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中国南方汉族群体11个Y染色体-短串联重复序列基因座及单倍型遗传多态性分析 被引量:2
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作者 百茹峰 胡泊 +1 位作者 于晓军 吕俊耀 《汕头大学医学院学报》 2007年第2期65-68,共4页
目的:获得11个(DYS588,DYS508,DYS576,DYS504,DYS643,DYS505,DYS461,DYS533,DYS481,DYS634,DYS607)Y染色体-短串联重复序列(STR)基因座及单倍型在中国南方汉族群体中的遗传多态性分布情况,探讨其法医学应用价值。方法:对中国南方... 目的:获得11个(DYS588,DYS508,DYS576,DYS504,DYS643,DYS505,DYS461,DYS533,DYS481,DYS634,DYS607)Y染色体-短串联重复序列(STR)基因座及单倍型在中国南方汉族群体中的遗传多态性分布情况,探讨其法医学应用价值。方法:对中国南方汉族160名无关男性个体进行11个Y-STR基因座的荧光标记复合扩增;用ABI310遗传分析仪对扩增后产物进行检测;GeneScan、Genotyper软件进行基因分型。结果:11个Y-STR基因座分别检测到8、7、7、7、6、7、6、4、11、4、6个等位基因,频率分布在0.006 3-0.900 0之间。各基因座基因多样性(GD)值分布在0.189 5-0.803 1之间,以DYS481最高;160名无关男性个体共检测到155种单倍型,其中151种只出现1次,3种2次,1种3次,单倍型的GD值为0.999 5。另对45个2代父性家系调查显示同一家系成员11个Y-STR基因座单倍型一致,未观察到基因突变。结论:中国南方汉族群体11个Y-STR基因座具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有应用价值。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复序列 复合扩增 遗传多态性 倍型
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成都地区汉族人群17个Y短串联重复序列基因座遗传多态性分析 被引量:8
2
作者 宋兴勃 范红 +3 位作者 应斌武 陆小军 王军 叶远馨 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1973-1976,1981,共5页
目的获得17个Y染色体短串联重复序列(Y-STR)基因座在成都汉族人群中的群体遗传学数据。方法应用AmpFlSTRYfilerTM荧光标记复合扩增系统,对成都地区111名无关男性个体血样进行17个Y-STR基因座的复合扩增,用ABI3130遗传分析仪对扩增产物... 目的获得17个Y染色体短串联重复序列(Y-STR)基因座在成都汉族人群中的群体遗传学数据。方法应用AmpFlSTRYfilerTM荧光标记复合扩增系统,对成都地区111名无关男性个体血样进行17个Y-STR基因座的复合扩增,用ABI3130遗传分析仪对扩增产物进行检测分析。结果DYS456、DYS389Ⅰ、DYS390、DYS389Ⅱ、DYS458、DYS19、DYS385a/b、DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYS392、Y-GATA-H4、DYS437、DYS438、DYS448基因座在成都地区汉族群体分别检出3~8个等位基因,DYS385a/b检出36个等位基因组,各基因座基因多样性最低为0.3970(DYS391),最高为0.9561(DYS385a/b)。检测16例女性血样和7种动物血样,17个Y-STR基因座均无扩增产物。另对20个二代父性家系调查显示同一家系成员17个Y-STR基因座单倍型一致,未观察到基因突变。结论上述17个Y-STR基因座构成的单倍型在成都人群中具有较高的遗传多态性,适用于法医个体识别和亲权鉴定、遗传学及人类学的相关研究。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复序列 遗传多态性 倍型 成都汉族人
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15个短串联重复序列位点与大骨节病传递不平衡分析及与低硒暴露的交互作用 被引量:2
