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天然抵抗力相关巨噬细胞蛋白研究进展 被引量:1
1
作者 张克斌 董解菊 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第B06期78-80.8,共4页
天然抵抗力相关巨噬细胞蛋白家族是一类离子转运蛋白 ,存在于多种生物细胞中。在哺乳动物中它与机体对巨噬细胞内寄生病原体的抵抗力密切相关。本文对该蛋白的分子生物学和功能方面的研究进展作一综述。
关键词 天然抵抗力 相关巨噬细胞蛋白 研究进展 蛋白
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藏猪天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因克隆及变异研究 被引量:4
2
作者 郑王山 程箫 赵生国 《畜牧兽医杂志》 2015年第6期1-6,9,共7页
采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779... 采用克隆及测序相结合的方法,研究了藏猪、甘肃黑猪、大白猪、约克夏猪和杜洛克五个猪种天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage protein,NRAMP1)基因全序及其结构和变异。分析表明,猪NRAMP1基因全长12779bp,其中包含14个内含子、15外显子,编码区全长1614bp,编码538个氨基酸。5'端非编码区存在2个核苷酸突变,3'端非编码区存在有10个核苷酸突变和1个碱基缺失,14个内含子存在11个变异位点。外显子有18个碱基突变,仅有4个有义突变位点(T2551G、A2552T、C4881A、T12113C),分别导致四个氨基酸(100(V→G)、100(V→G)、137(P→T)、471(L→P))的改变,有可能引起NRAMP1基因编码所蛋白质的跨膜结构域、三级结构或更高级结构以及其空间排列发生变化,导致藏猪和其他猪种抗病性存在差异,为揭示猪NRAMP1基因抗病性的分子机理奠定了理论基础。 展开更多
关键词 天然抗性相关巨噬细胞蛋白 藏猪 分子机理
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烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析 被引量:1
3
作者 陈邦兰 翟梦倩 +6 位作者 龙涛 赵顺程 刘娟 尹茂灵 万心言 王治杰 刘继恺 《安徽农业科学》 CAS 2021年第3期100-104,109,共6页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信... 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 自然抗性相关巨噬细胞蛋白 烟草 基因家族 表达分析
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人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因多态性与中国人群结核易感性的Meta分析 被引量:1
4
作者 于莹莹 栾潇潇 《中国医药》 2011年第4期463-465,共3页
目的 应用Meta分析探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因3'UTR多态性位点与中国人群结核病易感性的关系.方法 应用主题词和关键词检索网络数据库PubMed(1990-2010)、外文全文生物医学期刊(1995-2010)、中国医院数字图... 目的 应用Meta分析探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因3'UTR多态性位点与中国人群结核病易感性的关系.方法 应用主题词和关键词检索网络数据库PubMed(1990-2010)、外文全文生物医学期刊(1995-2010)、中国医院数字图书馆(1994-2010)、中国生物医学文献数据库(1977-2010)、WHOICTRP、WH0 EML等数据库和网站中所有有关文献,并辅以文献追溯方法,按照〈药品文献评价指导原则〉同时采用Cochrane协作网提供的RevMan 4.2软件分析数据.结果 最终纳入6篇研究文献.Meta分析结果 显示,中国人群NRAMPZ基因3'UTR多态性位点TGTG+/+、TGTG+/-及TGTG-/-的相对危险度分别为0.61(95%CI0.49~0.75)、1.06(95%CI1.40~2.34)和0.77(95%CI0.40~1.24).结论 NRAM P1基因3'UTR多态性与中国人群结核病易感性的相关性有待进一步探讨. 展开更多
关键词 结核 人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1 疾病易感性 META分析
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因与云南汉族人肺结核易感性的相关性研究
5
作者 高学祯 孙凯琳 +2 位作者 陆霓虹 沈莉 王毅鹏 《蚌埠医学院学报》 CAS 2019年第10期1301-1304,共4页
