 流感病毒 乙型流感 病毒生态 抗原性漂移 基因分析 变异规律 基因重组 病毒抗体 研究成果 流行株
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土壤病毒的研究进展与挑战 被引量:17
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作者 王光华 刘俊杰 +2 位作者 朱冬 叶茂 朱永官 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1319-1332,共14页
病毒是由蛋白质和核酸组成的结构简单的非细胞型生物实体,全球病毒数量估算为4.80Í1031,远高于具有细胞型结构的生物数量。土壤是病毒重要的储藏库,土壤中病毒主要以侵染原核生物的噬菌体为主,其数量与寄主细胞数目和土壤理化指标... 病毒是由蛋白质和核酸组成的结构简单的非细胞型生物实体,全球病毒数量估算为4.80Í1031,远高于具有细胞型结构的生物数量。土壤是病毒重要的储藏库,土壤中病毒主要以侵染原核生物的噬菌体为主,其数量与寄主细胞数目和土壤理化指标密切相关。虽然学术界已意识到土壤病毒在调控微生物群落结构组成、影响土壤元素循环利用、促进生物进化、以及影响动植物病害,乃至人类健康等方面可能起到重要的作用,但由于受到土壤病毒颗粒的吸附性、土壤异质性,以及研究手段和分析平台的制约,我们对土壤病毒的认知和重视程度远落后于流动的海洋等水体环境。土壤病毒宏基因组中大量的基因序列无法判断其来源及功能,被划分为未知基因,所以病毒也被喻为生物“暗物质”和最大的未知基因宝库。本文在简要介绍了病毒的形态,在土壤中数量、存在形式和多样性的基础上,着重介绍了利用分子标记基因、RAPD和宏病毒组研究技术解析土壤病毒多样性的方法及其局限性,阐述土壤病毒已证实和潜在生态功能。最后,文章提出未来土壤病毒研究应加强的研究方向,强调土壤病毒与土壤微生物耦合研究在揭示土壤生态功能研究中的重要性。 展开更多
关键词 土壤病毒 噬菌体 标记基因 多样性 宏基因组 病毒生态
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流感病毒快速诊断的研究进展 被引量:5
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作者 李先茜 王成贵 庄丽 《北华大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第2期142-147,共6页
临床对流感病毒的有效控制与治疗在于实验室的快速与准确的诊断,快速诊断可使9%~38%的流感被有效地控制.目前对流感病毒的诊断方法很多,特别是应用分子生物学手段进行流感病毒的快速诊断.同时从分子生物学角度了解流感病毒抗原变异的... 临床对流感病毒的有效控制与治疗在于实验室的快速与准确的诊断,快速诊断可使9%~38%的流感被有效地控制.目前对流感病毒的诊断方法很多,特别是应用分子生物学手段进行流感病毒的快速诊断.同时从分子生物学角度了解流感病毒抗原变异的机制及流感病毒生态学特点. 展开更多
关键词 流感病毒 快速诊断 研究进展 诊断方法 分子生物学 抗原变异 病毒生态
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分子生态学与医学 被引量:1
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作者 孔令根 《广州医药》 1997年第1期57-57,共1页
分子生态学与医学广州市医药卫生研究所病毒研究室(510180)孔令根《广州医药》1996年第3期封面的一段话:“生态学在本世纪60年代以前的主要工作是调查有机体的分布格局,以及与控制的环境变量相联系;60年代到80年... 分子生态学与医学广州市医药卫生研究所病毒研究室(510180)孔令根《广州医药》1996年第3期封面的一段话:“生态学在本世纪60年代以前的主要工作是调查有机体的分布格局,以及与控制的环境变量相联系;60年代到80年代注意到功能过程的实验研究;80年... 展开更多
关键词 分子生态 病毒分子生态
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丙型流感病毒分离及其流行病学意义的探讨
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作者 孙克诚 孙敬照 +3 位作者 熊范幼 孙小林 张爱华 姜珍霞 《中国公共卫生学报》 1989年第1期8-10,共3页
1987年6月在定时、定点的流感病原学监测中,分离到丙型流感病毒1株(c/青岛/77/87)。经鉴定,其抗原性与历年丙型毒株有些差异。在牛血清中查出≥1:20的丙型流感病毒抗体3份,其中1份单扩溶血复核为阳性。证实了牛在丙型流感病毒生态学上... 1987年6月在定时、定点的流感病原学监测中,分离到丙型流感病毒1株(c/青岛/77/87)。经鉴定,其抗原性与历年丙型毒株有些差异。在牛血清中查出≥1:20的丙型流感病毒抗体3份,其中1份单扩溶血复核为阳性。证实了牛在丙型流感病毒生态学上的意义。从34对产妇和新生儿的血清检测中,同时具有丙型流感病毒抗体者33对,首次在国内外证实了胎传的可能。 展开更多
关键词 丙型流感病毒 病毒生态
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AAV-mediated expression of p65shRNA and bone morphogenetic protein 4 synergistically enhances chondrocyte regeneration
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作者 Yu Yangyi Song Zhuoyue +2 位作者 Lian Qiang Ding Kang Li Guangheng 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第17期3537-3547,共11页
