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不同pH对瘤胃细菌数量和菌群结构的影响
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作者 詹彦波 张丽 +8 位作者 瞿明仁 邱清华 李川 张阳 张健 赵向辉 李艳娇 欧阳克蕙 汤小恩 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期184-195,共12页
【目的】试验旨在研究瘤胃不同pH下瘤胃酸中毒相关细菌数量和瘤胃细菌菌群结构的变化。【方法】选取5头干奶期荷斯坦奶牛作为瘤胃液供体,调节瘤胃液pH分别为6.5、5.8、5.5、5.2和5.0。培养3 h后,采用qPCR技术测定瘤胃酸中毒相关细菌数量... 【目的】试验旨在研究瘤胃不同pH下瘤胃酸中毒相关细菌数量和瘤胃细菌菌群结构的变化。【方法】选取5头干奶期荷斯坦奶牛作为瘤胃液供体,调节瘤胃液pH分别为6.5、5.8、5.5、5.2和5.0。培养3 h后,采用qPCR技术测定瘤胃酸中毒相关细菌数量,采用16S rDNA高通量测序技术研究瘤胃细菌菌群结构的变化。【结果】(1)瘤胃pH对白色瘤胃球菌(Ruminococcus ablus)的相对数量没有影响(P>0.05),但显著影响了乳酸产生菌和乳酸利用菌的相对数量(P<0.05)。其中牛链球菌(Streptococcus bovis)相对数量随着pH的下降而升高,在pH 5.0处极显著高于其余各组(P<0.05);埃氏巨型球菌(Megasphaeraelsdenii)、反刍兽新月单胞菌(Selenomonas ruminantium)及乳酸杆菌(Lactobacillus species)随pH下降呈现先升高后下降的趋势,pH分别在pH 5.5或pH 5.2处达到最大值(P<0.05);(2)α多样性结果显示,瘤胃细菌数量和菌群的丰富度及多样性呈现随瘤胃pH下降先升高后下降的趋势,其中Chao1指数在pH 5.5处,Observed species和Shannon指数在pH 5.2处最高(P<0.05)。β多样性结果显示pH 6.5、pH 5.8处理组与pH 5.2、pH 5.0处理组的菌群构成有明显差异,pH 5.5处理组样本与其他4组样本距离较远,其菌群构成与其他4组具有差异;(3)在菌群组成上,瘤胃内主要菌门和属的菌群丰度随pH的降低也多有改变。pH 5.2、pH 5.0处理组和pH 6.5、pH 5.8处理组菌群结构有显著差异(P<0.05)。pH 6.5组与pH 5.8组的菌群组成差异不大(P>0.05),仅普雷沃氏菌科UGG-003菌属(Prevotellaceae UCG-003)和琥珀酸弧菌科UGG 002菌属(Succinivibrionaceae UCG 002)有差异;pH 5.0处理组与pH 5.2处理组的菌群组成较一致(P>0.05),仅在螺旋体门(Spirochaetota)、放线菌门(Actinobacteriota)、瘤胃菌属(Ruminococcus)和解琥珀菌属(Succiniclasticum)有差异(P<0.05);而pH 5.5处理组的菌群构成与其他4组有显著差异(P<0.05)。【结论】环境pH改变是瘤胃细菌遭受的一种严重干扰,会引起瘤胃内乳酸产生菌和乳酸利用菌的相对数量显著改变。瘤胃细菌数量、菌群丰富度和多样性也随瘤胃pH的下降表现出先升高后降低的趋势,其变化规律符合生态学中的“中度干扰假说”。 展开更多
关键词 低PH 瘤胃酸中毒 瘤胃细菌 细菌数量 菌群结构 “中度干扰假说”
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应用16S rRNA测序技术分析冷暖季节放牧牦牛瘤胃细菌区系特征的研究 被引量:1
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作者 崔占鸿 杨得玉 焦洋 《饲料研究》 CAS 北大核心 2023年第3期1-6,共6页
试验旨在探究高海拔地区冷暖放牧季节的生长牦牛与成年牦牛瘤胃细菌区系组成及季节变化特征。采用随机区组设计,选取健康、体重相近的1.5岁公牦牛和3.5岁公牦牛各5头,根据牦牛年龄和采样时间不同分为4组,分别为BO组(暖季采集的1.5岁公... 试验旨在探究高海拔地区冷暖放牧季节的生长牦牛与成年牦牛瘤胃细菌区系组成及季节变化特征。采用随机区组设计,选取健康、体重相近的1.5岁公牦牛和3.5岁公牦牛各5头,根据牦牛年龄和采样时间不同分为4组,分别为BO组(暖季采集的1.5岁公牦牛瘤胃液)、BT组(冷季采集的1.5岁公牦牛瘤胃液)、DO组(暖季采集的3.5岁公牦牛瘤胃液)和DT组(冷季采集的3.5岁公牦牛瘤胃液)。结果表明,在门水平上,1.5岁和3.5岁公牦牛瘤胃中拟杆菌门、软壁菌门丰度在冷季明显高于暖季,而厚壁菌门和互养菌门的丰度在暖季明显高于冷季。在属水平上,1.5岁和3.5岁公牦牛瘤胃中产酸糖酵菌属、Papillibacter的菌属丰度在冷季明显高于暖季,而未分类-普雷沃氏菌属和欧氏菌属丰度明显降低。功能预测中显示,在冷季时期1.5岁和3.5岁公牦牛瘤胃微生物区系中的聚糖生物合成与代谢功能、酶家族和脂质代谢和运输和分解代谢功能等相关基因的表达量明显高于暖季,而翻译功能相关的基因表达量明显低于暖季。研究表明,暖季放牧牦牛瘤胃水解产物降解菌群在种类、数量、能量代谢等方面均高于冷季,表明暖季放牧更有利于牦牛瘤胃细菌区系的生长发育。 展开更多