目的:探究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因D543N、INT4位点多态性与肺结核易感的相关性。方法:采用病例-对照研究,挑选122例痰涂片阳性的云南汉族活动性肺结核病人为病例组,另选同期101名与病例组民族、年龄、性别相匹配的健康... 目的:探究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因D543N、INT4位点多态性与肺结核易感的相关性。方法:采用病例-对照研究,挑选122例痰涂片阳性的云南汉族活动性肺结核病人为病例组,另选同期101名与病例组民族、年龄、性别相匹配的健康体检者为对照组。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对2组入选者NRAMP1基因D543N、INT4位点多态性进行分型。结果:INT4位点野生纯合子(G/G)、杂合子(G/C)、突变纯合子(C/C)在病例组和对照组的分布频率分别为66.4%、32.0%、1.6%和86.1%、12.9%、1.0%,2组差异有统计学意义(P<0.01),其中杂合型(G/C)携带者肺结核的患病风险为野生纯合型(G/G)的3.22倍(95%CI:1.61~6.47)。而D543N位点野生纯合子(G/G)、杂合子(G/A)、突变纯合子(A/A)在病例组和对照组的分布频率分别为61.5%、36.9%、1.6%和70.3%、29.7%、0%,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:基因INT4位点多态性可能影响云南汉族人群对肺结核的易感性。 展开更多
关键词 肺结核 自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因 多态性
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因多态性与肺结核易感性的研究 被引量:10
6
作者 刘玮 张翠英 +7 位作者 田磊 李春芝 吴晓明 赵秋敏 张泮河 杨淑梅 杨红 曹务春 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期408-411,共4页
目的 探讨自然抗性相关巨噬细胞蛋白 1基因 (NRAMP1)多态性与中国汉族人群肺结核发病的关系。方法 采用以医院为基础的病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)法检测NRAMP1基因中INT4、D5 4 3N及 3′... 目的 探讨自然抗性相关巨噬细胞蛋白 1基因 (NRAMP1)多态性与中国汉族人群肺结核发病的关系。方法 采用以医院为基础的病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)法检测NRAMP1基因中INT4、D5 4 3N及 3′UTR 3个多态性位点的基因型 ,并对结核病相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件logistic回归分析。2 0 0 1年 4月至 2 0 0 2年 6月选择 110例肺结核病例 ,平均年龄为 (2 8± 13)岁 ;对照组为 180名健康体检者 ,平均年龄为 (2 7± 9)岁。对NRAMP1基因各多态性位点进行单因素分析。结果 病例组D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 2 2 2 (1 0 3~ 4 78)和 1 93(1 14~ 3 2 6 )。病例组和对照INT4各基因型频率比较差异无显著性。多因素分析调整暴露史和疫苗接种史 2个因素后 ,D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型仍与结核病显著相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3 0 4 (1 12~ 8 2 7)和 2 36 (1 2 0~ 4 6 4 ) ,而病例和对照组INT4位点多态性比较差异未见显著性。结论 NRAMP1基因D5 4 3N及 3′UTR位点多态性可能是汉族人群肺结核的易感因素。 展开更多
关键词 自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因 基因多态性 肺结核 易感性 中国 汉族人群
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自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因及其与结核病的关系
7
作者 李锋 李凫坚 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期319-320,共2页
结核病在世界范围内的卷土重来引起人们的再次关注。在感染人群中,发病个体仅占1/10,提示遗传背景差异可能与结核病易感性有关。自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1.NRAMP1)基因是目... 结核病在世界范围内的卷土重来引起人们的再次关注。在感染人群中,发病个体仅占1/10,提示遗传背景差异可能与结核病易感性有关。自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1.NRAMP1)基因是目前研究较多的结核病易感基因之一,我们就NRAMP1基因及其与结核病的关系作一综述。 展开更多
关键词 自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因 结核病 NRAMP1基因 PROTEIN 世界范围 感染人群 遗传背景 易感基因