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作者 史晓薇 吕爱莉 +3 位作者 任峰玲 李文荣 康龙丽 郭雄 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期567-571,共5页
目的寻找大骨节病(KBD)的易感基因,探讨低硒暴露与KBD易感基因的交互作用。方法在陕西省麟游县KBD病区收集23个KBD核心家系,应用聚合酶链反应技术及GeneScan Analysis 3.7和Genotyper3.7软件进行基因分析。对核心家系进行单体型相对风... 目的寻找大骨节病(KBD)的易感基因,探讨低硒暴露与KBD易感基因的交互作用。方法在陕西省麟游县KBD病区收集23个KBD核心家系,应用聚合酶链反应技术及GeneScan Analysis 3.7和Genotyper3.7软件进行基因分析。对核心家系进行单体型相对风险分析(HRR)和传递/不平衡检验(TDT)。采用原子荧光光谱法测定血清硒水平,用二项Logistic回归模型分析低硒暴露与KBD可疑易感基因的交互作用。结果 23个核心家系的HRR和TDT分析发现3个等位基因(位点D2S151的等位基因248 bp、位点D2S305的等位基因320 bp和位点D11S4094的等位基因194 bp)与KBD关联(P<0.05)。被研究人群的平均血硒浓度为0.037μg/ml,未发现低硒暴露与多态性STR位点的交互作用(P>0.05)。结论 D2S151、D2S305和D11S4094位点或其附近位点的多态性可能与KBD发病有关,可疑易感基因和低硒暴露在研究人群中无交互作用。 展开更多
关键词 大骨节病 低硒 串联重复序列 体型相对风险分析 传递不平衡分析
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中国深圳地区12个X染色体短串联重复序列基因座的遗传多态性:一项家系调查分析
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作者 李桢 李雪梅 +1 位作者 邹红岩 程良红 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2017年第25期4065-4070,共6页
背景:X染色体短串联重复序列(short tandem repeat on chromosome X,X-STR)具有特殊的遗传规律,使其在法医物证鉴定中表现出常染色体遗传标记无法比拟的优点。但其群体遗传学研究数据远比不上常染色体STR,尤其是单倍型遗传数据的报道在... 背景:X染色体短串联重复序列(short tandem repeat on chromosome X,X-STR)具有特殊的遗传规律,使其在法医物证鉴定中表现出常染色体遗传标记无法比拟的优点。但其群体遗传学研究数据远比不上常染色体STR,尤其是单倍型遗传数据的报道在国内外均很少见。目的:通过家系分析,研究深圳地区12个X染色体STR基因座的遗传多态性,为X-STR在法医学、遗传学的应用提供科学有效的数据。方法:常规Chelex-100法提取118个家系的血样DNA,使用Investigator Argus X-12试剂盒进行PCR扩增。用直接计数法和Excel软件统计231个无关个体的等位基因频率,并用卡方检验对女性样本的12个X-STR基因座进行Hardy-Weinberg平衡检验,根据公式计算个体识别力和平均排除率。采用家系分析确定女性样本的单倍型,用直接计数法和Excel软件计算111位父亲和119位母亲的4个连锁群的单倍型频率。结果与结论:(1)基因多态性分析:DXS10135基因座的多态性最高,检出了21个等位基因;DXS7423基因座多态性最差,仅有4个等位基因;男性累积个体识别力DPm为0.999 999 99;女性累积个体识别力DPf为0.999 999 99;累积三联体平均排除率MECtrio为0.999 999 99;累积二联体平均排除率MECduo为0.999 998 11;(2)单倍型分析:试验获得了349个单倍型。连锁群X1-X4中分别有238,139,153和157个不同的单倍型;(3)结果说明,X-12检测系统在中国深圳地区具有较高的遗传多态性,在法医学个体识别及亲权鉴定中具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 干细胞 组织工程 X染色体 串联重复序列 倍型 等位基因频率 个体识别力 平均排除率 家系分析 多态性 连锁群 法医学
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短串联重复序列多态性分析在鉴别妊娠早期葡萄胎和水肿性流产中的临床应用 被引量:3
