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草坪修剪废弃物好氧和好氧-厌氧耦合堆肥中真菌菌群演替对腐殖质合成的影响
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作者 陈开山 张文明 +2 位作者 蔡立群 邢彦宏 杨迎香 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期201-209,共9页
【目的】促进草坪修剪废弃物的资源化利用和探明好氧和好氧-厌氧耦合堆肥过程中真菌群落的演替对腐殖质合成的影响。【方法】以草坪修剪废弃物为主料,设置3个处理A(草坪修剪废弃物)、B(草坪修剪废弃物+10%玉米秸秆)和C(草坪修剪废弃物+... 【目的】促进草坪修剪废弃物的资源化利用和探明好氧和好氧-厌氧耦合堆肥过程中真菌群落的演替对腐殖质合成的影响。【方法】以草坪修剪废弃物为主料,设置3个处理A(草坪修剪废弃物)、B(草坪修剪废弃物+10%玉米秸秆)和C(草坪修剪废弃物+20%玉米秸秆)进行好氧和好氧-厌氧耦合堆肥。【结果】相比好氧-厌氧耦合堆肥(A),好氧堆肥(B和C)能够加速腐殖化程度,促进胡敏酸的合成,且C处理效果优于B处理。优势真菌菌群与腐殖质组分的冗余分析表明,好氧堆肥(B和C)更好地促进了木质纤维素降解真菌的相对丰度,而抑制了病原真菌的相对丰度,促进富里酸和胡敏素的降解而合成更多的胡敏酸。FUNGuild分析表明,相比好氧-厌氧耦合堆肥(A),好氧堆肥(B和C)可以灭活真菌病原体,增加腐生菌功能的相对丰度。【结论】在修剪草坪废弃物中添加10%~20%的玉米秸秆进行好氧堆肥,能够改善真菌菌群和营养模式,提高堆肥腐殖化程度,且20%的添加效果最好。 展开更多
关键词 修剪草坪 堆肥 木质纤维素 真菌菌群 腐殖质
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添加蔗糖对高水分苜蓿青贮中真菌菌群多样性的影响
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作者 李荣荣 胡明 +1 位作者 魏睿 徐春城 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期143-148,共6页
通过宏基因组测序研究了高水分苜蓿单独青贮(对照组)和添加蔗糖(蔗糖组)青贮中真菌菌群多样性。结果表明:与对照组相比,蔗糖添加剂显著增加了乳酸含量(P<0.05),显著降低了乙酸、丁酸和氨态氮含量以及好氧细菌数量(P<0.05)。子囊... 通过宏基因组测序研究了高水分苜蓿单独青贮(对照组)和添加蔗糖(蔗糖组)青贮中真菌菌群多样性。结果表明:与对照组相比,蔗糖添加剂显著增加了乳酸含量(P<0.05),显著降低了乙酸、丁酸和氨态氮含量以及好氧细菌数量(P<0.05)。子囊菌门是苜蓿原料和两组青贮中相对丰度最大的真菌门,担子菌门次之;莫氏黑粉菌属和链格孢属是苜蓿原料上的优势真菌属,而白僵菌属是两组青贮中最丰富的属,曲霉属和青霉属的相对丰度较低。与对照组相比,蔗糖组中白僵菌属、曲霉属和青霉属的相对丰度分别下降了24.59%、1.49%和0.22%。南极莫氏黑粉菌和互隔交链孢霉是苜蓿原料上最丰富的真菌种,而球孢白僵菌主导两组青贮中真菌菌群,黄曲霉相对丰度较低。球孢白僵菌和黄曲霉的相对丰度与乳酸含量呈反比,与氨态氮、丁酸和乙酸含量成正比。综上所述,蔗糖添加剂组发酵品质良好,南极莫氏黑粉菌主导苜蓿原料上的真菌菌群,而球孢白僵菌主导高水分青贮中真菌菌群,添加蔗糖能够在一定程度上抑制球孢白僵菌的繁殖。 展开更多
关键词 宏基因组 高水分 苜蓿青贮 真菌菌群 多样性
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基于高通量测序山西老陈醋和怀仁醋酒精发酵初期酒醅真菌菌群研究
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作者 杨玲 彭佳伟 +5 位作者 郭旭凯 段冰 邵强 郭睿 温贤将 王琪 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第4期109-114,共6页