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自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因多态性与结核病易感性的关系研究进展 被引量:2
8
作者 许洪 张宏其 《中国矫形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第21期1964-1967,共4页
结核病是由结核分枝杆菌引起的感染性疾病。结核病的发生发展受多种因素影响,其中自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance-associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因多态性与结核易感性密切相关。目前,自然抵抗相关巨噬细胞... 结核病是由结核分枝杆菌引起的感染性疾病。结核病的发生发展受多种因素影响,其中自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance-associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因多态性与结核易感性密切相关。目前,自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因主要有4个单核苷酸位点多态性与结核病有关:5'(GT)n、INT4、D543N和3'UTR。本文就自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因与结核病的关系予以综述。 展开更多
关键词 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1 结核 基因多态性 易感性
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单核巨噬细胞系统铁代谢调控机制 被引量:3
9
作者 孔卫娜 段相林 常彦忠 《自然科学进展》 北大核心 2008年第6期615-621,共7页
机体存在着严格的铁代谢调节机制,确保体内的铁始终处于正常的生理水平.单核巨噬细胞系统(mononuclear phagocyte system,包括单核细胞、巨噬细胞及其前体细胞)在机体铁稳态的调节过程中起着关键的作用,不仅可以从衰老的红细胞中回收铁... 机体存在着严格的铁代谢调节机制,确保体内的铁始终处于正常的生理水平.单核巨噬细胞系统(mononuclear phagocyte system,包括单核细胞、巨噬细胞及其前体细胞)在机体铁稳态的调节过程中起着关键的作用,不仅可以从衰老的红细胞中回收铁,还可以作为过量铁的贮存库,在机体需铁时将其释放到血液.然而,调控这一过程的分子机制还不甚清楚,近年来,随着CD163,天然抵抗力相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance-associated macrophage protein 1,Nramp1),二价金属离子转运蛋白1(divalent metal transporter 1,DMT1),HFE(HLA-linked hemechromatosis gene,HFE),膜铁转运蛋白1(ferroportin 1,FPN1),尤其是铁调素(hepcidin)的相继发现,使人们对单核巨噬细胞系统的铁代谢过程和调控机制有了较为全面的了解,为人们正确理解机体铁稳态和相关疾病提供了很大帮助. 展开更多
关键词 单核细胞系统 CD163 天然抵抗力相关巨噬细胞蛋白 l 二价金属离子转运蛋白 l HFE 膜铁 转运蛋白 l 铁调素
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人突触相关蛋白抗原表位分析、抗体制备及表达研究 被引量:1
10
作者 杨向东 王仁 +4 位作者 刘俊文 屈顺林 郭芳 王蕾 盛树力 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1119-1124,共6页
突触相关蛋白家族成员的功能与神经突触膜上的谷氨酸酯受体和钾离子通道的定位和功能有关 ,参与神经递质的释放、神经的生长、发育及修复 .为分析一个新的人突触相关蛋白基因 (FRG4 )的抗原表位和该蛋白质在血管细胞的表达 ,从人胎肝文... 突触相关蛋白家族成员的功能与神经突触膜上的谷氨酸酯受体和钾离子通道的定位和功能有关 ,参与神经递质的释放、神经的生长、发育及修复 .为分析一个新的人突触相关蛋白基因 (FRG4 )的抗原表位和该蛋白质在血管细胞的表达 ,从人胎肝文库PCR扩增获得FRG4基因全长cDNA序列 .通过生物信息学分析 ,预测FRG4编码氨基酸序列的二级结构、抗原决定簇和功能结构域 ;选取抗原 13肽PKLVKEEVFWRNY ,采用固相多肽合成法合成了FRG4抗原多肽 ,免疫新西兰白兔获得兔抗人FRG4多抗 ;免疫组化检测该蛋白质在人血管细胞中的表达 .高效液相色谱检测显示制备的兔抗人FRG4多克隆抗体纯度达 82 79% ,抗体滴度为 1∶16 0 0 0 ,蛋白质印迹证实该抗体具有较好的反应性和特异性 ,免疫组化证实 ,其主要在平滑肌细胞和内皮细胞的胞浆中表达 .结果表明 ,成功制备了兔抗人FRG4抗体 ,FRG4蛋白主要在细胞胞浆中表达 。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 细胞 突触相关蛋白 多肽合成 生物信息学