关键词 放牧牦牛 冷暖季节 瘤胃细菌 16S rRNA测序
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不同万寿菊粕水平对绵羊瘤胃细菌多样性的影响 被引量:1
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作者 陈颜旭 古再丽努尔·艾麦提 +1 位作者 郭同军 郭雪峰 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期4453-4464,共12页
本试验为了探索不同万寿菊粕水平对绵羊瘤胃细菌多样性的影响,采用单因素完全随机试验设计,选取体重为(28.30±3.95)kg的杜泊羊×湖羊杂交F1代公羊50只,随机分为5个组,每组10只。各组饲喂不同饲粮,对照组(CK组)饲粮不添加万寿菊... 本试验为了探索不同万寿菊粕水平对绵羊瘤胃细菌多样性的影响,采用单因素完全随机试验设计,选取体重为(28.30±3.95)kg的杜泊羊×湖羊杂交F1代公羊50只,随机分为5个组,每组10只。各组饲喂不同饲粮,对照组(CK组)饲粮不添加万寿菊粕,A组、B组、C组、D组饲粮中分别添加5%、15%、25%和35%万寿菊粕。试验期40 d,其中预试期10 d,正试期30 d。在第31天,从各组中随机选取4只公羊,经口腔采集瘤胃液,利用高通量测序技术进行瘤胃细菌多样性分析。结果表明:5组样品共获得1068个操作分类单元(OTU),其中共有OTU 296个;D组ACE指数极显著低于CK组(P<0.01),C组显著低于CK组(P<0.05)。D组Chao1指数极显著低于CK组(P<0.01),C组显著低于CK组(P<0.05)。D组Shannon指数极显著低于CK组(P<0.01)。各组在门水平的优势菌群为拟杆菌门和厚壁菌门。D组拟杆菌门相对丰度极显著高于CK组(P<0.01),C组显著高于CK组(P<0.05);C组和D组变形菌门相对丰度极显著低于CK组(P<0.01);B组、C组和D组疣微菌门相对丰度极显著低于CK组(P<0.01),D组显著低于A组(P<0.05);C组和D组蓝藻菌门的相对丰度极显著低于CK组(P<0.01),D组显著低于A组(P<0.05);C组和D组浮霉菌门的相对丰度极显著高于CK组(P<0.01),C组显著高于A组和B组(P<0.05),B组显著高于CK组(P<0.05)。属水平上的优势菌为普雷沃氏菌属、拟杆菌属、解琥珀酸菌属和奎因氏菌属。D组普雷沃氏菌属相对丰度极显著高于CK组(P<0.01);D组解琥珀杆菌属相对丰度极显著低于CK组(P<0.01),A组显著高于CK组(P<0.05),B组和C组极显著低于A组(P<0.01),显著低于CK组(P<0.05);C组和D组琥珀酸弧菌属相对丰度显著低于CK组(P<0.05)。D组厌氧弧菌属相对丰度极显著低于CK组(P<0.01)。综上所述,在绵羊饲粮中添加万寿菊粕水平为5%~15%时,不会影响绵羊瘤胃菌群丰富度和多样性;当添加万寿菊粕水平在25%~35%时,会降低绵羊瘤胃菌群丰富度和多样性,改变绵羊的菌群结构,增加拟杆菌门和普雷沃氏菌属的相对丰度,且普雷沃氏菌属和密螺旋体属相对丰度与万寿菊粕水平有较强的正相关性。 展开更多
关键词 万寿菊粕 绵羊 瘤胃细菌 菌群多样性
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日粮物理有效中性洗涤纤维对奶牛瘤胃细菌组成的影响 被引量:1
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作者 赵聪聪 王砀砀 +3 位作者 王菁 李永 姚军虎 曹阳春 《家畜生态学报》 北大核心 2023年第1期56-61,共6页
研究日粮物理有效中性洗涤纤维(peNDF)含量对奶牛瘤胃细菌组成的影响,旨在为奶牛日粮配制提供依据。选取12头体重相近的2胎次荷斯坦奶牛(产奶量为33.0±1.7 kg/d、泌乳天数131±8 d),随机分为3组,分别饲喂日粮组成相同但peNDF_(... 研究日粮物理有效中性洗涤纤维(peNDF)含量对奶牛瘤胃细菌组成的影响,旨在为奶牛日粮配制提供依据。选取12头体重相近的2胎次荷斯坦奶牛(产奶量为33.0±1.7 kg/d、泌乳天数131±8 d),随机分为3组,分别饲喂日粮组成相同但peNDF_(8.0)水平为高(11.25%)、中(10.56%)、低(9.02%)的全混合日粮。试验期为25 d,其中前21 d为适应期,后4 d为采样期。利用高通量测序技术测定3种日粮条件下瘤胃细菌的多样性。结果表明,低peNDF_(8.0)组ACE指数有低于其它两组的趋势(P<0.10)。在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,在属水平上,普雷沃氏菌(Prevotella)为优势菌属。BS11科在高peNDF_(8.0)组和中peNDF_(8.0)组显著高于低peNDF_(8.0)组(P<0.05)。综上所述,高精料日粮情况下,奶牛日粮中peNDF_(8.0)水平从9.02%上升至11.25%对瘤胃细菌群落的影响较小。 展开更多