BACKGROUND:Adeno-associated virus(AAV)gene therapy has been proven to be reliable and safe for the treatment of osteoarthritis in recent years.However,given the complexity of osteoarthritis pathogenesis,single gene ma... BACKGROUND:Adeno-associated virus(AAV)gene therapy has been proven to be reliable and safe for the treatment of osteoarthritis in recent years.However,given the complexity of osteoarthritis pathogenesis,single gene manipulation for the treatment of osteoarthritis may not produce satisfactory results.Previous studies have shown that nuclear factorκB could promote the inflammatory pathway in osteoarthritic chondrocytes,and bone morphogenetic protein 4(BMP4)could promote cartilage regeneration.OBJECTIVE:To test whether combined application of AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 will yield the synergistic effect on chondrocytes regeneration and osteoarthritis treatment.METHODS:Viral particles containing AAV-p65-shRNA and AAV-BMP4 were prepared.Their efficacy in inhibiting inflammation in chondrocytes and promoting chondrogenesis was assessed in vitro and in vivo by transfecting AAV-p65-shRNA or AAV-BMP4 into cells.The experiments were divided into five groups:PBS group;osteoarthritis group;AAV-BMP4 group;AAV-p65shRNA group;and BMP4-p65shRNA 1:1 group.Samples were collected at 4,12,and 24 weeks postoperatively.Tissue staining,including safranin O and Alcian blue,was applied after collecting articular tissue.Then,the optimal ratio between the two types of transfected viral particles was further investigated to improve the chondrogenic potential of mixed cells in vivo.RESULTS AND CONCLUSION:The combined application of AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 together showed a synergistic effect on cartilage regeneration and osteoarthritis treatment.Mixed cells transfected with AAV-p65shRNA and AAV-BMP4 at a 1:1 ratio produced the most extracellular matrix synthesis(P<0.05).In vivo results also revealed that the combination of the two viruses had the highest regenerative potential for osteoarthritic cartilage(P<0.05).In the present study,we also discovered that the combined therapy had the maximum effect when the two viruses were administered in equal proportions.Decreasing either p65shRNA or BMP4 transfected cells resulted in less collagen II synthesis.This implies that inhibiting inflammation by p65shRNA and promoting regeneration by BMP4 are equally important for osteoarthritis treatment.These findings provide a new strategy for the treatment of early osteoarthritis by simultaneously inhibiting cartilage inflammation and promoting cartilage repair. 展开更多
关键词 OSTEOARTHRITIS adeno-associated virus bone morphogenetic protein 4 p65-short hairpin RNA gene therapy short hairpin RNA transforming growth factor-β1 extracellular matrix articular cartilage chondrocytes.
