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肿瘤相关基因转录调控蛋白的识别与研究进展 被引量:1
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作者 张荣娟 于颖彦 《中国实验诊断学》 北大核心 2010年第4期608-611,共4页
关键词 相关基因转录 调控蛋白 相关基因 识别 肿瘤 细胞恶性转化 基因转录调控 反式作用因子
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肾上腺素受体对骨髓基质干细胞骨相关基因转录的调节作用
2
作者 黄铜勇 马昕 +4 位作者 夏新雷 金慰芳 戴志杰 黄煌渊 姜建元 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期532-532,共1页
骨髓基质干细胞(BMSCs)存在肾上腺素能受体,交感神经可能通过它们调节骨髓基质细胞的增殖和分化,本研究旨在观察肾上腺素受体对骨髓基质干细胞骨相关基因转录的调节作用。
关键词 骨髓基质干细胞 相关基因转录 肾上腺素受体 调节 肾上腺素能受体 骨髓基质细胞 交感神经
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卵巢癌顺铂耐药细胞中DNA转录与修复相关基因的表达 被引量:5
3
作者 曹漫明 张积仁 +2 位作者 汪森明 胡喜钢 胡利娟 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2005年第12期1478-1481,共4页
目的研究DNA转录与修复相关基因的表达与卵巢癌顺铂耐药性之间的关系。方法以卵巢癌亲本细胞系COC1为对照,应用cDNA微阵列检测其顺铂耐药细胞系COC1/DDP中DNA转录与修复相关基因的表达。结果和结论与COC1细胞相比,COC1/DDP细胞有143个... 目的研究DNA转录与修复相关基因的表达与卵巢癌顺铂耐药性之间的关系。方法以卵巢癌亲本细胞系COC1为对照,应用cDNA微阵列检测其顺铂耐药细胞系COC1/DDP中DNA转录与修复相关基因的表达。结果和结论与COC1细胞相比,COC1/DDP细胞有143个基因的表达水平发生改变,其中共有20个DNA转录与修复相关基因的表达发生改变,表达上调的有13个基因,表达下调的有7个基因,包括CAD、DDB1、DDIT4等大量DNA修复基因以及一般转录因子RNA多聚酶Ⅰ、Ⅱ基因和DHX9、DDX3X基因的表达上调以及MLH1和BTF3基因的低表达,提示COC1/DDP细胞对顺铂的耐药性与DNA转录和损伤修复能力的异常有关。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 顺铂 耐药 DNA转录和修复相关基因 CDNA微阵列 基因表达
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LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT在糖尿病肾病患者中的表达及与肾功能的相关性研究 被引量:1
4
作者 何德娇 凌娜 +3 位作者 李正翔 乔玲 张淼淼 夏露 《疑难病杂志》 CAS 2024年第7期809-813,共5页
目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学... 目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学人民医院肾内科收治的DN患者106例为DN组,并根据24 h尿蛋白定量(24 h Upro)水平分为正常蛋白尿亚组43例(<30 mg)、微量蛋白尿亚组39例(30~<300 mg)、大量蛋白尿亚组24例(≥300 mg),另选取同期医院单纯糖尿病患者106例作对照组,检测患者血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平;Pearson法分析LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT与肾功能指标的相关性;Logistic分析影响DN患者肾功能损伤的因素。结果DN组血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平低于对照组(t=11.471、10.257,P均<0.001)。血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT比较,正常尿蛋白亚组>微量尿蛋白亚组>大量尿蛋白亚组(F=58.720、117.722,P均<0.001),BUN、SCr、UA水平比较,正常尿蛋白亚组<微量尿蛋白亚组<大量尿蛋白亚组,差异均有统计学意义(F=122.493、595.589、53.178,P均<0.001);LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT分别与BUN、SCr、UA呈负相关(r=-0.487、-0.498、-0.521,-0.527、-0.515、-0.534,P均<0.001);Logistic回归分析显示,糖尿病病程长及高BUN、SCr、UA水平是影响DN患者肾功能损伤的危险因素[OR(95%CI)=1.672(1.128~2.479)、2.839(1.534~5.253)、2.754(1.512~5.017)、2.693(1.464~4.954)],高LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT是保护因素[OR(95%CI)=0.875(0.798~0.959)、0.898(0.832~0.969)]。结论血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平与DN患者肾功能有关,可能是评估DN患者肾功能的潜在指标。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1 长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录 肾功能 相关