该研究利用高通量测序技术分析比较山西老陈醋工艺(S)和怀仁醋酿造工艺(X)酒精发酵初期酒醅样品真菌菌群多样性,考察不同酿造工艺对酒醅真菌菌群的影响。结果表明,X酒醅样品真菌菌群的多样性及丰富度更高。两种工艺酒醅样品的真菌菌群... 该研究利用高通量测序技术分析比较山西老陈醋工艺(S)和怀仁醋酿造工艺(X)酒精发酵初期酒醅样品真菌菌群多样性,考察不同酿造工艺对酒醅真菌菌群的影响。结果表明,X酒醅样品真菌菌群的多样性及丰富度更高。两种工艺酒醅样品的真菌菌群组成在属水平差别较大;S酒醅样品的真菌绝大部分是待确定分类地位类群(Unclassified)(82.82%),少部分为维克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)(7.40%)、红曲霉属(Monascus)(3.12%)等;而X酒醅样品的绝对优势真菌属为哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)(75.08%),其次为Unclassifed(14.21%)、曲霉属(Aspergillus)(3.48%)等。造成两种工艺酒醅样品真菌菌群差异的菌属为Unclassifed、毕赤酵母属(Pichia)、哈萨克斯坦酵母属、Cystofilobasidium、枝孢霉属(Cladosporium)和被孢霉属(Mortierella)。与其他物种联系密切的菌属为Cystofilobasidium、绿僵菌属(Metarhizium)、柯达酵母属(Kodamaea)、Pseduallescheria和根毛霉属(Rhizomucor)。 展开更多
关键词 山西老陈醋工艺 怀仁醋酿造工艺 酒精发酵 真菌菌群 高通量测序
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丁酸梭菌及其胞外囊泡对结肠炎小鼠肠道真菌菌群结构的影响 被引量:2
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作者 彭浩 任莹 +4 位作者 马灵燕 吕文涛 陈渠 杨华 肖英平 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期4686-4696,共11页
本试验旨在研究丁酸梭菌及其胞外囊泡对小鼠结肠炎的缓解作用以及对肠道真菌结构的影响。试验选用8周龄雄性C57BL/6J小鼠24只,随机分为4组,每组6只。Control组、DSS组、CB组和EV组分别给予正常饮水并灌胃200μL/d生理盐水、3%葡聚糖硫酸... 本试验旨在研究丁酸梭菌及其胞外囊泡对小鼠结肠炎的缓解作用以及对肠道真菌结构的影响。试验选用8周龄雄性C57BL/6J小鼠24只,随机分为4组,每组6只。Control组、DSS组、CB组和EV组分别给予正常饮水并灌胃200μL/d生理盐水、3%葡聚糖硫酸钠(DSS)饮水并灌胃200μL/d生理盐水、3%DSS饮水并灌胃200μL/d丁酸梭菌溶液(5×108CFU/mL)、3%DSS饮水并灌胃50μg/d丁酸梭菌胞外囊泡(溶于200μL生理盐水),7 d后各组饮水均换为正常饮水。于第11天停止灌胃,对小鼠进行眼球取血,收集血清,测定炎症因子含量;随后麻醉处死小鼠,解剖后收集结肠组织及其内容物,进行组织病理学分析和真菌测序分析。结果显示:1)相对于Control组,DSS组小鼠血清中白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和脂多糖(LPS)的含量显著提高(P<0.05),白细胞介素-10(IL-10)的含量显著下降(P<0.05)。相对于DSS组,CB组和EV组小鼠血清中IL-6、TNF-α和LPS的含量显著下降(P<0.05),IL-10的含量有所提高(P>0.05)。2)经DSS处理的小鼠结肠真菌菌群操作分类单元(OTU)数量、Chao1指数和Shannon指数较Control组显著增加(P<0.05),而灌胃丁酸梭菌或其胞外囊泡使结肠炎小鼠结肠真菌菌群的OTU数量和Chao1指数减小,趋于Control组。在门水平上,DSS处理小鼠结肠中子囊菌门(Ascomycota)的相对丰度下降,担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度增加;在属水平上,DSS处理小鼠结肠中哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)的相对丰度下降,枝孢菌属(Cladosporium)、锥盖伞属(Conocybe)和青霉菌属(Penicillium)的相对丰度增加,而灌胃丁酸梭菌或及其胞外囊泡能使这些真菌门和真菌属的相对丰度趋于正常。3)斯皮尔曼相关性分析发现,DSS诱导的结肠炎小鼠结肠中暗梗单孢霉属(Chloridium)、帚霉属(Scopulariopsis)、Conocybe和丝孢菌属(Scedosporium)的相对丰度与血清中IL-6、TNF-α和LPS的含量呈显著或极显著正相关(P<0.05或P<0.01),与血清中IL-10含量呈极显著负相关(P<0.01);而结肠中Kazachstania的相对丰度与血清中IL-6、TNF-α和LPS的含量呈显著或极显著负相关(P<0.05或P<0.01),与血清中IL-10的含量呈极显著正相关(P<0.01)。综上所述,丁酸梭菌及其胞外囊泡能通过调节小鼠的肠道真菌菌群结构对DSS诱导的肠道黏膜损伤和炎症产生缓解作用。 展开更多
