外科ICU与内科ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌耐药性、碳青霉烯酶基因检测及流行病学研究

目的分析外科ICU和内科ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性、常见的碳青霉烯酶基因及菌株之间的亲缘性关系。方法收集2019年1月至2020年12月从某三甲医院外科ICU和内科ICU分离鉴定的CRKP非重复菌株,采用自动仪器法对菌株进行药物敏感性试验;采用mCIM联合eCIM试验进行碳青霉烯酶表型检测,并通过PCR技术联合DNA测序检测碳青霉烯酶基因;利用多位点序列分型(MLST)方法对碳青霉烯酶阳性菌株进行同源性分析。结果共收集15株CRKP菌株,其中外科ICU 8株,内科ICU 7株。CRKP菌株对临床多数抗菌药物表现高耐药性,仅对替加环素表现较高敏感性。mCIM联合eCIM试验并经PCR验证,共有14株CRKP携带碳青霉烯酶基因,其中7株单纯携带KPC⁃2基因,主要来源于内科ICU;5株单纯携带NDM⁃5基因,来源于外科ICU;1株携带KPC⁃2基因合并少见金属酶基因来源于内科ICU;1株携带NDM⁃1基因合并OXA⁃181基因来源于外科ICU。MLST结果显示,医院ICU分离的CRKP菌株为ST11、ST15、ST163个序列型别。内科ICU优势序列为ST11(6/6),全部携带KPC⁃2基因;外科ICU优势序列为ST15(5/8),主要携带NDM⁃5基因。结论医院外科ICU和内科ICU分离的CRKP菌株耐药性高,其携带的耐药基因和优势流行菌株存在差异。应加强多重耐药菌的监测及流行病学研究,及时采取有效治疗方案和防控策略,防止耐药菌株产生和流行播散。

广州某三甲医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药及毒力基因分析

目的统计院内耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)检出率,分析CRKP的主要耐药基因及毒力基因,了解其感染菌株分子流行病学机制。方法回顾性分析2020-2023年广东省第二中医院(下称该院)CRKP检出率,并收集该院2022年7-12月共计84株CRKP,统计菌株临床资料,PCR扩增相应耐药基因及毒力基因,改良碳青霉烯灭活(mCIM)试验检测碳青霉烯酶。结果2020-2023年该院年CRKP检出率较高,均>46.00%;收集2022年7-12月临床分离84例非重复CRKP菌株,呼吸道来源样本最多,占55.95%,患者以针灸康复科为主,占34.52%;药敏试验显示对多种头孢类及超广谱β内酰胺类药物高度耐药,仅对替加环素及多黏菌素E呈现较高敏感性;mCIM试验阳性率为84.52%(71/84),其余15.48%结果为中性,未能判断是否产碳青霉烯酶。73株检出携带碳青霉烯酶基因,占86.90%,共涉及4种基因型,blaKPC、blaNDM、blaIMP、blaOXA-48的检出率分别为83.33%、2.38%、1.19%、1.19%;其中1株同时携带blaKPC及blaNDM基因,同时检出多种β内酰胺酶,blaSHV、blaTEM、blaCTX-M-9、blaCTX-M-1的检出率分别为96.43%、78.57%、64.29%、2.38%,5种毒力基因blaiucA、blarmpA2、blairoB、blapeg-334、blarmpA检出率分别为42.86%、41.67%、27.38%、3.57%、2.38%;同时携带3种及以上毒力基因的菌株占比为17.85%(15/84)。结论该院CRKP检出率较高,耐药情况严峻,耐药基因以肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)为主;出现较高比例的耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)菌株,感染防控情况不容乐观。应进一步加强院内感控措施,科学合理规范用药。