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成人Xp11.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾细胞癌患者临床特征单中心分析 被引量:1
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作者 田霞 王剑 +2 位作者 康钦钦 白辰光 郝强 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期28-34,共7页
目的探讨成人Xp11.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾细胞癌(Xp11.2/TFE3 RCC)的临床表现、影像学表现与治疗效果。方法收集2014年9月至2019年7月海军军医大学(第二军医大学)长海医院收治的经病理确诊的43例成人Xp11.2/TFE3 RCC患者的... 目的探讨成人Xp11.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾细胞癌(Xp11.2/TFE3 RCC)的临床表现、影像学表现与治疗效果。方法收集2014年9月至2019年7月海军军医大学(第二军医大学)长海医院收治的经病理确诊的43例成人Xp11.2/TFE3 RCC患者的临床资料,对患者一般情况、临床症状、影像学资料、手术方式、病理资料及预后进行回顾性分析。结果43例Xp11.2/TFE3 RCC患者中男24例、女19例,年龄25~77岁,平均年龄为(47.5±15.2)岁。首发症状为肉眼血尿5例,腰腹部不适6例,转移部位症状表现1例;健康体检时发现、无明显症状者31例。影像学上,病灶最大径1.1~9.5 cm,平均为(5.1±2.7)cm;病灶为类圆形29例,不规则形14例;边界清楚、有假包膜37例,边界不清晰6例;病变多出现密度或信号不均质改变,主要表现为出血(21例)、囊变或坏死(24例)及钙化(11例);中度至明显强化30例,轻度强化13例,其中乳头状强化23例;肾周侵犯10例,远处转移8例。43例患者中15例行腹腔镜根治性肾切除术,13例行腹腔镜肾部分切除术,7例行智能臂辅助腹腔镜肾部分切除术,5例行开放根治性肾切除术,1例行开放肾局部切除术,1例行肾穿刺活检术,1例行转移性椎管肿瘤清除术。43例患者的TFE3免疫组织化学染色检测及3例患者的TFE3荧光原位杂交检测结果均为阳性;免疫组织化学染色检测结果显示碳酸酐酶Ⅸ(CAⅨ;74.4%,32/43)、亲和素-生物素-过氧化物酶复合物(ABC;93.0%,40/43)、CD10(93.0%,40/43)、希佩尔林道蛋白(VHL;72.1%,31/43)、低分子量细胞角蛋白(CAM5.2;83.7%,36/43)阳性表达率较高,Ki-67阳性率为1%~60%(平均为9.7%)。除6例失访外,其余37例患者术后随访11~68个月,平均(47.4±17.5)个月。随访期间5例患者出现肿瘤全身多发转移,其中3例死亡,2例使用靶向药物治疗后病情无明显进展、患者仍存活;1例患者术后出现复发。结论Xp11.2/TFE3 RCC患者临床表现主要为血尿及腰腹部不适,健康体检时发现及无症状者较多,影像学表现多样,确诊依赖组织病理检测。外科手术尤其根治性肾切除术是Xp11.2/TFE3 RCC患者的首选治疗方法。大部分患者预后良好,少数患者术后出现复发或转移。 展开更多
关键词 Xp11.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾细胞癌 肾肿瘤 成年人 诊断
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动脉粥样硬化相关基因甲基化研究进展 被引量:2
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作者 程昭栋 胡世莲 《中国临床保健杂志》 CAS 2010年第5期554-556,共3页
关键词 动脉粥样硬化形成 基因甲基化 致动脉粥样硬化 心血管疾病 表观遗传修饰 DNA甲基化 相关基因转录 表观遗传学
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TMPRSS2:ERG融合基因与前列腺原位癌和外周转移癌的相关性研究 被引量:1
7
作者 毛易捷 史伟峰 李青 《国际检验医学杂志》 CAS 2013年第1期44-45,48,共3页
