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小分子硼酸肽的自组装
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作者 陈昌盛 李仕颖 +2 位作者 王俊 张先正 卓仁禧 《中国材料进展》 CAS CSCD 2012年第6期49-54,共6页
利用FMOC化学固相多肽合成法合成了3种含精氨酸的小分子硼酸肽(标记为BPs(1-3))。在生理pH下,含阳离子的硼酸肽可自组装形成有序超分子纳米组装体。二羟基酚染料茜素红与硼酸肽可特异性结合形成五元环硼酸酯,伴随荧光和颜色的显著变化,... 利用FMOC化学固相多肽合成法合成了3种含精氨酸的小分子硼酸肽(标记为BPs(1-3))。在生理pH下,含阳离子的硼酸肽可自组装形成有序超分子纳米组装体。二羟基酚染料茜素红与硼酸肽可特异性结合形成五元环硼酸酯,伴随荧光和颜色的显著变化,可进一步调控硼酸肽的自组装行为。通过扫描电镜研究茜素红调控前后硼酸肽的自组装形态,并用红外光谱和圆二色谱研究其自组装机理。结果表明,3种含精氨酸硼酸肽在生理pH下可自组装形成不同的超分子纳米组装体。通过茜素红的调控,茜素红/硼酸肽化合物,可自组装形成更有序,更精致的超分子聚集体。 展开更多
关键词 硼酸肽 自组装 超分子聚集体 纳米材料
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R基团搜索技术用于硼酸三肽蛋白酶体抑制剂的分子设计
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作者 仝建波 李园园 +1 位作者 江国艳 李康楠 《分析科学学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期795-802,共8页
本文采用Topomer CoMFA对44个Tyropeptin硼酸三肽类蛋白酶体抑制剂进行三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得最优模型的拟合、交互验证、及外部验证的复相关系数分别为0.983、0.651、0.963。采用Topomer search对ZINC数据库进行R基团的... 本文采用Topomer CoMFA对44个Tyropeptin硼酸三肽类蛋白酶体抑制剂进行三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得最优模型的拟合、交互验证、及外部验证的复相关系数分别为0.983、0.651、0.963。采用Topomer search对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,得到具有特定活性贡献的R基团,以活性最高的分子为模板过滤,得到7个R1和5个R2基团。并以此设计得到活性优于模板分子的20个新化合物。结果表明,所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力,基于R集团的Topomer search技术可以有效筛选,并为设计出新的蛋白酶体抑制剂提供理论依据。 展开更多
关键词 硼酸 三维定量构效关系 Topomer COMFA Topomer SEARCH 分子设计
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Tyropeptin硼酸肽类蛋白酶体抑制剂的分子对接、三维定量构效关系及分子设计研究 被引量:2
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作者 吕娟 梅虎 +3 位作者 谢江安 潘显超 张亚兰 王青 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期518-518,共1页
作为第二代共价类蛋白酶体抑制剂,硼酸肽类抑制剂由于代谢稳定且具较高的蛋白酶体抑制活性和选择特异性,已成为当前新型抗肿瘤药物的重点研究内容。本文以最近合成的44个Tyropeptin硼酸三肽类蛋白酶体抑制剂为研究对象,采用共价距离约... 作为第二代共价类蛋白酶体抑制剂,硼酸肽类抑制剂由于代谢稳定且具较高的蛋白酶体抑制活性和选择特异性,已成为当前新型抗肿瘤药物的重点研究内容。本文以最近合成的44个Tyropeptin硼酸三肽类蛋白酶体抑制剂为研究对象,采用共价距离约束对该类分子与蛋白酶体进行了分子对接研究。结果表明,该类抑制剂与蛋白酶体的非共价相互作用主要以氢键和疏水作用为主,具体表现为:(1)硼酸基团的羟基与ARG19、LYS33和GLY47的氢键作用;(2)肽链骨架原子与THR21、GLY47和ALA49的氢键作用;(3)R1基团与S1口袋的疏水作用和氢键作用。基于对接构象,对上述分子进行了骨架叠合及随后的比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性形状指数分析(CoMSIA)。最优模型为包含氢键供体场、疏水场、氢键受体场以及立体场的CoMSIA模型,其最佳主成分数、决定系数r2、标准差S、交互验证系数q2以及外部预测r2pred分别为3、0.882、0.188、0.494以及0.756。在以上研究基础上,以活性最高的3C和6号分子为模板,采用基于遗传算法的结构搜索方法结合分子相似性评价函数对其侧链进行了优化设计。结合Lipinski"5规则"和最优CoMSIA模型活性预测结果,最终得到5个目标分子,其预测活性均达到纳摩尔水平。 展开更多
关键词 蛋白酶体抑制剂 Tyropeptin 硼酸 分子对接 比较分子场分析 比较分子相似性形状指数分析 分子设计
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Polydopamine-mediated immobilization of phenylboronic acid on magnetic microspheres for selective enrichment of glycoproteins and glycopeptides 被引量:2
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作者 Jiangnan Zheng Zian Lin +1 位作者 Lan Zhang Huanghao Yang 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS CSCD 2015年第6期1056-1064,共9页