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苦荞NRAMP家族全基因组鉴定
11
作者 李明锴 《生物化工》 CAS 2024年第2期11-17,33,共8页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组... 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance Associated Macrophage Protein,NRAMP)是一个高度保守的膜蛋白家族,在植物体中广泛参与过渡金属离子的跨膜转运。本研究基于基因组学,从重要粮食作物苦荞(Fagopyrum tataricum)的基因组中鉴定出11个NRAMP基因,并通过TBtools、Cell-PLoc、MEGA、SWISS-MODEL、SOPMA等工具对该家族成员的理化性质、保守基序、基因结构、系统发育关系、三维结构、顺式作用元件等方面进行了系统分析。结果发现,苦荞NRAMP基因家族在相同亚族下的保守基序和基因结构高度一致。此外,苦荞NRAMP基因的启动子区域中含有大量植物激素响应元件及胁迫响应元件,亚族间的元件分布存在明显差异。对苦荞NRAMP基因编码蛋白的三维结构、亚细胞定位以及顺式作用元件分析发现,FtNRAMP4、FtNRAMP10、FtNRAMP11三个成员和其他FtNRAMP具有差异。苦荞NRAMP蛋白的二级结构以α-螺旋为主,占比为35.37%~63.00%。本研究结果为深入挖掘苦荞NRAMP基因家族功能提供了科学依据。 展开更多
关键词 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP) 苦荞 基因家族 生物信息学
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青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性
12
作者 曹雪平 王兆芬 +4 位作者 王玉清 李斌 李咏雪 王玲 韩晓茹 《中国高原医学与生物学杂志》 2022年第1期44-50,共7页
目的研究青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。方出采用病例一对照研究,收集世居青海地区的273例肺结核患者为结核组,另选289名与结核组年龄、性别、民族、世居地相匹配的非结核患者为对照组。采用聚合酶链反应(PCR)技术扩... 目的研究青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。方出采用病例一对照研究,收集世居青海地区的273例肺结核患者为结核组,另选289名与结核组年龄、性别、民族、世居地相匹配的非结核患者为对照组。采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增3'UTR、D543NJNT4位点基因并测定基因型,分析青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性的相关性。结果(1)3'UTR位点TGTG/TGTG和TGTG/del+del/del基因型在结核组和对照组的分布频率分别为78.39%、21.61%和88.58%,11.42%,组间差异有统计学意义(P=0.001),TGTG/del+del/del基因型携带者患结核病的风险为野生纯合型TGTG/TGTG人群的2.139(1.354-3.440)倍,两组间TGTG.del等位基因频率有统计学差异(P=0.001);(2)D543N位点GG、GA基因型在结核组和对照组的分布频率分别为86.81%、13.19%和92.73%,7.27%,未见突变纯合子AA,组间差异有统计学意义(P<0.05),GA基因型携带者结核病的患病风险为野生纯合型GG的1.939(1.108~3.345)倍,两组间G、A等位基因频率有统计学差异(P<0.05);(3)INT4位点GG.GC+CC基因型在结核组和对照组的分布频率分别为8&64%、11.36%和90.66%、9.33%,无统计学差异(P>0.05),两组间G、C等位基因频率无统计学意义(P>0.05)o结论(l)NRAMPl基因3'UTR及D543N位点多态性可能与青海地区人群肺结核有关;(2)NRAMP1基因3'UTR-del及D543N-A等位基因可能与青海地区结核病易感性有关;(3)INT4位点多态性可能与青海地区人群对结核病的易感性无关。提示青海地区结核病易感性与NRAMP1基因多态性相关。 展开更多
关键词 自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1) 多态性 结核 易感性
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水稻OsNramp4介导锰离子吸收和转运的功能分析 被引量:1
13
作者 李少庄 莫伊凡 +3 位作者 郝小花 赵丹 胡爽 雷晗 《生命科学研究》 CAS 2023年第1期42-48,共7页