关键词 丁酸梭 胞外囊泡 结肠炎 小鼠 真菌菌群结构
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杰丁塞伯林德纳氏酵母对育成期乌苏里貉养分利用及粪便真菌菌群结构的影响
5
作者 赵德辉 马翠柳 +4 位作者 吴炎 刘可园 张博睿 张海华 刘晗璐 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3123-3132,共10页
【目的】研究饲粮中添加杰丁塞伯林德纳氏酵母对育成期乌苏里貉营养物质消化率、氮代谢、血清生化指标及粪便真菌菌群组成的影响。【方法】选取健康的(65±5)日龄体重相近雄性乌苏里貉45只,随机分成3组,每组15只,对照组(N组)饲喂基... 【目的】研究饲粮中添加杰丁塞伯林德纳氏酵母对育成期乌苏里貉营养物质消化率、氮代谢、血清生化指标及粪便真菌菌群组成的影响。【方法】选取健康的(65±5)日龄体重相近雄性乌苏里貉45只,随机分成3组,每组15只,对照组(N组)饲喂基础饲粮,试验组分别在基础饲粮中添加低(L组)和高剂量(H组)杰丁塞伯林德纳氏酵母菌,分别为每天每只2和10 mL(1×10^(9)CFU/mL)。预试期7 d,正试期30 d。于正试期最后3 d采集粪便和饲粮样品,测定各营养物质表观消化率;试验结束当天晨饲前采集血液,晨饲后采集新鲜粪便,测定血清生化指标和粪便真菌菌群组成。【结果】与N组相比,①L组乌苏里貉粗脂肪和粗蛋白质消化率显著提高(P<0.05),L和H组乌苏里貉氮沉积和净蛋白质利用率显著升高(P<0.05),L组乌苏里貉粪氮排出量显著降低(P<0.05);②L和H组乌苏里貉血清天门冬氨酸氨基转移酶(AST)活性和甘油三酯(TG)水平均显著升高(P<0.05);③H组乌苏里貉粪便真菌Chao1和ACE指数均显著降低(P<0.05),L和H组乌苏里貉粪便曲霉菌属(Aspergillus)和篮状菌属(Talaromyces)的相对丰度均显著降低(P<0.05),H组乌苏里貉粪便芽枝霉属(Cladosporium)的相对丰度显著降低(P<0.05)。【结论】饲粮中添加杰丁塞伯林德纳氏酵母可提高育成期乌苏里貉的营养物质消化率、氮代谢,降低粪便有害真菌的相对丰度,综合考虑,其适宜的添加量为每天每只2 mL(1×10^(9)CFU/mL)。 展开更多
关键词 杰丁塞伯林德纳氏酵母 乌苏里貉 营养物质消化率 氮代谢 真菌菌群结构
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真菌菌群在银屑病中的作用研究进展
6
作者 牛凡琪 李怡霏 +1 位作者 周文丽 王思农 《中国真菌学杂志》 CSCD 2023年第6期541-545,559,共6页
银屑病是一种常见的慢性炎症性皮肤病,其病因和发病机制复杂,尚未完全清楚。最近的研究表明,真菌菌群在银屑病的发生、发展中起着重要作用。该文综述了真菌微生物群落在银屑病中的作用,包括银屑病皮损中真菌微生物群落的组成、真菌微生... 银屑病是一种常见的慢性炎症性皮肤病,其病因和发病机制复杂,尚未完全清楚。最近的研究表明,真菌菌群在银屑病的发生、发展中起着重要作用。该文综述了真菌微生物群落在银屑病中的作用,包括银屑病皮损中真菌微生物群落的组成、真菌微生物群落与宿主免疫系统之间的相互作用、真菌微生物群落参与银屑病发病的潜在机制,从而探索真菌微生物群落在银屑病治疗中的潜在临床意义。 展开更多
关键词 银屑病 真菌菌群 潜在机制 免疫系统
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浓香型白酒糟醅中真菌菌群的多样性分析 被引量:61
7
作者 张文学 乔宗伟 +1 位作者 胡承 王忠彦 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期97-101,共5页
为了弄清中国浓香型白酒发酵糟醅真菌微生物优势菌群的系统发育规律,对不同发酵时间糟醅样品的微生物18S rDNA进行了PCR克隆分析和同源性比较。研究发现糟醅中心样品以Issatchenkia、Talaromyces、Aspergillus和Eurotium等4属的真菌为... 为了弄清中国浓香型白酒发酵糟醅真菌微生物优势菌群的系统发育规律,对不同发酵时间糟醅样品的微生物18S rDNA进行了PCR克隆分析和同源性比较。研究发现糟醅中心样品以Issatchenkia、Talaromyces、Aspergillus和Eurotium等4属的真菌为主要优势菌,分别占全部真菌DNA克隆数的28.6%、16.9%、14.3%、26.0%;Issatchen-kia属酵母菌主要出现在发酵前中期,Talaromyces属霉菌主要出现在发酵前期且在发酵过程中保持一定数量的存在,Aspergillus属霉菌则从发酵中期开始数量逐渐增多,Eurotium属霉菌在发酵中后期在数量上占有绝对多数。主要优势真菌的菌群变化及生物学特征说明其代谢活动与浓香型白酒糟醅发酵中大分子物质的降解及白酒风味物质的形成密切相关。 展开更多