目的分析跨膜丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)基因和ETS转录因子家族成员相关基因(ERG)融合基因与前列腺原位癌和外周转移癌的相关性。方法采用荧光原位杂交技术对24例前列腺癌(PCa)患者组织标本进行TMPRSS2:ERG融合基因检测,评价TMPRSS2:ERG与... 目的分析跨膜丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)基因和ETS转录因子家族成员相关基因(ERG)融合基因与前列腺原位癌和外周转移癌的相关性。方法采用荧光原位杂交技术对24例前列腺癌(PCa)患者组织标本进行TMPRSS2:ERG融合基因检测,评价TMPRSS2:ERG与前列腺原位癌和外周转移癌的相关性。结果 6例PCa原发癌患者中,4例检出TMPRSS2:ERG融合基因;18例转移性PCa患者中,14例检出该融合基因。外周淋巴结组织标本TMPRSS2:ERG融合基因阳性率为100%(8/8)。14例融合基因阳性转移性PCa患者原发病灶和转移病灶具有一致的融合基因情况。结论 TMPRSS2:ERG融合基因具有较高的PCa诊断特异性和敏感性;应对该融合基因阳性患者尽早采取综合、有效的治疗措施,从而延长患者生存期。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 融合基因 原位杂交 荧光 ETS转录因子相关基因 跨膜丝氨酸蛋白酶2
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不同基因突变的急性髓系白血病患者的疗效及预后研究进展 被引量:3
8
作者 刘洋 刘述川 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第22期4284-4289,共6页
急性髓系白血病(AML)是一组起源于造血干细胞的血液系统恶性肿瘤。近年来细胞遗传学改变被认为是AML患者重要的独立预后因素。FLT3、NPM1、RUNX1及WT1基因突变已成为重要的危险分层评价指标。其中FLT3-ITD突变可导致白血病细胞增殖失控... 急性髓系白血病(AML)是一组起源于造血干细胞的血液系统恶性肿瘤。近年来细胞遗传学改变被认为是AML患者重要的独立预后因素。FLT3、NPM1、RUNX1及WT1基因突变已成为重要的危险分层评价指标。其中FLT3-ITD突变可导致白血病细胞增殖失控,是独立预后不良因素。NPM1突变预示着更好的预后,可考虑选择全反式维甲酸和砷剂联合治疗、抗CD33单抗、放线菌素等治疗。RUNX1基因突变是近年来在髓系肿瘤中发现的热点突变,在初发核型正常AML中频发,与短的总体生存时间及不成熟的细胞形态有关,被认为是维持AML生存所必需的肿瘤抑制因子。WT1基因为调节造血和凋亡的肿瘤抑制基因,表达高低可能与临床缓解和复发有关,可作为潜在的预后因素和特异性免疫治疗的新靶点。复发时用定量PCR方法检测NPM1突变较WT1更具优势。本文就以上分子标志作一综述。旨在寻找潜在的基因靶点,为开发精准治疗AML的新型基因靶向药物提供参考。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 FMS样酪氨酸激酶3基因 核磷蛋白基因 Runt相关转录因子基因 Wilms肿瘤1基因
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转录因子OCT4、SOX2在胃癌中的表达及临床意义 被引量:2
9
作者 赵桂斌 江川 《中国实用医药》 2015年第34期21-23,共3页
目的观察POU5fl转录因子-4(OCT4)及性别决定基因相关转录因子-2(SOX2)在胃癌组织表达的变化及其与胃癌病理特征的相关性。方法 48例胃癌组织作为研究对象,48例胃正常组织作为对照(距离肿瘤病灶>10 cm)。利用免疫组化检测手段比较OCT4... 目的观察POU5fl转录因子-4(OCT4)及性别决定基因相关转录因子-2(SOX2)在胃癌组织表达的变化及其与胃癌病理特征的相关性。方法 48例胃癌组织作为研究对象,48例胃正常组织作为对照(距离肿瘤病灶>10 cm)。利用免疫组化检测手段比较OCT4及SOX2在胃癌组织及胃正常组织的变化,分析其与胃癌各病理指标的相关性。结果 OCT4及SOX2在胃癌组织阳性表达率分别为75.0%及25.0%,胃正常组织分别为27.1%及64.6%,癌组织与正常组织比较差异均有统计学意义(P<0.005);OCT4与SOX2蛋白在癌组织表达呈负相关性(r=-3.29,P=0.002<0.05)。经过分析后发现OCT4在胃癌组织的表达与淋巴结转移和TNM分期及分化程度有关(P<0.05),SOX2在胃癌组织的表达与胃癌的TNM分期和淋巴结转移及分化程度有关(P<0.05)。结论胃癌的发生可能与OCT4升高、SOX2的下调有关,OCT4及SOX2的联合检测可作为预测胃癌发展的靶指标。 展开更多
关键词 胃癌 POU5fl转录因子-4 性别决定基因相关转录因子-2 病理特征
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非小细胞肺癌患者血浆 RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO 基因甲基化状态观察 被引量:7
10
作者 曹丽 孙阳阳 +3 位作者 曹若琼 张毅 王建飞 钟理 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第43期84-87,共4页
