云南西双版纳百日咳博德特氏菌分离株抗原基因特征分析

目的比对云南省西双版纳地区新的百日咳临床分离株与疫苗株及其他地区流行的百日咳博德特氏菌基因特征,为百日咳的防控提供科学依据。方法对2019年10—12月从云南省西双版纳州人民医院采集的4株百日咳临床分离流行株进行全基因组测序,利用MegAlign 7.1.0软件确定分离株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因型,并与我国无细胞百日咳疫苗株CS株以及NCBI数据库中公开的其他国家和地区流行的百日咳博德特氏菌ptxP、ptxA、prn、fim3抗原基因特征进行对比分析;使用RAxML软件基于对28株百日咳博德特氏菌全基因组SNP构建系统发育树。结果云南西双版纳4株百日咳临床分离株BP-L1、BP-L2、BP-L3、BP-L4基因组比CS株多产生了33~36个插入序列引起的基因重排。4株百日咳临床分离流行株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因序列与CS株相似度在99.2%~100%。系统发育树结果显示,CS株与参考株TohamaⅠ聚为1支,形成独立进化分支;近年来全球流行的百日咳博德特氏菌分成2个聚类,BP-L1、BP-L4与多数欧美国家百日咳博德特氏菌聚为1支,主要为ptxP3/ptxA1/prn2型菌株,BP-L2、BP-L3与亚洲国家和地区的流行的百日咳博德特氏菌聚为1支,主要是ptxP1/ptxA1/prn1型菌株。结论云南西双版纳临床分离株与疫苗株相比,主要毒力蛋白基因和进化分支发生了明显变化,与近年来国际流行的百日咳博德特氏菌遗传进化一致。

病原菌

0110004 宏观限制性内切酶的联合分析可显示法国东部百日咳博德特氏菌菌株中的高度多形性/Prevost G//J Clin Microbiol.-1999,37(4).-1062～1068 医科情0116005 曾用于研究澳大利亚嗜血流感杆菌 b 型菌株遗传多样性的脉冲式凝胶电泳可显示出土著的和非土著的菌株之间的差别/Moor P E//J Clin Micmbiol.-1999,37(5).-1524～1531