36株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的耐药表型和基因型特征分析

目的分析广西百色市某三级甲等医院2020—2022年分离自临床的36株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性及耐药机制,为医院感染防控和指导临床治疗提供依据。方法使用微量肉汤稀释法及纸片扩散法检测分离的36株CRKP对临床常用抗生素及头孢他啶/阿维巴坦的耐药性,同时使用聚合酶链式反应检测常见耐药基因携带情况,并使用碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测菌株携带的碳青霉烯酶种类。结果36株CRKP对除头孢他啶/阿维巴坦之外的所有β内酰胺类药物和氟喹诺酮类药物耐药率均超过90%,对头孢他啶/阿维巴坦耐药率为33.3%,对阿米卡星的耐药率为63.9%,对磺胺类药物复方新诺明耐药率为61.1%。bla KPC携带率为63.89%,bla NDM携带率为19.44%,bla TEM携带率为75.00%,bla CTX-m携带率为16.67%,bla SHV携带率为91.67%,bla Ampc携带率为5.56%,未检出携带bla OXA-48的菌株。表型检测显示有34株菌产碳青霉烯酶,其中23株单产A类酶,10株单产B类酶,1株同时产A类酶和B类酶。结论通过对常见CRKP耐药性及基因表型进行调查可以为临床抗生素的合理应用和感染的防控提供科学依据。

多重耐药肺炎克雷伯菌中碳青霉烯酶的检测和分析

探究多重耐药肺炎克雷伯菌中碳青霉烯酶的检测和分析。方法 在2021年1月至2023年11月期间,本研究对黄河中心医院采集的78株肺炎克雷伯菌(一种多重耐药菌)进行深入研究。为了探究这些菌株中是否存在碳青霉烯酶基因,进行碳青霉烯酶表型试验。随后,为了进一步验证这些基因的存在,利用聚合酶链反应对它们进行检测,并对扩增产物进行DNA测序,确保能够准确地确定它们的基因型。经分析发现这78株肺炎克雷伯菌中,有48株被明确鉴定为超广谱β内酰胺酶(ESBL)阳性菌,而另外30株则为ESBL阴性菌。这一研究结果对肺炎克雷伯菌的耐药机制提供了更为精确的认识,对于指导临床用药和防控耐药菌的传播具有重要意义。结果 经过严格的检测,发现所检测的菌株中,产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的阳性率高达61.54%。药敏分析结果显示,产ESBL菌株对第一,二代头孢菌素及青霉素类抗菌药物具有较高的耐药性。特别是针对单环类氨曲南,耐药率达到惊人的100.00%。值得注意的是,除了亚胺培南、厄他培南、美罗培南及左氧氟沙星外,产ESBL菌株相较于非产ESBL菌株具有更高的耐药性。在78株肺炎克雷伯菌中,Hodg试验阳性菌共有10株,占比12.82%;阴性菌68株,占比87.18%。在10株Hodg试验阳性菌中,仅有1株金属酶试验呈阳性。通过PCR扩增技术,成功确认10株阳性菌中的4株,其中3株为KPC型,阳性率为3.85%,另1株为IMP型,阳性率为1.28%。进一步的PCR产物测序分析显示,3株产KPC型菌株均携带KPC-2基因亚型,而产IMP型菌株携带的基因亚型为MP4。这些数据为研究和应对肺炎克雷伯菌的抗药性提供宝贵的线索和依据。结论 碳青霉烯酶在克雷伯菌中的检出率较高,尤其以KPC-2为最高,因此,在临床用药时应给予足够的关注,合理应用碳青霉烯,尽量减少耐药株,提高治疗效果,具有一定的意义。

