疱疹病毒编码的miRNAs的研究进展

MicroRNAs(miRNAs)是一类长约22个核苷酸的RNA,在数量、序列、结构、表达和功能上具有多样性。目前,通过生物信息学手段和分子克隆方法,已发现了3518种miRNAs,在控制细胞的生长发育、分化、凋亡等过程中发挥着十分重要的作用。最近研究发现某些病毒基因组也能够编码miRNAs,其中大部分为疱疹病毒,这些miRNAs在调控病毒自身表达以及病毒与宿主相互作用方面可能起到重要的作用。找出病毒可能编码的miRNAs,探索其对病毒感染、复制、表达的作用,有助于病毒分子生物学的研究,也会为研发防治病毒的新方法和新途径提供新的思路。

病毒编码的miRNAs研究进展

miRNA是一类在多种基因调控过程中起重要作用的小RNA分子。最近已经发现了许多病毒编码miRNAs,这表明病毒也利用这一重要的基因调控模式。尽管大多数病毒编码miRNAs的功能还不知道,但是目前已经发现一些病毒miRNAs参与了CTL逃避、潜伏感染介导和凋亡抑制等过程。揭示病毒miRNA(viralmiRNA,vmiRNA)在致病过程中的作用不仅有助于开发有效的抗病毒疗法,而且还能为开发抗病毒药物提供新的分子靶标。因此,就vmiRNAs的最新研究进展作一综述。

沉默病毒编码的miRNA——新型抗病毒治疗法研究进展

miRNA是一类在转录后水平调节基因表达的非编码RNA。病毒编码的miRNA在调控病毒基因自身表达及病毒与宿主相互作用方面起着重要作用,这一类miRNA有助于提高病毒的致病性。因此,通过使用与病毒miRNA互补的单链核苷酸即抗miRNA寡核苷酸(anti-miRNA oligonucleotides,AMOs)来抑制病毒miRNA的表达,从而沉默其功能达到抑制病毒复制的效果,这可能成为一种治疗病毒性感染的新方法。文章描述了研究较深入的病毒miRNA与其功能及AMOs的修饰方式,并讨论了AMOs应用的可能性。

鸡马立克氏病病毒编码的miRNA体内表达特征分析

最新研究发现,鸡马立克氏病病毒(MDV)基因组编码的miRNAs在肿瘤发生发展中发挥了重要的调控作用。为阐明强弱毒株编码的miRNA差异表达与病毒复制的关系,本研究采用SYBR Green荧光定量PCR方法检测了MDV CVI988疫苗株和MDV GA强毒株编码的M4-5P、M8-3P和M12-3P 3种miRNAs在肝脏和胸腺中的动态表达特征。结果表明,强弱毒株编码的这3种miRNAs在病毒感染过程中具有明显的差异性,其中GA株编码的miRNAs表达量高于CVI988株,这是由于强弱毒株在体内的复制滴度差异造成的,表明在感染前期miRNAs的表达量与病毒载量有关。该研究为进一步研究miRNAs的功能提供了实验依据。

海洋病毒编码的miRNA研究取得突破进展

中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室（依托于南海海洋研究所）秦启伟研究员领导的团队，在海洋病毒编码的miRNA研究方面取得突破性进展。团队成员闫阳博士等首次鉴定并验证了一种新的海洋病毒——石斑鱼虹彩病毒，该病毒能够编码功能性miRNA。

病毒编码miRNA与宿主免疫

MicroRNA（miRNA）是一类不编码的,长度为19～25nt的小RNA分子,通过与靶基因形成完全或者不完全互补的双链来抑制靶基因的翻译或者降解靶蛋白,也可通过调控促进蛋白表达.MiRNA首次于1993年由Ambros及其同事在模式生物线虫中发现[1],通过基因组研究,证实miRNA为一种具有发卡结构的小RNA,通过与其靶标转录本3‘UTR结合抑制靶标的转录后翻译[2].本来miRNA被认为只在线虫特异性存在,后来证实这些线虫miRNA在其他的多细胞生物比如人体内保守存在[3].