目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)患者血浆抑癌基因runt相关转录因子3(RUNX3)、ras相关结构域家族基因1A(RASSF1A)、3-0-硫基转移酶-2(3-OST-2)、死亡相关蛋白激酶(DAPK)、膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O(PTPRO)等基因启动子区域的甲基化状... 目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)患者血浆抑癌基因runt相关转录因子3(RUNX3)、ras相关结构域家族基因1A(RASSF1A)、3-0-硫基转移酶-2(3-OST-2)、死亡相关蛋白激酶(DAPK)、膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O(PTPRO)等基因启动子区域的甲基化状态。方法采用甲基化特异PCR技术对63例NSCLC患者血浆中RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因是否甲基化进行观察,并以25例健康人作对照。结果 NSCLC患者血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率分别为46.0%、50.8%、26.9%、34.9%、41.3%;健康人血浆中甲基化PTPRO基因检出率为12.0%,而甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK均未检出;两者甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率相比,P均<0.05。NSCLC患者血浆中上述5种甲基化基因联合检测的敏感度为88.9%、特异度为88.0%。血浆甲基化RUNX3基因检出率与NSCLC的病理类型、临床分期以及分化程度有关(P均<0.05);甲基化RASSF1A基因检出率与NSCLC的分化程度有关(P<0.05)。结论 NSCLC患者血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率明显高于健康人。联合检测血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因有可能会有助于NSCLC的早期诊断及其生物学行为的判断。 展开更多
关键词 抑癌基因 runt相关转录因子3基因 ras相关结构域家族基因1A 3-0-硫基转移酶-2基因 死亡相关 蛋白激酶基因 膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O基因 甲基化基因 基因启动子区域 肺肿瘤 非小细胞肺癌
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RUNX3基因rs2236852多态性与胃癌的关系
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作者 鞠亚菲 隋牮箐 +1 位作者 宋明全 姜相君 《胃肠病学》 2013年第8期487-489,共3页
背景:Runt相关转录因子3(RUNX3)基因多态性与亚洲人群胃癌的发生相关。目的:初步探讨RUNX3基因rs2236852多态性与中国汉族人群胃癌发病风险之间的关系。方法:选取2011年3月~2013年4月青岛大学医学院附属青岛市市立医院确诊的310例胃癌... 背景:Runt相关转录因子3(RUNX3)基因多态性与亚洲人群胃癌的发生相关。目的:初步探讨RUNX3基因rs2236852多态性与中国汉族人群胃癌发病风险之间的关系。方法:选取2011年3月~2013年4月青岛大学医学院附属青岛市市立医院确诊的310例胃癌患者,以327名健康者作为对照。采用DNA直接测序法检测RUNX3rs2236852位点基因型,并分析其与胃癌发病风险之间的关系。结果:胃癌组RUNX3 rs2236852基因型分布频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。与AA基因型相比,GG基因型能显著增加胃癌的发病风险(OR=2.46,95%CI:1.60~3.78);AG基因型可增加胃癌发病风险,但差异无统计学意义(OR=1.58,95%CI:0.99~+2.54)。结论:RUNX3 rs2236852位点GG基因型可能与中国汉族人群的胃癌发病有关。 展开更多
关键词 Runt相关转录因子3基因 多态性 单核苷酸 基因 胃肿瘤
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中华鳖(Pelodiscus sinensis)MITF基因的生物信息学及表达差异研究 被引量:3
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作者 田儒品 张海琪 +3 位作者 许晓军 何中央 丁雪燕 苏胜齐 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期662-670,共9页