关键词 物理有效中性洗涤纤维 奶牛 瘤胃细菌组成
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泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃细菌群落组成与多样性变化 被引量:1
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作者 马晓娇 薛茗元 +1 位作者 孙会增 刘建新 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期578-590,共13页
本研究旨在探究泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃细菌群落组成及其多样性的变化。共设置2个试验:试验1,选取20头泌乳中期健康高产荷斯坦奶牛,饲喂相同饲粮,持续8周,分别在第0、4、7周的第7天采集瘤胃内容物;试验2,选取30头泌乳中期健康高产荷斯... 本研究旨在探究泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃细菌群落组成及其多样性的变化。共设置2个试验:试验1,选取20头泌乳中期健康高产荷斯坦奶牛,饲喂相同饲粮,持续8周,分别在第0、4、7周的第7天采集瘤胃内容物;试验2,选取30头泌乳中期健康高产荷斯坦奶牛,在基础饲粮的基础上补充20 g/d瘤胃保护蛋氨酸,持续8周,分别在第0、8周的第7天采集瘤胃内容物。分析2个试验在不同时间点采集到的瘤胃内容物的细菌群落组成与多样性变化,以及功能稳定性差异。结果发现:2个试验中,瘤胃细菌的α多样性、β多样性、功能稳定性在不同时间点之间都不存在显著差异(P>0.05)。试验1在高丰度细菌的门和属水平上分别发现6个与1个差异细菌,分别是放线菌门、变形菌门、蓝菌门、绿弯菌门、互养菌门、纤维杆菌门与Lachnospiraceae_NK3A20_group;试验2在高丰度细菌的门和属水平上分别发现3个与1个差异细菌,分别为放线菌门、螺旋体门、迷踪菌门与unclassified_f_Lachnospiraceae。由此可见,在相同的饲粮条件下,泌乳中期荷斯坦奶牛瘤胃细菌组成随时间变化的程度有限,其多样性与功能稳定性均未发生显著改变;在基础饲粮基础上补充瘤胃保护蛋氨酸时,得到的结果相似。综上所述,本研究表明,处于泌乳中期荷斯坦奶牛的瘤胃微生物群落组成和功能相对稳定,在奶牛泌乳中期开展相关试验时,无需特别考虑瘤胃细菌会随泌乳阶段进程出现群落结构和功能的改变。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 泌乳中期 瘤胃细菌 微生物多样性 功能稳定性
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褐藻多酚提取物对奶牛瘤胃发酵性能及主要瘤胃细菌含量的影响 被引量:1
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作者 陈誉华 魏元浩 +1 位作者 吉慧敏 黄倩倩 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2343-2351,共9页
本文旨在探究添加褐藻多酚提取物对奶牛瘤胃体外发酵和主要瘤胃细菌含量的影响。以水稻(Oryza sativa L.)秸秆∶豆(Glycine max)粕=6∶4为发酵底物,试验共分9组,前4组在底物的基础上分别添加0,125,250,500μg·mL^(-1)褐藻多酚(Phlo... 本文旨在探究添加褐藻多酚提取物对奶牛瘤胃体外发酵和主要瘤胃细菌含量的影响。以水稻(Oryza sativa L.)秸秆∶豆(Glycine max)粕=6∶4为发酵底物,试验共分9组,前4组在底物的基础上分别添加0,125,250,500μg·mL^(-1)褐藻多酚(Phlorotannin,PT);后4组在前4组的基础上添加30 mg聚乙二醇(PEG)。结果表明:褐藻多酚提取物的添加能够显著降低瘤胃pH值和氨态氮浓度(P<0.05),促进瘤胃发酵类型的转变,显著提高了普雷沃氏菌和牛链球菌含量,降低瘤胃甲烷短杆菌的含量(P<0.05);对瘤胃发酵各项参数进行综合评定,无论是否添加PEG,125μg·mL^(-1)组的多项组合效应值(MFAEI)均最高。综上所述,日粮中添加褐藻多酚提取物为瘤胃发酵提供了一个更具酸性的环境,减少了瘤胃内蛋白质的分解,具有降低甲烷排放的潜能,且在本试验中褐藻多酚的最佳添加量为125μg·mL^(-1)。 展开更多
关键词 褐藻多酚 瘤胃发酵 干物质降解率 瘤胃细菌
