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基于血清miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志
1
作者
赵文倩
曾婷
+5 位作者
郭俊
龙永金
刘玉婷
张勤
尹博杰
李娜
《赣南医学院学报》
2022年第3期253-260,274,共9页
目的:基于血清中miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志。方法:以正常血清样本中miRNA相对表达秩序关系高度稳定的miRNA对为参考,筛选在乳腺癌样本中miRNA相对表达秩序关系高度逆转的基因对为候选乳腺癌预警标志,并在独立数据集中进...
目的:基于血清中miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志。方法:以正常血清样本中miRNA相对表达秩序关系高度稳定的miRNA对为参考,筛选在乳腺癌样本中miRNA相对表达秩序关系高度逆转的基因对为候选乳腺癌预警标志,并在独立数据集中进行验证。通过miRNA靶基因数据库分析预警标志与癌症发生发展的关系。结果:基于2686例正常样本和1280例乳腺癌样本miRNA表达谱,筛选得到11对相对表达秩序关系在正常和乳腺癌样本间高度逆转的miRNA对,共涉及13个miRNA。3套独立验证集结果表明这11对预警标志对乳腺癌具有很好的预测能力,预测准确率为93%~100%。功能富集分析表明这13个miRNA的324个靶基因,主要富集到PI3K-AKT信号通路,细胞增殖、转录等与乳腺癌的发生发展相关的通路中。结论:基于血清样本内miRNA间相对表达秩序关系的预警标志,能够有效识别乳腺癌,具有高度的鲁棒性和临床转化价值。
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关键词
血清
乳腺癌
MIRNA
相对表达秩序关系
预警标志
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题名
基于血清miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志
1
作者
赵文倩
曾婷
郭俊
龙永金
刘玉婷
张勤
尹博杰
李娜
机构
赣南医学院
赣南医学院医学信息工程学院
出处
《赣南医学院学报》
2022年第3期253-260,274,共9页
基金
江西省大学生创新创业训练计划项目(S202010413012)
赣南医学院校级一般科研课题(YB201926)。
文摘
目的:基于血清中miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志。方法:以正常血清样本中miRNA相对表达秩序关系高度稳定的miRNA对为参考,筛选在乳腺癌样本中miRNA相对表达秩序关系高度逆转的基因对为候选乳腺癌预警标志,并在独立数据集中进行验证。通过miRNA靶基因数据库分析预警标志与癌症发生发展的关系。结果:基于2686例正常样本和1280例乳腺癌样本miRNA表达谱,筛选得到11对相对表达秩序关系在正常和乳腺癌样本间高度逆转的miRNA对,共涉及13个miRNA。3套独立验证集结果表明这11对预警标志对乳腺癌具有很好的预测能力,预测准确率为93%~100%。功能富集分析表明这13个miRNA的324个靶基因,主要富集到PI3K-AKT信号通路,细胞增殖、转录等与乳腺癌的发生发展相关的通路中。结论:基于血清样本内miRNA间相对表达秩序关系的预警标志,能够有效识别乳腺癌,具有高度的鲁棒性和临床转化价值。
关键词
血清
乳腺癌
MIRNA
相对表达秩序关系
预警标志
Keywords
Serum
Breast cancer
miRNA
Relative expression order
Biomarkers
分类号
R730.49 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于血清miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志
赵文倩
曾婷
郭俊
龙永金
刘玉婷
张勤
尹博杰
李娜
《赣南医学院学报》
2022
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