小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)是一种黑色素细胞重要的转录因子。本研究通过中华鳖(Pelodiscus sinensis)的肝脏组织进行转录组测序,获得MITF基因的全长序列,生物信息学分析结果显示中华... 小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)是一种黑色素细胞重要的转录因子。本研究通过中华鳖(Pelodiscus sinensis)的肝脏组织进行转录组测序,获得MITF基因的全长序列,生物信息学分析结果显示中华鳖MITF基因5’和3’非编码区分别为32bp和175bp,开放阅读框1512bp,编码503个氨基酸,预测蛋白分子质量为56kDa,理论等点电为6.06。中华鳖MITF蛋白二级结构预测显示,α-螺旋(Alpha helix)占25.37%,延伸链(Extended strand)占20.90%,β-转角(Beta-turn)占7.76%,无规则卷曲(Random coil)占45.97%。氨基酸序列多重比对分析显示,中华鳖MITF基因核苷酸序列与绿海龟、西部锦龟、美国短吻鳄、非洲爪蟾和人的同源性分别为93%、93%、85%、58%和76%。构建进化树分析表明,中华鳖与西部锦龟、绿海龟MITF基因分子进化距离最近,亲缘关系最密切。实时荧光定量PCR对中华鳖8个组织MITF基因表达差异性研究结果表明,该基因在中华鳖的肌肉表达量最高,心脏次之,二者存在显著性差异,肝脏、脾脏、肺、肾脏、眼、皮肤等组织表达量相对较少,显著低于肌肉和心脏。这些研究结果不仅为研究中华鳖MITF基因在黑色素合成过程中的重要作用提供理论基础,还有助于了解龟鳖类体色调控的内在机理,同时也可为中华鳖等爬行动物的遗传育种提供参考。 展开更多
关键词 中华鳖 小眼畸形相关转录因子(MITF)基因 体色 转录 基因表达
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膝关节骨关节炎中miR-1271的表达及其与ERG的相关性分析
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作者 俞东升 董涛 +1 位作者 夏洪超 徐建 《局解手术学杂志》 2022年第3期231-234,共4页
目的探讨miR-1271在膝关节骨关节炎中的表达情况及其与E26转录因子相关基因(ERG)的相关性。方法选取我院60例膝关节骨关节炎患者作为OA组,另选取60例外伤导致的单纯膝关节半月板损伤患者(非OA组)作为对照。采用qRT-PCR检测膝关节滑液中m... 目的探讨miR-1271在膝关节骨关节炎中的表达情况及其与E26转录因子相关基因(ERG)的相关性。方法选取我院60例膝关节骨关节炎患者作为OA组,另选取60例外伤导致的单纯膝关节半月板损伤患者(非OA组)作为对照。采用qRT-PCR检测膝关节滑液中miR-1271与ERG的表达水平;采用双荧光素酶报告基因实验检测miR-1271与ERG的靶向结合关系;miR-1271与ERG的相关性采用Spearman分析。结果qRT-PCR检测结果显示,与非OA组相比,OA组miR-1271在膝关节骨关节炎中显著高表达(P<0.001),而ERG在膝关节骨关节炎中显著低表达(P<0.001)。OA组关节滑液中miR-1271与ERG的表达呈负相关(r=-0.746,P=0.013),非OA组关节滑液中miR-1271与ERG的表达也呈负相关(r=-0.723,P=0.024)。双荧光素酶报告基因实验结果显示,与共转染NC mimic和PGLO-ERG WT细胞相比,共转染miR-1271 mimic和PGLO-ERG WT细胞的荧光强度显著降低(P<0.001);而共转染NC mimic和PGLO-ERG MUT细胞与共转染miR-1271 mimic和PGLO-ERG MUT细胞的荧光强度比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论miR-1271在膝关节骨关节炎患者中显著高表达,而ERG在膝关节骨关节炎患者中显著低表达,且miR-1271可靶向ERG进行负性调控,对膝关节骨关节炎的发生发展起重要作用。 展开更多
关键词 膝关节骨关节炎 miR-1271 E26转录因子相关基因 双荧光素酶
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外周血RUNX2基因甲基化及表达水平与乳腺癌新辅助化疗敏感性的相关性研究
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作者 胡东玉 谷振芳 冯蕾 《中华内分泌外科杂志》 CAS 2023年第6期739-743,共5页
目的探讨外周血Runt相关转录因子2(Runt associated transcription factor 2,RUNX2)基因甲基化及表达水平与乳腺癌新辅助化疗敏感性的相关性。方法纳入2021年1月至2022年6月于济宁医学院附属医院首次接受全程新辅助化疗并进行手术切除... 目的探讨外周血Runt相关转录因子2(Runt associated transcription factor 2,RUNX2)基因甲基化及表达水平与乳腺癌新辅助化疗敏感性的相关性。方法纳入2021年1月至2022年6月于济宁医学院附属医院首次接受全程新辅助化疗并进行手术切除治疗的90例女性乳腺癌患者作为研究对象,同时纳入同期于我院进行体检的90名健康女性作为对照组。采用亚硫酸盐转化法检测所有研究对象的外周血RUNX2基因甲基化水平,采用荧光定量PCR反应检测所有研究对象的外周血RUNX2基因mRNA表达水平。将乳腺癌患者经新辅助化疗后的效果分为敏感和不敏感组。