-
题名基于相邻频繁模式段的闭合序列模式挖掘算法
- 1
-
-
作者
王淼
尚学群
薛贺
-
机构
西北工业大学计算机学院
-
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第11期148-151,共4页
-
基金
西北工业大学研究生创新实验室资助(No.06044)
-
文摘
直接对生物序列进行频繁模式挖掘会产生很多冗余模式,闭合模式更能表达出序列的功能和结构。根据生物序列的特点,提出了基于相邻闭合频繁模式段的模式挖掘算法-JCPS。首先产生闭合相邻频繁模式段,然后对这些闭合频繁模式段进行组合,同时进行闭合检测,产生新的闭合频繁模式。通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据。
-
关键词
闭合模式
相邻频繁模式段
模式组合
-
Keywords
closed pattern
joined frequent pattern segment
pattern combination
-
分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
-
-
题名基于相邻模式段组合的生物序列模式挖掘算法
被引量:1
- 2
-
-
作者
王淼
尚学群
薛贺
-
机构
西北工业大学计算机学院
-
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2008年第2期190-193,共4页
-
基金
西北工业大学研究生创新实验室资助(No.06044)。
-
文摘
传统的序列模式挖掘算法应用在生物序列上有其局限性,根据生物序列的特点,提出了基于相邻频繁模式段的模式挖掘算法-JPS。首先产生相邻频繁模式段,然后对这些频繁模式段进行组合,产生新的频繁模式。通过实验分析,该方法在相似性很强的序列数据库中比传统的PrefixSpan算法效率高。通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据。
-
关键词
前缀
频繁集
相邻频繁模式段
模式组合
-
Keywords
prefix
frequent set
joined frequent pattern segment
pattern combination
-
分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
-
-
题名一种新的生物序列模式挖掘算法
- 3
-
-
作者
常磊玲
朱春鹤
-
机构
上海海事大学信息工程学院
-
出处
《电脑知识与技术》
2010年第7期5140-5142,共3页
-
文摘
针对传统模式挖掘方法挖掘生物序列会生成大量不必要的短而且无用的模式,导致效率降低,在多支持度思想的基础上提出了基于邻近频繁模式段的模式挖掘算法JBioPM。首先,产生邻近短频繁模式段,然后组合这些短频繁模式段,产生新的长频繁模式。通过实验分析,该方法在相似性很强的序列数据库中比BioPM算法效率高。通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据。
-
关键词
相邻频繁模式段
模式组合
生物序列
模式挖掘
数据挖掘
生物信息学
-
Keywords
joined frequent pattern segment
pattern combination
biological sequence
pattern mining
data mining
bioinformatics
-
分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
-