长链非编码RNA癌症易感候选因子19在肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)与恶性肿瘤已成为目前lncRNA研究领域最活跃的模块之一。癌症易感候选因子19(CASC19)是一种新发现的lncRNA,在多种肿瘤中发挥重要的调控作用,包括细胞增殖、迁移和侵袭以及细胞辐射耐受、疾病预后等。较高的CASC19水平与疾病的进展、预后及疗效等密切相关,可能是多种肿瘤的可靠生物标志物和潜在治疗靶点。因此,深入研究CASC19在不同肿瘤中的作用机制,可以为疾病的治疗提供新思路。

长链非编码RNA癌症易感性候选物2与印记基因H19在肝外胆管癌中差异表达的分析

目的探讨肝外胆管癌(ECC)中长链非编码RNA(lncRNA)癌症易感性候选物2(CASC2)和印记基因H19表达及其潜在的功能作用。方法收集ECC患者样本4例,基于高通量测序技术进行转录组测序,分析lncRNA CASC2和H19的表达模式,并基于生物信息学方法预测潜在功能。另取22例ECC组织样本和不同分化程度的胆管癌细胞株(RBE、QBC939、HuH-28、HuCCT1)进行验证,分别以癌旁组织和正常胆管上皮细胞(HIBEC)作为对照,应用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法分别检测癌组织、癌旁组织与细胞系中lncRNA CASC2和H19的表达水平。汇总患者临床指标并结合目标基因的差异表达进行相关性分析。结果4对ECC癌组织与癌旁组织中lncRNA CASC2和H19的表达差异有统计学意义(P均<0.05)。qRT-PCR结果显示,lncRNA CASC2在ECC癌组织中表达水平明显高于癌旁组织(t=1.262,P=0.025),而lncRNA H19在ECC癌组织中表达水平明显低于癌旁组织(t=1.285,P=0.005);细胞系QBC939(t=8.114,P=0.015)和HuH-28(t=9.202,P=0.012)中CASC2的表达水平显著高于对照组,而RBE(t=-10.244,P<0.001)、QBC939(t=-10.476,P<0.001)、HuH-28(t=-19.798,P<0.001)和HuCCT1(t=-16.193,P=0.004)中H19的表达水平均显著低于对照组。生物信息分析结果显示,CASC2主要参与代谢过程,而H19参与多细胞生物发展等过程,两者均与催化活性功能相关。相关性分析结果显示,lncRNA CASC2表达水平与病理中分化(χ^(2)=6.222,P=0.022)、淋巴结转移(χ^(2)=5.455,P=0.020)显著相关;而lncRNA H19表达水平与病理中分化(χ^(2)=1.174,P=0.029)、肿物大小(χ^(2)=-0.507,P=0.037)显著相关。结论ECC中lncRNA CASC2和H19均出现转录失调,其中lncRNA CASC2在癌组织中呈上调趋势,H19呈下调趋势,两者具有成为ECC新的分子标志物的潜力。

信号转导和转录激活因子3和长链非编码RNA肿瘤易感候选基因11在子痫前期胎盘中的表达及与胎盘螺旋动脉重铸的关系

目的 探究子痫前期(PE)病人胎盘组织中信号转导及转录活化因子3(STAT3)、长链非编码RNA肿瘤易感候选基因11(lncRNA CASC11)表达水平与胎盘螺旋动脉重铸的关系。方法 选取2019年1月至2022年4月于沧州市人民医院行剖宫产分娩的68例PE病人为PE组,并选取同期该院行剖宫产分娩的68例健康孕妇为健康组。比较PE组、健康组一般资料及胎盘组织中STAT3 mRNA、lncRNA CASC11表达水平;分析PE病人胎盘组织中STAT3 mRNA表达水平与lncRNA CASC11的相关性;比较健康组与PE组胎盘螺旋动脉管壁厚度、管腔面积;分析PE病人胎盘组织中STAT3 mRNA、lncRNA CASC11表达水平与胎盘螺旋动脉管壁厚度、管腔面积的相关性。结果 PE组病人舒张压、收缩压高于健康组(P<0.05),胎盘组织中STAT3mRNA、lncRNA CASC11表达水平分别为0.40±0.14、0.46±0.15,低于健康组的1.04±0.35、1.01±0.34(P<0.05),胎盘螺旋动脉管壁厚度高于健康组(P<0.05),管腔面积小于健康组(P<0.05);PE病人胎盘组织中STAT3 mRNA表达水平与lncRNA CASC11,及STAT3 mRNA、lncRNA CASC11表达水平与胎盘螺旋动脉管腔面积均呈正相关(P<0.05),STAT3 mRNA、lncRNA CASC11表达水平与胎盘螺旋动脉管壁厚度呈负相关(P<0.05)。结论 PE病人胎盘组织中STAT3 mRNA、lncRNA CASC11表达水平均较低,二者均与胎盘螺旋动脉重铸关系密切,可能为临床诊治PE提供新方向。

