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大肠杆菌编码区碱基片段的分析研究 被引量:5
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作者 李宏 罗辽复 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期167-173,共7页
对大肠杆菌1231个编码开始区域和1307个编码终止区域内的6碱基片段、4碱基片段和3碱基片段进行了统计。发现绝大多数4碱基和3碱基模式出现在相对频率小于2的范围之内 ;在这两个区域中 ,出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码... 对大肠杆菌1231个编码开始区域和1307个编码终止区域内的6碱基片段、4碱基片段和3碱基片段进行了统计。发现绝大多数4碱基和3碱基模式出现在相对频率小于2的范围之内 ;在这两个区域中 ,出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;以TAG或CTA构造的3碱基模式为编码开始区和编码终止区的禁用模式。 展开更多
关键词 大肠杆菌 基因编码区 碱基片段 相对频率
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大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析 被引量:4
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作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第2期153-160,共8页
对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之... 对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之内 ;编码区出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;密码子之间 ,以TAG或CTA构造的关联模式为编码区禁用模式 .另外 ,还发现编码开始区域或编码终止区域碱基片段的相对频率与基因表达水平有明显关系 ,多数高频出现的碱基片段其相对频率随基因表达水平的提高而增加 . 展开更多
关键词 碱基片段 大肠杆菌 基因编码区 统计分析
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大肠杆菌SD序列碱基片段的统计分析 被引量:3
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作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1998年第5期655-659,共5页
统计了大肠杆菌基因中构成SD区域的碱基片段,给出了SD区域中相对使用频率高的和低的2碱基、3碱基、4碱基和6碱基片断.我们发现,构成SD序列的碱基片段有很强的偏好性;另外我们还研究了这几类碱基片段与基因表达水平的关系... 统计了大肠杆菌基因中构成SD区域的碱基片段,给出了SD区域中相对使用频率高的和低的2碱基、3碱基、4碱基和6碱基片断.我们发现,构成SD序列的碱基片段有很强的偏好性;另外我们还研究了这几类碱基片段与基因表达水平的关系,发现碱基片段出现的相对频率有些与基因表达水平成正比,有些与基因表达水平成反比,还有一些与基因表达水平无关。 展开更多
关键词 SD区域 碱基片段 基因表达水平 大肠杆菌
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人类转录假基因序列碱基片段的分析研究
4
作者 齐磊 刘国庆 《集宁师范学院学报》 2012年第4期105-110,共6页
对人类201条转录假基因的2碱基片段、3碱基片段、4碱基片段、5碱基片段和6碱基片段进行了统计。发现所统计的碱基片段在相对频率小于2范围内的模式占总模式数的89%以上;长度较长的碱基片段(5碱基片段、6碱基片段)同三核苷酸碱基片段之... 对人类201条转录假基因的2碱基片段、3碱基片段、4碱基片段、5碱基片段和6碱基片段进行了统计。发现所统计的碱基片段在相对频率小于2范围内的模式占总模式数的89%以上;长度较长的碱基片段(5碱基片段、6碱基片段)同三核苷酸碱基片段之间包含和被包含关系较明显;人类转录假基因序列里出现最多的碱基片段大多是由AG核组成的,稀有模式主要是以CG核组成的3碱基片段,这可能是因为转录假基因序列与其同源编码基因mRNA竞争去稳定蛋白所引起的;在人类转录假基因序列中每平均约26个碱基就有一个终止密码子模式(TAG、TAA和TGA),终止密码子的频繁出现可能是原功能基因编码区的一种容错机制。另外,进行了相对频率的统计分析,发现对于2碱基片段、3碱基片段、4碱基片段、5碱基片段和6碱基片段的研究是具有其统计意义的。 展开更多
关键词 转录假基因 碱基片段 相对频率
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变性梯度凝胶电泳中PCR实验条件的探讨 被引量:5
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作者 王玉明 段勇 +3 位作者 赵淮 宋滇平 刘华 张秋霞 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期159-159,共1页
变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)能可靠快速地检测含有一个碱基突变、达536bp的DNA片段。当结合PCR技术后,在一个引物的5′端加入30~50b... 变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)能可靠快速地检测含有一个碱基突变、达536bp的DNA片段。当结合PCR技术后,在一个引物的5′端加入30~50bp的GC片段(GC-clamp),... 展开更多
关键词 聚合酶链反应 变性梯度 凝胶电泳 碱基片段
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Cloning and Sequencing of Two Acetylcholinesterase cDNA Fragments from Cotton Aphid,Aphis gossypii Glover 被引量:1
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作者 李飞 韩召军 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期444-448,共5页
Two acetylcholinesterase (AChE) genes cDNA fragments,Ag.acel and Ag.ace2,have been cloned from cotton aphid,Aphis gossypii Glover using degenerate primers with RT-PCR technique.Ag.acel gene cDNA fragment is of 282?bp ... Two acetylcholinesterase (AChE) genes cDNA fragments,Ag.acel and Ag.ace2,have been cloned from cotton aphid,Aphis gossypii Glover using degenerate primers with RT-PCR technique.Ag.acel gene cDNA fragment is of 282?bp encoding 94 amino acids,and Ag.ace2 gene cDNA fragment is of 264?bp encoding 88 amino acids.Both two putative AChE genes cDNA fragments share numerous similarities with those cloned from other insects.This is the first report of two AChE cDNA fragment sequences in the insect species,which provided the direct evidence of multiple AChE existence in insects. 展开更多
关键词 Aphis gossypii Glover ACETYLCHOLINESTERASE Gene clone cDNA fragment
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基因免疫法在制备凝血酶调节蛋白抗体中的应用研究
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作者 钱高潮 王红 +2 位作者 郑佐娅 李稻 王鸿利 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期412-416,共5页
目的探讨应用基因免疫法制备凝血酶调节蛋白(throbomodulin,TM)抗体。方法运用基因免疫法,即PCR特异性扩增TM胞外编码区所有碱基片段(包括信号肽,TMLEO),构建pcDNA3.1/TMLEO真核表达质粒。以碱裂解法提取,PEG沉淀法纯化质粒。将纯化后... 目的探讨应用基因免疫法制备凝血酶调节蛋白(throbomodulin,TM)抗体。方法运用基因免疫法,即PCR特异性扩增TM胞外编码区所有碱基片段(包括信号肽,TMLEO),构建pcDNA3.1/TMLEO真核表达质粒。以碱裂解法提取,PEG沉淀法纯化质粒。将纯化后的质粒pcDNA3.1/TMLEO经生理盐水稀释后直接肌肉注射免疫BALB/c小鼠,检测质粒pcDNA3.1/TMLEO在小鼠体内有无表达以及TM抗体的效价和特异性。结果通过RTPCR以及TM含量测定在RNA以及蛋白水平上均说明质粒pcDNA3.1/TMLEO在小鼠体内有表达。以EVC304包板的cellELISA检测抗体滴度,随着免疫次数的增加,小鼠血清抗体滴度明显增加,到第五次达到最高1∶8000,第6~7次均保持在这一水平。小鼠抗血清通过免疫印迹(Westernblot)和免疫组织化学鉴定,特异性好。结论在天然TM提取纯化困难的情况下,通过基因免疫制备抗体是可行的。 展开更多
关键词 免疫法 PCDNA3.1 蛋白抗体 BALB/c小鼠 凝血酶调节蛋白 ELISA检测 真核表达质粒 PEG沉淀法 RT-PCR 血清抗体滴度 基因免疫制备 特异性 碱基片段 裂解法 注射免疫 生理盐水 蛋白水平 含量测定 免疫印迹 化学鉴定 免疫组织
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