盔孢伞属真菌DNA条形码及微条形码技术

收集盔孢伞属Galerina 16个物种40份标本,提取样品基因组DNA,使用通用引物扩增内转录间隔区(ITS)、基因内间隔区(IGS)、核糖体大亚基(nrLSU)、线粒体小亚基(mtSSU)、翻译延长因子(EF1-α)、RNA聚合酶第一大亚基(RPB1)、RNA聚合酶第二大亚基(RPB2)和β-微管蛋白(β-tubulin)8个基因序列进行双向测序,将得到的序列进行拼接校对后计算物种的种内、种间遗传距离并构建发育树。结果表明:ITS序列最适合作为盔孢伞属的DNA条形码,基于ITS序列开发出盔孢伞属的DNA微条形码、设计出微条形码引物。该引物具有良好的通用性和较强的适用性,对材料品质要求低,能够扩增由于蒸煮或消化等原因导致DNA发生降解的材料,具有一定的实际应用意义。