广西地区耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的流行特征、耐消毒剂基因检测及同源性分析

目的了解耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)临床分离菌株的流行特征,检测、分析耐消毒剂基因携带情况及菌株同源性。方法回顾性分析该院2020—2022年临床分离得到的252株CRPA的临床分布特点、耐药趋势。并随机选取其中30株菌株,采用聚合酶链反应检测耐消毒剂基因qacEΔ1-sul1及aceⅠ的表达情况;采用肠杆菌科基因间重复序列-聚合酶链反应检测菌株同源性。结果CRPA的标本来源主要为痰液(63.49%)、肺泡灌洗液(17.06%);来自综合重症监护病房(ICU)和其他ICU占比为40.87%,来自非ICU的占比为59.13%,非ICU病区主要分布在康复医学科(14.68%)和呼吸科(12.70%)。除头孢吡肟、头孢他啶/阿维巴坦、阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素、多黏菌素外,CRPA对其他临床常用抗菌药物的耐药率均在30.00%以上。CRPA在ICU及非ICU病区的耐药率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。30株临床分离的CRPA qacEΔ1-sul1和aceⅠ基因检出率分别为16.67%、26.67%。同源性分析结果显示A型和B型为主要流行株。结论CRPA对常用抗菌药物普遍耐药,应加强对CRPA菌株的耐药性监测,根据药敏试验结果合理选择抗菌药物,减少耐药株的产生。CRPA中qacEΔ1-sul1和aceⅠ两种耐消毒剂基因均有检出,但检出率均较低,实际工作中应加强对各病区的消毒效果监测。CRPA中存在A、B两种优势型别的克隆流行,应作为铜绿假单胞菌院内感染防控的重点。

某医院2020-2021年CRE耐药性及碳青霉烯酶基因分析

目的分析该院近2年住院患者耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的临床特征、耐药性及碳青霉烯酶基因型特点,为临床有效抗感染治疗及院感防控提供依据。方法回顾性分析兰州大学第一医院2020年1月—2021年12月临床分离CRE327株。采用全自动时间飞行质谱检测系统(VITEK MS)及全自动细菌鉴定药敏分析仪(VITEK 2 Compact)进行菌株鉴定及药敏试验,药敏结果依据CLSI M100-S31判读;PCR方法检测bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(VIM)和bla_(OXA-48)5种碳青霉烯酶耐药基因。结果2020年1月—2021年12月我院临床标本中分离出327株CRE,主要为肺炎克雷伯菌70.64%(231/327),其次为阴沟肠杆菌17.13%(56/327)和大肠埃希菌6.73%(22/327);标本来源为痰50.76%(166/327)、血液13.15%(43/327)、分泌物10.09%(33/327)及尿液8.26%(27/327)等;科室分布主要是重症监护室41.9%(137/327)、儿科23.24%(76/327)及普外科14.37%(47/327)等。327株CRE对阿米卡星、庆大霉素、四环素、复方磺胺甲恶唑、左氧氟沙星和氨曲南耐药率分别是46.2%、61.80%、71.90%、74.60%、79.00%和81.4%。327株CRE中有317株(96.94%)检测到本研究关注的碳青霉烯酶耐药基因,其中168株菌携带bla_(KPC-2)基因(肺炎克雷伯菌124株、阴沟肠杆菌27株、大肠埃希菌10株、产酸克雷伯菌4株、弗劳地柠檬酸杆菌3株);107株携带bla_(NDM-1)基因(肺炎克雷伯菌75株、阴沟肠杆菌14株、大肠埃希菌11株、产酸克雷伯菌7株);42株携带bla_(NDM-5)基因(肺炎克雷伯菌25株、阴沟肠杆菌15株、弗劳地柠檬酸杆菌1株、奇异变形杆菌1株);7株菌携带bla_(IMP-4)基因(肺炎克雷伯菌3株,同时携带bla_(NDM-1)基因,阴沟肠杆菌4株,同时携带bla_(NDM-5)基因)。未检出bla_(OXA-48)和bla_(VIM)基因。结论该院近两年对临床常用抗菌药物耐药形势严峻,CRE菌株以携带bla_(KPC-2)和bla_(NDM-1)基因为主,应加强碳青霉烯类抗菌药物控制和使用,预防CRE菌株感染和传播。

黄芩消除产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌耐药质粒的研究

目的研究中药黄芩对产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(Carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae,CRKP)的抑菌及质粒消除作用。方法用肉汤稀释法测得黄芩、亚胺培南对CRKP的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC);用质粒消除试验测定黄芩对CRKP的质粒消除率;用质谱检测系统对质粒消除菌株的菌种进行鉴定,用K-B纸片琼脂扩散法(Kirby-Bauerdiscagar diffusion method,K-B法)确认消除子对亚胺培南、美罗培南的敏感性,用碳青霉烯灭活试验/乙二胺四乙酸碳青霉烯灭活试验(mCIM/eCIM)确认消除子是否产碳青霉烯酶,用聚酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测消除子是否携带blaKPC基因。结果黄芩对CRKP的MIC值为6.25mg/mL,在24、48、72h的质粒消除率分别为0%、0.3%、1%;消除子经全自动微生物质谱检测系统鉴定为肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN),对亚胺培南、美罗培南敏感,mCIM/eCIM实验阴性,PCR未检测到blaKPC基因。结论黄芩对CRKP有一定的抑菌作用及质粒消除作用。