人巨细胞病毒编码miRNA功能及其作用机制

人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)是疱疹病毒β亚科中的代表成员之一,是一种具有囊膜包裹的DNA双链病毒,对免疫耐受群体和先天性感染的婴幼儿具有很高的发病率。HCMV具有潜伏感染和裂解感染两种感染状态。这两种感染过程中均有不同的miRNA表达模式。这些miRNA不仅参与胞内宿主或病毒自身基因表达调控与病毒复制,也能调节胞内物质的转运和病毒感染状态的转变等过程。本文就HCMV编码的miRNA,其生物合成机制和生物学功能进行简要综述,为深入研究其生物功能和作用机制奠定基础。

柞蚕核型多角体病毒基因组编码的VmiRNA筛选及功能分析

[目的]VmiRNA不仅可以控制自身基因,还可调节宿主的稳定表达,研究VmiRNA的功能有助于从分子水平说明核型多角体病毒与柞蚕的寄生关系,从而改进对病毒的防控措施。[方法]利用生物信息学及实时定量PCR等分子生物学相关技术,对柞蚕核型多角体病毒编码的miRNA及其作用的靶标基因进行研究。[结果]经预测和筛选得到了Ap NPV编码的miRNA MD217,与其有关的宿主靶基因14种,主要参与细胞组成、生化过程以及分子功能等途径,涉及到生物体细胞内一些催化、免疫反应等过程;实时定量PCR结果表明,MD217在病毒感染后上调表达,脂肪体组织内的靶基因MAPKK7表达水平与MD217的表达呈正相关。[结论]miRNA MD217在病毒感染后诱导表达,推测很可能降低了宿主免疫系统的防御能力,并同时影响靶基因MAPKK7的功能表达,从而避免了在免疫应答过程中的免疫清除。

EBV编码miRNAs在病毒感染和肿瘤发生中的功能和意义

EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是一种172 kb大小的线性双链DNA病毒,与鼻咽癌、淋巴瘤、胃癌等恶性肿瘤的发生密切相关. EBV编码的微小RNAs (miRNAs)可以调节病毒和宿主细胞基因的表达,并且在癌症发生发展中起着多种作用.本文综述了EBV编码的miRNAs (EBV-encoded miRNA,EBV miRNAs)在病毒感染和肿瘤发生、侵袭转移、抗凋亡、信号通路等方面的生物学功能,以及对于EBV相关肿瘤诊断标志物的潜在意义. EB病毒编码的miRNAs也可能成为进一步研究EBV相关肿瘤治疗的一个候选靶点.

柞蚕核型多角体病毒基因组编码VmiRNA的预测与功能分析

柞蚕核型多角体病毒（ApNPV）是危害柞蚕的主要病原物之一。病毒microRNAs（VmiRNA）是由病毒基因组编码的小RNA分子，在病毒繁殖及与宿主的相互作用中发挥作用。采用高通量测序Solexa技术测定ApNPV感染柞蚕后的VmiRNA，并通过vMir软件预测ApNPV基因组可能编码的VmiRNA前体序列。在预测得到的16条前体序列中，有13条能够从病毒感染的柞蚕蛹脂肪体中扩增出条带，并有10条能在病毒基因组中找到同源序列。在ApNPV MicroRNA Solexa测序数据库中搜索到与这10条前体VmiRNAs相匹配的序列，用RT-PCR方法证明有9条能扩增出大小相应的片段，确定其为病毒基因组编码的VmiRNA的成熟序列。利用靶基因在线预测程序RNAhybrid预测到这些VmiRNA作用的135个可能的靶基因，其中有与免疫应答过程相关的基因36个，与免疫系统进程相关的基因19个，与免疫调节相关的基因8个，与免疫系统发育相关的基因9个。推测这些ApNPV基因组编码的VmiRNA在病毒与宿主之间的相互作用中扮演重要角色。

乙肝病毒编码miRNA的预测及鉴定

为探究乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是否能够编码microRNA(miRNA),与宿主mRNA靶向结合来参与病毒感染的调控机制,实验通过Vir-Mir数据库预测乙肝病毒编码的pre-miRNA,并结合miRNA测序和实时荧光定量PCR方法验证成熟体miRNA。结果显示:乙肝病毒DNA阳性的肝癌血清样本中存在六条premiRNA,并成功验证其中一条成熟体命名为hbv-miR-15467,为肝病治疗提供新的思路。

长链非编码RNA MSTRG.15296.5在流感病毒感染中的作用

旨在分析H1N1亚型流感病毒A/WSN/1934(WSN)感染A549细胞后差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)MSTRG.15296.5作用,为阐明流感病毒致病相关lncRNA的功能及机制提供基础。利用实时荧光定量PCR验证MSTRG.15296.5的表达;通过空斑试验确定MSTRG.15296.5对病毒复制的影响;检测天然免疫相关基因的表达并对MSTRG.15296.5潜在靶基因进行分析。结果:MSTRG.15296.5对WSN的感染具有促进作用,能够下调多个干扰素刺激基因(ISGs)的表达。综上,MSTRG.15296.5通过抑制ISGs介导的天然免疫信号通路促进流感病毒复制,为宿主和病毒相互作用提供了一定理论依据,为后续防控流感病毒感染提供了新思路。

