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烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构分析
被引量:
8
1
作者
陈乾丽
汪汉成
+5 位作者
梁永进
蔡刘体
黄宇
周浩
李忠
韩洁
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第6期1019-1028,共10页
为了解烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落多样性,采用Illumina MiSeq测序平台对烤后健康与霉烂烟叶样品上真菌群落的ITS1-ITS2区域PCR扩增片段进行测序并分析。健康烟叶组(MJ)和霉烂烟叶组(MB)2类样品真菌主要为子囊菌门(Ascomycota)、担...
为了解烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落多样性,采用Illumina MiSeq测序平台对烤后健康与霉烂烟叶样品上真菌群落的ITS1-ITS2区域PCR扩增片段进行测序并分析。健康烟叶组(MJ)和霉烂烟叶组(MB)2类样品真菌主要为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、接合菌门(Zygomycota)等6个门25纲58目187科260个属的394个真菌分类单元(OTUs)。在属水平上,健康烟叶组(MJ)优势真菌为链格孢属(Alternaria),其次为曲霉属(Aspergillus)、新凸轮孢菌属(Neocamarosporium)、赤霉属(Gibberella)、支顶孢属(Acremonium);霉烂烟叶组(MB)优势真菌为曲霉属(Aspergillus),其次为青霉属(Penicillium)和根霉属(Rhizopus)。Alpha指数表明,健康烟叶组(MJ)真菌群落丰富度与多样性均高于霉烂烟叶组(MB)。71.06%的OTUs归属于8个功能类群,其中腐生菌是主要功能类群,研究结果揭示了烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构,为制定相应的防治方案提供参考依据。
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关键词
霉烂烟叶
真菌its区
群落结构
Illumina高通量测序
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职称材料
题名
烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构分析
被引量:
8
1
作者
陈乾丽
汪汉成
梁永进
蔡刘体
黄宇
周浩
李忠
韩洁
机构
贵州大学农学院
贵州省烟草科学研究院
广西中烟工业有限责任公司
长江大学农学院
贵州中医药大学基础医学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第6期1019-1028,共10页
基金
广西中烟工业有限责任公司科技项目(201852010064028)
贵州市科学技术基金(黔科合J字〔2012〕2065号)。
文摘
为了解烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落多样性,采用Illumina MiSeq测序平台对烤后健康与霉烂烟叶样品上真菌群落的ITS1-ITS2区域PCR扩增片段进行测序并分析。健康烟叶组(MJ)和霉烂烟叶组(MB)2类样品真菌主要为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、接合菌门(Zygomycota)等6个门25纲58目187科260个属的394个真菌分类单元(OTUs)。在属水平上,健康烟叶组(MJ)优势真菌为链格孢属(Alternaria),其次为曲霉属(Aspergillus)、新凸轮孢菌属(Neocamarosporium)、赤霉属(Gibberella)、支顶孢属(Acremonium);霉烂烟叶组(MB)优势真菌为曲霉属(Aspergillus),其次为青霉属(Penicillium)和根霉属(Rhizopus)。Alpha指数表明,健康烟叶组(MJ)真菌群落丰富度与多样性均高于霉烂烟叶组(MB)。71.06%的OTUs归属于8个功能类群,其中腐生菌是主要功能类群,研究结果揭示了烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构,为制定相应的防治方案提供参考依据。
关键词
霉烂烟叶
真菌its区
群落结构
Illumina高通量测序
Keywords
rotten tobacco leaf
fungal ITS area
community structure
Illumina high throughput sequencing
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烤后健康烟叶和霉烂烟叶真菌群落结构分析
陈乾丽
汪汉成
梁永进
蔡刘体
黄宇
周浩
李忠
韩洁
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020
8
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