有机污染物对水体真细菌群落结构的影响

为了揭示有机污染物对环境真细菌组成和多样性的影响,应用末端限制性片段长度多态性(tRFLP)和16S rDNA文库技术并结合水质分析方法,比较分析了松花江流域内受不同程度有机污染的4个水体及其沉积物中真细菌的群落结构。tRFLP分析表明各水体及底泥均呈现较为复杂的群落结构模式,不同底泥群落形成的末端限制性片段(TRF)图谱具有很高的相似性,但随着污染程度的加强,部分类群明显富集,而且在水样组和泥样组内,群落结构的相似性同水质相似性是一致的,主成分分析(PCA)显示水样和泥样中的真细菌TRF形成不同的群。16SrDNA文库分析表明松花江哈尔滨段底泥中真细菌分布于10个门,Proteobacteria门占优势,达群落总数的21.92%(β-Proteobacteria亚门占10.96%),而有机染污物严重超标的生活污水排污道底泥中的微生物多样性较低,分布于7个门,Proteobacteria门为优势群,占群落的47.37%(α-Proteobacteria亚门占21.05%,δ/ε-Proteobacteria亚门占15.79%)。该研究表明向水体中长期排放高浓度有机物能使系统中微生物群落多样性降低,与污染物降解相关的功能微生物类群明显富集。

垃圾填埋场中真细菌群落16S rRNA基因的分析

回灌式垃圾填埋场渗滤液中真细菌群落的多样性同样通过不依赖于微生物培养的分析而获得。利用特异性的引物对,选择性地扩增渗滤液DNA中的真细菌16S rRNA基因片断(16S rDNA),并用于构建16S rDNA克隆文库。文库内真细菌16S rDNA的遗传多样性通过限制片断长度多态性分析(RFLP,限制性内切酶Hin PII和Msp I)而获得。初步的结果表明,随机选出的200个真细菌克隆子被分为147个不同的RFLP型(组),当中丰度最高的两个型均仅含有9个克隆子,两者共占所有被分析克隆子的不到10%;克隆子数≥2的型共有21个(包括以上2个丰度最高的型),它们共代表74个克隆子,占所有被分析克隆子的37%;而剩下的126个型均只含有1个克隆子,它们共占整个基因文库的63%。由此可见,李坑垃圾渗滤液中的真细菌具有非常复杂的群落结构。

具有真细菌和真核生物融合特征的古生菌转录系统

古生菌是一类区别于真细菌和真核生物的第三域生命形式 ,转录是生物体遗传信息传递系统中的一个中心环节。近年来研究结果表明 ,古生菌的转录系统具有真细菌和真核生物的融合特征 :古生菌的基本转录装置包括RNA聚合酶、基本转录因子、启动子元件等与真核生物相似 ;而古生菌的转录调控机制却更加类似于真细菌 ,在古生菌中发现并鉴定了许多类似于真细菌的转录调控蛋白。

具有真细菌基因启动子活性的古生菌DNA片段

以大肠杆菌启动子探测质粒pKK232-8 为载体,用4 组限制性内切酶分别消化古生菌盐生盐杆菌R1(Halobacterium halobium )的染色体DNA,在体外进行重组,转化E.coliDH-5α感受态细胞,得到12 个转化子(T1～T12),其抗性水平分布在10～500 m g/L的区间内. 将这些转化子所含质粒分别命名为pSX1～pSX12,限制性酶切分析表明,这些质粒各插入了一段不同的外源DNA 片段,杂交分析表明,抗性最强的转化子T11 所含质粒pSX11 上插入了一段来源于盐生盐杆菌R1 染色体的DNA 片段. 该DNA 片段在大肠杆菌中具有启动子功能.

具有真细菌基因启动子活性的盐生盐杆菌质粒DNA片段

利用大肠杆菌启动子探测质粒ｐＫＫ２３２－８为载体、用两组限制性内切酶ＢａｍＨＩ－ＳａｌＩ和ＨｉｎｄⅢ－ＳａｌＩ分别消化盐生盐杆菌Ｊ７（Ｈａｌｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｈａｌｏｂｉｕｍ）的质粒ｐＨＨ２０５，在体外进行重组，转化Ｅ．ｃｏｌｉＨＢ１０１感受态细胞，在含氨苄青霉素和氯霉素的选择平板上筛选转化子，并从随机挑选的２０株转化子中，获得抗氯霉素水平达到１１０μｇ／ｍｌ的转化子Ｔ１和Ｔ２，所含重组质粒分别被命名为ｐＪＨ和ｐＪＢ。经限制性酶切分析及杂交分析表明，ｐＪＨ质粒上插入了一段来源于ｐＨＨ２０５质粒的ＤＮＡ片段，其大小为８００ｂｐ左右。通过重新转化实验进一步表明，该ＤＮＡ片段在大肠杆菌中具有启动子功能，从而证明，在古细菌（盐生盐杆菌）的质粒ＤＮＡ中存在具有真细菌（大肠杆菌）基因启动子活性的ＤＮＡ片段。