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作者 王珺 陈素文 +5 位作者 安雅楠 李长东 郑兴征 何东华 秦旭颖 王鹏 《生殖医学杂志》 CAS 2017年第6期573-577,共5页
目的探讨短串联重复序列(STR)多态性分析在鉴别妊娠早期葡萄胎(HM)和水肿性流产(HA)中的临床应用价值。方法收集2015年9月至2016年11月于北京妇产医院计划生育科行高危流产手术、疑似HM的17例患者为研究对象,常规取材固定后分别采用传... 目的探讨短串联重复序列(STR)多态性分析在鉴别妊娠早期葡萄胎(HM)和水肿性流产(HA)中的临床应用价值。方法收集2015年9月至2016年11月于北京妇产医院计划生育科行高危流产手术、疑似HM的17例患者为研究对象,常规取材固定后分别采用传统组织病理学方法及STR分析方法进行分析。评价STR方法在HM和HA鉴别中的效果。结果 17例可疑HM病例,经组织病理学检查发现9例符合HM[其中完全性HM(CHM)6例,部分性HM(PHM)3例],8例符合HA。STR基因分型结果为10例HM,其中6例CHM(单精纯合型CHM 4例,双精杂合型CHM 2例),4例PHM(均为双精杂合型);7例符合HA。组织病理学诊断中有1例PHM漏诊,1例双精杂合型PHM被误诊为HA。结论STR多态性分析可以作为一种快速、简洁、精准的方法,有效用于妊娠早期HM和HA的鉴别诊断。 展开更多
关键词 串联重复序列多态性分析 葡萄胎 水肿性流产
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优选短串联重复序列应用于脊肌萎缩症产前诊断的连锁分析 被引量:1
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作者 孙维 沈嘉玮 +3 位作者 龙飞 季星 杨祖菁 陶炯 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期707-712,共6页
目的建立完整的适合汉族人群的脊肌萎缩症(SMA)产前基因诊断体系。方法对30名正常汉族人的外周血样本进行基因多态性分析,评估位于运动神经元存活基因1(SMN1)两侧的短串联重复序列(STR)位点的多态信息含量;并通过在6个SMA产前诊断家系... 目的建立完整的适合汉族人群的脊肌萎缩症(SMA)产前基因诊断体系。方法对30名正常汉族人的外周血样本进行基因多态性分析,评估位于运动神经元存活基因1(SMN1)两侧的短串联重复序列(STR)位点的多态信息含量;并通过在6个SMA产前诊断家系连锁中的应用,优选出STR位点,并结合PCR酶-切法(PCR-RFLP)进一步评价STR位点与SMN1基因的连锁紧密性。结果从7个STR位点中优选出D5S435、D5S629、D5S610和D5S351四个STR位点用于家系连锁分析,联合PCR-RFLP,在6名待检胎儿中检出2例患者和4例携带者。结论通过优选出的4个多态性强、与SMN1基因紧密连锁的STR位点,联合家系连锁和PCR-RFLP,建立起稳定可靠的适合汉族人群的SMA产前基因诊断体系。 展开更多
关键词 脊肌萎缩症 串联重复序列 连锁分析 产前诊断
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河南汉族人群9个Y染色体短串联重复序列单倍型遗传多态性 被引量:1
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作者 宋丽君 刘建新 +1 位作者 陈辉 李晓文 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2011年第2期225-227,共3页
目的:检测河南汉族人群中DYS456、DYS389Ⅰ、DYS392、DYS389Ⅱ、H4、A7.1、DYS448、DYS393及DYS439等9个Y染色体短串联重复序列(Y-STR)位点构建的单倍型遗传多样性。方法:180名河南汉族健康无关男性个体、50名女性个体及经常染色体STR... 目的:检测河南汉族人群中DYS456、DYS389Ⅰ、DYS392、DYS389Ⅱ、H4、A7.1、DYS448、DYS393及DYS439等9个Y染色体短串联重复序列(Y-STR)位点构建的单倍型遗传多样性。方法:180名河南汉族健康无关男性个体、50名女性个体及经常染色体STR检测确定的20对真父子和20对非父子为测定对象,应用PCR-聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术分析上述9个Y-STR位点等位基因及单倍型分布情况。结果:180名河南汉族健康无关男性个体中上述9个位点的等位基因检出数目分别为5、5、8、7、5、5、7、5和5个,基因多样性分别为0.6501、0.6330、0.8147、0.7633、0.5858、0.6857、0.7521、0.7019和0.6472,共检测出180种由上述9个Y-STR位点构建的单倍型,单倍型多样性为1。50名女性样本中均未检测到任何扩增产物。在20对真父子样本中,各父子对的9个Y-STR位点检测结果均完全一致。在20组非父子样本中,各非父子对均有至少5个Y-STR位点的检测结果不一致。结论:上述9个Y-STR位点构建的Y-STR单倍型具有较高的遗传多态性。 展开更多