关键词 浓香型白酒 窖池糟醅 PCR 生物多样性 真菌菌群
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应用PCR-DGGE技术检测发酵食品和饲料中真菌菌群 被引量:14
8
作者 许爱清 李宗军 +1 位作者 王远亮 文杰宇 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第7期317-322,共6页
PCR-DGGE技术是近年来新兴的一项开展微生物分子生态学研究的工具。本文介绍了PCR-DGGE技术的基本原理和技术背景,总结了应用PCR-DGGE研究发酵食品和饲料中真菌菌群时所设计或选择的PCR引物,图示了获得DGGE图谱中DNA条带序列信息的实验... PCR-DGGE技术是近年来新兴的一项开展微生物分子生态学研究的工具。本文介绍了PCR-DGGE技术的基本原理和技术背景,总结了应用PCR-DGGE研究发酵食品和饲料中真菌菌群时所设计或选择的PCR引物,图示了获得DGGE图谱中DNA条带序列信息的实验流程,并列举了DGGE技术的一些局限性和优化策略。综述结果有助于建立可行的PCR-DGGE技术方案用于发酵过程或产品中真菌群落结构和演替规律的检测分析。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 发酵食品 真菌菌群 PCR引物
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ITS rDNA高通量测序研究不同饲养方式对滩羊瘤胃真菌菌群的影响 被引量:10
9
作者 张洁 李娜 +3 位作者 郭婷婷 胡丹丹 徐晓锋 张力莉 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期25-34,共10页
【目的】利用ITS rDNA高通量测序,研究不同饲养方式对滩羊瘤胃真菌菌群的影响.【方法】试验采用随机区组设计,将体况相近的24只4月龄滩羊随机分为两组,每组12只,分别采用放牧和舍饲的饲养方式.于9月龄屠宰取样,运用ITS rDNA技术研究瘤... 【目的】利用ITS rDNA高通量测序,研究不同饲养方式对滩羊瘤胃真菌菌群的影响.【方法】试验采用随机区组设计,将体况相近的24只4月龄滩羊随机分为两组,每组12只,分别采用放牧和舍饲的饲养方式.于9月龄屠宰取样,运用ITS rDNA技术研究瘤胃真菌菌群的变化.【结果】放牧组滩羊瘤胃真菌物种多样性高于舍饲组,舍饲组滩羊瘤胃真菌物种丰度的均匀度高于放牧组.在门水平上,壹菌门为舍饲组特异性菌门.与放牧组相比,舍饲组新丽鞭毛菌门的丰度显著降低(P<0.05),未注释菌门和担子菌门的丰度有提高的趋势(P<0.075),子囊菌门的丰度提高75.10%,但差异不显著.在属水平上,与放牧组相比,舍饲组未注释属丰度极显著提高(P<0.01),梨霉属的丰度显著降低(P<0.05),节担菌属和新丽鞭毛菌属的丰度显著提高(P<0.05),广义酿酒酵母菌属丰度提高47.20%,但差异不显著.【结论】舍饲降低了滩羊瘤胃真菌的多样性,提高了真菌物种丰度的均匀度;优势菌比例发生变化,对纤维素、半纤维素降解菌和葡萄糖降解菌的影响明显. 展开更多
关键词 滩羊 瘤胃 ITS RDNA 真菌菌群
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盐渍青菜真菌菌群结构DGGE分析及酵母菌分离鉴定 被引量:5
10
作者 尹礼国 马伟玲 +6 位作者 李文芳 杨婧 梁会朋 张其圣 陈功 吴正云 张文学 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期29-33,共5页
盐渍青菜又称酸菜,是制作川菜及其调味品的一种非常重要的食品原料,对其菌群结构的研究与功能微生物的分离可以为工业化生产提供理论依据。采用变性梯度凝胶电泳技术(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)对不同盐渍青菜样品... 盐渍青菜又称酸菜,是制作川菜及其调味品的一种非常重要的食品原料,对其菌群结构的研究与功能微生物的分离可以为工业化生产提供理论依据。采用变性梯度凝胶电泳技术(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)对不同盐渍青菜样品的真菌菌群结构进行了分析,结果表明,随着盐渍时间的延长,优势条带数量逐渐增多,真菌以酵母菌为主。4个主要的优势条带分别与假丝酵母属(Candida)、德巴氏酵母属(Debaryomyces)、接合酵母属(Zygosaccharomyces)的菌株相似。从盐渍青菜样品中分离得到10株酵母菌,通过分子生物学鉴定为汉逊德巴利酵母(Debaryomyces hansenii)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、鲁氏接合酵母(Zygosaccharomyces rouxii)。PCR-DGGE技术对盐渍青菜菌群结构的解析不依赖培养,方法简便快捷,能够直观准确地分析盐渍青菜的真菌菌群结构。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 盐渍青菜 酵母 真菌菌群结构
