目标序列捕获及平行测序在临床耳聋基因诊断中的应用

目的利用目标序列捕获(Targeted sequence capture)、生物编码(Barcode)及大规模平行测序(Massivelyparallel sequencing,MPS)技术,对遗传性耳聋患者进行分子病因学研究,探索低成本、多基因、多样本的耳聋基因检测在临床应用的可行性。方法利用Illumina测序平台对来自解放军总医院聋病分子诊断中心88例(来自61个家系)具有明确家族史且常见耳聋基因检测阴性的耳聋患者,以及8例阳性对照患者进行42种基因的目标序列捕获、Barcode和MPS,并对测序结果进行生物信息学分析。结果利用上述方法在88个个体中大于一人入组家系中发现了10个家系8个基因(TECTA、DFNA5、CDH23、USH1C、MYO7A、POU3F4、SLC26A4、EYA4)14个位点的致病性突变。准确验证了8个阳性对照。大于一人入组家系的致病基因检出率明显高于单人入组家系。结论高通量测序的发展为遗传性耳聋的诊断带来了巨大的机遇。目标序列捕获、Barcode、MPS的结合进一步提高了测序的准确性、降低了测序成本,同时生物信息学的进步,将促进低成本、多基因、多样本的临床耳聋基因检测成为可能。

目标序列捕获测序检出红细胞丙酮酸激酶缺乏症PKLR基因新的复合突变

目的:探讨红细胞丙酮酸激酶缺乏症(pyruvate kinase deficiency,PKD)的分子发病机制。方法:应用目标序列捕获和高通量二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对临床拟诊PKD患儿的PKLR基因12个外显子及其侧翼序列进行测序,采用SIFT及PolyPhen-2数据库预测突变对蛋白质功能的影响,在确定患者致病基因型后,应用Sanger测序技术对此基因型进行验证。结果:NGS结果显示,患儿PKLR基因存在罕见的双重杂合突变:第5外显子661G>A(Asp221Asn)和第10外显子1528C>T(Arg510Ter),导致该基因的第221位氨基酸由天冬氨酸突变为天冬酰胺,第510位氨基酸由精氨酸突变为终止密码子,使PKLR基因氨基酸链编码提前终止;Sanger测序技术进一步验证了该双重突变的存在。检索相关文献及数据库显示,这两种突变在人群中的发生率极低,蛋白质功能预测均显示为有害。结论:PKLR基因661 G>A与1528 C>T双重杂合突变是该PKD患儿的分子发病机制,PKD患者同时存在上述复合突变的报道在国内外尚属首次。

PCR法制备乙肝病毒基因芯片目标序列的探讨

比较对称与不对称PCR法制备的乙肝病毒基因芯片目标序列的杂交效果,并对不对称PCR法中上、下游引物浓度比例的最佳条件进行了探讨。

目标序列部分确定的翻转距离星树问题

讨论翻转距离星树问题,将3SAT问题归约到目标序列部分固定的翻转距离星树问题,证明实例中当有向符号序列个数为3时,若目标序列符号顺序固定,且有部分符号方向给定,则只确定其余符号方向以使得目标序列与已知3条给定序列翻转距离之和最小所对应的翻转距离星树问题也是NP-难解问题.同时,还给出了该问题的多项式时间近似算法.

构建目标序列 优化教学过程——小学作文教学“整体设计,循序训练”改革初探

作文教学历来是小学语文教学的重点和难点.小学生要学会写哪些文章?达到什么样的写作水平?怎样使学生达到这样的水平?这一直是多年来广大语文教师都在研究、探索的大课题。近年来,我们在现代信息论、系统论、控制论原理的启发和指导下,以贯彻九年义务教育教学大纲和试用义务教育新教材为契机。

目标序列捕获技术及其应用

新一代测序技术的发展，为现代基因组学的研究打开了新的局面，然而全基因组测序的成本和分析的复杂程度还是让科研人员倍感困难，目标序列捕获技术的出现，缓解了上述问题。目标序列获测序是针对已知的特定基因组区域设计探针捕获后进行测序。外显子组捕获测序则是其中的一个特例，它是专门针对基因组中全部外显子区域的研究。采用这样的技术，研究人员可以将重点放在人类基因组的重要组成部分，并且在相同的时间和成本下，研究更多的样本。本文简要介绍了目前用于基因组中目标序列和外显子组捕获的方法，并重点综述了这些技术的最新应用情况。

提高目标序列图像特征定位速度的算法研究

随着技术的发展,对目标识别跟踪系统的要求正朝着智能化方向发展,即要求系统具有对目标的自动捕获、自动识别和自动跟踪的能力。为此,在利用目标与背景之间的灰度分布特性的基础上,提出了一种在一定的范圈内能自动搜索并锁定目标的目标搜索算法,该算法能提高目标序列图像特征的定位。它首先由一个收缩算法逐步缩小搜索区域,再结台图像的梯度信息来搜索目标,最后锁定目标轮廓。该算法在搜索过程中只对少数的控翻点进行计算,而且对控翻点的初始位置无严格限制,因此在2-D模型中对人体运动的跟踪定位具有重要意义,对目标的形状都可以取得很好的搜索结果。

明确目标序列,把握口语交际《图书借阅公约》的要求

统编小学语文教科书遵循学生口语交际能力的发展规律,将口语交际作为单独的板块进行编排,具有明确的序列性。教师应通过研读教科书,把握口语交际教学目标体系,聚焦口语交际内容的编排特点,优化口语交际教学设计,进一步提升学生的口语交际能力。

初中作文目标序列训练设计(六)

初中三年级上学期（一）写作目标掌握新闻报道的一般写法Ⅰ专项训练训练项目明确消息的行文要求［课堂训练］１消息的标题，必须表达一个相对完整的意思，能让读者明白。据此，为下列简讯拟定恰当的新闻标题，限写单句，不超过１５字。本报讯：《中华人民共和国教师法》...