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酵母培养物和活性酵母对湖羊血清生化指标、瘤胃发酵及瘤胃细菌结构与组成的影响
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作者 武奥林 蔡大亮 +4 位作者 彭清洁 周迪 谢绿绿 张彦 戴晋军 《中国饲料》 北大核心 2023年第19期211-219,共9页
为探究酵母培养物与活性酵母对湖羊瘤胃细菌结构与组成的影响,试验以72只湖羊作为试验动物,随机分为三组,对照组(基础日粮,CON)、酵母培养物A组(基础日粮+1%酵母培养物,YCA)、酵母培养物B组(基础日粮+1%酵母培养物+1.0×10^(9) CFU/... 为探究酵母培养物与活性酵母对湖羊瘤胃细菌结构与组成的影响,试验以72只湖羊作为试验动物,随机分为三组,对照组(基础日粮,CON)、酵母培养物A组(基础日粮+1%酵母培养物,YCA)、酵母培养物B组(基础日粮+1%酵母培养物+1.0×10^(9) CFU/g活性酵母,YCB),试验结束后每组随机选取6只羊,采集血液及瘤胃液,进行相关分析。结果表明:(1)YCB组湖羊瘤胃液戊酸比例极显著高于CON组和YCA组(P<0.01),氨态氮浓度显著高于CON组(P<0.05);(2)各组间血清生化指标无显著差异(P>0.05);(3)3组瘤胃液样品聚类后共得到1996个OTU,共享823个OTU,各组间α-多样性指数无显著差异(P>0.05);(4)各组测序数据量足够大,可以反映样品中绝大多数的微生物物种信息;(5)在门水平上,共注释到3个优势菌门(丰度>1%),包括拟杆菌门(Bacteroidota),厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),各组间差异不显著(P>0.05);(6)在属水平上,共注释到66个优势菌属(丰度>0.1%),YCA组和YCB组的解琥珀酸菌属(Succiniclasticum)相对丰度显著低于对照组(P<0.05);(7)普雷沃氏菌属相对丰度与血清总蛋白(R=-0.502,P≤0.05)、总胆固醇(R=-0.568,P≤0.05)、戊酸(R=-0.519,P≤0.05)浓度呈显著负相关,未分类的月形单细胞菌科与血清总蛋白(R=0.506,P≤0.05)浓度呈显著正相关,与血清谷丙转氨酶(R=0.604,P≤0.01)浓度呈极显著正相关,瘤胃球菌属与血清谷丙转氨酶(R=0.540,P≤0.05)呈显著正相关,未分类的拟杆菌科RF16群与血清总蛋白(R=-0.479,P≤0.05)呈显著负相关。研究表明,反刍动物日粮中添加酵母培养物和活性酵母,均会对瘤胃菌群产生影响,在添加1%酵母培养物的基础上添加活性酵母更有利于瘤胃发酵和细菌菌群的富集。 展开更多
关键词 酵母培养物 活性酵母 瘤胃发酵参数 血清生化指标 瘤胃细菌
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应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究 被引量:22
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作者 石鹏君 柏映国 +6 位作者 袁铁铮 姚斌 范云六 周志刚 孟昆 伍宁丰 刁其玉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期285-289,共5页
采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有... 采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%~96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。 展开更多
关键词 DGGE 16S RDNA基因 编码RNA聚合酶β亚基(rpoB)基因 瘤胃细菌 遗传多样性
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应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对山羊瘤胃细菌多样性的研究 被引量:53
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作者 姚文 朱伟云 +3 位作者 韩正康 Antoon D L Akkermans Barbara Williams Seerp Tamminga 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期1374-1378,共5页