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真菌菌群在肠道疾病中的作用进展 被引量:15
11
作者 车媛 刘凯 李秋荣 《肠外与肠内营养》 北大核心 2015年第6期378-381,共4页
肠道菌群对人体能量代谢、肠道功能、免疫系统、治疗糖尿病等方面具有重要作用。肠道定植真菌菌群虽在肠道菌群中所占比例极少,但对肠道菌群内稳态平衡的维持作用显著。真菌菌群不仅通过细胞壁上的多种抗原复合物激活人体先天性和获得... 肠道菌群对人体能量代谢、肠道功能、免疫系统、治疗糖尿病等方面具有重要作用。肠道定植真菌菌群虽在肠道菌群中所占比例极少,但对肠道菌群内稳态平衡的维持作用显著。真菌菌群不仅通过细胞壁上的多种抗原复合物激活人体先天性和获得性免疫反应,而且还参与促进肠系膜和肠道周围免疫淋巴系统的成熟,涉及多系统性疾病(如肠易激综合征、消化性溃疡、肿瘤、乙型肝炎、侵袭性肺炎和冠状动脉粥样硬化症等)的病理生理过程。肠道真菌菌群在肠道疾病中的重要作用正逐渐得到关注。以下将对其在菌群失调相关性腹泻和炎性肠病中的关键作用作一综述。 展开更多
关键词 真菌菌群 肠道微生物 炎性肠病 失调相关性腹泻
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抗生素相关性腹泻与肠道真菌菌群多样性关系 被引量:26
12
作者 车媛 李秋荣 《肠外与肠内营养》 北大核心 2016年第3期165-169,共5页
目的:研究抗生素相关性腹泻与肠道真菌菌群多样性的关系。方法:将BALB/C雄性小鼠分为空白对照组、生理盐水组、实验组和恢复组。实验组给予头孢拉啶联合庆大霉素腹腔注射,2次/d,收集小鼠第3、5、7、14和21天的粪便,采用变性梯度凝胶电... 目的:研究抗生素相关性腹泻与肠道真菌菌群多样性的关系。方法:将BALB/C雄性小鼠分为空白对照组、生理盐水组、实验组和恢复组。实验组给予头孢拉啶联合庆大霉素腹腔注射,2次/d,收集小鼠第3、5、7、14和21天的粪便,采用变性梯度凝胶电泳实验方法分析真菌菌群多样性变化。结果:与空白对照组比,实验组小鼠真菌菌群多样性明显增加(21.15±2.66 vs 15.5±0.57,P<0.05)。恢复组(停药7 d)小鼠真菌菌群多样性明显降低,与空白对照组比无显著性差异(14.5±3.08 vs 15.5±0.57,P>0.05)。结论:抗生素相关性腹泻与肠道真菌菌群多样性有关,且以其多样性增加为主。抗生素可能对肠道真菌菌群的变化有影响。 展开更多
关键词 抗生素相关性腹泻 肠道真菌菌群 多样性
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脾虚造模及参苓白术散的真菌菌群调整功能 被引量:18
13
作者 丁维俊 周邦靖 +1 位作者 冯立秀 王宇 《成都中医药大学学报》 2004年第1期24-25,共2页
目的 观察参苓白术散对脾虚证小鼠肠道真菌菌群的微生态调节作用。方法 运用苦寒泻下中药大黄造模脾虚,以沙堡弱氏、马丁氏和蔡氏等真菌培养基测定粪便中真菌菌落并同时做真菌种属鉴定,用配对t检验分析其统计学差异。结果 模型鼠肠道真... 目的 观察参苓白术散对脾虚证小鼠肠道真菌菌群的微生态调节作用。方法 运用苦寒泻下中药大黄造模脾虚,以沙堡弱氏、马丁氏和蔡氏等真菌培养基测定粪便中真菌菌落并同时做真菌种属鉴定,用配对t检验分析其统计学差异。结果 模型鼠肠道真菌总数显著性上升(p<0.05)。参苓白术散治疗之后,霉菌与酵母茵含量下降(p<0.05),真菌总数则极显著性下降(p<0.01)。与造模前正常值比较,酵母菌显著降低(p<0.05)。真菌种属鉴定结果显示,小白鼠肠道青霉、酵母菌为优势种,曲霉、枝孢霉、毛霉,链孢霉为常见种。结论 脾虚证小白鼠模型肠道真菌数量增加,参苓白术散具有真菌菌群调整作用。 展开更多
关键词 脾虚造模 参苓白术散 真菌菌群 酵母 真菌感染 中医
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两种鲨鱼鳃部真菌菌群的PCR-DGGE分析
14
作者 张翼 穆军 +1 位作者 冯妍 阎松 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期183-189,共7页
