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题名江苏海域几种绿潮藻类rDNA ITS序列分析
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作者
陈淑吟
胡传明
陆勤勤
孙中响
许广平
丁亚平
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机构
江苏省海洋水产研究所
苏州大学医学部基础医学与生物科学学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期135-140,共6页
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基金
江苏省海洋与渔业局渔业重点项目
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文摘
于2009年5-7月定点采集了江苏海域绿潮藻类,测定、分析了这些藻类核糖体rDNA ITS序列,并进行分类鉴定。研究结果显示,ITS+5.8S序列片段长度为552-578 bp,其中ITS1序列部分长度为179-182 bp,5.8S序列全长为155-158 bp,ITS2序列全长为180-196 bp,序列的平均GC含量(contents)为61.6%-63.3%,不同ITS序列存在不同的插入/缺失位点。扩增得到27个序列中有7个不同序列,依据NCBI数据库相似性查找、系统进化关系及遗传距离等分析结果,确定有4个种类:浒苔(Ulva prolifeya),缘管浒苔(U.linza),石莼属(Ulva sp.)1种及盘苔属(Blidingia sp.)1种。分析表明,ITS序列可作为石莼科种类鉴定的标记。
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关键词
绿潮藻类
浒苔
石莼
盘苔
ITS序列
分类鉴定
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Keywords
Green-tides Ulva Enterornorpha Blidingia ITS region Phylogenetic relationship
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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