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Hendra Virus Re-visited
9
作者 Hume Field 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2009年第2期105-109,共5页
Hendra virus,a novel member of the family Paramyxovirus that has emerged from bats in Australia,causes fatal disease in livestock and humans. Eleven spillover events have been identified since the first description of... Hendra virus,a novel member of the family Paramyxovirus that has emerged from bats in Australia,causes fatal disease in livestock and humans. Eleven spillover events have been identified since the first description of the virus in 1994,resulting in a total of 37 equine cases and six human cases. All human cases have been attributed to exposure to infected horses;there is no evidence of bat-to-human or human-to-human transmission. Low infectivity and a high case fatality rate are features of Hendra virus infection in both horses and humans. The temporal pattern of spillover events suggests seasonal factors(plausibly be environmental,biological or ecological) as the proximate triggers for spillover. Minimisation of the future occurrence and impact of Hendra virus infections requires an understanding of the ecology of flying foxes,of virus infection dynamics in flying foxes,and of the factors that promote spillover. Management strategies seek to minimize the opportunity for effective contact between bats and horses,and limit potential horse-to-horse and horse-to-human transmission. Incomplete knowledge of the ecology of the virus,of the proximate factors associated with spillover,and the inherent difficulties of effectively managing wild populations,preclude a management approach targeted at bats. 展开更多
关键词 Hendra virus Bats ZOONOSES EMERGENCE EPIDEMIOLOGY
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掀开土壤生物“暗物质”——土壤病毒的神秘面纱 被引量:10
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作者 王光华 《中国科学院院刊》 CSCD 2017年第6期575-584,共10页
病毒是地球上数量最多的生命体,在调控寄主群落结构、促进元素生物地球化学循环和生物进化中起到重要的作用。病毒被喻为生物"暗物质"。近年来,海洋环境下病毒生态学研究进展迅速;与此相反,在陆地生态系统,特别是土壤环境中... 病毒是地球上数量最多的生命体,在调控寄主群落结构、促进元素生物地球化学循环和生物进化中起到重要的作用。病毒被喻为生物"暗物质"。近年来,海洋环境下病毒生态学研究进展迅速;与此相反,在陆地生态系统,特别是土壤环境中病毒研究进展缓慢。文章从生态学角度对目前有关土壤病毒丰度、形态多样性、基因多样性、研究方法和生态功能等进行简要的阐述,目的在于呼吁从事土壤微生物和土壤生态学研究的工作者重视对土壤病毒的研究工作,从而促进土壤病毒生态学科的发展。 展开更多
关键词 土壤病毒 噬菌体 多样性 宏基因组 病毒生态
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自然环境中T4型噬菌体g23基因多样性研究进展 被引量:8
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作者 王光华 刘俊杰 Makoto Kimura 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期732-739,共8页
过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋... 过去的20多年,伴随着分子生物学技术在环境微生物研究中的应用,环境中细菌和真菌群落基因多样性及与其生存环境间的关系逐渐被揭示,但对于地球上广泛存在且数量巨大的生命体-噬菌体基因多样性研究还很少。本文以编码T4型噬菌体主要壳蛋白基因g23为目标,综述了近年来T4型噬菌体在海洋、湖泊和稻田中基因多样性的研究进展。研究结果表明T4型噬菌体g23基因分布与其生存环境关系很大,许多g23基因按获取环境不同划分为几个新类群。同时文中也指出了针对环境中T4型噬菌体g23基因研究应该注意的几点问题及未来的研究发展趋势。 展开更多
关键词 噬菌体 T4型噬菌体 g23基因 病毒生态 稻田
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不同自然环境下噬藻体g20基因多样性研究进展 被引量:6
12
作者 荆瑞勇 Makoto Kimura 王光华 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1149-1157,共9页
随着分子生物学技术发展与病毒基因组测序的推进,对地球上数量最大且广泛存在的病毒及其基因多样性的研究备受科学家们关注。迄今为止,仍未发现类似于细菌16S rDNA和真菌18S rDNA的病毒通用分子标记,但利用病毒某些家族的保守氨基酸序... 随着分子生物学技术发展与病毒基因组测序的推进,对地球上数量最大且广泛存在的病毒及其基因多样性的研究备受科学家们关注。迄今为止,仍未发现类似于细菌16S rDNA和真菌18S rDNA的病毒通用分子标记,但利用病毒某些家族的保守氨基酸序列设计简并性引物可研究环境中病毒多样性,并取得了一系列突破性成果。本文以编码噬藻体壳组装蛋白基因g20为目标,综述了噬藻体在海洋、湖泊和稻田中噬藻体基因多样性的研究进展,讨论了噬藻体g20基因分布与生存环境的相关性,发现不同的自然环境中都存在着独特的类群。同时指出了针对环境中噬藻体g20基因研究存在的问题及未来研究发展的趋势。 展开更多