以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上... 以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%~55%);饲料中添加大豆黄酮一定程度上影响了瘤胃细菌的组成,DGGE 谱带变化程度分别为 1 号 36% 、2 号 46% 、3 号 30%。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有5个基因序列与基因数据库登录的相关序列的相似性大于97%,8个基因序列的相似性在90%~96%,余下的低于90%。相似性大于97%的5个克隆中,只有1个被鉴定为Prevotella sp .,其余 4 个都属于未被鉴定的瘤胃细菌。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 16SrDNA序列分析 山羊 瘤胃细菌 多样性
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藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态分析 被引量:13
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作者 淡瑞芳 龙瑞军 +2 位作者 张海涛 张欣 丁学智 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期798-802,共5页
本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6~V8可变区的... 本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6~V8可变区的扩增产物进行DGGE图谱分析、相似性分析和Shannon多样指数分析。结果表明:(1)秋季瘤胃细菌种群丰富度极显著(P<0.01)高于冬、春季节,显著(P<0.05)高于夏季,而其他3个季节之间差异不显著(P>0.05);(2)瘤胃细菌区系组成结构在春季和夏季相似性高于90%,在秋、冬季相似性低于70%,而春、夏季与秋、冬季之间的相似性低于60%;(3)夏季牧草中DE和CP含量极显著(P<0.01)高于其他季节,其瘤胃液pH极显著(P<0.01)低于其他季节,瘤胃细菌区系丰富度也相应降低;秋季牧草的DE和CP含量显著(P<0.05)高于春、冬季节,其瘤胃液pH范围为7.1~7.3,瘤胃细菌区系丰富度高于其他3个季节。由以上结果可以看出,不同季节瘤胃内优势菌群发生了改变,瘤胃细菌区系的季节变化与瘤胃pH、瘤胃内容物的物理特性、营养成分及其比例等有关。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 藏系绵羊 瘤胃细菌 季节动态分析
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基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构 被引量:12
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作者 陈芸 刘旗 +3 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期286-291,共6页
采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对... 采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰度为拟杆菌门的(占总序列数的40.87%),其次为厚壁菌门的(27.19%),样品F最高相对丰度为拟杆菌门的(47.12%),其次为变形菌门的(19.99%),再次为厚壁菌门的(18.05%),样品A厚壁菌门的相对丰度极显著高于样品F的(P<0.01);4)在属水平上,样品A与样品F的最高相对丰度均为普雷沃氏菌属的(样品A的为25.54%,样品F的为27.67%),样品A中月形单胞菌属、丁酸弧菌属、瘤胃球菌属、琥珀酸弧菌属、琥珀酸菌属等的相对丰度显著高于样品F的(P<0.05)。试验结果表明,川中黑山羊瘤胃中相对丰度最高的菌门为拟杆菌门,相对丰度最高的菌属为普雷沃氏菌属,且两瘤胃样品中部分细菌相对丰度间的差异显著。 展开更多
关键词 川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 MiSeq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属
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藏系绵羊瘤胃细菌数量及其放牧地牧草养分随季节变化的研究 被引量:16
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作者 淡瑞芳 张海涛 +2 位作者 龙瑞军 丁学智 张欣5 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第1期100-104,共5页