初中作文目标序列训练设计(七)

初中三年级下学期（一）写作目标正确把握题意·掌握命题作文的审题要领Ⅰ专项训练训练项目把握审题的着眼点［课堂训练｝１限制性题目的审题（１）把握题目中的关键词语分析下列题目，分别指出标志文章体裁、中心和限制写作范围的关键词语。①童年的梦②睦邻琐记③假如...

初中作文目标序列训练设计(二)

初中作文目标序列训练设计（二）山东沂水县教委教研室姜元夫（五）写作目标培养观察事物的能力，能写出观察结果和感受Ⅰ专项训练训练项目掌握常用的观察方法写观察片断［课堂训练］１、选定学校的一处景点，如一座塑像、一个花坛，按下列要求写出观察结果。（１）用定点...

初中作文目标序列训练设计(一)

初中作文目标序列训练设计（一）山东沂水县教委教研室姜元夫【编者按】作文教改究竟如何进行，在语文教师中是个热门话题。山东省沂水县教研室在沂新中学对作文教学进行了“目标序列训练”试验，取得了可喜的成果。本刊将从本期起连载这一“初中作文目标序列训练设计”初...

初中作文目标序列训练设计(三)

初中作文目标序列训练设计（三）山东沂水县教委教研室姜元夫初中一年级下学期（一）写作目标交代清楚记叙的要素Ⅰ专项训练训练项目交代记叙要素的要求和方法［课堂训练］１事情是由人在一定的时间、地点做出来的。事情本身有它的起因、经过和结果。在记叙事情的时候...

初中作文目标序列训练设计(五)

初中作文目标序列训练设计（五）山东沂水县教委教研室姜元夫初中二年级下学期（一）写作目标提出明确的观点Ⅰ专项训练训练项目论点的正确提出和准确表述选题作文［课堂训练］提出论点要有针对性，表述论点要用肯定句式。请按此要求，分别就下列材料提出恰当的立意角度，...

初中作文目标序列训练设计(四)

初中作文目标序列训练设计（四）山东沂水县教委教研室姜元夫初中二年级上学期（一）写作目标把握说明对象特征Ⅰ专项训练训练项目区别事物的一般特征和本质特征［课堂训练］１读《中国石拱桥》，分别用恰当的词语概括中国古代石拱桥的特征。（１）古代赵州桥的特征：（...

目标序列训练设计(八)

写作目标恰当安排结构·设计好开头和结尾Ⅰ专项训练训练项目掌握常用的开头和结尾的写法［课堂训练］一、文章开头是表现主题的重要组成部分，写好开头是作文布局谋篇的重要环节。文章立意确定后，如何设计开头，是能否顺利写作的关键。常用的开头方法主要有以下几种：（...

关注目标序列,打造习作基因链——从统编教材出发探寻习作评价的尺度

在统编教材中,小学习作教学的目标是呈序列化展开的。教师应基于统编教材的习作要素,探索习作评价的实施策略:关注目标序列,明确各学段的评价标准;根据目标序列,明晰习作合格线;根据目标序列,巧搭“评价前置”支架;根据目标序列,构建“双螺旋”评价机制。

大概念下的单篇课文学习目标模型建构——以《阿长与〈山海经〉》为例

近两年来,大概念教学一直都是教育热点,但在其实践过程中我们应持有批判性思维:单篇课文的经典性与大概念教学的整体性之间应该如何平衡?文章旨在引入学习任务序列,解决大概念下的单篇教学如何既体现自身的经典性又兼顾整体性的问题。经典文本作品具有讲述的“无限性”,但课文不同于文本,我们需要基于学习目标来确定经典性。因此文章以学习目标序列的建构为重点,确定单篇课文的学习目标,进而在此基础上挖掘该篇的独特性、设计相应的学习情境和活动,最终完成单篇学习任务。

基于教学目标阶梯序列的写人作文进阶路径

习作教学是个老大难的问题,就事论事、强调技法的教学无法有效培育学生习作的核心能力,其背后的原因是教学目标序列不清、习作能力进阶路径不明,学生无法得到切中目标序列的有效训练。表现在写人作文的教学上,一味强调所谓的"外、语、动、心、神",强调细节,便是典型例症。要在不同年级循序渐进地教好写人作文,乃至其他题材、体裁的作文,有两条必由之路:一是厘清课程标准要求的小学习作教学目标的阶梯序列,做到教学有循序;二是找准写人作文教学目标的阶梯路径,实现学生习作能力的渐进式发展。