关键词 噬藻体 g20基因 病毒生态 海洋 湖泊 稻田
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何谓H7N9禽流感——应正确认识和积极防治 被引量:13
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作者 任成山 杨仕明 +1 位作者 晋献春 钱桂生 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 CAS 2013年第2期76-78,共3页
H7N9型禽流感(H7N9 avian influenza)是一种新型禽流感病毒引起,并且可导致人类感染,于2013年3月31日在中国上海和安徽两地率先报告。
关键词 H7N9禽流感 人感染 H7N9病毒生态 临床特征 正确认识 防治
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气候与登革热传播:证据与启示 被引量:1
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作者 Cory W. Morin Andrew C. Comrie Kacey Ernst 《环境与职业医学》 CAS 北大核心 2014年第2期133-133,共1页
[背景]气候通过矢量动力学、药物研发和蚊子/人类的相互作用而影响登革热的生态。虽然人们已认识到这些关系,但是气候变化对传播途径的影响尚不清楚。研究人员采用气候驱动统计模型和基于过程的模型,来完善这些关系的知识,并预测气候变... [背景]气候通过矢量动力学、药物研发和蚊子/人类的相互作用而影响登革热的生态。虽然人们已认识到这些关系,但是气候变化对传播途径的影响尚不清楚。研究人员采用气候驱动统计模型和基于过程的模型,来完善这些关系的知识,并预测气候变化对登革热发生的影响,但得到的结果却并不一致。[目的]明确气候对登革热病毒生态学的主要影响,并评估以气候为基础的登革热模型在描述气候和登革热之间关联、模拟疫情并预测气候变化方面的能力。[方法]回顾实验室研究、现场研究和统计学分析中有关气候与登革热之间直接和间接关联的证据,这些研究均涉及虫媒、登革热发病率和气候条件之间关联。评估以气候为驱动因子、基于过程的登革热模型的潜在作用,并提出建议以提高其性能。[结果和讨论]气候变量与影响登革热传播的因素之间具有复杂的关系。一个气候变量可能通过该系统的一个方面增强登革热的潜在传播力,同时又通过该系统的另一个方面减弱这种潜在的传播力。这种复杂性至少可以部分解释登革热与气候之间在统计学关联上的不一致性。基于过程的模型能够解释复杂的动力学,但往往忽略登革热生态的重要方面,特别是病毒形成与宿主-物种的相互作用。[结论]整合并应用现有的关于气候对登革热病毒生态各方面影响的知识,将有助于指引今后的研究,并促进更有效地预测气候变化对登革热发病的影响。 展开更多
关键词 气候变化 传播途径 登革热 病毒生态 证据 统计模型 相互作用 药物研发
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Ecology of avian influenza viruses in migratory birds wintering within the Yangtze River wetlands
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作者 Decheng Wang Mingxin Li +17 位作者 Chaochao Xiong Yi Yan Juefu Hu Mengchan Hao Bilin Liang Jing Chen Guang Chen Guoxiang Yang Yong Li Jun Zhang Marina Gulyaeva Alexander Shestopalov Weifeng Shi Yuhai Bi Haizhou Liu Hanzhong Wang Di Liu Jianjun Chen 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2021年第19期2014-2024,M0004,共12页
Migratory birds are considered natural reservoirs of avian influenza A viruses(AIVs).To further our viral ecology knowledge and understand the subsequent risk posed by wild birds,we conducted a 4-year surveillance stu... Migratory birds are considered natural reservoirs of avian influenza A viruses(AIVs).To further our viral ecology knowledge and understand the subsequent risk posed by wild birds,we conducted a 4-year surveillance study of AIVs in the bird wintering wetlands of the Yangtze River,China.We collected over8000 samples and isolated 122 AIV strains.Analyses were then carried out with 108 novel sequenced genomes and data were deposited in GISAID and other public databases.The results showed that the Yangtze River wintering wetlands functioned as a mixing ground,where various subtypes of AIVs were detected harboring a high diversity of nucleotide sequences;moreover,a portion of AIV gene segments were persistent inter-seasonally.Phylogenetic incongruence presented complex reassortment events and distinct patterns among various subtypes.In addition,we observed that viral gene segments in wintering wetlands were closely related to known North American isolates,indicating that intercontinental gene flow occurred.Notably,highly pathogenic H5 and low pathogenic H9 viruses,which usually circulate in poultry,were found to have crossed the poultry/wild bird interface,with the viruses introduced to wintering birds.Overall,this study represented the largest AIV surveillance effort of wild birds within the Yangtze River wintering wetlands.Surveillance data highlighted the important role of wintering wild birds in the ecology of AIVs and may enable future early warnings of novel AIV emergence. 展开更多