非编码RNA与人巨细胞病毒潜伏感染关系的研究进展

人巨细胞病毒(HCMV)是一种高宿主特异性疱疹病毒,其感染率高、潜伏感染激活后的致病性强。由于目前尚无针对病毒潜伏感染的监测手段,导致HCMV临床诊断困难。近年来有研究报道非编码RNA在疱疹病毒的潜伏感染过程中发挥重要作用,提示可以将HCMV感染相关的特异性非编码RNA应用于病毒潜伏感染期的诊断和监测。本文就与HCMV潜伏感染相关的非编码RNA调控机制作简要综述,进一步阐明非编码RNA与HCMV潜伏感染的关系。

非编码RNA在传染性法氏囊病病毒感染中的研究进展

传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“战役”似乎永不停息。因此,迫切需要制定一种更全面和更有效的策略来控制该疾病,而深入了解IBDV与宿主之间的相互作用,将有助于开发新型疫苗。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNAs)是一类丰富的不编码蛋白质的RNA分子,其中包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)和环状RNA(circular RNA,circRNAs)。近年来,研究发现ncRNAs广泛参与IBDV与宿主的相互作用过程,在IBDV感染中发挥重要的调控作用。本文阐述了宿主miRNAs、lncRNAs和circRNAs在IBDV感染中的作用,以期为IBDV的感染与致病机制研究提供理论参考和新思路。

猪圆环病毒2型诱发肠炎与非编码RNA的研究

本文综述了PCV 2诱发肠炎的研究现状,阐述了miRNA、circRNA和lncRNA等作用机制及在炎症性疾病中的作用,进一步介绍了PCV 2感染对非编码RNA表达影响的相关研究,以期为探索PCV 2相关性肠炎的发病机制提供思路。

疱疹病毒编码的miRNA与病毒潜伏

MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22核苷酸的非编码小RNA,能够在转录后水平上对基因的表达进行调节,进而影响细胞活动。病毒依赖宿主细胞进行复制。宿主可以通过免疫系统抵御病毒的入侵,病毒会发展不同的策略用于逃避宿主的免疫。目前,一些病毒已经被证明可以编码miRNA来重塑细胞环境。疱疹病毒是一类双链DNA病毒,该类病毒能够在宿主体内保持长久的潜伏状态。疱疹病毒家族的很多成员都能够表达miRNA。越来越多实验结果表明,疱疹病毒的miRNA对于调节病毒潜伏以及抑制宿主的抗病毒免疫反应方面发挥着重要的作用。该文讨论了疱疹病毒所编码的miRNA的产生过程和功能,希望有助于了解疱疹病毒的潜伏感染以及病毒与宿主的相互作用。

亨尼帕病毒编码蛋白的特征及致病机制

亨尼帕病毒(Henipavirus,HNV)是一类重要的新发人兽共患病原,经接触、口鼻传播感染可引发呼吸、神经系统疾病,死亡率高达75%。HNV属于副黏病毒科单股负链RNA包膜病毒,随着环境变化,新的亚型不断涌现,传播范围逐渐扩大,严重威胁全球公共卫生安全、经济发展与社会稳定。然而,其致病机制尚不清楚,预防疫苗及治疗药物也未上市,引起WHO高度关注,HNV疫苗与药物研发列入需要紧急研发蓝图清单。本文通过对HNV的病原学特征、编码蛋白的结构和功能、致病机制进行总结,为研制有效干预HNV感染的药物和疫苗提供思路。

血清长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8与微小RNA-21水平在高危型人乳头瘤病毒阳性患者中的表达及对宫颈癌的诊断价值