乳腺癌患者血清中乳腺癌易感基因1和细胞角蛋白19的含量及意义

目的探讨健康女性、乳腺腺病及乳腺浸润性导管癌患者手术前后血清中乳腺癌易感基因1(BRCA1)、细胞角蛋白19(CK19)表达变化及临床意义。方法采用酶联免疫吸附试验(ELISA)分别检测20例健康女性、20例乳腺腺病患者、60例乳腺癌患者手术前后血清中BRCA1、CK19的表达情况。分析两者与乳腺癌发生发展的关系。结果乳腺癌组血清BRCA1、CK19表达均明显高于乳腺腺病和健康女性组(P<0.05)。在乳腺腺病患者和健康女性血清中BRCA1、CK19表达差异均无统计学意义(P>0.05)。BRCA1在乳腺癌术前与术后血清中的表达差异无统计学意义(P>0.05)。CK19在乳腺癌患者术前组血清中的表达高于术后组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论联合检测乳腺肿瘤患者血清中的BRCA1及CK19对乳腺癌的诊断及治疗效果的判断具有重要的临床意义。

长链非编码RNA肿瘤易感候选基因11在卵巢癌组织中的表达及意义

目的观察长链非编码RNA(lncRNA)肿瘤易感候选基因11(CASC11)在卵巢癌组织中的表达情况,探讨抑制该基因对卵巢癌SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭力的影响。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测卵巢癌组织和癌旁组织中CASC11表达情况。将SKOV3细胞分为si-CASC11组、阴性对照组和空白组,分别转染CASC11的干扰物序列、阴性对照序列和加入转染试剂,采用实时荧光定量PCR法检测细胞中CASC11表达情况,采用噻唑蓝(MTT)法检测细胞增殖活力,采用划痕实验检测细胞迁移能力,采用Transwell小室检测细胞侵袭能力。结果卵巢癌组织中CASC11相对表达量高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.001)。不同分化程度、国际妇产科联盟(FIGO)分期和淋巴结转移情况下,卵巢癌组织中CASC11相对表达量差异有统计学意义(P<0.05)。与阴性对照组和空白组比较,si-CASC11组细胞中CASC11相对表达量降低,细胞增殖活力、迁移能力、侵袭能力降低,差异有统计学意义(P<0.05或P<0.01)。结论卵巢癌组织中CASC11呈高表达,且与恶性进展临床病理指标相关,抑制CASC11表达能够显著抑制SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力。

利用病例-父母设计的候选疾病易感基因的LOD值排除分析

已有的一种LOD值排除方法,可在随机群体样本中反过来检测引起复杂疾病和数量特征的候选基因的重要性．LOD值排除方法是常规关联分析的有效补充．虽然与传统的关联分析相比, 方法更加保守,但是仍然受到群体分层的影响．为了控制群体异质性所带来的混杂影响,文中通过病例-父母设计,发展了一种LOD值排除分析方法．这种方法与连锁分析中的排除分析是相似的．观测到的核心家系数据的似然函数可以构建多项分布式: ．其中nij是父母配对类型为i而受累子代的基因型为j的家庭个数,pij为有一个受累子代的核心家庭中父母配对类型是i而受累子代的基因型为j的核心家庭的条件概率．这个似然值是基因频率和被检测遗传标记的相对风险的函数．在这种方法中,能够分析候选基因的特定遗传效应和遗传模型．如果LOD 值≤-2．0,检测位点没有含有比特定位点更大的效应而被排除．我们进行了模拟研究来检测排除分析中遗传效应和遗传模型的功效．模拟表明,这种方法有一定的合理功效来排除一个具很小遗传效应的候选基因．与核心家系中传递不平衡检验(TDT)关联分析相似的是,该排除分析一般不受群体混层的影响．排除分析可以作为排除不含有或者含很小遗传效应的候选基因的TDT分析方法的补充．这种方法已经被用来检测维生素D受体对骨质疏松症的重要性．

白癜风易感基因及候选基因的研究现状

白癜风的病因尚不明确,目前认为其发生可能为在多基因累加效应的基础上,同时有环境因素起作用。通过全基因组扫描及候选基因的相关性研究是确定白癜风遗传因素常用的重要方法,但近年来的研究显示不同种族中与白癜风相关的易感基因位点及候选基因并不完全一致,所报道的结果缺乏可重复性。