锰(Mn)是植物生长发育必需的矿质营养元素。水稻天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance-associated macrophage protein, OsNramp)家族有7个成员,其中4个具有Mn^(2+)转运活性。OsNramp4已被鉴定为一个铝离子转运蛋白,但尚未报道... 锰(Mn)是植物生长发育必需的矿质营养元素。水稻天然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance-associated macrophage protein, OsNramp)家族有7个成员,其中4个具有Mn^(2+)转运活性。OsNramp4已被鉴定为一个铝离子转运蛋白,但尚未报道其是否具有Mn^(2+)转运活性。本文利用Mn^(2+)吸收突变株Δsmf1进行OsNramp4功能互补实验,分析OsNramp4对Mn^(2+)的响应,研究环境Mn^(2+)胁迫对敲除突变体nramp4的生长势以及Mn^(2+)吸收和转运的影响。结果显示:OsNramp4能互补Δsmf1的Mn^(2+)吸收缺陷表型;水稻根部OsNramp4的表达受Mn^(2+)的诱导;高Mn^(2+)胁迫下, nramp4的长势明显优于野生型对照,突变体地上部Mn^(2+)含量显著低于野生型,且根-茎Mn^(2+)转运率明显低于野生型,暗示OsNramp4可能作为一个低亲和性Mn^(2+)转运蛋白,具有在高Mn^(2+)环境下吸收Mn^(2+),并由根部向地上组织运输Mn^(2+)的功能。本研究结果对深入探讨植物Mn^(2+)吸收、转运和分配的分子机制具有重要意义。 展开更多
关键词 锰离子转运蛋白 水稻天然抗性相关巨噬细胞蛋白4(OsNramp4) 水稻
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结核病易感基因的研究进展 被引量:1
14
作者 郭艳玲 刘洋 +2 位作者 宋长兴 岳思东 王甦民 《结核病与胸部肿瘤》 2009年第1期62-64,共3页
结核病在全世界一直以来都是一种重要的感染性疾病,然而仅1/10的感染者发病。除环境和暴露因素外,宿主遗传因素对引发结核起到不可忽视的作用…。已有研究表明几个候选基因与结核病易感有关,如自然抗性相关巨噬细胞蛋白l(Nrampl或S... 结核病在全世界一直以来都是一种重要的感染性疾病,然而仅1/10的感染者发病。除环境和暴露因素外,宿主遗传因素对引发结核起到不可忽视的作用…。已有研究表明几个候选基因与结核病易感有关,如自然抗性相关巨噬细胞蛋白l(Nrampl或Sicl1a1)基因、维生素受体(VDR)基因、人类白细胞抗原(HLA).DR2、甘露糖结合凝集素(MBL)基因等。这些易感基因的发现和研究对于建立和健全结核病预防和控制措施起到不可忽视的作用。 展开更多
关键词 结核病预防 易感基因 相关巨噬细胞蛋白 甘露糖结合凝集素 人类白细胞抗原 宿主遗传因素 感染性疾病 维生素受体
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半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选 被引量:4
15
作者 邢贺飞 高峰涛 +2 位作者 张永珍 董忠典 陈松林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第4期116-127,共12页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表... 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表达分析,并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点进行了筛选。该基因c DNA序列全长3717 bp,其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)1677 bp,所编码蛋白含有558个氨基酸,该蛋白具有Nramp家族的典型特征,包括10个跨膜区(Transmembrane,TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运蛋白特征结构域(Consensus Transport Motif,CTM)。半滑舌鳎Nramp的ORF末端有1个类似于脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(Iron-responsive regulatory protein-binding site,IRE)。半滑舌鳎Nramp与其他14个物种的Nramp氨基酸序列同源性在63%-91%之间,系统进化分析表明,半滑舌鳎Nramp和所有鱼类Nramp聚集为一簇,与其他物种Nramp2的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析显示,Nramp基因在半滑舌鳎脾脏和肾脏中的表达量最高,而在肌肉和性腺中的表达量最低;在哈维氏弧菌感染的半滑舌鳎肾脏、脾脏和肝脏中表达量呈升高趋势,而在鳃中则表现为下调趋势。利用直接测序法检测感染鳗弧菌后同一家系的233个个体(抗病个体165个,感病个体68个),共检测到15个SNP位点,对其中3个SNP位点即SNP-g.3113(T→C)、SNP-g.3125(A→G)和SNP-g.3164(A→T)进行测序分型后发现,SNPg.3125(A→G)的等位基因(G)频率和基因型(GG)频率与半滑舌鳎抗鳗弧菌疾病呈极显著相关(P<0.01)。研究结果表明,Nramp基因不同基因型对半滑舌鳎的抗病能力有着极其重要的影响,SNP-g.3125(A→G)可作为潜在的抗性遗传标记位点。本研究将为半滑舌鳎抗性品系培育提供技术支持。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Nramp) 基因克隆 RT-PCR 单核苷酸多态性(SNP)
