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鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用 被引量:2
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作者 张鹏 杨官品 +2 位作者 张立楠 危起伟 邹桂伟 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2011年第2期43-50,29,共9页
基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测... 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。 展开更多
关键词 鲢(Hypophthalmichthys molitrix) 碱基插入缺失 限制性片段长度多态性 连锁图谱
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人类线粒体DNA中碱基缺失/插入的真伪能否从世系的系统发育关系来推断? 被引量:3
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作者 姚永刚 孔庆鹏 +1 位作者 孙昌 张亚平 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第4期348-352,共5页
从线粒体DNA世系的系统发育关系角度来说,稀少的点突变在多个不同世系(或者说单倍型类群)中出现,就很有可能是错误的,这条对mtDNA序列中观察到的稀少的点突变进行检验的经验是否对序列中出现的碱基缺失/插入也适用,目前未见报道,本研究... 从线粒体DNA世系的系统发育关系角度来说,稀少的点突变在多个不同世系(或者说单倍型类群)中出现,就很有可能是错误的,这条对mtDNA序列中观察到的稀少的点突变进行检验的经验是否对序列中出现的碱基缺失/插入也适用,目前未见报道,本研究中统计了国内50个不同人群2352个个体mtDNA序列中出现的一些稀少的碱基插入/缺失事件,结果显示,除去单倍型类群特征性或相关性的碱基缺失/插入外,mtDNA序列中的碱基插入/缺失事件,特别是发生的位置上含有该突变碱基(碱基对)重复的时候,基本上不能通过世系系统发育关系来判别其准确性,对于研究中偶尔观察到的个别稀少的碱基插入/缺失事件,建议进行独立多次的序列测定予以核实。 展开更多
关键词 人类线粒体DNA 碱基缺失/插入事件 系统发育 序列测定 点突变
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乙型变异病毒所致的血清阴性的急性乙型肝炎和重症肝炎
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作者 沈志平 《传染病信息》 1994年第3期116-117,共2页
目前肝炎病毒分为甲、乙、丙、丁、戊五型,自从其血清诊断法确立以来。
关键词 急性乙型肝炎 变异病毒 诊断法 病毒变异株 急性肝炎 氨基酸置换 重症肝炎患者 碱基插入 光谱带 遗传基因
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日本痣样基底细胞瘤综合征患者PTCH基因的胚系突变
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作者 Tanioka M. TakahashiK. +2 位作者 Kawabata T. C. Nishigori 田中伟 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2005年第5期8-8,共1页
We identified seven novel germline mutations of the PTCH gene in eight unrelat ed Japanese patients with nevoid basal cell carcinoma syndrome (NBCCS). In order to ensure genetic diagnosis, all 23 coding exons of the P... We identified seven novel germline mutations of the PTCH gene in eight unrelat ed Japanese patients with nevoid basal cell carcinoma syndrome (NBCCS). In order to ensure genetic diagnosis, all 23 coding exons of the PTCH gene were amplifie d from genomic DNA by polymerase chain reaction (PCR) and sequenced. Mutations w ere found in all eight patients with NBCCS. The mutations detected in this study include one insertion/deletion mutation, one 1-bp insertion, two 1-bp deletio ns, one nonsense mutation and two missense mutations. None of the mutations have been previously reported. Five mutations caused premature stop codons that are predicted to result in a truncated protein. In the two missense mutations, the s trong basic residue arginine was substituted by serine or glycine in highly cons erved components of the putative transmembrane domain of PTCH, and these mutatio ns may therefore affect the conformation and function of the PTCH protein. No ph enotype-genotyperelationshipswerefoundintheJapanese NBCCS patients, consistent with results of previous studies on NBCCS in African-American and Caucasian pat ients. 展开更多
关键词 PTCH基因 基底细胞 胚系突变 碱基缺失 缺失突变 编码外显子 遗传学诊断 碱基插入 高加索人 跨膜结构域
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常染色体显性遗传性桥粒芯糖蛋白1基因突变引起的局限性掌跖角化病
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作者 Milingou M. Wood P. +3 位作者 Masouyé I. L. Borradori 罗素菊 徐波 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2006年第4期45-45,共1页
Background: Palmoplantar keratodermas (PPK) encompass a large genetically heterogeneous group of diseases associated with hyperkeratosis of the soles andor palms that occur either isolated or in association with other... Background: Palmoplantar keratodermas (PPK) encompass a large genetically heterogeneous group of diseases associated with hyperkeratosis of the soles andor palms that occur either isolated or in association with other cutaneous and extracutaneous manifestations. Pathogenic mutations in the desmoglein 1 gene (DSG1) have recently been identified in a subset of patients with the striate type of PPK. Observation: We have identified a patient with a focal non- striated form of PPK associated with discrete troubles of keratinisation at sites exposed to mechanical trauma, such as the knees, ankles or finger knuckles, and with mild nail dystrophy. Genetic analyses disclosed a novel dominantly inherited heterozygous single base insertion in exon 3 of DSG1, 121insT, leading to a premature termination codon. The mutation was also present in the father and in a sister. Conclusion: Our observation extends the spectrum of clinical features associated with genetic defects in DSG1 and provides further evidence that perturbation of desmoglein 1 expression has a critical impact on the integrity of tissues experiencing strong mechanical stress. 展开更多
关键词 桥粒芯糖蛋白 基因突变 掌跖角化病 过度角化 条纹状 甲营养不良 碱基插入 外伤部位 基因分析 基因
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天然DNA用于功能材料的研究进展 被引量:3
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作者 王彩飞 安毅 刘向东 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1008-1013,共6页
天然DNA由于其资源丰富、可生物合成再生、特有的双螺旋分子结构等特点而倍受材料研究者关注。近年来,天然DNA已经广泛应用于环境净化、电子、光学和生物医用材料等领域。本文主要从DNA的聚阴离子性、对小分子的选择吸附性和生物相容性... 天然DNA由于其资源丰富、可生物合成再生、特有的双螺旋分子结构等特点而倍受材料研究者关注。近年来,天然DNA已经广泛应用于环境净化、电子、光学和生物医用材料等领域。本文主要从DNA的聚阴离子性、对小分子的选择吸附性和生物相容性这3个基本特性出发,归纳和描述近年天然DNA在作为功能材料方面的应用研究。 展开更多
关键词 天然DNA 金属纳米线 碱基对空隙插入 沟槽选择性吸附 生物相容性
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不同商品化试剂盒STR分型异常的2例分析 被引量:3
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作者 傅燕芳 吴微微 +1 位作者 郝宏蕾 苏艳佳 《中国法医学杂志》 CSCD 2017年第3期326-327,共2页
近年来,随着STR技术在法庭科学的广泛应用,各家公司均纷纷推出各种STR荧光标记复合扩增试剂盒,在使用不同试剂盒过程中出现分型差异的现象也越来越引起法庭工作者的重视。本文对日常检案中采用不同的试剂盒遇到的STR基因座分型差异的样... 近年来,随着STR技术在法庭科学的广泛应用,各家公司均纷纷推出各种STR荧光标记复合扩增试剂盒,在使用不同试剂盒过程中出现分型差异的现象也越来越引起法庭工作者的重视。本文对日常检案中采用不同的试剂盒遇到的STR基因座分型差异的样本,进行克隆测序,对基因座分型差异的成因进行分析探究,现报告如下。 展开更多
关键词 法医物证学 短串联重复序列(STR) 分型差异 碱基插入 碱基缺失
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