关键词 Avian influenza viruses Migratory birds Yangtze River wetlands
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Using Virus to Restore and Construct Stable Forest Ecosystem for Pest Insects Control
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作者 ZHANG Yong'an QU Liangjian WANG Yuzhu 《Chinese Forestry Science and Technology》 2007年第4期53-61,共9页
Using the viruses to sustainable control forest pest insects were reviewed in this paper. And the status of forest pest insects and bio-control technique in China were introduced. The criterion of stable ecological sy... Using the viruses to sustainable control forest pest insects were reviewed in this paper. And the status of forest pest insects and bio-control technique in China were introduced. The criterion of stable ecological system and the methods of restoration and construction were also analyzed. Meanwhile, the experiment in which 4 species of insect viruses were used and successfully control the forest pest insects persistently indicate that the insect viruses play an important role in restoring and constructing stable forest ecology system. 展开更多
关键词 forest ecological system restoration and construction biological control insect virus
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Electron microscopy:essentials for viral structure,morphogenesis and rapid diagnosis 被引量:2
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作者 ZHANG Ying HUNG Tao +1 位作者 SONG JingDong HE JinSheng 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第5期421-430,共10页
Electron microscopy(EM) should be used in the front line for detection of agents in emergencies and bioterrorism,on accounts of its speed and accuracy.However,the number of EM diagnostic laboratories has decreased con... Electron microscopy(EM) should be used in the front line for detection of agents in emergencies and bioterrorism,on accounts of its speed and accuracy.However,the number of EM diagnostic laboratories has decreased considerably and an increasing number of people encounter difficulties with EM results.Therefore,the research on viral structure and morphology has become important in EM diagnostic practice.EM has several technological advantages,and should be a fundamental tool in clinical diagnosis of viruses,particularly when agents are unknown or unsuspected.In this article,we review the historical contribution of EM to virology,and its use in virus differentiation,localization of specific virus antigens,virus-cell interaction,and viral morphogenesis.It is essential that EM investigations are based on clinical and comprehensive pathogenesis data from light or confocal microscopy.Furthermore,avoidance of artifacts or false results is necessary to exploit fully the advantages while minimizing its limitations. 展开更多
关键词 electron microscopy viral structure viral morphology viral diagnosis
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