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甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析 被引量:6
16
作者 卢婷婷 李艳玲 +1 位作者 李存法 李利红 《河南农业科学》 北大核心 2019年第2期40-47,共8页
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维... 为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300~549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。 展开更多
关键词 甘草 自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族 生物信息学分析
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滇陆猪Nramp1基因多态性对其在组织中表达的影响 被引量:3
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作者 张斌 韩敏 +5 位作者 相德才 刘韶娜 沙茜 张桂生 赵智勇 赵彦光 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期202-208,共7页
【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基... 【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据。【方法】采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基因进行扩增,以DNASTAR 5.0进行序列比对分析及多态性(SNP)位点检测;同时利用实时荧光定量PCR检测Nramp1基因在滇陆猪各组织中的相对表达量,并运用SPSS 19.0分析Nramp1基因多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响。【结果】在滇陆猪Nramp1基因第5外显子、第5内含子和第6外显子上分别发现SNP1(T→C)、SNP2(A→G)和SNP3(G→A)等3个SNPs位点,都只存在2种基因型,且SNP1位点和SNP3位点在试验猪群体中属于低度多态[多态信息含量(PIC)/杂合度(He)<0.25)],SNP2位点属于中度多态(0.25肝脏>脾脏>心脏;此外,Nramp1基因在不同基因型滇陆猪群体中表现出的组织差异表达也不同,尤其是Nramp1基因在SNP2位点纯合群体肝脏中的相对表达量显著低于在杂合群体肝脏中的相对表达量,说明Nramp1基因多态性变异对其在滇陆猪组织中的表达有显著影响。【结论】Nramp1基因SNP位点变异能影响Nramp1基因在滇陆猪各组织中的表达变化,从而影响机体的免疫应答反应,其中SNP2位点可作为滇陆猪抗病育种的分子标记。 展开更多
关键词 滇陆猪 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1) 多态性位点(SNPs) 基因型 组织差异表达
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牦牛NRAMP1基因3′UTR克隆及其miRNA生物信息学分析
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作者 常新明 温东旭 +5 位作者 徐业芬 王运路 栗亮亮 丰亚迪 索朗斯珠 牛家强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第5期140-145,160,共7页
为了解牦牛天然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因3′UTR序列多态性及可能具有靶向关系的miRNAs,试验选取5个地区总计325头牦牛的血液样本,构建5个DNA混合池,对牦牛NRAMP1基因3′... 为了解牦牛天然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因3′UTR序列多态性及可能具有靶向关系的miRNAs,试验选取5个地区总计325头牦牛的血液样本,构建5个DNA混合池,对牦牛NRAMP1基因3′UTR进行PCR扩增,利用反向测序方法对扩增产物进行测序,使用DNAMAN 8.0软件将扩增序列与野牦牛、瘤牛、家牛和水牛NRAMP1基因3′UTR序列进行对比分析,并运用TargetScan和miRWalk数据库对靶向牦牛NRAMP1基因3′UTR的miRNAs进行预测。结果表明:成功扩增出牦牛NRAMP1基因3′UTR,扩增片段含有多个短串联重复序列,并检测出3个突变碱基;其与野牦牛、瘤牛/家牛和水牛的NRAMP1基因3′UTR同源性分别为100%、99%、99%、98%;牦牛NRAMP1基因3′UTR的可能靶向miRNAs基因共有11个。 展开更多
关键词 牦牛 天然相关细胞蛋白1基因 多态性 同源性 MIRNA
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NRAMP1基因INT4和3’UTR位点多态性与肺结核易感性的研究 被引量:19