结果乳腺癌患者外周血RUNX2基因甲基化阳性率为41.11%(37/90),显著低于对照组64.44%(58/90),差异有统计学意义(χ^(2)=9.83,P=0.002);乳腺癌患者的外周血RUNX2基因mRNA表达水平为1.73±0.24,显著高于对照组1.19±0.18,差异有统计学意义(t=5.22,P<0.001)。乳腺癌患者外周血RUNX2基因甲基化阳性患者的基因mRNA表达水平为1.26±0.20,显著低于RUNX2基因甲基化阴性患者1.84±0.26,差异有统计学意义(t=4.98,P<0.001)。乳腺癌新辅助化疗敏感者的外周血RUNX2基因甲基化阳性率为49.28%(34/69),显著高于不敏感者14.29%(3/21),差异有统计学意义(χ^(2)=8.14,P=0.004)。新辅助化疗敏感者的外周血RUNX2基因mRNA表达水平为1.62±0.17,显著低于不敏感者2.09±0.22,差异有统计学意义(t=5.28,P<0.001)。ROC曲线结果显示外周血RUNX2基因mRNA表达水平预测乳腺癌新辅助化疗效果的灵敏度和特异度分别为85.7%和85.5%。结论外周血RUNX2基因甲基化及表达水平与乳腺癌新辅助化疗敏感性有关,可作为预测乳腺癌新辅助化疗疗效的标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 Runt相关转录因子2基因 DNA甲基化 新辅助化疗
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红细胞转化特异性转录因子相关基因的生物信息学研究
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作者 梁辉 张建文 +2 位作者 胡七一 植凡 张圣平 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1515-1517,共3页
目的利用生物信息学方法分析人红细胞转化特异性转录因子(ETS)相关基因(ERG)以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供理论依据。方法通过GenBank搜索ERG基因序列(NM_001136154)及蛋白序列(NP_001230357),采用... 目的利用生物信息学方法分析人红细胞转化特异性转录因子(ETS)相关基因(ERG)以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供理论依据。方法通过GenBank搜索ERG基因序列(NM_001136154)及蛋白序列(NP_001230357),采用生物信息学方法分析该基因在不同物种中的差异,分析该蛋白的亚细胞定位、二级结构、功能域以及相互作用蛋白。结果该基因编码一个长度为468个氨基酸的蛋白质,具有2个PNT和ETS两个功能域。ERG蛋白理论相对分子质量为53837.51,理论等电点为7.29。二级结构中α螺旋(H)占比12.35%,β折叠(E)占比3.50%,无规卷曲占比84.16%。ERG蛋白含有4个可能的N连接糖基化位点,11个潜在的酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个豆蔻酰基化位点,7个蛋白激酶C(PKC)磷酸化位点以及1个酪氨酸激酶磷酸化位点。并进一步利用STRING分析了该蛋白的相互作用网络。结论利用生物信息学预测出的结构和功能信息,为ERG的相关研究提供一定的信息基础。 展开更多
关键词 跨膜丝氨酸蛋白酶2-红细胞转化特异性转录因子相关基因 前列腺癌 生物信息学
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人肺腺癌转移相关转录本1基因在上皮性卵巢癌中的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 黄群 王莉 王红英 《肿瘤研究与临床》 CAS 2015年第11期745-747,759,共4页
目的研究长链非编码人肺腺癌转移相关转录本1(MALAT-1)mRNA在上皮性卵巢癌组织中的表达及其临床意义。方法采用实时荧光定量反转录一聚合酶链反应(RT.PCR)方法检测29例上皮性卵巢癌组织和20例正常卵巢组织中MALAT-lmRNA的表达,并... 目的研究长链非编码人肺腺癌转移相关转录本1(MALAT-1)mRNA在上皮性卵巢癌组织中的表达及其临床意义。方法采用实时荧光定量反转录一聚合酶链反应(RT.PCR)方法检测29例上皮性卵巢癌组织和20例正常卵巢组织中MALAT-lmRNA的表达,并分析其表达的差异与患者临床病理特征的关系。结果MALAT-1mRNA在上皮性卵巢癌组织中的相对表达量低于正常卵巢组织(0.089±0.090比1.450±1.404),差异有统计学意义(t=4.331,P〈0.001);肿瘤分期为Ⅲ、Ⅳ期的肿瘤组织中MALAT-1mRNA的相对表达量低于Ⅰ、Ⅱ期(0.044±0.043比0.174±0.095),差异有统计学意义(t=-5.125,P〈0.05);病理类型为中低分化、低分化及未分化的卵巢癌组织中MALAT-1mRNA的相对表达量低于高分化组织(O.070±0.091比0.161±0.021),差异有统计学意义(t=2.409,P=O.023);发生大网膜或淋巴组织转移的卵巢癌组织中MALAT-1mRNA的相对表达量低于未发生远处转移的卵巢癌组织(0.045±0.047比0.142±0.102),差异有统计学意义(t=3.378,P=0.002)。结论MALAT-1在上皮性卵巢癌组织中低表达,并且与卵巢癌的临床分期、病理分级、大网膜或淋巴结转移有相关性。提示MALAT-1与卵巢癌的恶性程度显著相关,在卵巢癌的发生和发展中可能起到了抑癌基因的作用。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 长链非编码RNA 人肺腺癌转移相关转录本1基因