以提取自东海海域两种鲨鱼(尖吻鲭鲨和噬人鲨)鳃耙组织的总DNA为模板,对其真菌菌群rDNA的基因内转录间隔区ITS1序列进行了PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,电泳图谱中的7条主要条带经过二次PCR扩增后进行了克隆测序。NCBI... 以提取自东海海域两种鲨鱼(尖吻鲭鲨和噬人鲨)鳃耙组织的总DNA为模板,对其真菌菌群rDNA的基因内转录间隔区ITS1序列进行了PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,电泳图谱中的7条主要条带经过二次PCR扩增后进行了克隆测序。NCBI-BLAST比对及分子系统发育分析结果表明,尖吻鲭鲨鳃部真菌菌群的优势种来自四个分类单元,其中一个来自青霉属,三个来自曲霉属;噬人鲨鳃部真菌的优势种来自四个分类单元,其中一种来自青霉属、两个来自梗孢酵母属、一个来自枝顶孢属;青霉属为两种鲨鱼鳃部共同的优势菌;另外DGGE指纹图谱显示还有种类较丰富的劣势菌存在。数据库检索显示多数真菌分类单元具有较好的产生生物活性天然产物的潜力。该PCR-DGGE分析揭示鲨鱼鳃部栖生有较丰富的真菌类群,它们的代谢产物及其与宿主之间的相互作用还有待深入研究。 展开更多
关键词 鲨鱼 真菌菌群 ITS RDNA 变性梯度凝胶电泳
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基于ITS高通量测序技术研究果寡糖对奶牛瘤胃真菌菌群的影响 被引量:5
15
作者 冶文兴 张洁 +2 位作者 李娜 张力莉 徐晓锋 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第6期965-970,共6页
【目的】利用ITS高通量测序分析技术研究果寡糖对奶牛瘤胃真菌菌群的影响。【方法】采用两阶段交叉设计,选择泌乳阶段相近、胎次相同、健康状况良好的泌乳期奶牛4头。随机分为2组,对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加果寡糖,添... 【目的】利用ITS高通量测序分析技术研究果寡糖对奶牛瘤胃真菌菌群的影响。【方法】采用两阶段交叉设计,选择泌乳阶段相近、胎次相同、健康状况良好的泌乳期奶牛4头。随机分为2组,对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加果寡糖,添加量为60 g/(cow·d)。【结果】本试验条件下,在日粮中添加果寡糖并未显著影响奶牛瘤胃真菌的多样性(P>0.05),但优势菌属的相对丰度在两组之间存在差异,其中接合菌门(Zygomycota)仅存在于对照组,新丽鞭毛菌门(Neocallimastigomycota)相对丰度试验组比对照组增加了628.28%,但差异不显著(P=0.21)。试验组假丝酵母属(Candida)和平革菌属(Phanerochaete)相对丰度极显著高于对照组(P=0.001、P=0.003),试验组毛壳属(Chaetomidium)相对丰度显著增加(P=0.037),试验组瘤胃壶菌属(Piromyces)相对丰度较对照组增加1 205.71%,但差异不显著(P=0.135)。试验组柄孢壳属(Zopfiella)和德巴利氏酵母属(Debaryomyces)相对丰度比对照组分别降低99.08%和64.14%,但差异不显著(P=0.523、P=0.671)。【结论】日粮中果寡糖的添加对奶牛瘤胃真菌菌群的多样性并未产生明显的影响,但优势菌比例发生变化,瘤胃中瘤胃壶菌属、平革菌属等纤维降解菌的相对丰度提高,增强了瘤胃真菌菌群对纤维的降解能力。 展开更多
关键词 ITS高通量测序技术 奶牛 果寡糖 瘤胃真菌菌群
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基于高通量测序技术分析浓香型白酒大曲真菌菌群多样性 被引量:11
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作者 周森 王成 +2 位作者 朱绍宾 赵文俊 刘京国 《中国酿造》 CAS 北大核心 2021年第11期55-59,共5页
