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基于特征结构组合描述的抗癌药物筛选
1
作者
杨亚鑫
王璟德
孙巍
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期907-914,共8页
收集了200个抗癌药和10 940个非抗癌药,采用加权和欠采样方法,获得了均衡数据集。为了从众多结构指纹或者描述符中找出简短且对抗癌药物筛选贡献最大的描述符组合,采用了两种相关性特征选择方法去简化指纹或者描述符,并结合决策树筛选...
收集了200个抗癌药和10 940个非抗癌药,采用加权和欠采样方法,获得了均衡数据集。为了从众多结构指纹或者描述符中找出简短且对抗癌药物筛选贡献最大的描述符组合,采用了两种相关性特征选择方法去简化指纹或者描述符,并结合决策树筛选抗癌药物。筛选得到了3类各10个可以最有效识别抗癌药物的结构描述符组合,其中特征筛选后的10位MACC指纹最优,可以筛选出81%的抗癌药物,说明这两种相关性特征选择方法有效地提升了抗癌药物的筛选效果。
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关键词
相关性特征筛选
特征
结构描述组合
决策树
抗癌药物
分类性能
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题名
基于特征结构组合描述的抗癌药物筛选
1
作者
杨亚鑫
王璟德
孙巍
机构
北京化工大学化学工程学院
出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期907-914,共8页
文摘
收集了200个抗癌药和10 940个非抗癌药,采用加权和欠采样方法,获得了均衡数据集。为了从众多结构指纹或者描述符中找出简短且对抗癌药物筛选贡献最大的描述符组合,采用了两种相关性特征选择方法去简化指纹或者描述符,并结合决策树筛选抗癌药物。筛选得到了3类各10个可以最有效识别抗癌药物的结构描述符组合,其中特征筛选后的10位MACC指纹最优,可以筛选出81%的抗癌药物,说明这两种相关性特征选择方法有效地提升了抗癌药物的筛选效果。
关键词
相关性特征筛选
特征
结构描述组合
决策树
抗癌药物
分类性能
Keywords
correlation feature selection
featured structure combination description
decision tree
antitumor drug
classification performance
分类号
R917 [医药卫生—药物分析学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于特征结构组合描述的抗癌药物筛选
杨亚鑫
王璟德
孙巍
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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