宏基因组二代测序在耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌医院感染暴发中的应用

目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)医院感染暴发事件调查中的应用。方法 应用mNGS及传统病原学培养方法对某院重症监护病房(ICU)2023年6月8—22日5例检出CRAB患者进行病原学检测,对可能污染的环境进行微生物采样及细菌培养、鉴定和药物敏感试验,同时采取综合控制措施并评价其效果。结果 mNGS结果回报所需时间短于培养所需时间[(3.92±1.05)d VS (6.24±0.25)d,P<0.001]。5例患者的标本培养分离出CRAB,mNGS检测结果显示均检出OXA-23耐药基因,经专家综合判断4例患者为医院感染,1例患者为标本污染。依据《医院感染暴发控制指南》中的医院感染暴发定义,此事件考虑为医院感染暴发。环境卫生学监测结果显示,暴发时环境中CRAB检出率为51.30%(59/115),主要集中在医务人员手与呼吸机表面,实施多学科联合感染控制措施后,医生手卫生依从率及呼吸机消毒落实率分别由40.83%(49/120)、33.33%(16/48)提高至82.61%(95/115)、83.33%(30/36)。患者预后良好,后续监测未发现新病例,此医院感染暴发事件得到有效控制。结论 mNGS具有精准度高、耗时短、准确率高的特点,可以应用于医院感染暴发防控及耐药基因组研究,对多重耐药菌感染患者的抗感染治疗及医院感染防控措施的制定具有重要意义。持续提高消毒效果及手卫生依从率是防控CRAB感染的重要手段。

耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌毒力基因的表达与耐药性研究

目的探讨临床检测的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌中Ⅲ型分泌系统(T3SS)4种毒力基因(exoT、exoY、exoS、exoU)的表达情况及其对抗菌药物的耐药性。方法收集安徽医科大学附属安庆第一人民医院2022-2023年临床检测的各种来源的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌87株,采用Vitek2-Compact仪器对菌株进行鉴定,并且进行药敏试验,采用聚合酶链反应对T3SS的4种毒力基因(exoT、exoY、exoS、exoU)进行检测,比较不同毒力基因型组合与抗菌药物耐药性之间的关系。结果87株耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌表达exoT与exoY基因的阳性率均为100.00%(87/87),exoS基因阳性率为77.01%(67/87),exoU基因阳性率为27.59%(24/87)。共检出4种类型的T3SS毒力基因型组合,以exoT+/exoY+/exoS+/exoU-基因型组合为主,阳性率为71.26%(62/87),其次是exoT+/exoY+/exoS-/exoU+基因型组合,阳性率为21.84%(19/87)。药敏试验结果显示,exoT+/exoY+/exoS-/exoU+基因型组合对大部分常见抗菌药物,如阿米卡星、妥布霉素、头孢吡肟、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、环丙沙星、哌拉西林的耐药率均明显高于exoT+/exoY+/exoS+/exoU-基因型组合,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论该院检出的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌携带表达的T3SS毒力基因主要以exoT+/exoY+/exoS+/exoU-基因型组合为主,不同毒力基因型组合的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌对常见抗菌药物的耐药性存在差异。