采用高通量测序技术对15份浓香型白酒大曲真菌多样性进行分析。结果表明,不同样品真菌群落丰度和多样性存在显著差异。主坐标分析(PCoA)结果表明,样品NX-1、NX-3、NX-4、NX-10、NX-11真菌组成相似、样品NX-2、NX-8真菌组成相似、其余样... 采用高通量测序技术对15份浓香型白酒大曲真菌多样性进行分析。结果表明,不同样品真菌群落丰度和多样性存在显著差异。主坐标分析(PCoA)结果表明,样品NX-1、NX-3、NX-4、NX-10、NX-11真菌组成相似、样品NX-2、NX-8真菌组成相似、其余样品真菌组成存在差异。15份大曲样品中共检测到393个操作分类单元(OTUs),隶属于6个门19个纲和117个属,其中子囊菌门(Ascomycota)、酵母纲(Saccharomycetes)和散囊菌纲(Eurotiomycetes)在15份大曲样品中的相对丰度均较高。在属分类水平上,15份大曲样品出现明显差异,样品NX-1、NX-4、NX-11中的热子囊菌属(Thermoascus)、嗜热真菌属(Thermomyces),样品NX-3、NX-10、NX-13、NX-6和NX-14中的覆膜孢酵母属(Saccharomycopsis)、毕赤酵母属(Pichia),样品NX-5、NX-12、NX-15、NX-7中的曲霉属(Aspergillus),样品NX-9中的曲霉属和根毛霉属(Rhizomucor)、样品NX-2中的威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)、酵母属(Saccharomyces),及样品NX-8中的耐碱酵母属(Galactomyces)和双足酵母属(Dipodascus)相对丰度较高。 展开更多
关键词 高通量测序 浓香型白酒大曲 真菌菌群多样性 主坐标分析
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肠道真菌菌群和炎症性肠病 被引量:7
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作者 李亚周 江慧琴 秦阳华 《世界华人消化杂志》 CAS 2017年第17期1528-1535,共8页
炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生受到遗传、环境、免疫、肠道内微生物群的影响.研究发现IBD与真菌微生物群存在密切关系:(1)真菌在肠道中正常定植,是肠道微生物的重要组成成员;(2)IBD患者存在微生物群失调,真菌分布... 炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生受到遗传、环境、免疫、肠道内微生物群的影响.研究发现IBD与真菌微生物群存在密切关系:(1)真菌在肠道中正常定植,是肠道微生物的重要组成成员;(2)IBD患者存在微生物群失调,真菌分布异常可能参与IBD发生或者进展;(3)粪便微生物移植、微生态制剂等在IBD治疗中已有初步疗效;(4)IBD患者肠道内真菌群落的改变是继发于肠道细菌群落的失衡还是IBD的独立病原学因素,有待进一步的研究.本文就近年来人们对真菌菌群在IBD进展中的作用的研究性进展与微生态制剂在IBD治疗进展中的潜在应用价值进行简要的综述. 展开更多
关键词 真菌菌群 炎症性肠病 微生物失调 微生态制剂
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基于ITSrDNA高通量测序方法研究玉米粉碎粒度对奶牛瘤胃真菌菌群的影响 被引量:3
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作者 吉武龙 郭成 +2 位作者 胡丹丹 张力莉 徐晓锋 《中国饲料》 北大核心 2019年第15期15-19,共5页
本试验利用ITS高通量测序技术研究玉米粉碎粒度对泌乳早期奶牛真菌菌群的影响。选用4头体况良好,泌乳20d左右,日产奶量约30kg,体重550kg左右经产中国荷斯坦奶牛。试验采用2×2交叉试验设计,对照组奶牛日粮添加10%的破碎玉米,试验组... 本试验利用ITS高通量测序技术研究玉米粉碎粒度对泌乳早期奶牛真菌菌群的影响。选用4头体况良好,泌乳20d左右,日产奶量约30kg,体重550kg左右经产中国荷斯坦奶牛。试验采用2×2交叉试验设计,对照组奶牛日粮添加10%的破碎玉米,试验组是将该比例破碎玉米由细粉碎玉米代替。结果表明:用细粉碎玉米替代破碎玉米(10%DM)并未显著影响奶牛瘤胃真菌的多样性与丰富度。在门水平上,试验组与对照组瘤胃真菌丰度差异不显著;在属水平上,德巴利酵母属与蜡孔属等优势菌属有较大幅度的下降,但差异不显著(P>0.05),这可能与奶牛个体差异有关。而与淀粉降解有关的根囊鞭菌属的菌群丰度显著升高(P<0.05)。其他相对丰度较低的真菌也有检出,如试验组柄孢壳属(Zopfiella)与被孢霉属(Mortierella)增加明显(P<0.05),但其在瘤胃的功能目前尚鲜见报道。 展开更多
关键词 ITS高通量测序技术 中国荷斯坦奶牛 玉米粉碎粒度 瘤胃真菌菌群
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不同原料组成对黏豆包酸面团的真菌菌群及流变学特性的影响 被引量:7
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作者 韩雨茜 芦淋 郭鸰 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第22期101-108,119,共9页