关键词 Y染色体串联重复序列 倍型 遗传多态性 河南 汉族
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应用四个短串联重复序列基因座研究七个民族间的遗传关系 被引量:2
8
作者 滕少康 徐林 +4 位作者 曹林枝 汪萍 赵丽娟 黄世宁 陈祖聪 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期403-406,共4页
目的:调查广西黑衣壮族人群4个短串联重复序列(short tandem repeats,STR)基因座:D5S818、D7S820、D13S317、vWA的群体遗传分布资料,探讨7个民族间的遗传关系。方法:应用荧光标记STR基因扫描技术分析152名广西黑衣壮族无关个体。以... 目的:调查广西黑衣壮族人群4个短串联重复序列(short tandem repeats,STR)基因座:D5S818、D7S820、D13S317、vWA的群体遗传分布资料,探讨7个民族间的遗传关系。方法:应用荧光标记STR基因扫描技术分析152名广西黑衣壮族无关个体。以遗传距离和系统发生树来分析7个民族间遗传关系。结果:4个STR基因座平均观察杂合度为0.7814;平均多态信息总量为0.7375;累积个体识别力达0.9928809,累积非父排除率达0.9928809。新疆乌孜别克族、新疆维吾尔族、甘肃裕固族、云南白族、广西黑衣壮族、浙江畲族聚为一群,东部蒙古族自成一群。结论:广西黑衣壮族的4个STR基因座属高度遗传多态性标记;新疆乌孜别克族和维吾尔族、广西黑衣壮族和浙江畲族遗传关系较近。 展开更多
关键词 串联重复序列 遗传关系 遗传距离 黑衣壮族 系统发生分析
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东北满族1O个Y染色体短串联重复序列的多态性研究 被引量:2
9
作者 郑立红 李士林 +2 位作者 白静 陈峰 傅松滨 《国际遗传学杂志》 CAS 2007年第3期165-168,共4页
目的调查满族Y染色体上10个短串联重复序列基因座及单体型的遗传多态性。方法采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检测满族71例无关个体10个Y—STR位点的遗传多态性分布。结果在DYS392、DYS389I、DYS389II、DYS441、DYS442、DYS... 目的调查满族Y染色体上10个短串联重复序列基因座及单体型的遗传多态性。方法采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检测满族71例无关个体10个Y—STR位点的遗传多态性分布。结果在DYS392、DYS389I、DYS389II、DYS441、DYS442、DYS447、DYS460、DYS461、DYS463和DYS459等10个基因座中共检出59个等位基因,等位基因频率分布在0.0141~0.5915之间,基因多样性(GD)分布在0.6006(DYS459)~0.8384(DYS441)之间,等位基因多样性均大于0.6。由10个基因座组成的Y染色体单体型系统中单体型有70种,单体型多样性为0.9998。结论上述10个Y—STR所构成的单体型在满族群体中具有较高的多态性,可用于法医学个体识别和亲子鉴定、遗传学及人类学的相关研究。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复 遗传多态性 体型
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辽宁满族15个短串联重复序列基因座遗传多态性 被引量:1
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作者 徐国昌 朱艳 +4 位作者 任甫 刘海东 席焕久 喻少波 郝春雨 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期825-827,共3页
