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基于8种真核生物的整合分析揭示种属特异性小蛋白的功能和进化特征(英文)
1
作者
赵倩
肖景发
于军
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期359-367,共9页
小蛋白(<100个氨基酸)广泛存在于三界生命中,具有重要生物功能.早期涉及小蛋白的研究主要集中于少量特殊物种中的蛋白质家族,以及在全基因组尺度预测短小开放读码框(sORFs)的算法开发,但并无跨真核物种的大规模组学分析来揭示小蛋白...
小蛋白(<100个氨基酸)广泛存在于三界生命中,具有重要生物功能.早期涉及小蛋白的研究主要集中于少量特殊物种中的蛋白质家族,以及在全基因组尺度预测短小开放读码框(sORFs)的算法开发,但并无跨真核物种的大规模组学分析来揭示小蛋白的功能和进化特征.通过对已知小蛋白和拥有短小开放读码框的基因进行全基因组尺度的计算分析,长度小于100个氨基酸的RefSeq proteins按照其序列保守性被划分为存在于所有8种真核生物、只存在于脊椎动物和只存在于哺乳动物三个进化分类中,此三个进化分类所对应的生物学功能揭示了小蛋白行使种属特异性功能的特征.进一步研究发现,大多数人类特有的小蛋白也是组织表达特异性的,并且绝大多数古老的小蛋白在人体内普遍表达.因此认为,一些真核小蛋白出现并在自然选择压力下富集,行使种属特异性功能,并且以特殊的方式进化和表达.
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关键词
真核小蛋白
选择压力
种属特异性
组织特异性表达
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题名
基于8种真核生物的整合分析揭示种属特异性小蛋白的功能和进化特征(英文)
1
作者
赵倩
肖景发
于军
机构
中国科学院北京基因组研究所
中国科学院研究生院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期359-367,共9页
基金
supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(31071163)
National Basic Research Programof China(2010CB126604)~~
文摘
小蛋白(<100个氨基酸)广泛存在于三界生命中,具有重要生物功能.早期涉及小蛋白的研究主要集中于少量特殊物种中的蛋白质家族,以及在全基因组尺度预测短小开放读码框(sORFs)的算法开发,但并无跨真核物种的大规模组学分析来揭示小蛋白的功能和进化特征.通过对已知小蛋白和拥有短小开放读码框的基因进行全基因组尺度的计算分析,长度小于100个氨基酸的RefSeq proteins按照其序列保守性被划分为存在于所有8种真核生物、只存在于脊椎动物和只存在于哺乳动物三个进化分类中,此三个进化分类所对应的生物学功能揭示了小蛋白行使种属特异性功能的特征.进一步研究发现,大多数人类特有的小蛋白也是组织表达特异性的,并且绝大多数古老的小蛋白在人体内普遍表达.因此认为,一些真核小蛋白出现并在自然选择压力下富集,行使种属特异性功能,并且以特殊的方式进化和表达.
关键词
真核小蛋白
选择压力
种属特异性
组织特异性表达
Keywords
eukaryotic small proteins
selective pressure
lineage-specific
tissue-specific expression
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
基于8种真核生物的整合分析揭示种属特异性小蛋白的功能和进化特征(英文)
赵倩
肖景发
于军
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
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职称材料
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