肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是世界范围内发病率居第五、死亡率居第二的恶性肿瘤。对HCC进行特异及灵敏的早期诊断是提高患者疗效和存活率的关键。维生素K缺乏或拮抗剂Ⅱ诱导的蛋白质(protein induced by vitamine K absen...肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是世界范围内发病率居第五、死亡率居第二的恶性肿瘤。对HCC进行特异及灵敏的早期诊断是提高患者疗效和存活率的关键。维生素K缺乏或拮抗剂Ⅱ诱导的蛋白质(protein induced by vitamine K absence or antagonistⅡ,PIVKA-Ⅱ)是一种新的肿瘤标志物,其对HCC的诊断、治疗效果评估、预后判断及肿瘤复发监测均具有较好的临床应用价值,现就PIVKA-Ⅱ的生物学特性和临床应用作一概述。展开更多
尽管近年来靶点鉴定和药物发现领域取得了重要进展,但目前仍缺乏有效的疾病治疗靶点。与此同时,在过去几十年里,每年获批的新分子实体数量急剧下降,如何更好地进行药物发现仍有很大的改进空间。基于活性的蛋白质组学分析(activity-based...尽管近年来靶点鉴定和药物发现领域取得了重要进展,但目前仍缺乏有效的疾病治疗靶点。与此同时,在过去几十年里,每年获批的新分子实体数量急剧下降,如何更好地进行药物发现仍有很大的改进空间。基于活性的蛋白质组学分析(activity-based protein profiling,ABPP)是一种直接在真实生物环境中研究复杂蛋白质组功能的化学蛋白质组学方法,主要通过使用化学探针标记蛋白质活性位点的氨基酸残基,被广泛用于靶点鉴定和药物发现。本文总结了ABPP的设计策略,并介绍了ABPP技术在靶点鉴定和药物发现领域的相关应用实例。展开更多
The PvSR1(Phaseolus vulgaris stress-related protein) gene encoding an 11 kD proline-rich protein (PRP) was constitutively expansed in the primary leaf tissue of beau (Phaeolus vulgaris L. cv. Saxa). The coarse studies...The PvSR1(Phaseolus vulgaris stress-related protein) gene encoding an 11 kD proline-rich protein (PRP) was constitutively expansed in the primary leaf tissue of beau (Phaeolus vulgaris L. cv. Saxa). The coarse studies of mRNA accumulation of the PvSR1 has been studied in this plant against virus infection and various abiotic sacsses. Northern blot analysis revealed that the gene expression of PvSR1 was greatly enhanced in the leaf tissue by AIMV (alfalfa mosaic vims) infection, wounding, heat shock, UV, drought and salt stress. The PvSR1 transcripts could also be increased by the exogenous inducing fartors such as salicylic acid and H2O2. The Precise biological roles of PvSR1 is unknown, but the expression of PvSR1 genes in various form of stress suggest that PvSR1 may play an important role during the strees, in maintaining cellular integrity by forming strong linkages with the cell wall.展开更多
促分裂原活化蛋白质激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)在真核生物中高度保守,在水稻逆境应答反应中也发挥着重要作用。本研究表达纯化了水稻OsMPK17蛋白质,制备了特异性抗体,对多种非生物逆境胁迫下的蛋白质样品进行免疫印...促分裂原活化蛋白质激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)在真核生物中高度保守,在水稻逆境应答反应中也发挥着重要作用。本研究表达纯化了水稻OsMPK17蛋白质,制备了特异性抗体,对多种非生物逆境胁迫下的蛋白质样品进行免疫印迹分析,发现OsMPK17蛋白质在干旱胁迫下诱导表达,提示该蛋白质在干旱胁迫应答中发挥作用。对脱落酸和茉莉酸甲酯处理的离体叶片蛋白质分析发现,OsMPK17蛋白质表达丰度下降,提示该蛋白质的功能发挥可能受激素调控。为此,构建了过表达OsMPK17蛋白质的载体,转化水稻后筛选获得了OsMPK17蛋白质过表达的纯合株系。田间种植鉴定结果表明,转基因株系的株高变矮、穗长变短、结实率降低。种子萌发期拟旱(PEG-6000)处理条件下,过表达OsMPK17株系的种子长势明显比野生型好,根长与芽长均显著大于野生型。幼苗期失水试验表明,转基因植株的失水率低于野生型。在土培干旱胁迫后恢复浇水的试验中,过表达OsMPK17蛋白质的转基因水稻生长也好于野生型。综上,过表达OsMPK17蛋白质提高了水稻的耐旱性。本研究增进了对水稻OsMPK17基因功能的了解。展开更多