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血清lncRNA MIAT、HMGB1水平变化与急性心源性脑梗死病情及预后的关系
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作者 江涛 许昕炜 姜加宏 《山东医药》 CAS 2023年第35期55-58,共4页
目的 观察急性心源性脑梗死患者血清长链非编码RNA心肌梗死相关转录基因(lncRNA MIAT)、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)水平变化,并探讨其与病情严重程度及预后的关系。方法 选择急性心源性脑梗死患者122例作为观察组(其中预后不良32例、预后... 目的 观察急性心源性脑梗死患者血清长链非编码RNA心肌梗死相关转录基因(lncRNA MIAT)、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)水平变化,并探讨其与病情严重程度及预后的关系。方法 选择急性心源性脑梗死患者122例作为观察组(其中预后不良32例、预后良好90例),同期体检健康志愿者118例作为对照组。采用ELISA法检测血清HMGB1水平,实时荧光定量PCR法检测血清lncRNA MIAT水平;采用Spearman相关性分析急性心源性脑梗死患者血清lncRNA MIAT、HMGB1水平与梗死面积、美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分的关系;采用多元逐步回归分析急性心源性脑梗死患者预后不良的影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA MIAT、HMGB1水平单独及联合检测对急性心源性脑梗死患者预后不良的预测价值。结果 观察组血清lncRNA MIAT、HMGB1水平均高于对照组(P均<0.05)。大面积梗死、NIHSS评分为≥16分的患者血清lncRNA MIAT、HMGB1分别低于小/中面积梗死、NIHSS评分<16分者,预后不良患者的血清lncRNA MIAT、HMGB1水平高于预后良好者(P均<0.05)。急性心源性脑梗死患者血清lncRNA MIAT、HMGB1水平与梗死面积、NIHSS评分均呈正相关关系(P均<0.05)。多元逐步回归分析结果显示,血清lncRNA MIAT、HMGB1水平升高及大面积梗死均是急性心源性脑梗死患者预后不良的独立危险因素(P均<0.05)。血清lncRNA MIAT、HMGB1单独及联合预测急性心源性脑梗死患者预后不良的曲线下面积分别为0.847、0.779、0.937,联合预测的曲线下面积高于二者单独预测(P均<0.05)。结论 急性心源性脑梗死患者血清lncRNA MIAT、HMGB1水平均升高,且与患者的病情严重程度有关,二者联合检测有助于预测患者的预后。 展开更多
关键词 急性心源性脑梗死 长链非编码RNA 心肌梗死相关转录基因 高迁移率族蛋白B1
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矮小同源盒基因亚型2、Runt相关转录因子3基因甲基化在肺癌发生发展中的意义 被引量:5
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作者 黄晖 冯旭 孔勇 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期758-760,共3页
目的探讨矮小同源盒基因亚型2(SHOX2)、Runt相关转录因子3(Runx3)基因甲基化在非小细胞肺癌(NSCLC)发生发展过程中的意义。 方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)方法检测70例癌组织、60例癌旁组织和30例非肺癌良性切除组织... 目的探讨矮小同源盒基因亚型2(SHOX2)、Runt相关转录因子3(Runx3)基因甲基化在非小细胞肺癌(NSCLC)发生发展过程中的意义。 方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)方法检测70例癌组织、60例癌旁组织和30例非肺癌良性切除组织中SHOX2、Runx3基因启动子区的甲基化率,分析NSCLC患者癌组织与癌旁组织甲基化水平的差异,并分析性别、年龄、吸烟史、临床分期及病理分型、分化程度、淋巴结转移对基因启动子区甲基化率的影响。 结果70例肺癌组织、60例癌旁组织、30例非肺癌良性切除组织中SHOX2、Runx3基因启动子区甲基化检出率分别为68.57%(48/70)、62.86%(44/70);8.33%(5/60)、5.00%(3/60);6.67%(2/30)、3.33%(1/29),三者基因甲基化检出率比较,差异有统计学意义(χ2=64.530,P=0.000;χ2=63.350,P=0.000)。SHOX2基因启动子区甲基化与分化程度(χ2=8.672,P=0.003)、淋巴结转移(χ2=6.481,P=0.011)明显相关;RUNX3基因启动子甲基化与病理分型(χ2=4.749,P=0.029)、临床分期(χ2=7.035,P=0.008)、分化程度(χ2=9.341,P=0.002)、淋巴结转移(χ2=5.240,P=0.022)明显相关。 结论SHOX2、Runx3基因启动子区的甲基化与NSCLC有关。 展开更多
