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密码子优化提高多粘类芽孢杆菌β-葡萄糖苷酶异源表达量
被引量:
6
1
作者
陈荫楠
刘震
+1 位作者
石贤爱
王祖鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期414-422,共9页
多粘类芽孢杆菌BN1株β-葡萄糖苷酶A的基因中含有很多大肠杆菌的稀有密码子,这限制了其在大肠杆菌中的表达。本研究选择部分稀有密码子同义替换为大肠杆菌的偏爱密码子,结果得到了表达量显著提高的基因型。经过对β-葡萄糖苷酶A基因各...
多粘类芽孢杆菌BN1株β-葡萄糖苷酶A的基因中含有很多大肠杆菌的稀有密码子,这限制了其在大肠杆菌中的表达。本研究选择部分稀有密码子同义替换为大肠杆菌的偏爱密码子,结果得到了表达量显著提高的基因型。经过对β-葡萄糖苷酶A基因各密码子使用频率的分析,选出2种密码子:大肠杆菌使用频率极低的密码子(Ⅰ型)、大肠杆菌使用频率一般但酶基因中频繁出现的密码子(Ⅱ型)。通过定点突变,这些密码子均被替换为宿主细胞使用频率最高的同义密码子。研究结果表明,I型单密码子替换可以使酶的表达量提高3~6倍,II型单密码子替换可以使酶的表达量提高3~4倍。最终,通过组合对提高该酶表达量贡献较大的突变,得到一个表达量提高13倍的基因型(WT-13)。本研究显著提高了β-葡萄糖苷酶A在大肠杆菌宿主中的异源表达水平,为酶的工业化应用奠定了基础。本研究将Escherichia coli BL21(DE3)本源表达的β-半乳糖苷酶选为内参蛋白质,提出相对表达量指数的概念,为同类酶在E.coli BL21(DE3)表达水平的表征提供了参考。
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关键词
Β-葡萄糖苷酶
密码子偏性
定点突变
同义替换
相对表达量指数
下载PDF
职称材料
题名
密码子优化提高多粘类芽孢杆菌β-葡萄糖苷酶异源表达量
被引量:
6
1
作者
陈荫楠
刘震
石贤爱
王祖鑫
机构
泉州医学高等专科学校
福州大学生物科学与工程学院
福建省医疗器械和医药技术重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期414-422,共9页
基金
国家海洋公益性行业科研专项(201205022-3)
福建省科技重大专项(2013NZ0003)~~
文摘
多粘类芽孢杆菌BN1株β-葡萄糖苷酶A的基因中含有很多大肠杆菌的稀有密码子,这限制了其在大肠杆菌中的表达。本研究选择部分稀有密码子同义替换为大肠杆菌的偏爱密码子,结果得到了表达量显著提高的基因型。经过对β-葡萄糖苷酶A基因各密码子使用频率的分析,选出2种密码子:大肠杆菌使用频率极低的密码子(Ⅰ型)、大肠杆菌使用频率一般但酶基因中频繁出现的密码子(Ⅱ型)。通过定点突变,这些密码子均被替换为宿主细胞使用频率最高的同义密码子。研究结果表明,I型单密码子替换可以使酶的表达量提高3~6倍,II型单密码子替换可以使酶的表达量提高3~4倍。最终,通过组合对提高该酶表达量贡献较大的突变,得到一个表达量提高13倍的基因型(WT-13)。本研究显著提高了β-葡萄糖苷酶A在大肠杆菌宿主中的异源表达水平,为酶的工业化应用奠定了基础。本研究将Escherichia coli BL21(DE3)本源表达的β-半乳糖苷酶选为内参蛋白质,提出相对表达量指数的概念,为同类酶在E.coli BL21(DE3)表达水平的表征提供了参考。
关键词
Β-葡萄糖苷酶
密码子偏性
定点突变
同义替换
相对表达量指数
Keywords
β-glucosidase
codon bias
site-specific mutagenesis
synonymous substitution
relativee xpression index
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
密码子优化提高多粘类芽孢杆菌β-葡萄糖苷酶异源表达量
陈荫楠
刘震
石贤爱
王祖鑫
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
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职称材料
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