自闭症易感候选基因2单核苷酸多态性与海洛因依赖群体的相关性研究

目的探讨自闭症易感候选基因2(autism susceptibility candidate 2,AUTS2)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与中国汉族群体海洛因依赖的相关性。方法采用病例对照研究,选取430例海洛因依赖患者(海洛因依赖组)及420例健康人群(健康对照组),采集其血样并收集相应临床资料。采用荧光标记单碱基延伸的SNPshot技术对AUTS2 rs2270162(启动子区)、rs6943555(内含子4)、rs2293507(外显子7)、rs1918425(3’侧翼区)共4个多态性位点进行分型,比较两组基因型分布频率。结果 AUTS2 rs6943555基因型频率分布在海洛因依赖组及健康对照组差异有统计学意义(χ~2=12.150,P=0.002)。与健康对照组相比,海洛因依赖组rs6943555 A等位基因频率高于健康对照组(χ~2=12.444,P=0.0004,OR=1.419,95%CI=1.168~1.724)。结论 AUTS2基因rs6943555可能与海洛因依赖有关,携带有rs6943555 A等位基因个体更易对海洛因依赖。

癌症易感基因及其所致肿瘤综合征的防治策略

癌症易感基因是近几年研究的热点之一。癌症易感基因异常所致的肿瘤综合征具有遗传性及伴有其他器官病变等特性。不同类型的癌症易感基因突变可引起不同的肿瘤综合征。通过对病人肿瘤发生的家族史的了解、遗传学咨询、遗传学试验等措施可以对不同的遗传性肿瘤综合征提出相应的防治策略。

恶性肿瘤中肿瘤易感候选基因11的作用研究

大量研究证实异常表达的长链非编码RNA(lncRNA)调控肿瘤增殖、侵袭转移、耐药等恶性生物学行为,并且与癌肿临床病理学特征及患者预后密切相关。肿瘤易感候选基因11(CASC11)作为一种新发现的lncRNA,已被发现在胃癌、肝癌、膀胱癌等恶性肿瘤中异常表达,并通过多种机制调控肿瘤的发生发展。此外,CASC11作为生物学标志物在肿瘤诊断、靶向治疗及预后评估等方面具有潜在的临床应用价值。本文对CASC11在恶性肿瘤中的调控作用及其机制进行综述。

PSORS1C1/CDSN基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性关系的研究

目的银屑病易感基因1候选基因1(psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1,之前的SEEK1)的5'-UTR区域存在角膜锁链蛋白(corneodesmosin,CDSN)基因。本文探讨PSORS1C1/CDSN基因多态性与强直性脊柱炎(ankylosing spondyli-tis,AS)遗传易感性之间的关系。方法本研究首先针对PSORS1C1/CDSN基因区域的16个SNP位点,采用定制的Illumina 96-SNP VeraCode microarray基因芯片,对51例AS患者DNA进行基因分型。初步筛选到AS疾病易感性相关位点后,再使用同样方法增大样本量,对200例AS患者DNA进行基因分型。最后采用Taqman基因分型方法验证两次芯片结果。结果基因芯片结果表明rs3130983、rs3778638和rs4959053在AS和对照组中等位基因频率和基因型频率有显著差异。Taqman基因分型技术验证了基因芯片结果。说明rs3130983、rs3778638和rs4959053与AS发病有相关性。结论 PSORS1C1和CDSN基因可能是AS的易感基因。

银屑病易感基因位点PSORS1的研究进展

银屑病是一种常见的多基因遗传性皮肤病,通过对不同群体的银屑病患者的基因样本进行全基因组扫描,确定了7个银屑病易感基因位点(PSORS1～PSORSS7),其中位于6p21染色体上的易感基因位点PSORS1是当前银屑病易感基因研究的热点,它包括三个银屑病候选基因:HLA-Cw6,CDSN,HCR。分别对这三个易感基因进行综述。

银屑病易感基因研究进展

银屑病是常见的一种多基因遗传病。迄今为止 ,在 OMIM中收录了 PSORS1、PSORS2、PSORS3、PSORS4、PSORS5、PSORS6、PSORS7共 7个银屑病易感基因位点。CDSN、S10 0 A7、TNF- α和 HCR等银屑病的候选基因研究也被广泛开展。

基于网络的哮喘易感基因研究新策略

哮喘易感基因的研究正在世界各地许多实验室蓬勃开展,由于此种疾病的复杂性和异质性等原因,哮喘易感基因的鉴定依然任重而道远。目前的研究表明,哮喘所涉及的染色体达10多条,与其关联或连锁的候选易感基因多达170多个,但多数研究结果的一致性和重复性较差。分析其中的原因,除了哮喘的复杂性、种族的差异、病例的选择与分层的不同外,研究策略、技术路线和方法应该是导致结果不一致的主要原因之一。本文基于系统生物学理论与候选基因的方法,系统阐述一种哮喘易感基因研究的新策略。