随着人类基因组研究的深入,人类已发现许多短串联重复序列(short tandem repeats,STR)属于微卫星DNA序列,STR基因座因其在人类基因组中分布广泛、片段小、易扩增、所需检材微量及其高度杂合性、高度多态性而广泛应用于构建人类遗... 随着人类基因组研究的深入,人类已发现许多短串联重复序列(short tandem repeats,STR)属于微卫星DNA序列,STR基因座因其在人类基因组中分布广泛、片段小、易扩增、所需检材微量及其高度杂合性、高度多态性而广泛应用于构建人类遗传连锁图谱、基因定位、遗传病连锁分析、 展开更多
关键词 串联重复序列 STR基因座 遗传多态性 微卫星DNA序列 人类基因组 满族 辽宁 连锁分析
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广西毛南族6个短串联重复序列的遗传多态性
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作者 滕少康 徐林 +4 位作者 劳明 周丽宁 邓琼英 李松峰 龚继春 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2007年第7期745-748,共4页
目的调查广西毛南族人群6个短串联重复序列的群体遗传分布资料,探讨7个民族的遗传关系。方法应用荧光标记STR基因扫描技术分析200名广西毛南族无关个体。以遗传距离和系统发生树来分析7个民族间的遗传关系。结果6个STR基因座平均观察杂... 目的调查广西毛南族人群6个短串联重复序列的群体遗传分布资料,探讨7个民族的遗传关系。方法应用荧光标记STR基因扫描技术分析200名广西毛南族无关个体。以遗传距离和系统发生树来分析7个民族间的遗传关系。结果6个STR基因座平均观察杂合度0.7825,平均多态信息总量分别为0.7324,累积个体识别力达0.99999951,累积非父排除率达0.994575。鄂伦春族、东乡族、锡伯族3个民族聚为一支,金秀瑶族、融水苗族、罗城仫佬族、毛南族4个少数民族聚成另一支。结论D3S1358的等位基因16、D5S818的等位基因11、D7S820的等位基因11、D13S317的等位基因8、vWA的等位基因14、FGA的等位基因22可能是广西毛南族群体中相应STR基因座最原始的等位基因。广西毛南族的6个STR基因座属高度遗传多态性标记,广西毛南族与罗城仫佬族的遗传关系最近,其次分别为融水苗族、金秀瑶族、锡伯族、东乡族、鄂伦春族。 展开更多
关键词 串联重复序列 遗传多态性 毛南族 系统发生分析
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基于15个短串联重复序列基因座分型技术的湖北土家族与汉族群体遗传结构及系统发育关系
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作者 邹洁 朱远雁 沈钢 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期152-152,共1页
关键词 串联重复序列 分型技术 基因座 群体遗传结构 系统发育关系 广西苗族 基因型频率 群体遗传学 多态性分析 个体识别
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辽宁汉族人群6个短串联重复序列基因座的遗传多态性
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作者 梁晓华 于卫建 胡荣花 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2005年第2期219-222,共4页
利用多重PCR和4色荧光(5-FAM,JOE,NED和ROX)自动化检测技术调查辽宁地区汉族人群CSF1PO,THO1,D16S539,2S1338,D19S433和TPOX等6个STR基因座多态性分布并计算该6个基因座的基因频率(Pi)、个体识别率(DP)、无偏倚期望杂合度(H)、多态性信... 利用多重PCR和4色荧光(5-FAM,JOE,NED和ROX)自动化检测技术调查辽宁地区汉族人群CSF1PO,THO1,D16S539,2S1338,D19S433和TPOX等6个STR基因座多态性分布并计算该6个基因座的基因频率(Pi)、个体识别率(DP)、无偏倚期望杂合度(H)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE).结果显示,6个STR基因座的基因型分布符合HardyWeinberg定律.6个STR基因座累积个体识别率(CDP)为0.99999948,累积非父排除率(CPE)为0.98927.6个STR基因座适合作为中国人群的遗传标记,用于人类学、遗传疾病基因连锁分析、法医学亲子鉴定和个体识别等研究领域. 展开更多