文摘目的通过探讨含DEP结构域的蛋白质1(DEP domain containing 1,DEPDC1)在子宫内膜癌(Endometrial cancer,EC)组织中的表达,阐明其对EC诊断和预后的意义。方法利用UALCAN在线分析工具分析DEPDC1 mRNA在EC中的表达以及与临床病理特征的相关性。利用人类蛋白质表达图谱(The human protein atlas,HPA)数据库分析DEPDC1蛋白在EC中的表达。Kaplan-Meier Plotter用于分析DEPDC1表达与EC预后的关系。采用STRING和Metascape在线分析工具探索DEPDC1相互作用蛋白网络以及功能富集。结果DEPDC1的mRNA和蛋白水平在EC中的表达高于正常子宫内膜组织,DEPDC1基因的表达与人种、肿瘤分期、组织亚型以及TP53突变状态相关。DEPDC1的高表达与EC的不良预后相关。与DEPDC1相互作用的蛋白富集于有丝分裂、微管相关运动等生物学进程。结论DEPDC1可能与EC的恶性表型和进展有关,可能作为EC潜在的诊断标志物和治疗靶点。
文摘肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是世界范围内发病率居第五、死亡率居第二的恶性肿瘤。对HCC进行特异及灵敏的早期诊断是提高患者疗效和存活率的关键。维生素K缺乏或拮抗剂Ⅱ诱导的蛋白质(protein induced by vitamine K absence or antagonistⅡ,PIVKA-Ⅱ)是一种新的肿瘤标志物,其对HCC的诊断、治疗效果评估、预后判断及肿瘤复发监测均具有较好的临床应用价值,现就PIVKA-Ⅱ的生物学特性和临床应用作一概述。
文摘尽管近年来靶点鉴定和药物发现领域取得了重要进展,但目前仍缺乏有效的疾病治疗靶点。与此同时,在过去几十年里,每年获批的新分子实体数量急剧下降,如何更好地进行药物发现仍有很大的改进空间。基于活性的蛋白质组学分析(activity-based protein profiling,ABPP)是一种直接在真实生物环境中研究复杂蛋白质组功能的化学蛋白质组学方法,主要通过使用化学探针标记蛋白质活性位点的氨基酸残基,被广泛用于靶点鉴定和药物发现。本文总结了ABPP的设计策略,并介绍了ABPP技术在靶点鉴定和药物发现领域的相关应用实例。
文摘The PvSR1(Phaseolus vulgaris stress-related protein) gene encoding an 11 kD proline-rich protein (PRP) was constitutively expansed in the primary leaf tissue of beau (Phaeolus vulgaris L. cv. Saxa). The coarse studies of mRNA accumulation of the PvSR1 has been studied in this plant against virus infection and various abiotic sacsses. Northern blot analysis revealed that the gene expression of PvSR1 was greatly enhanced in the leaf tissue by AIMV (alfalfa mosaic vims) infection, wounding, heat shock, UV, drought and salt stress. The PvSR1 transcripts could also be increased by the exogenous inducing fartors such as salicylic acid and H2O2. The Precise biological roles of PvSR1 is unknown, but the expression of PvSR1 genes in various form of stress suggest that PvSR1 may play an important role during the strees, in maintaining cellular integrity by forming strong linkages with the cell wall.
文摘促分裂原活化蛋白质激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)在真核生物中高度保守,在水稻逆境应答反应中也发挥着重要作用。本研究表达纯化了水稻OsMPK17蛋白质,制备了特异性抗体,对多种非生物逆境胁迫下的蛋白质样品进行免疫印迹分析,发现OsMPK17蛋白质在干旱胁迫下诱导表达,提示该蛋白质在干旱胁迫应答中发挥作用。对脱落酸和茉莉酸甲酯处理的离体叶片蛋白质分析发现,OsMPK17蛋白质表达丰度下降,提示该蛋白质的功能发挥可能受激素调控。为此,构建了过表达OsMPK17蛋白质的载体,转化水稻后筛选获得了OsMPK17蛋白质过表达的纯合株系。田间种植鉴定结果表明,转基因株系的株高变矮、穗长变短、结实率降低。种子萌发期拟旱(PEG-6000)处理条件下,过表达OsMPK17株系的种子长势明显比野生型好,根长与芽长均显著大于野生型。幼苗期失水试验表明,转基因植株的失水率低于野生型。在土培干旱胁迫后恢复浇水的试验中,过表达OsMPK17蛋白质的转基因水稻生长也好于野生型。综上,过表达OsMPK17蛋白质提高了水稻的耐旱性。本研究增进了对水稻OsMPK17基因功能的了解。