基于小RNA深度测序鉴定湖北省荆半夏病毒病主要病原

目的:了解不同粒径半夏种苗的病毒病发病情况以及鉴定荆半夏病毒病主要种类,为荆半夏病毒病的防治提供参考。方法:本研究将购买于潜江的半夏种苗按粒径分级种植于田间并统计发病率,利用小RNA深度测序技术(small RNA deep sequencing)对病样进行检测,并使用透射电镜观察和RT-PCR技术从显微和分子鉴定对主要病毒种类进行验证,并对所扩增的病毒衣壳蛋白(CP)序列进行比对分析。结果:不同粒径种苗半夏病毒病发病率均较高且差异不大。湖北荆半夏的主要病毒病种类有黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、魔芋花叶病毒(Konjac mosaic virus,KoMV)、大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)和芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus,DsMV)。结论:本研究确定了不同粒径半夏种苗的发病状况,确定了荆半夏病毒病4种主要病原,为湖北产区荆半夏种苗病毒病检测和防治提供一定理论基础。