关键词 肺癌 矮小同源盒基因亚型2 Runt相关转录因子3基因 甲基化特异性聚 合酶链反应 基因甲基化
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胚胎发育相关基因精子转录本在白血病细胞系中的表达及其调节
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作者 安莉莉 马小彤 +3 位作者 石洋 林永敏 郑国光 吴克复 《白血病.淋巴瘤》 CAS 2006年第1期1-3,9,共4页
目的探讨胚胎发育相关基因(EDAG)在白血病细胞中的调控机制。方法用半定量RT-PCR方法检测白血病细胞系中EDAG精子转录本EDAG-t的表达;使用不同的分化诱导剂诱导K562和U937细胞分化,检测EDAG-t的表达改变情况。结果在白血病细胞系K562和U... 目的探讨胚胎发育相关基因(EDAG)在白血病细胞中的调控机制。方法用半定量RT-PCR方法检测白血病细胞系中EDAG精子转录本EDAG-t的表达;使用不同的分化诱导剂诱导K562和U937细胞分化,检测EDAG-t的表达改变情况。结果在白血病细胞系K562和U937中也可检测到EDAG-t的表达;使用不同的分化诱导剂诱导K562和U937细胞分化,发现EDAG精子转录本和造血转录本的表达都会随细胞分化而下调,但它们的下调步伐不一致,总的说来,EDAG-t的减弱较EDAG-h慢。结论EDAG精子转录本在白血病细胞中的异常表达值得进一步研究。 展开更多
关键词 胚胎发育相关基因精予转录 白血病细胞系
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核磷蛋白1与Runt相关转录因子1基因共突变对非急性早幼粒细胞白血病型急性髓系白血病患者化疗疗效及预后的影响
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作者 刘石琳 彭栋 +2 位作者 陈鹏 逯霞 石雨薇 《临床内科杂志》 CAS 2022年第10期688-691,共4页
目的探讨核磷蛋白1(NPM1)与Runt相关转录因子1(RUNX1)基因共突变对非急性早幼粒细胞白血病(M3)型急性髓系白血病(AML)患者化疗疗效及预后的影响。方法纳入120例非M3型AML患者,收集其一般临床资料(性别、年龄、AML类型、骨髓幼稚细胞数量... 目的探讨核磷蛋白1(NPM1)与Runt相关转录因子1(RUNX1)基因共突变对非急性早幼粒细胞白血病(M3)型急性髓系白血病(AML)患者化疗疗效及预后的影响。方法纳入120例非M3型AML患者,收集其一般临床资料(性别、年龄、AML类型、骨髓幼稚细胞数量)、初诊时血常规结果[WBC计数、中性粒细胞(NEU)计数、淋巴细胞(LYM)计数]及化疗疗效。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测患者NPM1与RUNX1基因表达情况,根据基因突变检测情况将120例患者分别分为NPM1基因突变型组(33例)和NPM1基因野生型组(87例)、RUNX1基因突变型组(26例)和RUNX1基因野生型组(94例)、NPM1与RUNX1基因共突变型组(23例)和NPM1与RUNX1基因野生型组(97例)。比较不同NPM1与RUNX1基因型组患者一般临床资料、初诊时血常规结果及化疗疗效。采用Kaplan-Meier生存分析评估NPM1和RUNX1基因与非M3型AML患者预后的相关性。采用多因素logistic分析探讨影响非M3型AML患者化疗预后的因素。结果与正常核型患者相比,异常核型患者NPM1基因突变与RUNX1基因突变比例均较高(P<0.05)。NPM1基因野生型组与NPM1基因突变型组、RUNX1基因野生型组与RUNX1基因突变型组、NPM1与RUNX1基因野生型组与NPM1与RUNX1基因突变型组患者性别、年龄、AML类型及初诊血常规中WBC、NEU、LYM计数比较差异均无统计学意义(P>0.05)。NPM1基因突变型组患者化疗有效率效显著高于NPM1基因野生型组,NPM1与RUNX1基因共突变组患者化疗有效率显著高于NPM1与RUNX1基因野生型组(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,随访2年NPM1与RUNX1基因共突变患者总生存期(OS)长于NPM1与RUNX1基因野生型,而NPM1或RUNX1基因单突变患者OS介于前两者之间(P<0.05)。多因素logistic分析结果显示,骨髓幼稚细胞数量是接受化疗的非M3型AML患者化疗后2年生存率的危险因素(P=0.018),而NPM1与RUNX1基因共突变是其保护因素(P=0.026)。结论NPM1与RUNX1基因共突变的非M3型AML患者化疗疗效及预后较佳。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 核磷蛋白1基因 Runt相关转录因子基因 预后
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