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作者 安雅臣 冯福民 +7 位作者 袁聚祥 纪春梅 王育华 郭梅 邓小娟 高宝霞 王东 刘茜 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期37-40,共4页
目的 探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因INT4和3'UTR位点多态性与中国北方汉族成人肺结核发病的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究设计,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法检测NRAMP1基因中INT4和3'UT... 目的 探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因INT4和3'UTR位点多态性与中国北方汉族成人肺结核发病的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究设计,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法检测NRAMP1基因中INT4和3'UTR两个多态性位点,对与肺结核相关的危险因素进行问卷调查,进行单因素和多因素条件logistic回归分析,同时对基因型与肺结核病变的性质和程度进行研究.结果 对124对研究对象进行了INT4和3'UTR两个多态性位点的基因分型,3'UTR TGTG+/del基因型病例组频率显著高于对照组,粗OR值(95%CI)为2.923(1.557~5.487).病例组和对照组INT4各基因型频率比较差异均无统计学意义.对17个环境危险因素进行了单因素分析,在多因素分析中调整卡痕、体重指数、人均居住面积、家族史4个因素后,3'UTR TGTG+/del基因型仍与肺结核显著相关,调整OR值(95%CI)为2.955(1.369~6.381).在INT4不同基因型中,病例组和对照组肺结核病变性质差异具有统计学意义(x2=9.634,P<0.05).结论 NRAMP1基因3'UTR位点多态性可能是中国北方汉族成人肺结核的易感因素,而INT4多态性可能与肺结核的病变性质有关系. 展开更多
关键词 肺结核 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因 基因多态性 病例对照研究
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中国汉族人群肺结核易感基因的病例对照研究 被引量:15
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作者 刘玮 张翠英 +7 位作者 田磊 李春芝 吴晓明 赵秋敏 张泮河 杨淑梅 杨红 曹务春 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2003年第6期409-412,451,共5页
目的 :探讨VDR ,NRAMP1基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关联。方法 :采用病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应_限制性片段长度多态性分析 (PCR_RFLP)法检测VDR基因FoKⅠ和TaqⅠ位点 ,NRAMP1基因中INT4 ,D5 4 3N及 3'UTR位点... 目的 :探讨VDR ,NRAMP1基因多态性与中国汉族人群肺结核发病间的关联。方法 :采用病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应_限制性片段长度多态性分析 (PCR_RFLP)法检测VDR基因FoKⅠ和TaqⅠ位点 ,NRAMP1基因中INT4 ,D5 4 3N及 3'UTR位点的基因型别 ,并对肺结核相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析。结果 :2 0 0 1年 4月到 2 0 0 2年 6月 ,共有 110名肺结核病例 [平均年龄 (2 7.6 5± 12 .72 )岁 ]和 180名对照 [平均年龄 (2 7.2 6± 9.2 1)岁 ]纳入本研究 ,单因素分析表明病例组中FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 3.36 (1.4 3~ 7.89) ,2 .2 2 (1.0 3~ 4 .78)和 1.93(1.14~ 3.2 6 ) ,TaqⅠ与INT4位点各基因型在病例和对照中的分布无显著性差异。多因素分析中调整了接触史和卡介苗接种史两个因素后 ,FoKⅠ_ff,D5 4 3NG A及 3′UTRTGTG + del基因型仍与肺结核发病显著性相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3.15 (1.0 6~ 9.33) ,3.0 4 (1.12~ 8.2 7)和 2 .36 (1.2 0~ 4 .6 4 ) ,而TaqⅠ和INT4位点多态性与肺结核发病仍无显著关联。结论 :中国汉族人群VDR_FoKⅠ ,NRAMP1_D5 4 3N和NRAMP1_3′UTR位点多态性可? 展开更多
关键词 肺结核 维生素D受体基因 自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因 病例对照研究
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