试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他... 试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他3个季节,分别是春季、秋季、冬季细菌数量的5.56,2.35和2.49倍;秋、冬季是春季细菌数量的2.38和2.23倍;而秋和冬季瘤胃细菌的数量差异不显著(P>0.05)。2)夏季藏系绵羊采食量分别为春季、冬季和秋季的1.98,1.61和1.80倍,饲料中的纤维性物质含量增高,采食量也随着降低,瘤胃细菌的数量也相应降低;3)实时定量PCR技术能准确的反映出放牧藏系绵羊瘤胃细菌数量随季节的动态变化。 展开更多
关键词 实时定量PCR 藏系绵羊 季节 瘤胃细菌数量
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大额牛瘤胃细菌16S rRNA基因序列分析 被引量:10
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作者 毛华明 马松成 +2 位作者 陈静 邓卫东 和天宝 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3769-3775,共7页
【目的】研究大额牛(Bos frontalis)瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为揭示大额牛瘤胃细菌组成的多样性以及开发这一珍稀生物资源提供分子生物学依据。【方法】采用细菌通用引物F27和R1492对目标基因进行PCR扩增,克隆、测序后利用Neighbor-jo... 【目的】研究大额牛(Bos frontalis)瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为揭示大额牛瘤胃细菌组成的多样性以及开发这一珍稀生物资源提供分子生物学依据。【方法】采用细菌通用引物F27和R1492对目标基因进行PCR扩增,克隆、测序后利用Neighbor-joining方法构建系统进化树。【结果】共获得147个16S rRNA基因序列,在GenBank登录号为DQ673466~DQ673612。按照97%的相似性标准,这些序列被分为86个操作分类单元。有16个序列与已培养菌的序列相似性≥97%,占总序列的10.9%;另有22个序列与已培养菌的序列相似性为90%~97%,占总序列的15%;剩余109个序列为未培养、鉴定菌,所占比例高达74.1%。系统进化分析显示,大额牛瘤胃细菌主要分布于低G+C含量细菌门(57.1%)和噬纤维菌/屈扰杆菌/拟杆菌门(42.2%),仅有一个序列位于螺旋体门。【结论】本试验获得了大额牛瘤胃细菌16S rRNA基因序列,为进一步研究大额牛瘤胃微生态系统组成及其与饲料消化之间的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 大额牛 瘤胃细菌 16SrRNA基因序列 系统进化分析
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不同NFC/NDF比日粮对奶山羊瘤胃细菌及瘤胃和血浆中内毒素及组胺含量的影响 被引量:6
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作者 郭鹏 刘大程 +2 位作者 赵培厅 高民 胡红莲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期96-103,共8页
旨在观察不同NFC/NDF比日粮对奶山羊瘤胃细菌及瘤胃和血浆中内毒素及组胺含量的影响。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关中奶山羊为试验动物,试验分四期进行,每期10d,依次饲喂NFC/NDF比分别为1.02(Ⅰ期)、1.24(Ⅱ期)、1.63(Ⅲ期)、... 旨在观察不同NFC/NDF比日粮对奶山羊瘤胃细菌及瘤胃和血浆中内毒素及组胺含量的影响。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关中奶山羊为试验动物,试验分四期进行,每期10d,依次饲喂NFC/NDF比分别为1.02(Ⅰ期)、1.24(Ⅱ期)、1.63(Ⅲ期)、2.58(Ⅳ期)的4种日粮,以逐渐增加日粮精料的方式诱导奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(SARA)。分别利用pH动态监测记录系统和滚管培养法测定瘤胃pH、瘤胃细菌总数、淀粉分解菌及坏死梭形杆菌的浓度;以鲎试验试剂法和荧光分光光度法测定内毒素和组胺含量。结果表明:随着日粮NFC/NDF比的增大,瘤胃pH显著降低(P<0.05),并且瘤胃pH下降速率和下降幅度也随之加快;日粮NFC/NDF比为2.58时,瘤胃内组胺和内毒素的浓度明显增加(P<0.05),坏死梭形杆菌和淀粉分解菌的数量也显著升高(P<0.01)。内毒素、组胺和坏死梭形杆菌三者浓度的异常增加对SARA发生和发展起重要作用。 展开更多