2021-2023年某院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性和产酶表型分析

目的:分析某三甲医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的临床分布、耐药特点和碳青霉烯酶表型,为制定有效的CRKP控制策略提供参考。方法:回顾性分析2021—2023年某三甲医院住院患者标本中分离的非重复CRKP菌株的分布、常用抗菌药物的耐药性变迁和产酶表型。结果:2021—2023年共检出183株CRKP,主要来源于痰液(65.0%)、尿液(11.5%)和血液(10.4%)。科室分布以ICU(33.3%)为主,其次是呼吸科(24.0%)和神经外科(15.3%)。其中,神经外科构成比呈逐年下降趋势(P<0.05),而康复科构成比则呈逐年上升趋势(P<0.05)。药敏检测结果显示CRKP对β-内酰胺类、氟喹诺酮类和氨基糖苷类药物高度耐药,对替加环素、多黏菌素B和头孢他啶/阿维巴坦较敏感;对左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率均呈上升趋势(P<0.05)。大多数CRKP产生碳青霉烯酶,以丝氨酸酶为主,其中产D类丝氨酸酶的(OXA-48)菌株呈逐年下降趋势(P<0.05)。结论:该院临床分离的CRKP菌株主要分布在ICU病房,以肺部感染最为常见。这些菌株对多数常用抗菌药物表现出较高的耐药性,主要与产丝氨酸酶有关。医院需加强重点科室的监控,优化抗菌药物的使用策略,实施精准的防控措施,以有效遏制CRKP的传播。

肠杆菌目细菌碳青霉烯酶检测的研究进展

近年来,细菌耐药已经成为公共卫生的一项重大挑战,其中碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)对抗生素的耐药形势尤为严峻。CRE的主要耐药机制是碳青霉烯酶的产生,不同菌株携带的耐药基因不同,产生的碳青霉烯酶也不同,因此,碳青霉烯酶和耐药基因的早期检测对于控制耐药菌的传播起到重要作用。目前对于碳青霉烯酶的表型检测方法有改良Hodge实验、改良碳青霉烯灭活试验、Carba NP试验、免疫学技术、质谱技术,对于耐药基因型的检测方法有实时荧光定量PCR技术、微阵列技术、等温扩增技术、测序技术,这些方法在碳青霉烯酶的检测中均具有广泛应用。了解各检测技术的优缺点对于在实际应用中选择最适检测方法是非常重要的。本文主要对CRE碳青霉烯酶检测方法的研究进展和各方法的优缺点进行综述,为CRE的检测、预防以及院内感染控制提供数据支持。

耐碳青霉烯类肠杆菌血流感染患者耐药基因分析

目的 调查耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌血流感染(CRE-BSI)的临床科室分布及耐药情况,分析其耐药基因型、毒力因子,以指导临床诊疗中抗菌药物的合理使用,预防耐药菌株的传播。方法 收集2021—2022年济宁市第一人民医院分离的21株临床CRE-BSI菌株,分析菌株的药敏结果;检测菌株的碳青霉烯酶基因(KPC、OXA-48、VIM、IMP、NDM);提取菌株DNA,并进行多位点序列分型(MLST)。结果 21株CRE-BSI菌株中,12株源于重症医学科,除对替加环素、多黏菌素/黏菌素、阿米卡星、米诺环素敏感性较好,部分菌株抗菌药物耐药率为100.00%。21株菌株中,肺炎克雷伯菌10株,大肠埃希菌10株,均以bla_(NDM)为主要产酶基因型;MLST结果显示,肺炎克雷伯菌主要流行ST11,大肠埃希菌主要流行ST361、ST410。毒力因子均有不同数量的检出,其中iroN、fimH检出率最高,分别为100.00%(20/20)、85.00%(17/20)。结论 济宁市第一人民医院分离的临床CRE-BSI菌株肺炎克雷伯菌中bla_(KPC-2)为主要产酶基因,大肠埃希菌中bla_(NDM-5)为主要产酶基因型,可能存在克隆流行和水平传播,临床需加强抗菌药物应用的监管,预防CRE院内爆发。

耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌5种耐药基因检测

目的研究耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的流行与耐药机制,为医院治疗和预防鲍曼不动杆菌提供依据。方法本研究共收集海南医学院第二附属医院住院患者临床分离的243株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌,所有菌株按照统一的操作规程进行药敏试验,采用PCR检测碳青霉烯类耐药基因。结果243株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌中,主要来自ICU 68株(27.98%),痰液标本149株(61.32%);9种常用抗菌药物的耐药率>90%,其中替卡西林/棒酸耐药率最高为100.00%,多黏菌素B未出现耐药情况;5种耐药基因检出率分别为bla OXA23(88.07%)、bla OXA51(88.07%)、bla NDM(23.05%)、bla OXA58(11.93%)及bla OXA24(2.88%)。结论对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的耐药情况监控有助于医院加强抗菌药物的使用和管理,防止产生耐药菌株的产生与蔓延。