目的探析血清长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8(lncRNA SNHG8)、微小RNA-21(miR-21)在高危型人乳头瘤病毒(HPV)阳性患者对宫颈癌的诊断价值及经扶正清毒颗粒治疗后的表达变化。方法回顾性分析2021年1月至2022年11月枣庄市妇幼保健院收治的160例高危型HPV阳性患者病历资料,收集患者临床资料,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测血清lncRNA SNHG8、miR-21表达水平。所有患者均接受扶正清毒颗粒治疗,停药6月后随访,根据预后结局分为宫颈癌组(34例)、非宫颈癌组(126例)。对比高危型HPV阳性患者治疗前后血清lncRNA SNHG8、miR-21水平和不同预后结局高危型HPV阳性患者临床特征;多因素logistic分析高危型HPV阳性患者治疗后发生宫颈癌的独立影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA SNHG8、miR-21对高危型HPV阳性患者发生宫颈癌的预测价值。结果治疗后高危型HPV阳性患者血清lncRNA SNHG8、miR-21水平均低于治疗前(P<0.05)。对比不同预后结局患者高危型HPV阳性患者的绝经情况、分娩史、HPV分型资料,差异无统计学意义(P>0.05);而年龄、血清lncRNA SNHG8、miR-21表达,差异有统计学意义(P<0.05)。logistic回归分析结果显示年龄、血清lncRNA SNHG8、miR-21均为高危型HPV阳性患者治疗后发生宫颈癌的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线结果显示,血清lncRNA SNHG8、miR-21联合预测高危型HPV阳性患者发生宫颈癌的曲线下面积为0.847,高于单一生物标志物(lncRNA SNHG8、miR-21),P<0.05,其灵敏度、特异度分别为83.52%、86.41%。结论血清lncRNA SNHG8、miR-21为高危型HPV阳性患者宫颈癌独立影响因素,可用于高危型HPV阳性患者疗效及宫颈癌发病风险的评估,且联合应用效能更高。

人乳头瘤病毒16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA表达水平及其与乳腺癌分子分型和预后关系

目的 分析人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA(NF-κB interacting long non-coding RNA,NKILA)表达情况及其与乳腺癌分子分型、预后的相关性。方法 选取2016年1月至2018年1月南通大学附属海安医院收治的334例乳腺癌患者(观察组)和50例乳腺良性疾病患者(对照组)作为研究对象,对观察组患者肿瘤组织、癌旁组织和对照组患者病灶组织标本进行NKILA表达检测,并检测血清指标水平。分析两组NKILA表达情况与血清学指标的相关性,比较不同HPV分型感染情况、不同分子分型、不同预后患者病灶NKILA表达差异。结果 观察组患者肿瘤组织NKILA相对表达量显著低于癌旁组织(P <0.05),癌旁组织NKILA相对表达量显著低于对照组(P <0.05)。HPV 16/18型感染组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著低于非HPV16/18型感染组(均P <0.05)。Luminal A型组、Luminal B型组患者肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著高于人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor-2,HER-2)过表达型组(均P <0.05),HER-2过表达型组肿瘤组织NKILA相对表达量显著高于三阴性组(P <0.05)。复发转移组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均低于未复发转移组(均P <0.05)。NKILA低表达组3年无复发转移率显著低于NKILA高表达组[24.7%(36/146)∶40.0%(58/145),P <0.05]。结论 相比乳腺癌旁组织和良性疾病病灶,乳腺癌患者病灶NKILA表达下降,且HPV 16/18型感染者、三阴性乳腺癌者和术后复发转移者病灶NKILA表达下降更为明显,NKILA低表达与患者术后复发转移相关。

乙型肝炎病毒基因组S区编码产物的检测及临床意义

为了进一步明确 ＨＢＶ基因组 Ｓ区编码产物对乙型病毒性肝炎诊断的临床价值，用双抗体夹心 ＥＬＩＳＡ法检测 ９０份乙型病毒性肝炎患者血清标本ＨＢｓＡｇ·ＰＨＳＡ－Ｒｅ、Ｐｒｅ－Ｓ１和 Ｐｒｅ－Ｓ２，并与 ＨＢＶＭ及 ＨＢＶＤＮＡ ＰＣＲ进行对比分析。结果以抗 ＨＢｃ、ＨＢｓＡｇ·ＰＨＳＡ－Ｒｅ、ＨＢＶＤＮＡ（ＰＣＲ）及 Ｐｒｅ－Ｓ２的阳性检出率为最高，分别为８７．８％、７３．３％、７２．２％和６４．４％，以ＨＢＶＤＮＡ作为ＨＢＶ感染的金标准，无显著性差异（Ｐ＞０．０５）；其中ＨＢｓＡｇ·ＰＨＳＡ－Ｒｅ与 ＨＢＶＤＮＡ和ＨＢｅＡｇ的符合率最高，分别为 ７６．７ ％和 ７４．７ ％；ＭＢｓＡｇ·ＰＨＳＡ－Ｒｅ与 ＨＢＶＤＮＡ具有高度相关性。ＨＢｓＡｇ·ＰＨＳＡ－Ｒｅ做为早期诊断ＨＢＶ感染及判断是否具有传染性方面，是一项非常重要的血清学指标，Ｐｒｅ－Ｓ２也可作为ＨＢＶ复制活跃的标志之一，用于急慢性肝炎的预后判断．