关键词 汉族人群 串联重复序列 遗传多态性 STR基因座 D16S539 CSF1PO 基因连锁分析 多重PCR 自动化检测 多态性分布 Hardy 辽宁地区 技术调查 THO1 基因频率 TPOX 信息含量 遗传标记 中国人群 遗传疾病 研究领域 个体识别 亲子鉴定
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WGA、RDB结合STR单体型分析在β⁃地中海贫血胚胎植入前遗传学诊断中的应用 被引量:2
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作者 李伍高 严提珍 +4 位作者 李哲涛 唐永梅 秦祖兴 李忻琳 蔡稔 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第2期138-141,155,共5页
目的分析全基因组扩增技术结合致病位点检测和短串联重复序列单体型分析进行β⁃地中海贫血胚胎植入前遗传学诊断效果。方法对2017年1月至2018年12月在本院进行β⁃地中海贫血植入前遗传学诊断的囊胚检测结果进行分析,统计植入前遗传学诊... 目的分析全基因组扩增技术结合致病位点检测和短串联重复序列单体型分析进行β⁃地中海贫血胚胎植入前遗传学诊断效果。方法对2017年1月至2018年12月在本院进行β⁃地中海贫血植入前遗传学诊断的囊胚检测结果进行分析,统计植入前遗传学诊断检测结果与产前诊断结果。结果纳入统计分析的合计71个检测周期501枚囊胚,检测成功率94.4%(473/501)。其中69对夫妻进行了移植,移植周期92个,生化妊娠率63.04%,临床妊娠率53.26%,合计45对夫妇进行了产前诊断或流产物分析,符合率100%。结论利用全基因组扩增技术结合致病位点检测和短串联重复序列单体型分析进行β⁃地中海贫血胚胎植入前遗传学检测准确率高,能满足临床工作需求。 展开更多
关键词 HBB基因 植入前遗传学诊断 全基因组扩增 短串联重复序列单体型分析
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高变异Y染色体短串联重复片段检验体系的建立及对北方汉族群体调查 被引量:3
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作者 李运丽 宋诚诚 +4 位作者 郝世诚 张金佩 刘岩 徐妍 袁丽 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期550-556,共7页
【目的】建立一套五色荧光复合扩增体系,并调查中国北方汉族遗传多态性和父子家系突变情况。【方法】根据文献筛查出在中国某一群体中突变率为高变异和快速变异的Y-STR基因座,建立一套五色荧光Y-STR复合扩增体系,计算在500个北方汉族无... 【目的】建立一套五色荧光复合扩增体系,并调查中国北方汉族遗传多态性和父子家系突变情况。【方法】根据文献筛查出在中国某一群体中突变率为高变异和快速变异的Y-STR基因座,建立一套五色荧光Y-STR复合扩增体系,计算在500个北方汉族无关男性个体中的基因多样性,观察每个样本的Y-STR单倍型,并对中国北方汉族500个父子对进行检测,统计父子间的突变情况。【结果】成功构建了包含21个Y-STR基因座复合扩增检验体系,在北方汉族群体中基因多态性在0.4023~0.9904之间,500个无关个体中未发现有相同的单倍型。在500个父子对中观察到21个Y-STR基因座共发生134次突变,其中突变率最高的基因座是DYF399S1,为7.40×10^(-2);在DYS612、DYS547、DYS627、DYS526b、DYS576、DYS630、DYS449、DYF404S1、DYS390、DYS570和DYS518基因座上突变率≥1.00×10^(-2)。此外,DYS626、DYS458和DYS439基因座突变率≥4.00×10^(-3)。有97个父子家系出现1个基因座突变,16个家系同时出现2个基因座突变,仅有1个家系同时出现3个基因座突变,家系突变的概率为0.268。其中127次为一步突变,7次为两步突变,符合逐步突变模式。【结论】高变异Y-STR基因座能够有效区分具有父系亲缘关系的男性个体,可作为联合DNA索引系统(combined DNA index system,CODIS)常染色体和常规低突变Y-STR系统基因座的补充。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复序列 复合扩增 倍型 突变
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广东汉族DXS10011和DXS8377单体型 被引量:2
