以碱性聚合酶2(PB2)为靶点的抗流感病毒药物的虚拟筛选

目的:基于流感病毒的碱性聚合酶2 (PB2)亚基筛选新的抗流感病毒先导化合物.方法:基于SPECS数据库,通过文献限制条件初筛出了282717个化合物,再利用分子对接软件SYBYL,与PB2的活性位点进行对接,筛选出了对21个PB2有潜在抑制活性的中靶化合物.结果:所选中靶化合物能以氢键、π-π相互作用等方式与PB2靶点稳固螯合,有潜在的抗流感病毒活性.结论:中靶化合物可作为先导化合物用于新型抗流感病毒药物开发.

流感病毒RNA碱性聚合酶-2抑制剂研究进展

季节流行性感冒是一种易在人际传播的急性病毒感染,是目前对人类健康构成威胁的主要呼吸道传染病之一。迄今为止,流感的预防和治疗主要采用接种疫苗预防和开发抗病毒药物防治并重的应对手段。目前临床应用的抗流感病毒药物包括基质蛋白-2抑制剂(如金刚烷胺)、神经氨酸酶抑制剂(如奥司他韦)、内切酶抑制剂(如巴洛沙韦酯)和聚合酶抑制剂(如法匹拉韦)等,均已产生广泛耐药性。研究开发机制新颖的、与现有药物没有交叉耐药的抗流感病毒药物是解决季节流行性感冒治疗这一尚未完全解决的医学问题,以及应对流感大规模爆发的有效手段。流感病毒RNA碱性聚合酶-2(PB2),由于其在不同流感病毒间的高度保守性而不易产生耐药性,使其成为一个非常有吸引力的药物靶点。目前PB2抑制剂的研究开发已成为抗流感病毒药物的一个热点,特别是围绕明星分子吡莫地韦及其类似物的研究吸引了极大的关注,虽然吡莫地韦因疗效不理想最终止步于Ⅲ期临床试验,但是在其研究过程中所揭示出的PB2蛋白与小分子结合模式及构效关系,为进一步开发该类药物奠定了扎实的基础。本文主要针对PB2抑制剂近10年相关药物化学的研究进展进行综述,并对该药物研究领域的前景提出展望。

广东省H1N1pdm亚型流感病毒聚合酶碱性蛋白2变异株基因分析

目的了解广东省甲型H1N1pdm流感病毒聚合酶碱性蛋白2(polymerase basic protein 2,PB2)基因变异株的分子特征,探讨其特异性分子位点,为流感病毒防控提供科学依据。方法采集感染PB2基因变异株的2例病例咽拭子标本进行病毒分离,并挑选23株广东省流感病毒株进行测序分析,利用GISAID提供的参考序列和疫苗株序列对血凝素(hemagglutinin,HA)和PB2基因进行进化分析;开展毒株抗原分析和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)抑制试验;构建PB2蛋白模型,分析聚合酶活性。结果PB2-D701N和PB2-A271S变异株HA基因出现H399N氨基酸位点突变,均属于6B.1A.5a.2a分支;与疫苗株A/Victoria/4897/2022同属大分支不同小分支,均为疫苗类似株。在三维结构中,PB2-D701N和PB2-A271S突变发生电荷改变和亲疏水变化。结论PB2-D701和A271高度保守,PB2突变株尚未成为优势株,但其抗原性与疫苗匹配性高,对NA抑制剂敏感。三维模型推测,PB2-D701N突变可增强病毒的致病力而影响传播能力,PB2-A271S则可能影响流感病毒的聚合酶活性和聚合酶复合物的合成。