为探究原料组成对东北地区黏豆包酸面团中的真菌菌群构成及流变学特性的影响,收集东北地区手工制作的黏豆包酸面团16份并依据原料组成不同分为A(江米+大米)、B(江米+黏玉米)、C(黏玉米、黄米和大米)和D(黄米+黏玉米)四组,采用高通量测... 为探究原料组成对东北地区黏豆包酸面团中的真菌菌群构成及流变学特性的影响,收集东北地区手工制作的黏豆包酸面团16份并依据原料组成不同分为A(江米+大米)、B(江米+黏玉米)、C(黏玉米、黄米和大米)和D(黄米+黏玉米)四组,采用高通量测序技术结合聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)研究黏豆包酸面团中真菌菌群构成,并测定酸面团的流变学特性、pH和总滴定酸度(TTA)。结果显示:在属水平上,A和C组检出的菌属除共有菌属[微囊藻属(Cystofilobasidium)、隐球酵母菌(Cryptococcus)、德巴利氏酵母属(Debaryomyces)和丝孢酵母属(Trichosporon)]外,A组中还发现曲霉属(Aspergillus)、青霉属(Penicillium)、附球菌属(Epicoccum)、威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)和根霉属(Rhizopus),而C组中还发现汉逊氏酵母属(Hanseniaspora)。B组有隐球酵母属和德巴利氏酵母属;D组中仅含有汉逊氏酵母属。汉逊氏德巴利酵母(Dabaryomyces hansenii)为优势酵母。此外,添加玉米或黄米能提高酸面团的黏性和弹性。生酸面团的弹性模量、复合黏度与拟威尔酵母(Cyberlindnera)有显著正相关性(P<0.05),拟威尔酵母的发酵作用能增强酸面团的弹性。生酸面团的损耗因子与汉逊氏酵母属呈显著正相关(P<0.05),与隐球酵母菌及Naumovozyma呈显著负相关(P<0.05),即真菌可影响生酸面团的流体性质和固体性质;丝孢酵母属等真菌能加强熟酸面团的流体性质。pH与掷孢酵母属、汉纳酵母属和亚球壳属等真菌之间呈显著正相关(P<0.05),TTA值与微囊藻属、隐球酵母菌和青霉属等8个菌属呈显著负相关性(P<0.05),说明pH低和总酸度高的酸性环境抑制掷孢酵母属和微囊藻属等真菌的生长。因此,原料组成对黏豆包酸面团中真菌菌群构成有影响(江米和大米混合制备酸面团中酵母菌多样性最丰富),对酸面团的流变学特性也有一定的影响,且流变学特性、pH和TTA与酸面团中真菌有相关性。 展开更多
关键词 黏豆包酸面团 高通量测序 聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术( PCR-DGGE) 真菌菌群 流变学特性
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番鸭盲肠真菌菌群结构及其发育性变化研究 被引量:2
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作者 申宇 杨华 +4 位作者 樊倩 许旖旎 肖英平 孙杨赢 吕文涛 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期5072-5083,共12页
本试验旨在研究番鸭盲肠真菌菌群结构及其生长发育过程中真菌菌群多样性的变化。试验选用1日龄健康番鸭70只,饲养70 d,分别在番鸭1、3、7、14、28、42和70日龄时,每组随机选取6只番鸭,屠宰取盲肠内容物,提取盲肠内容物中真菌DNA进行测... 本试验旨在研究番鸭盲肠真菌菌群结构及其生长发育过程中真菌菌群多样性的变化。试验选用1日龄健康番鸭70只,饲养70 d,分别在番鸭1、3、7、14、28、42和70日龄时,每组随机选取6只番鸭,屠宰取盲肠内容物,提取盲肠内容物中真菌DNA进行测序分析。结果表明:在门水平上,1~70日龄番鸭的盲肠中子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)均为优势菌门。在属水平上,3~7日龄番鸭的盲肠中赤霉菌属(Gibberella)、念球菌属(Candida)和小戴维霉属(Davidiella)为优势菌属,14~28日龄番鸭的盲肠中赤霉菌属和念球菌属为优势菌属,70日龄番鸭的盲肠中以红酵母菌属(Rhodotorula)、毛芽孢子菌属(Trichosporon)和赤霉菌属为优势菌。42~70日龄番鸭盲肠中的真菌菌群种类比1~28日龄多。综上所述,番鸭盲肠中的真菌菌群种类会随着日龄的增加而逐渐丰富多样,这为番鸭肠道真菌菌群与生长发育关系的研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 番鸭 盲肠 真菌菌群结构
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