有机污染物对水体真细菌群落结构影响分析

对水体环境中的真细菌群落结构进行研究,其中有机污染物的影响较为明显。通过对我国水域环境当中的样本进行分析之后发现,其中不同群落结构的微生物结构图谱具有相对较高的相似性,且伴随着有机污染物含量的增加,则促使其中的部分真菌群落呈现出明显的富集状态。经过实验研究发现,如若水体环境当中的有机污染物实际含量相对较多,则会降低微生物的群落多样性,同时能够有效降解污染物的群落,呈现出明显的富集状态。

温度对厚指海绵Pachychalina sp.体内真细菌的影响

温度是影响微生物多样性的重要因素之一。【方法】本研究采用16S rDNAs扩增产物酶切片段多态性(amplified rDNArestriction analysis,ARDRA)和16SrDNAs序列分析方法,对生长在16℃和30℃条件下厚指海绵Pachychalinasp.体内真细菌(eubacteria)的多样性进行了研究,【目的】探讨温度对海绵体内细菌的影响。【结果】根据ARDRA聚类分析,16℃条件下海绵体内100个真细菌的16SrDNAs克隆片断被分成34个类群,而30℃条件下,海绵体内100个细菌的16SrDNAs克隆片断则被分为32个类群,说明在不同温度条件下,海绵体内真细菌的组成与群落结构有所变化,但研究发现温度没有明显改变海绵体内真细菌总的群落结构。【结论】根据厚指海绵Pachychalinasp.体内真细菌的16SrDNAs序列分析结果发现:在16℃和30℃条件下,海绵体内的真细菌均属于α、γ、δ-变形菌、硫细菌、硫还原菌和烃类分解菌,此外还有少数放线菌。16℃条件下海绵体内的优势菌为γ-变形菌,而且体内的硫细菌和硫还原菌主要是耐寒细菌,而30℃条件下海绵体内的优势菌为α-变形菌。该研究还发现:同一ARDRA类型的克隆序列分析表明在同一ARDRA群内各组分间彼此关系比较密切。

柠檬酸废水IC反应器厌氧颗粒污泥真细菌结构分析

目的:分析柠檬酸工业废水IC厌氧反应器处理时产生的厌氧颗粒污泥中真细菌的菌群结构。方法:构建细菌的16SrDNA克隆文库,对文库中的16S rDNA基因序列进行测序,然后Blast比对,并进行分类、建系统发育树。结果:对获得的77个16S rDNA序列进行测序,按序列相似性≥97%的分类标准,这些序列可分为22个OTU,其中4个优势OTU分别与棒杆菌属(Corynebacterium)、梭菌属(Clostridium)、消化球菌属(Peptococcus)、疣微菌属(Verrucomicrobia)最为相近,其余OTU的克隆数较少。颗粒污泥中的真细菌主要为放线菌纲(Actinobacteria)、梭菌纲(Clostridia)、拟杆菌纲(Bacteroidetes)以及δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)的细菌,分别占克隆总数的34/77、31/77、6/77、6/77。结论:该文研究了柠檬酸废水处理过程中产生的厌氧颗粒污泥中细菌的菌群组成和结构,为深入了解柠檬酸废水的厌氧处理过程提供了一定的理论借鉴作用。

干热处理对萝卜种带真菌、细菌防治效果的研究

1995年进行了萝卜种子干热处理的研究，通过玻板直立发芽法、测定种子生活力；吸湿培养法测定发芽势与发芽率；琼脂平皿试验法测定杀菌效果。结果表明：76℃干热处理对萝卜种带真、细菌有明显的杀灭效果，对萝卜种子的发芽势、发芽率没有影响，对萝卜种子生活力影响甚小。

产甲烷细菌

产甲烷细菌系生命第三种特征，从其生存的环境，代谢的基质，分子生物学的特点等资料分析，产甲烷细菌是一类原始菌群，它应当早于真细菌和真核生物。厌氧菌群的工谢作用，无疑构建了产甲烷菌代谢物质基础和原始环境。

真菌和动物比人们预料的关系更密切

真菌和动物比人们预料的关系更密切一些对核糖体ＲＮＡ序列进行了比较的研究人员称，真茵在遗传上与动物的近似甚于其与植物的近似。他们的工作改进了美国伊利诺伊大学的沃斯首创的遗传“生命树”。沃斯把生物划为三个“范畴”——真细菌，右细菌和真核生物。传统上，生物...