关键词 亚急性瘤胃酸中毒 瘤胃pH 瘤胃细菌 内毒素 组胺
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PCR-DGGE技术研究青贮桑叶对肉牛瘤胃细菌区系的影响 被引量:12
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作者 崔振亮 孟庆翔 +2 位作者 吴浩 周振明 任丽萍 《饲料研究》 CAS 北大核心 2011年第1期1-4,共4页
研究饲料中添加青贮桑叶对肉牛瘤胃细菌区系的影响。选用18月龄,体质量约350kg的各4头本地黄牛公牛和利木赞×福州牛杂交母牛,每种牛分别饲喂青贮桑叶比例为0(对照组)、7.5%、15%和22.5%的日粮,饲养14周后屠宰取样,提取样品总DNA,... 研究饲料中添加青贮桑叶对肉牛瘤胃细菌区系的影响。选用18月龄,体质量约350kg的各4头本地黄牛公牛和利木赞×福州牛杂交母牛,每种牛分别饲喂青贮桑叶比例为0(对照组)、7.5%、15%和22.5%的日粮,饲养14周后屠宰取样,提取样品总DNA,利用聚合酶链式反应和变性梯度凝胶电泳相结合的(PCR-DGGE)技术对瘤胃细菌区系进行相似性和多样性分析。结果表明:牛的品种影响瘤胃细菌区系结构及多样性;青贮桑叶添加水平影响瘤胃细菌区系结构,对细菌多样性的影响不显著。 展开更多
关键词 青贮桑叶 肉牛 瘤胃细菌区系 变性梯度凝胶电泳
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降解有毒的含羞草素和二羟基吡啶化合物的瘤胃细菌 被引量:11
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作者 谭蓓英 王旭明 汪儆 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第5期379-384,共6页
从采食银合欢不引起中毒症状的我国广西北海市涠洲岛的黄牛瘤胃中,分离出4株厌氧细菌.经高效液相色谱分析证实,菌株BR-1,BR-2,BR-5和BR-7能降解有毒的含羞草素(mimosine)、3-羟基-4(1氢)吡啶酮(3,4 DHP)和2,3-二羟基吡啶(2,3DHP).在宿... 从采食银合欢不引起中毒症状的我国广西北海市涠洲岛的黄牛瘤胃中,分离出4株厌氧细菌.经高效液相色谱分析证实,菌株BR-1,BR-2,BR-5和BR-7能降解有毒的含羞草素(mimosine)、3-羟基-4(1氢)吡啶酮(3,4 DHP)和2,3-二羟基吡啶(2,3DHP).在宿主体外进行纯菌和混菌液体培养,3天分别降解含羞草素44—59%,3,4DHP 30—47%和2,3DHP58—60%.经分类鉴定,确定为三个种:BR-1和BR-2很相似,为乳杆菌属(Lactobacillus),可能是一个新种.BR-5为牛链球菌(Streptococcus bovis)和BR-7为生孢梭菌(Clostridiumsporogenes).上述这些兼性和严格厌氧的革兰氏阳性细菌对含羞草素和二羟基吡啶类毒素具有降解活性,这是以前没有报道过的.由于这些脱毒细菌栖居于瘤胃的微生态系统中,从而保护宿主动物免受银合欢的毒害. 展开更多
关键词 瘤胃细菌 含羞草素 二羟基吡啶
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瘤胃细菌、原虫和真菌降解植物细胞壁的相对贡献及其互作 被引量:26
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作者 高巍 孟庆翔 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期98-104,共7页
采用体外产气量法 ,以球磨与未球磨玉米秸细胞壁为底物 ,对瘤胃微生物不同区系降解植物细胞壁的相对贡献和发酵特征进行了研究。用化学试剂和抗生素来分离瘤胃细菌、原虫和真菌 ,并设计下列微生物区系 :全瘤胃液 (WRF)、细菌 (B)、原虫 ... 采用体外产气量法 ,以球磨与未球磨玉米秸细胞壁为底物 ,对瘤胃微生物不同区系降解植物细胞壁的相对贡献和发酵特征进行了研究。用化学试剂和抗生素来分离瘤胃细菌、原虫和真菌 ,并设计下列微生物区系 :全瘤胃液 (WRF)、细菌 (B)、原虫 (P)、真菌 (F)、细菌 +原虫 (B +P)、细菌 +真菌 (B +F)、原虫 +真菌 (P +F)和负对照(CON)。结果表明 ,细胞壁经球磨后可以显著提高瘤胃微生物的产气量和降解率 (P <0 .0 1) ,但不改变发酵类型 ;不同微生物区系的产气量和降解率具有极显著的差异 (P <0 .0 1) ,WRF的产气量和降解率最高 ,其次是混合培养(B +P、P +F、B +F) ,而单培养 (B、P、F)的最低 (P <0 .0 1)。结果说明植物细胞壁在瘤胃内的降解是在细菌、原虫和真菌的协同作用下完成的 ,对植物细胞壁的降解程度可能不是某一种或二种微生物所能及第的。B +P的产气量和降解率仅次于WRF ,表明瘤胃细菌和原虫在降解植物细胞壁过程中存在协同效应 ,对细胞壁降解的贡献率较大。另外 ,随着产气量和降解率的提高 ,发酵液的pH值降低、总VFA、氨态氮和甲烷气体的含量升高 ,进一步证明植物细胞壁的发酵程度提高了。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 原虫 真菌降解 植物细胞壁 相对贡献 互作效应 植物细胞壁 瘤胃降解
