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核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用 被引量:66
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作者 张志华 洪葵 《华南热带农业大学学报》 2006年第2期39-43,共5页
综述核酸序列直接分析在真菌分类鉴定方面的基础理论及特点,介绍核酸序列直接分析在真菌鉴定方面的应用及常用的引物,比较真菌分类鉴定中常用的18SrDNA,ITS分子生物学方法。
关键词 真菌鉴定 核酸序列直接分析 18S RDNA ITS
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日本血吸虫(中国大陆株)表达基因的分离和EST序列测定 被引量:23
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作者 吴忠道 余新炳 +2 位作者 郑亦男 李焱 周俊梅 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第1期3-5,共3页
目的 运用表达序列标签技术(EST方法) ,从SjcDNA文库中分离、鉴定和测定血吸虫表达基因序列。方法 应用EST方法,从Sj cDNA 文库中随机挑选出单个重组克隆进行PCR直接序列分析,通过互联网将获得的EST 序... 目的 运用表达序列标签技术(EST方法) ,从SjcDNA文库中分离、鉴定和测定血吸虫表达基因序列。方法 应用EST方法,从Sj cDNA 文库中随机挑选出单个重组克隆进行PCR直接序列分析,通过互联网将获得的EST 序列送入NCBIGenBank 进行同源性检索,并将发现的未知基因EST序列送入NCBIdbEST 以获得GenBank 进入号。结果 分离了100 个Sj重组克隆,并已对25 个克隆cDNA 插入片段的PCR 产物进行直接序列分析,获得了21 个EST 序列。其中2 个EST 序列为GenBank 中已知的血吸虫基因序列,19 个为未知基因序列。这19 个EST序列已被NCBIdbEST和GenBank 接受并获得了新序列进入号。结论 采用ESTPCR直接序列分析方法可大量获得血吸虫表达基因EST序列,为进一步开展日本血吸虫(中国大陆株) 表达基因的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 PCR 直接序列分析 CDNA文库
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山东地区汉族人群MICA基因多态性分析 被引量:3
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作者 焦淑贤 迟晓云 +2 位作者 杜占慧 冯智慧 孙桂荣 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第6期438-441,共4页
目的分析山东地区汉族人群MICA基因外显子2~6多态性,并与国内外其他地区人群进行比较。方法用聚合酶链反应-测序分型法(PCR-SBT)对100例山东地区汉族骨髓库捐献志愿者MICA基因外显子2~6进行多态性分析。结果共检出18个MICA等位基因,... 目的分析山东地区汉族人群MICA基因外显子2~6多态性,并与国内外其他地区人群进行比较。方法用聚合酶链反应-测序分型法(PCR-SBT)对100例山东地区汉族骨髓库捐献志愿者MICA基因外显子2~6进行多态性分析。结果共检出18个MICA等位基因,基因频率最高的前3位依次为MICA*008:01(35%),MICA*002:01(14%),MICA*010:01(12%)。与南方多地区汉族人群比较,MICA*004*,*019,*008,*010,*027分布差异均有统计学意义(P均〈0.05);与内蒙古地区汉族人群比较MICA*008,*012,*004差异有统计学意义(P均〈0.05);与韩国人群比较MICA*008,*010,*019差异有统计学意义(P均〈0.05);与美国高加索人种比较,只有MICA*045差异有统计学意义(P〈0.05);与非洲裔美国人比较差异有统计学意义的等位基因达10个。结论山东地区汉族人群MICA基因多态性有高加索人群特征,且与国内外其他地区人群存在较大差异。 展开更多
关键词 山东 汉族 MICA基因多态性 聚合酶链反应-序列碱基直接分析
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PCR-SSP/PCR-SBT-HLA高分辨等位基因分型比较 被引量:11
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作者 黄飞 肖露露 +1 位作者 阎文瑛 钱小兵 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第B03期21-24,共4页
【目的】为了预测无关捐献者干细胞移植(HSCT)后GVHD的发生及程度和选择相容的干细胞捐献者,通过同时采用PCR-序列特异性引物扩增技术(sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR-直接碱基序列分析基因分型技术(sequence based genotyping... 【目的】为了预测无关捐献者干细胞移植(HSCT)后GVHD的发生及程度和选择相容的干细胞捐献者,通过同时采用PCR-序列特异性引物扩增技术(sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR-直接碱基序列分析基因分型技术(sequence based genotyping,PCR-SBT)的方法,提高HLA基因分型的准确性和分辨水平。【方法】采用PCR-SSP和PCR-SBT分别对57份捐献者血样进行HLA-A、B和DRB1位点的高分辨等位基因分型(即识别基因的编码达到*后4位数)。【结果】PCR-SBT实验中有27份DNA的基因分析结果模棱两可,PCR-SSP实验中有10份DNA的基因分析结果模棱两可。经两种方法相互佐证实验后,57份样本均获得结果一致、清楚和精确的HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型。【结论】PCR-SSP和PCR- SBT是HLA高分辨基因分析的标准方法,两种方法具有实验互补意义,若同时应用两种方法能够有效改善HLA等位基因高分辨分型的准确性和重复一致率。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 序列特异性引物扩增 直接碱基序列分析 高分辨基因分型
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宫颈癌和子宫内膜癌虽然有KRAS突变,但一致缺乏BRAF突变
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作者 Pappa K.I. Choleza M. +1 位作者 Markaki S. 翁梨驹 《世界核心医学期刊文摘(妇产科学分册)》 2006年第6期49-50,共2页
Background. Mutational activation of KRAS and BRAF protooncogenes contributes to the development of many hu man cancers. Current research on gynecological cancer and specifically in cervical and endometrial cancer is ... Background. Mutational activation of KRAS and BRAF protooncogenes contributes to the development of many hu man cancers. Current research on gynecological cancer and specifically in cervical and endometrial cancer is focused on the mechanisms of their mutational activation. Objectives. In view of the paucity of data on their mutation frequency and the status of BRAF in these two types of gynecological cancer, we performed a systematic molecular study in 114 clinically and histologically well- defined malignant tumors of uterine cervix and endometrium and correlated the mutation status of KRAS and BRAF with the age at diagnosis and with tumor grade, stage or histological type. Methods. Direct sequence analysis of the PCR products of KRAS and BRAF genes was used to screen for known activating mutations. Results. In 67 cases of endometrial cancer, six KRAS mutations (8.9% ) were found, four at codon 12 (5.9% ) and two at codon 13 (2.9% ),while no mutation was detected at codon 61. Most of the mutations occurred in surgical stage I and in the endometrioid adenocarcinoma subtype. We also detected three KRAS point mutations (6.3% ) in the 47 cervical cancer samples, two at codon 12 (4.2% ) and one at codon 13 (2.1% ), while there was no mutation at codon 61. On the contrary,nomutation was identified inBRAF exon 15 for either endometrial or cervical cancer samples at position V600, which represents the most frequently mutated site of BRAF in human cancer. There was no association between KRAS mutations with either histological type, tumor grade or stage. Interestingly, however, KRAS mutation status in endometrial cancer was strongly associated with increased age at diagnosis (P < 0.001). Conclusions. Our data document (a) the absence of BRAF mutations in cervical and endometrial cancer, despite the mutation status of KRAS, (b) suggest that KRAS mutations reflect an early event in endometrial carcinogenesis and (c) imply that BRAF activation is involving alternative pathways in these two types of cancer. 展开更多
关键词 癌基因突变 子宫内膜癌 KRAS 宫颈癌 妇科癌症 直接序列分析 分子学研究 相关性分析 PCR产物 突变频率
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