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传统发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组特征与糖代谢表型分析
1
作者
吴青海
三月
+5 位作者
萨初拉
郭煜
王力伟
王莉梅
杨静
其布日
《食品与发酵科技》
CAS
2024年第6期1-7,21,共8页
该文探究传统发酵乳源短乳杆菌(Lactobacillus brevis)HQ1-1的基因组基本特征和糖代谢表型。经PacBio平台对短乳杆菌HQ1-1进行全基因组测序,并对基因组进行功能分类和注释。结果显示,短乳杆菌HQ1-1包含1条长度为2376708bp的环状染色体和...
该文探究传统发酵乳源短乳杆菌(Lactobacillus brevis)HQ1-1的基因组基本特征和糖代谢表型。经PacBio平台对短乳杆菌HQ1-1进行全基因组测序,并对基因组进行功能分类和注释。结果显示,短乳杆菌HQ1-1包含1条长度为2376708bp的环状染色体和7个大小不同的质粒DNA,编码2268个基因。通过KEGG数据库注释到参与代谢过程的基因有860个,其中,碳水化合物代谢相关基因的数量为142个,占比为16.51%。进一步用CAZy数据库注释到了糖苷水解酶类基因114个,占碳水化合物相关基因总数的45.24%。通过OmniLog微阵列表型芯片分析发现,短乳杆菌HQ1-1对L-阿拉伯糖、D-木糖、D-核糖、L-来苏糖等碳源的利用效率相对更高。因此,发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组中包含碳水化合物代谢相关基因的数量较多,能够利用多种碳源。该文全面阐述了短乳杆菌HQ1-1基因组特征和代谢表型,为今后开发功能性发酵食品提供新型乳酸菌发酵剂。
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关键词
传统发酵
乳
短乳杆菌hq1-1
全基因组测序
功能基因
糖代谢表型
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职称材料
题名
传统发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组特征与糖代谢表型分析
1
作者
吴青海
三月
萨初拉
郭煜
王力伟
王莉梅
杨静
其布日
机构
内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究所
内蒙古商贸职业学院餐饮食品系
出处
《食品与发酵科技》
CAS
2024年第6期1-7,21,共8页
基金
内蒙古农牧业青年创新基金项目(2023QNJJM03)。
文摘
该文探究传统发酵乳源短乳杆菌(Lactobacillus brevis)HQ1-1的基因组基本特征和糖代谢表型。经PacBio平台对短乳杆菌HQ1-1进行全基因组测序,并对基因组进行功能分类和注释。结果显示,短乳杆菌HQ1-1包含1条长度为2376708bp的环状染色体和7个大小不同的质粒DNA,编码2268个基因。通过KEGG数据库注释到参与代谢过程的基因有860个,其中,碳水化合物代谢相关基因的数量为142个,占比为16.51%。进一步用CAZy数据库注释到了糖苷水解酶类基因114个,占碳水化合物相关基因总数的45.24%。通过OmniLog微阵列表型芯片分析发现,短乳杆菌HQ1-1对L-阿拉伯糖、D-木糖、D-核糖、L-来苏糖等碳源的利用效率相对更高。因此,发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组中包含碳水化合物代谢相关基因的数量较多,能够利用多种碳源。该文全面阐述了短乳杆菌HQ1-1基因组特征和代谢表型,为今后开发功能性发酵食品提供新型乳酸菌发酵剂。
关键词
传统发酵
乳
短乳杆菌hq1-1
全基因组测序
功能基因
糖代谢表型
Keywords
traditional fermented milk
Lactobacillus brevis
hq
1
-
1
whole genome sequencing
functional gene
glycometabolic phenotype
分类号
TS252.1 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
传统发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组特征与糖代谢表型分析
吴青海
三月
萨初拉
郭煜
王力伟
王莉梅
杨静
其布日
《食品与发酵科技》
CAS
2024
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