一株定植ST23-K1型耐碳青霉烯高毒力肺炎克雷伯菌的耐药性及全基因组分析

目的分析肺炎克雷伯菌临床分离株K63[第63号耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)]的毒力耐药情况及全基因组特征。方法收集分离自宁夏某医院新生儿重症监护室男性患儿痰液标本的肺炎克雷伯菌K63株,通过VITEK 2 Compact对其进行鉴定和药物敏感性试验。PCR法检测菌株毒力基因(ybtS、iutA、iucA、iroB、rmpA2、fimH、mrkD、peg344)和耐药基因(bla_(TEM)、bla_(SHV)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(OXA-48)、bla_(VIM))。PacBio RSⅢ和illuminate高通量测序平台对其进行全基因组测序、基因组组装及生物信息学分析,获得菌株基因组特征。结果成功从呼吸窘迫和新生儿肺部感染患儿痰液标本中分离出一株CRKP,命名为K63。药敏结果显示其对碳青霉烯类、磺胺类、头孢菌素类、β-内酰胺类、β-内酰胺酶抑制剂复合物等抗生素均耐药。PCR结果显示,毒力基因ybtS、iucA、iutA、rmpA2、iroB、fimH、mrkD、peg344为阳性,同时携带bla_(TEM)、bla_(SHV)、bla_(NDM)及bla_(VIM)耐药基因。全基因组测序及组装得到1条完整的基因组序列及1条质粒序列,其基因组大小为5880871 bp,序列比对结果显示K63菌株为ST23-K1型。在染色体基因组基因鉴定中,发现有8种毒力基因,有7种耐药相关基因。质粒携带有bla_(SHV-66)、bla_(SNDM-5)、sul1、mphA和aph(3’)-Ia、tetC、vanA和mexe等耐药基因。clb(ABCDFGHIJKLMNOPQS)、glf、pilW、ibeB等毒力基因也被注释。同时,水平转移区域预测结果显示质粒pVir-CR-63-1具有转移的潜力。基因富集及功能分析显示主要富集于代谢相关通路。结论分离定植的K63株可能为高毒力耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌,有潜在传播风险,临床上应予以高度重视。

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌及大肠埃希菌临床分离株耐药性及耐药基因分析

目的分析住院患者临床分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CR-Kpn)及大肠埃希菌(CR-Eco)耐药现状、耐药类型并检测其相关耐药基因,为临床治疗耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(CRE)感染,合理使用抗菌药物提供参考。方法收集上海交通大学附属仁济医院浦南分院2022年1月至12月患者临床标本分离的CR-Kpn、CR-Eco非重复分离株共400株,使用肉汤微量稀释法检测分离株对临床常用的抗菌药物的最低抑菌浓度,并通过耐药表型检测、聚合酶链反应(PCR)对CRE的碳青霉烯酶及其相关耐药基因进行检测。结果400株菌株中,检出CRE 51株(12.75%),CRE对替加环素、多黏菌素B的敏感率>95%。51株CRE中有49株产碳青霉烯酶,其中携带bla_(KPC) 34株(66.67%)、携带bla_(NDM) 13株(25.49%)、携带bla_(OXA-482)株(3.92%)。结论和其他临床常用抗菌药物相比,替加环素和多黏菌素B对产碳青霉烯酶的CR-Kpn及CR-Eco具有较好的体外抗菌活性。此外,耐药表型检测和基因型检测有较好的符合性,临床微生物实验室可持续跟踪检测CRE耐药表型和基因型,根据实际情况制订用药方案。

