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高通量DNA测序数据的生物信息学方法
被引量:
3
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作者
詹晓娟
姚登举
朱怀球
《大数据》
2016年第2期76-87,共12页
高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短,而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的挑战和机遇,总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具等研究成果。最后,展望了高通量测序下...
高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短,而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的挑战和机遇,总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具等研究成果。最后,展望了高通量测序下DNA短读序列数据研究的发展趋势。
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关键词
高通量DNA测序
生物信息学
短读序列数据压缩
短
读
序列
数据
拼接
短
读
序列
数据
分析
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职称材料
题名
高通量DNA测序数据的生物信息学方法
被引量:
3
1
作者
詹晓娟
姚登举
朱怀球
机构
黑龙江工程学院计算机科学与技术学院
哈尔滨理工大学软件学院
北京大学生物医学工程系
出处
《大数据》
2016年第2期76-87,共12页
基金
黑龙江省自然科学基金资助项目(No.F201313)
黑龙江省教育厅科学技术研究资助项目(No.12541124)
哈尔滨市科技创新(No.2013RFQXJ114)~~
文摘
高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短,而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的挑战和机遇,总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具等研究成果。最后,展望了高通量测序下DNA短读序列数据研究的发展趋势。
关键词
高通量DNA测序
生物信息学
短读序列数据压缩
短
读
序列
数据
拼接
短
读
序列
数据
分析
Keywords
high-throughput DNA sequencing
bioinformatics
short read sequence data compression
short read sequence data splicing
short read sequence data analysis
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量DNA测序数据的生物信息学方法
詹晓娟
姚登举
朱怀球
《大数据》
2016
3
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