目的分析癌胚抗原相关细胞黏附分子5(carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 5,CEACAM5)在胃癌中的表达价值及潜在分子机制,为胃癌靶向治疗提供新思路。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)、癌...目的分析癌胚抗原相关细胞黏附分子5(carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 5,CEACAM5)在胃癌中的表达价值及潜在分子机制,为胃癌靶向治疗提供新思路。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)、癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载胃癌mRNA数据,结合人类蛋白质图谱,剖析CEACAM5表达状态。评估CEACAM5在免疫治疗队列的预后价值。鉴定胃癌CEACAM5共表达基因并进行功能注释,探究CEACAM5影响胃癌发展的潜在分子机制。结果本研究共纳入35个胃癌数据集,经整合获得16个平台矩阵。与956名健康人的正常胃腺体组织相比,CEACAM5 mRNA在全球1798例胃癌组织中表达增加,标准化平均差(standardized mean difference,SMD)=0.51[0.02,0.99];对胃癌具有中等区分能力,曲线下面积(area under the curve,AUC)=0.79,敏感度=78.42%,特异度=64.75%。CEACAM5在胃癌细胞胞质/胞膜呈强阳性表达。在接受免疫治疗的933例患者中,CEACAM5过表达者预后较差,风险比(hazard ratio,HR)=1.47[1.24,1.74]。CEACAM5共表达基因主要参与红细胞癌基因B(erythroblastic oncogene B,ERBB)信号通路并正性调控上皮细胞迁移。结论CEACAM5在胃癌组织中呈高表达,可能通过介导共表达机制促进胃癌转移。展开更多
目的:研究在非小细胞肺癌及癌旁组织中ceacam1通过选择性拼接而产生的两种转录产物的调控机制。方法:将用PCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长1 606 bp DNA片段插入到真核表达载体pCMV中,构建成ceacam1迷你基因模型并与ptb基...目的:研究在非小细胞肺癌及癌旁组织中ceacam1通过选择性拼接而产生的两种转录产物的调控机制。方法:将用PCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长1 606 bp DNA片段插入到真核表达载体pCMV中,构建成ceacam1迷你基因模型并与ptb基因共转染,用PCR法鉴定转染后的产物变化;根据外显子7序列设计的探针GAE(16-nt)及ACE(8-nt)进行凝胶阻滞分析实验。分离与探针结合的蛋白并进行质谱分析。结果:ptb3种cDNA与ceacam1迷你基因共转染后,CEACAM lL表达水平下降,其中ptb4对迷你基因的表达产物影响最大。仅转染迷你基因的细胞中ceacam1L在两条带中所占比例为76.7%,而与ptb3种重组质粒共转染后,比例分别下降至58.3%、64.8%和54.0%。凝胶阻滞实验表明,探针GAE能与核蛋白结合,而ACE基本不能与核蛋白结合,与GAE结合的蛋白经质谱分析为PTB。结论:PTB过表达与ceacam1低表达有明显的相关性,拼接因子PTB参与ceacam1的选择性拼接。展开更多
文摘目的分析癌胚抗原相关细胞黏附分子5(carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 5,CEACAM5)在胃癌中的表达价值及潜在分子机制,为胃癌靶向治疗提供新思路。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)、癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载胃癌mRNA数据,结合人类蛋白质图谱,剖析CEACAM5表达状态。评估CEACAM5在免疫治疗队列的预后价值。鉴定胃癌CEACAM5共表达基因并进行功能注释,探究CEACAM5影响胃癌发展的潜在分子机制。结果本研究共纳入35个胃癌数据集,经整合获得16个平台矩阵。与956名健康人的正常胃腺体组织相比,CEACAM5 mRNA在全球1798例胃癌组织中表达增加,标准化平均差(standardized mean difference,SMD)=0.51[0.02,0.99];对胃癌具有中等区分能力,曲线下面积(area under the curve,AUC)=0.79,敏感度=78.42%,特异度=64.75%。CEACAM5在胃癌细胞胞质/胞膜呈强阳性表达。在接受免疫治疗的933例患者中,CEACAM5过表达者预后较差,风险比(hazard ratio,HR)=1.47[1.24,1.74]。CEACAM5共表达基因主要参与红细胞癌基因B(erythroblastic oncogene B,ERBB)信号通路并正性调控上皮细胞迁移。结论CEACAM5在胃癌组织中呈高表达,可能通过介导共表达机制促进胃癌转移。
文摘目的:研究在非小细胞肺癌及癌旁组织中ceacam1通过选择性拼接而产生的两种转录产物的调控机制。方法:将用PCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长1 606 bp DNA片段插入到真核表达载体pCMV中,构建成ceacam1迷你基因模型并与ptb基因共转染,用PCR法鉴定转染后的产物变化;根据外显子7序列设计的探针GAE(16-nt)及ACE(8-nt)进行凝胶阻滞分析实验。分离与探针结合的蛋白并进行质谱分析。结果:ptb3种cDNA与ceacam1迷你基因共转染后,CEACAM lL表达水平下降,其中ptb4对迷你基因的表达产物影响最大。仅转染迷你基因的细胞中ceacam1L在两条带中所占比例为76.7%,而与ptb3种重组质粒共转染后,比例分别下降至58.3%、64.8%和54.0%。凝胶阻滞实验表明,探针GAE能与核蛋白结合,而ACE基本不能与核蛋白结合,与GAE结合的蛋白经质谱分析为PTB。结论:PTB过表达与ceacam1低表达有明显的相关性,拼接因子PTB参与ceacam1的选择性拼接。