细菌帮你找凶手

刑侦人员经常遇到一种非常令人头疼的情况：犯罪分子早已逃之夭夭,翻遍犯罪现场,找不到任何线索。没错,能够通过DNA认证来辨别嫌犯身份信息的东西统统找不到。什么都没有,这案子可就难查难破喽!不过,随着刑侦科技的进步,探员们还是找到了另外一些东西来帮忙,那就是细菌。

盐单胞菌属一新种——黄海盐单胞菌

以《伯杰氏系统细菌学手册》第1卷(1984年)等为主要依据,对从江苏省黄海盐场晒盐池分离到的H_5菌株进行了鉴定。结果表明,H_5菌株符合盐单胞菌属(Halomonas)的特征。但该菌株的形态、生理生化特性及DNA中G十C mol％等又不同于该属中的已知种。同时,H_5菌株与该属中的相关种——伸长盐单胞菌(Halomonas elongata ATCC 33173)的DNA杂交率为44.7％。因而将H_5菌株鉴定为盐单胞菌属的一个新种,命名为黄海盐单胞菌(Halomonas huanghaiensis sP. nov.),且H_5菌株作为模式株。

荧光原位杂交(FISH)技术研究窖泥微生物群落

为了探索荧光原位杂交(FISH)技术,研究窖泥微生物群落结构特征多样性,进行了纯培养微生物及窖泥微生物的FISH检测。以Escherichia coli、Bacillus subtilis、Lactobacillus planetarium、Acetobacter rancens、Clostridiumacetobytylicum 5株不同种属的细菌为对象,研究了影响荧光原位杂交(FISH)技术对其定量表征的因素,并将该技术应用于窖泥微生物群落的研究。实验结果表明,E.coli及L.planetarium的定量表征受到生长期的影响,在对数和稳定期的菌体检出率>82%,衰退期的L.planetarium则明显减少;死菌体比活菌体的检出信号显著减弱;经硫酸铝处理,除去腐植酸的窖泥样品明显地提高了可辨力,加入窖泥中的E.coli,FISH检出量为光学显微镜计数量的46.89%。采用FISH技术可视化定量表征了窖泥中细菌和古菌的特征,有益于从细胞水平研究其微生物群落的关系。

阿泰宁联合美沙拉嗪治疗慢性反复发作型溃疡性结肠炎随机对照研究

目的 探讨阿泰宁（有效成分酪酸梭菌CGMCC0313—1）联合美沙拉嗪治疗慢性反复发作型溃疡性结肠炎患者的疗效及安全性。方法 将40例慢性反复发作型溃疡性结肠炎患者随机分为试验组和对照组，各20例。试验组给予阿泰宁（1260mg，3次／d）和美沙拉嗪（0．5g，3次／d）治疗8周；对照组只给予美沙拉嗪（0．5g，3次／d）治疗8周。观察两组患者治疗后临床疗效、临床症状缓解情况、肠镜检查结果、组织学检查结果、复发情况及不良反应。结果 试验组患者治疗后的临床疗效、临床症状缓解情况、肠镜检查结果、组织学检查结果及不良反应发生率与对照组的比较，差别均有统计学意义（P〈0．05）。复发情况：随访6个月～1年，试验组2例复发，而对照组7例复发。结论 阿泰宁联合美沙拉嗪治疗慢性反复发作型溃疡性结肠炎患者的疗效及安全性优于单纯应用美沙拉嗪，并且可降低复发。

降解五氯酚厌氧生物反应器微生物种群结构的分子特性研究

采用PCR DGGE技术,对降解PCP厌氧生物反应器污泥颗粒化过程微生物种群结构的时空分布变化特性进行了初步研究.结果表明,随着PCP负荷增加与污泥的颗粒化,污泥真细菌、古细菌组成均发生明显变化.当反应器稳定运行时,反应器内上下层污泥微生物种群结构组成相似,真细菌相似性Cs在71 4～77 6之间,古细菌Cs在70 4～76 7之间.反应器一旦受污染物负荷冲击干扰,反应器上下层污泥真细菌组成相似性Cs降至43 3,古细菌降至35 2.测序表明,颗粒污泥中存在不可培养的脱氯细菌,优势产甲烷细菌为Methanosaetaconcilii、Methanobacteri umsp.、Methanobrevibactersp.和Methanothrixsoehngenii.

真/细菌及其共存体系净化挥发性有机化合物研究进展

微生物是废气生物净化的核心,近年来利用生物处理挥发性有机化合物(VOCs)已成为研究热点之一.首先总结国内外有关真菌或细菌为主的体系和真菌-细菌共存体系对于VOCs净化性能的研究,真菌-细菌共存体系在VOCs去除性能以及效果稳定性方面都具有明显的优势,且共存体系对于疏水性VOCs具有更好的净化性能;在此基础上进一步剖析细胞表面特性对于污染物降解性能的影响,真菌因其特殊的菌丝结构及较大比表面积、较高的细胞表面疏水性及细胞表面丰富的官能基团使得其对于疏水性VOCs净化性能较佳.此外,在共存体系中真/细菌之间也存在相互影响机制,真菌通过菌丝延展强化了细菌对污染物及营养物质的可及性,分泌物质提供营养或将疏水性VOCs降解为水溶性较好的中间产物来增强细菌对这些物质的降解性能;细菌则通过分泌物质促进真菌生长、刺激真菌酶活、消除真菌分泌的抑制其生长的化合物及强化生物膜形成来协同降解复杂有机化合物.真/细菌共存体系优异的VOCs净化性能应用前景广阔,未来的研究将集中在细菌细胞及VOCs随真菌菌丝迁移机制的剖析、功能基因对于VOCs降解性能强化机理的解析和共存体系中疏水性VOCs的传质-反应过程强化的数值模拟等.