分子动力学模拟中不同短程作用力计算方法的效率研究

利用分子动力学模拟的基准问题 ,对截断半径 (cut offdistance)法、Verlet链 (Verletlist)法和链格 (linked cell)法等分子间短程作用力的计算方法与模拟系统的粒子数、对比密度之间的关系进行了研究 .研究结果表明 ,各计算方法的效率与模拟系统的对比密度、粒子数量有密切关系 .在粒子数为 16 384时 ,若对比密度为 0 9,linked cell法的计算效率是截断半径法的 18倍 ,若对比密度为 0 1,两者的效率则相差 10 0倍 ;在粒子数超过 86 4以后 ,linked cell法具有明显的优势 .