新型抗KPC-2型碳青霉烯酶纳米抗体的筛选与鉴定

目的:产KPC-2型肺炎克雷伯菌可引起β-内酰胺类抗生素、碳青霉烯类抗生素产生耐药性。通过噬菌体展示技术从抗KPC-2纳米抗体文库中筛选与KPC-2特异性结合的纳米抗体,为产KPC-2型肺炎克雷伯菌耐药性的检测和诊断提供技术支持。方法:利用重组KPC-2免疫双峰骆驼,从骆驼的外周血淋巴细胞中提取RNA,逆转录为cDNA,通过两轮嵌套式PCR扩增出纳米抗体片段,构建抗体文库,并通过噬菌体展示技术筛选特异性纳米抗体。通过HPLC和OCTET分别进行表位分析和亲和力测定。结果:构建了一个库容为5.47×10^(8)cfu/ml且插入有效片段不低于81.25%的纳米抗体文库;并建立抗KPC-2纳米抗体的免疫淘选方法;获得了2个不同CDR3区的纳米抗体K2和K5,亲和力分别为6.0 nmol/L和4.8 nmol/L。且在KPC-2上具有2个非竞争性结合表位。结论:成功淘选出2个不同表位的特异性纳米抗体,有望替代传统抗体用于肺炎克雷伯菌耐药性疾病的检测和诊断。

ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的毒力基因分布及分子流行病学特征

目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜血清型及分子流行病学特征,了解ICU中CRKP的感染特点,为ICU有效监测和防控CRKP感染提供科学依据。方法:收集2021年1月至2022年12月广东省人民医院ICU所分离并已确定为CRKP的非重复菌株共40株。采用全基因组测序方法,分析待测菌株耐药基因、毒力基因、荚膜血清型的分布,同时将CRKP基因组7个管家基因序列上传至肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)数据库进行分析,以明确菌株的序列型(sequence typing,ST)。结果:40例ICU CRKP感染患者年龄为(69.03±17.82)岁,且伴有多种基础疾病,临床结局好转和死亡各20例。所分离菌株主要来源于中段尿、肺泡灌洗液等标本。全基因组测序结果显示其主要携带blaKPC-1(29株,72.5%)和blaNDM-1(6株,15.0%),另有5株同时携带blaKPC-1和blaNDM-1。所携带的毒力基因有多种,其中entA、entB、entE、entS、fepA、fepC、fepG、yag/ecp、ompA等基因的携带率达100%,entD、fimB、iroB、iroD、fes、pla等基因携带率较低。ICU所分离的CRKP以ST11型(27例,67.5%)为主,荚膜血清型以KL64型(29例,72.5%)为主。共检出23例ST11-KL64型CRKP,占57.5%。结论:ICU CRKP主要为ST11-KL64型,并携带多种毒力基因,其中以铁吸收类毒力基因为主;且blaKPC已由blaKPC-2转为blaKPC-1。因此,需密切监测CRKP的分子流行病学变化,同时制订严格的防控措施,有效遏制CRKP感染的发生。

Autof MS1000质谱鉴定系统快速检测肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌产碳青霉烯酶的临床价值评估

目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速检测肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌产碳青霉烯酶的临床价值。方法收集2022年1月至2023年10月徐州医科大学附属邳州市人民医院分离的肺炎克雷伯菌60株和铜绿假单胞菌80株,其中碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)30株,碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)30株,碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌(CRPA)50株,碳青霉烯类敏感铜绿假单胞菌(CSPA)30株。分别采用改良碳青霉烯灭活试验(mCIM)、胶体金免疫层析法和Autof MS 1000质谱鉴定系统进行检测,评估Autof MS 1000质谱鉴定系统检测肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌产碳青霉烯酶的能力。结果Autof MS 1000质谱鉴定系统检测结果与mCIM和胶体金免疫层析法结果完全一致,30株CRKP中,有28株检测到碳青霉烯酶,2株阴性;50株CRPA中,有15株检测到碳青霉烯酶,35株阴性;30株CSKP和30株CSPA均为阴性。3种方法检测碳青霉烯酶的结果符合率为100%。结论Autof MS 1000质谱鉴定系统检测碳青霉烯酶的结果与mCIM法和胶体金免疫层析法一致,且既有mCIM法低成本的特点,又有胶体金免疫层析技术速度快、准确率高的优点,可用于临床肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌产碳青霉烯酶菌株的快速鉴定。

碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌的耐药特点与碳青霉烯酶基因类型分析

目的:分析碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌(carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,CRPA)的耐药特点与碳青霉烯酶基因类型,为临床CRPA感染患者的抗感染治疗提供参考。方法:收集2022年1月—12月苏州市立医院临床上检出的58株CRPA作为研究资料,以改良碳青霉烯灭活试验(modified carbapenem inactivation method,mCIM)观察CRPA是否为产碳青霉烯酶CRPA(carbapenemase-producing CRPA,CP-CRPA),比较CP-CRPA和非CP-CRPA的耐药情况,同时采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)法和肠杆菌基因间重复共有序列基因聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)技术分析CP-CRPA的碳青霉烯酶基因类型。结果:58株CRPA中,mCIM表型阳性的有16株(即为CP-CRPA),而mCIM表型阴性的有42株(即为非CP-CRPA);PCR结果显示,16株CP-CRPA中携带bla_(KPC-2)基因的有13株,携带bla_(VIM-2)基因的有2株,携带bla_(IMP-4)基因的有1株;ERIC-PCR结果显示,16株CP-CRPA可分为3种基因型菌株(设为A型、B型和C型),其中A型有13株(均携带bla_(KPC-2)基因,其中9株具有克隆亲缘),B型有2株(均携带bla_(VIM-2)基因),而C型有1株(携带bla_(IMP-4)基因);药敏试验结果显示,CP-CRPA对头孢他啶、头孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦钠、氨曲南和美罗培南的耐药率显著高于非CP-CRPA(P<0.05),而对庆大霉素、阿米卡星、环丙沙星、左氧氟沙星和多黏菌素的耐药率与非CP-CRPA无显著差异(P>0.05)。结论:当前医院临床上检出的CRPA以非CP-CRPA为主,而在CP-CR‐PA中则以携带bla_(KPC-2)基因为多见,此外CP-CRPA与非CP-CRPA对部分抗菌药物的耐药情况存在,临床在诊治CRPA感染患者时应尽量明确其耐药特点和碳青霉烯酶基因类型,以便临床更正确地进行抗感染治疗,从而确保患者得到有效的治疗。

32株碳青霉烯类耐药的高毒力肺炎克雷伯菌血清荚膜、毒力基因及多位点序列分型

目的探讨耐碳青霉烯高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)的基因型、耐药现状及相关感染因素,为临床的早期预警提供参考。方法收集2018年2月至2022年11月在浙江中医药大学附属温州市中医院进行细菌培养的非重复耐碳青酶烯类肺炎克雷伯杆菌(CRKP)共230株,采用MALDI-TOF质谱仪细菌鉴定,VITEK-2 Compact进行药敏实验,采用反转录PCR法检测碳青霉烯耐药基因、血清分型和毒力基因,并进行多位点序列分析(MLST)分型。结果230株CRKP中共有CR-hv KP 32株(13.91%),其中32株CR-hv KP对亚胺培南、卮他培南、哌拉西林/他唑巴坦、氨苄西林/舒巴坦耐药率为100%,其次为头孢替坦(82.1%)、头孢吡肟(84.3%)、呋喃妥因(89.3%)、环丙沙星(78.5%)、庆大霉素(60.7%)、妥布霉素(60.6%)、阿米卡星(60.7%)、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑(37.5%)。通过PCR及琼脂糖电泳分析共有K1型2株、K2型2株、K5型1株,部分常见毒力基因携带率超过50%,其中rmp A占56.25%(18/32)、iro N占59.37%(19/32)、aerobactin占18.75%(6/32)、mag A占6.25%(2/32)。MLST主要以ST11、ST23为主,结论血清型以K1、K2为主的碳青霉烯类耐药的肺炎克雷白菌,大部分以rmp A、iro N毒力基因为主,MLST主要以ST11、ST23为主,基因型复杂,临床上要加强该类菌株的流行病学监测与基因型分析。