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作者 吕德坚 陈树春 +2 位作者 王学文 刘秋玲 陆惠玲 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期207-209,共3页
目的调查DX10011和DXS8377两个X染色体STR在广东汉族男性群体中的遗传多态性。方法DNA样本来自广东汉族男性无关个体,PCR后用聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法进行DNA分型。结果在113名个体中,DXS10011和DXS8377分别检出20和12个等位基因。DX... 目的调查DX10011和DXS8377两个X染色体STR在广东汉族男性群体中的遗传多态性。方法DNA样本来自广东汉族男性无关个体,PCR后用聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法进行DNA分型。结果在113名个体中,DXS10011和DXS8377分别检出20和12个等位基因。DXS10011-DXS8377共有72种不同的单体型,最多见的单体型只出现了3次。在没有母亲时,DXS10011-DXS8377的女孩的非父排除率为0.9588。在83个孩子为女孩的三联体家系和29个有两个孩子的家系中,DXS10011和DXS8377均表现为共显性连锁遗传,且没有发现突变。结论本数据表明DXS10011和DXS8377在复杂的亲权鉴定中可提供高的遗传多态性信息。 展开更多
关键词 串联重复 X染色体 体型 亲权鉴定
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联合应用PCR-单链构象多态性和短串联重复序列连锁分析方法进行20例苯丙酮尿症产前基因诊断 被引量:2
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作者 金煜炜 李莎莎 +1 位作者 王红 宋昉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期110-111,共2页
目的建立技术简便、准确性高的苯丙酮尿症产前基因诊断方法,探索遗传性疾病的产前基因诊断的临床应用价值。方法应用聚合酶链反应.单链构象多态性和短串联重复序列连锁分析的方法,对20例经典型苯丙酮尿症再怀孕家系进行了产前基因诊... 目的建立技术简便、准确性高的苯丙酮尿症产前基因诊断方法,探索遗传性疾病的产前基因诊断的临床应用价值。方法应用聚合酶链反应.单链构象多态性和短串联重复序列连锁分析的方法,对20例经典型苯丙酮尿症再怀孕家系进行了产前基因诊断。结果经过产后基因诊断和新生儿血苯丙氨酸浓度筛查的验证,取得令人满意的产前诊断结果。结论联合应用聚合酶链反应.单链构象多态性和短串联重复序列方法是技术简便、准确性高的产前基因诊断方法,具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 产前基因诊断 链构象多态性 串联重复序列 连锁分析
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用Y-STR单倍型信息指导数据库采样分析 被引量:4
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作者 吴微微 任文彦 +2 位作者 郝宏蕾 苏艳佳 吕德坚 《刑事技术》 2013年第1期3-5,共3页
目的分析浙江省绍兴诸暨市(县级市)各镇、村和姓的Y-STR单倍型分布,为Y-STR数据库的采样与应用提供依据。方法采集诸暨市17个镇156村的55个姓氏,且各镇-村有同姓人员10人以上(含)的家族样本5903份男性个体血样。采用Yfiler TM复合扩增... 目的分析浙江省绍兴诸暨市(县级市)各镇、村和姓的Y-STR单倍型分布,为Y-STR数据库的采样与应用提供依据。方法采集诸暨市17个镇156村的55个姓氏,且各镇-村有同姓人员10人以上(含)的家族样本5903份男性个体血样。采用Yfiler TM复合扩增试剂盒进行17个Y-STR分型,所得数据进行镇(乡/街道)/村/姓氏的组合和镇(乡/街道)/村/姓氏/单倍型组合分布情况统计分析。结果在5903份男性样本中,获得1987种Y-STR单倍型,它们分布于235种镇(乡/街道)/村/姓氏组合,共构成2547种镇(乡/街道)/村/姓氏/单倍型组合。各单倍型对应的"镇/村/姓"组合次数出现从1到18次不等,其中有1686种单倍型对应1种镇-村-姓组合(84.9%),绝大部分的单倍型对应1~2种镇-村-姓组合(95.3%)。各镇/村中同姓人员出现的主流分型大部分为1~2种(90.7%)。在镇/村的同姓人员中出现次要分型的频率平均为18.22%。结论 Y-STR数据库在诸暨的采样在家族调查的基础上,应针对次要分型较多的姓增加采样量,减少遗漏风险,获得高质量的YSTR数据库。 展开更多