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瘤胃细菌生物合成共轭亚油酸的累积特性 被引量:4
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作者 刘晓华 李海星 +1 位作者 陈燕 曹郁生 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第17期254-257,共4页
为了解瘤胃细菌生物合成共轭亚油酸(CLA)的特性,通过毛细管电泳(CE)分析,发现瘤胃细菌生物合成CLA的主要异构体有c9,t11-CLA、t10,c12-CLA和t9,t11-CLA 3种。在厌氧和有氧条件下,瘤胃细菌均能合成CLA,且氧气有利于CLA的累积,随反应时间... 为了解瘤胃细菌生物合成共轭亚油酸(CLA)的特性,通过毛细管电泳(CE)分析,发现瘤胃细菌生物合成CLA的主要异构体有c9,t11-CLA、t10,c12-CLA和t9,t11-CLA 3种。在厌氧和有氧条件下,瘤胃细菌均能合成CLA,且氧气有利于CLA的累积,随反应时间的延长,CLA的量呈现先增加后减少的变化趋势。结果表明瘤胃细菌参与了反刍动物体内CLA异构体的生物合成与代谢,瘤胃细菌生物合成CLA异构体的特异性还有待更深入的研究。 展开更多
关键词 瘤胃细菌 生物转化 共轭亚油酸 异构体 毛细管电泳
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高精料日粮条件下酵母培养物对瘤胃细菌体外发酵的影响 被引量:7
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作者 刘相玉 毛胜勇 朱伟云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期199-204,共6页
本试验研究添加不同活性和不同浓度的酵母培养物在高精料日粮的发酵体系中对混合瘤胃细菌发酵的影响。采用二因子设计,进行体外厌氧发酵,发酵结束采集样品,测定乳酸、挥发性脂肪酸及酶活浓度。结果表明,发酵24 h后各处理pH均随着酵母培... 本试验研究添加不同活性和不同浓度的酵母培养物在高精料日粮的发酵体系中对混合瘤胃细菌发酵的影响。采用二因子设计,进行体外厌氧发酵,发酵结束采集样品,测定乳酸、挥发性脂肪酸及酶活浓度。结果表明,发酵24 h后各处理pH均随着酵母培养物添加量的增加而升高。活性组各处理乳酸浓度均显著低于灭活组(P<0.05),灭活组与活性组中各处理之间淀粉酶酶活均差异显著(P<0.05),且各处理均随着酵母培养物添加量的增加而逐渐降低。活性组中各处理乙丙比均显著低于灭活组,而TVFA浓度均显著高于灭活组(P<0.05),发酵系统中NH3.N浓度均随着酵母培养物添加量的增加而逐渐降低。结果提示,在高精料日粮条件下添加酵母培养物可改善瘤胃环境,改变瘤胃发酵类型。 展开更多
关键词 酵母培养物 瘤胃细菌 体外发酵 高精料
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体外共培养法研究瘤胃真菌对瘤胃细菌发酵的影响 被引量:4
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作者 毛胜勇 陈洁 +1 位作者 姚文 朱伟云 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期610-613,共4页
采用体外厌氧共培养技术,研究了山羊瘤胃真菌对瘤胃细菌发酵的影响。结果表明:在瘤胃真菌与瘤胃细菌共培养24 h内,瘤胃真菌对瘤胃细菌表现出一定的抑制作用,共培养组24 h时底物稻草表观干物质消失率(5.85%)、总挥发性脂肪酸浓度(28.21 m... 采用体外厌氧共培养技术,研究了山羊瘤胃真菌对瘤胃细菌发酵的影响。结果表明:在瘤胃真菌与瘤胃细菌共培养24 h内,瘤胃真菌对瘤胃细菌表现出一定的抑制作用,共培养组24 h时底物稻草表观干物质消失率(5.85%)、总挥发性脂肪酸浓度(28.21 mmol/L)及乙酸浓度(20.32 mmol/L)显著低于瘤胃细菌培养组(10.49%、32.66 mmol/L和24.39 mmol/L);而共培养组在48 h和72 h时稻草表观干物质消失率(24.37%、29.04%)均高于瘤胃细菌培养组(21.69%、26.41%);试验结果同时显示,经灭菌处理的瘤胃真菌发酵液可显著降低瘤胃细菌对稻草片段的降解活力。 展开更多
关键词 瘤胃真菌 瘤胃细菌 共培养
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