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干眼患者眼表宏基因组研究
被引量:
4
1
作者
陈红
文小凤
+2 位作者
邓裕华
魏来
彭广华
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2017年第2期129-132,共4页
目的通过比较干眼患者和健康受试者眼表宏基因组的异同探讨眼表微生物组的改变在干眼发病机制中的作用。方法在解放军总医院眼科和中山大学中山眼科中心收集干眼患者20例及健康受试者90名。对所有受试者双眼进行结膜印迹细胞样本采集,...
目的通过比较干眼患者和健康受试者眼表宏基因组的异同探讨眼表微生物组的改变在干眼发病机制中的作用。方法在解放军总医院眼科和中山大学中山眼科中心收集干眼患者20例及健康受试者90名。对所有受试者双眼进行结膜印迹细胞样本采集,提取核酸后进行宏基因组测序。通过计算Shannon指数比较两者微生物群落α多样性的差异;对两者微生物种群的相对丰度及代谢途径进行生物信息学分析。并对微生物中的抗生素抗性基因进行比对。结果干眼患者眼表微生物的α多样性与健康受试者相比差异无统计学意义(P=0.13)。干眼患者眼表15种微生物的相对丰度较高,健康受试者10种微生物的相对丰度较高,且在代谢途径上存在着差异。干眼患者眼表微生物中的抗生素抗性基因明显多于健康受试者。结论虽然干眼患者眼表微生物的多样性与健康受试者相似,但某些特定微生物种群的相对丰度及代谢途径存在特征性的改变,表明这些特定的微生物种群可能与干眼的发病机制有关。
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关键词
干
眼
眼表微生物组
宏基因
组
测序
抗性基因
下载PDF
职称材料
题名
干眼患者眼表宏基因组研究
被引量:
4
1
作者
陈红
文小凤
邓裕华
魏来
彭广华
机构
解放军总医院眼科
中山大学中山眼科中心
出处
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2017年第2期129-132,共4页
基金
国家自然科学基金面上项目(编号:31271400
31470065)
国家重点基础研究发展计划(编号:2013CB967001)~~
文摘
目的通过比较干眼患者和健康受试者眼表宏基因组的异同探讨眼表微生物组的改变在干眼发病机制中的作用。方法在解放军总医院眼科和中山大学中山眼科中心收集干眼患者20例及健康受试者90名。对所有受试者双眼进行结膜印迹细胞样本采集,提取核酸后进行宏基因组测序。通过计算Shannon指数比较两者微生物群落α多样性的差异;对两者微生物种群的相对丰度及代谢途径进行生物信息学分析。并对微生物中的抗生素抗性基因进行比对。结果干眼患者眼表微生物的α多样性与健康受试者相比差异无统计学意义(P=0.13)。干眼患者眼表15种微生物的相对丰度较高,健康受试者10种微生物的相对丰度较高,且在代谢途径上存在着差异。干眼患者眼表微生物中的抗生素抗性基因明显多于健康受试者。结论虽然干眼患者眼表微生物的多样性与健康受试者相似,但某些特定微生物种群的相对丰度及代谢途径存在特征性的改变,表明这些特定的微生物种群可能与干眼的发病机制有关。
关键词
干
眼
眼表微生物组
宏基因
组
测序
抗性基因
Keywords
dry eye
ocular surface microbiota
metagenomic shotgun sequencing
antibiotic resistance genes
分类号
R777.34 [医药卫生—眼科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
干眼患者眼表宏基因组研究
陈红
文小凤
邓裕华
魏来
彭广华
《眼科新进展》
CAS
北大核心
2017
4
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