关键词 法医物证学 Y染色体 串联重复序列(STR) 倍型 样本采集
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河南汉族人群7个Y-STR基因座单倍型分析 被引量:2
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作者 张秀华 李延兰 吴登俊 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2010年第3期356-360,共5页
分析河南汉族群体7个Y-STR基因座单倍型及其在法医学应用,利用PCR扩增检测7个Y染色体特异性的STR基因座,并用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色技术分析单倍型频率分布.结果显示:在河南汉族102名无关男性个体中7个基因座DYS438、DYS44... 分析河南汉族群体7个Y-STR基因座单倍型及其在法医学应用,利用PCR扩增检测7个Y染色体特异性的STR基因座,并用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色技术分析单倍型频率分布.结果显示:在河南汉族102名无关男性个体中7个基因座DYS438、DYS446、DYS391、DYS390、DYS458、DYS534、DYS426分别检出5、8、7、4、8、6、7个等位基因,共检出100种单倍型,其中98种为唯一的,单倍型基因多样性为0.999 612。7个Y-STR基因座具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学鉴定有重要意义。 展开更多
关键词 Y染色体 串联重复序列 倍型
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2号染色体父源单亲二倍体亲子鉴定的遗传分析
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作者 龙若庭 李桦 +2 位作者 肖鸽飞 肖奇志 谢建红 《检验医学与临床》 CAS 2019年第S02期60-63,共4页
目的通过染色体微阵列分析(CMA)技术分析孩子的遗传背景,对母子间四个短串联重复序列(STR)STR位点不符合孟德尔遗传规律的亲子鉴定进行分析判断,给出鉴定意见。方法采用AGCU EX22和AGCU EX21+1多重荧光复合扩增分析系统检测D3S1358等39... 目的通过染色体微阵列分析(CMA)技术分析孩子的遗传背景,对母子间四个短串联重复序列(STR)STR位点不符合孟德尔遗传规律的亲子鉴定进行分析判断,给出鉴定意见。方法采用AGCU EX22和AGCU EX21+1多重荧光复合扩增分析系统检测D3S1358等39个STR位点。应用AGCU EX21+1-FS及AGCU EX 19X多重荧光复合扩增分析系统增加常染色体和X染色体遗传标记检测。应用染色体微阵列分析技术分析母子间出现四个STR位点不符合遗传规律的原因。结果经检测39个STR位点结果显示:孩子与被检母之间2号染色体上存在四个不符合遗传规律的STR位点。被检母:D2S441为11/11.3,TPOX为9/9,D2S1338为20/23,D2S1776为11/12。孩子:D2S441为10/10,TPOX为8/8,D2S1338为16/16,D2S1776为13/13,该4个STR基因型均为纯合子。而被检父均能提供孩子必需的等位基因。增加检测AGCU EX21+1-FS及AGCU EX 19X分析系统遗传标记后,孩子与被检母之间未再出现新的不符合基因位点,推测孩子2号染色体为单亲二倍体(UPD)。CMA结果表明除2号染色体外的常染色体的SNP信号都有3条带,说明其等位基因都有AA、AB、BB三种组合,符合孟德尔遗传规律。但2号染色体的SNP信号为两条带,且带的位置在2拷贝处,说明其拷贝数为2,等位基因只有AA和BB两种组合,即等位基因均为纯合状态,不符合孟德尔遗传规律。UPD-Tool软件分析整条2号染色体的纯合状态比例几乎达到100%,且与父亲基因型相同的比例明显高于母亲,为父源性UPD。结论在亲子鉴定中,当同一染色体上存在多个基因座不符合孟德尔遗传规律时,应考虑为单亲二倍体所致。同时,需进一步分析进行确认,以免造成误判。 展开更多
关键词 亲子鉴定 串联重复序列 染色体微阵列分析技术 亲二倍体
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