In this work, we demonstrate for the first time, a method to synthesize phenylboronic acid-Fe304@polydopamine (Fe3O4@ PDA-PBA) magnetic microspheres via the combination of mussel-inspired polydopamine coating and cl... In this work, we demonstrate for the first time, a method to synthesize phenylboronic acid-Fe304@polydopamine (Fe3O4@ PDA-PBA) magnetic microspheres via the combination of mussel-inspired polydopamine coating and click chemistry. Uniform-size and core-shell structured Fe3O4@PDA-PBA magnetic microspheres with a core diameter of -240 nm and a shell thickness of -13 nm were obtained as identified by the characterization of the morphology, structure and composition of the synthesized microspheres. We evaluated the selectivity and binding capacity of the Fe3O4@PDA-PBA magnetic microsphcres by using standard glycoproteins (ovalbumin, immunoglobulin G and catalase) and nonglycoproteins (human serum albumin, bovine hemoglobin, myoglobin, lysozyme, and ribonuclease A) as model proteins. Adsorption experiments, SDS-PAGE and mass spectrometry analysis demonstrated that the Fe3O4@PDA-PBA magnetic microspheres had much high binding capacity and selectivity for glycoproteins/glycopeptides compared to nonglycoproteins/nonglycopeptides. In addition, the practicability of the Fe3O4@PDA-PBA magnetic microspheres was further assessed by selective capture of glycoproteins from healthy hu- man serum. The good results demonstrated its potential in glycoproteome analysis. 展开更多
关键词 magnetic microspheres click chemistry phenylboronic acid ENRICHMENT GLYCOPROTEINS GLYCOPEPTIDES
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Boronic acid-rich dendrimer for efficient intracellular peptide delivery 被引量:3
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作者 Jia Lv Chongyi Liu +2 位作者 Kexin Lv Hui Wang Yiyun Cheng 《Science China Materials》 SCIE EI CSCD 2020年第4期620-628,共9页
Interests in intracellular peptide delivery have continued to grow,significantly fueled by the importance of peptides and their mimetics in modern cell biology and pharmaceutical industry.However,efficient intracellul... Interests in intracellular peptide delivery have continued to grow,significantly fueled by the importance of peptides and their mimetics in modern cell biology and pharmaceutical industry.However,efficient intracellular delivery of membrane-impermeable peptides of different polarities remains a challenging task.In this study,we develop a general and robust strategy for intracellular peptide delivery by using a boronic acid-rich dendrimer.The designed material is capable of transporting peptides with different polarities and charge properties into the cytosol of various cell lines without inducing additional cytotoxicity.The transduction efficacy and proteolytic stability of cargo peptides delivered by the boronic acid-rich dendrimer are much superior to peptides conjugated with cell penetrant peptides such as octaarginine.In addition,the bioactivities of pro-apoptotic peptides are maintained after intracellular delivery.This study provides a versatile and robust platform for the intracellular delivery of membrane-impermeable peptides. 展开更多
关键词 intracellular peptide delivery DENDRIMER boronic acid
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