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题名基于YKW图形表达的人类基因短编码序列识别
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作者
骆嘉伟
颜军
何海峰
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机构
湖南大学信息科学与工程学院
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出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2011年第8期2087-2091,共5页
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基金
国家自然科学基金资助项目(60873184)
湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
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文摘
针对人类短编码序列的识别问题,根据碱基在密码子三个位置的偏性和碱基自身物理化学性质的分类,提出一种新的图形表示方法——YKW图形,然后在此图形上,提取了9个有效的面积矩阵特征,识别过程中,为了提高识别率利用递增特征选择算法添加4个统计特征,并采用主元分析(PCA)方法对这13个特征降维,最后使用支持向量机(SVM)对人类的短编码序列进行编码区/非编码区识别。实验结果表明,与其他方法相比,该方法使用较少的特征(7个或4个)取得了更好的识别结果。
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关键词
图形表达
短编码序列识别
面积矩阵
基因序列
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Keywords
graphical representation
short coding sequence identification
area matrix
gene sequence
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分类号
TP391.412
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名短序列条纹编码法检测三维物体形状
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作者
金泉洁
余玲玲
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机构
东南大学自动控制系
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出处
《仪器仪表用户》
2007年第1期98-99,共2页
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文摘
条纹边界编码法检测三维物体形状需要利用条纹边界的调变来匹配多帧图像,所以在检测纹理较复杂的物体表面时.条纹边界编码的调变次数尽量多对检测精度的提高具有很重要的意义。本文采用了一种短序列编码的办法.有效地增加了条纹调变次数.提高了场景局部的检测精度。
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关键词
条纹边界编码
短序列编码
三维物体检测
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Keywords
Stripe boundary codes
Short serial stripe boundary codes
Three-dimensional shape measurement
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分类号
TM930.1
[电气工程—电力电子与电力传动]
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题名短基因编码序列识别及基因突变检测问题研究
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作者
支豪
毛瑜锋
马鹏
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机构
东南大学信息科学与程学院
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出处
《数学的实践与认识》
CSCD
北大核心
2013年第14期77-84,共8页
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文摘
基于频谱分析的基因预测方法普遍有一个缺点就是对短编码序列识别效果不佳,采用多参数Z-curve方法,再运用Fisher线性判别法对短编码序列(<100bp)进行预测,并进行了仿真验证.接着对基因突变问题采用频谱和信噪比分析方法的可行性进行了研究.
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关键词
短编码序列预测
多参数z—CUrVe法
FISHER线性判别
基因突变
频谱和
信噪比方法
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Keywords
short oding sequene predition
Z-Curve methods with multi-parameter
Fisherlinear disriminant
genovariation
spetrum and SNR method
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分类号
TM935
[电气工程—电力电子与电力传动]
O242.1
[理学—计算数学]
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