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题名水稻磷脂酶PLD家族生物信息学分析
被引量:1
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作者
康伟伟
张超
易自力
陈智勇
谭炎宁
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机构
湖南农业大学生物科学技术学院
湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室
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出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第10期2259-2264,共6页
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基金
湖南农业科技创新资金项目(2017XC09)
湖南省自然科学基金(2019JJ40206)
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文摘
【目的】磷脂酶PLD(Phospholipase D)家族是水稻中一类重要的蛋白,它在植物的生长发育调控以及非生物胁迫应答中发挥着重要作用。本研究旨在了解水稻PLD家族的基本信息。【方法】采用生物信息学的方法,对该家族16个成员基因的结构、蛋白基序、时空表达模式以及激素诱导表达模式等进行了分析。【结果】水稻PLD家族基因的长度为2982~11305 bp,含有3~21个外显子,同亚类基因的外显子数目一致;所有家族成员在蛋白序列上表现出较高的相似性,除OsPLDφ,OsPLDκ外的大部分成员含有3种相同类型的基序。提取RiceXPro数据库中的表达数据后发现,PLD基因在根、茎、叶、花药、子房等部位中的表达量相对较高,而在胚芽和胚乳等部位中的表达量较低;PLD基因对不同激素的响应行为呈现出丰富的多样性,它们受茉莉酸(JA)和脱落酸(ABA)诱导表达,受油菜素内酯(BR)和细胞分裂素(CTK)所抑制,而对赤霉素(GA)和生长素(IAA)不敏感。【结论】成员含有相同类型的基序,表明它们在功能上具有保守性和一致性;各成员在不同激素处理后表现出不同的应答方式,暗示水稻PLD成员在逆境响应中执行不同的功能。这些研究结果为进一步研究水稻PLD家族基因的生物学功能奠定了基础。
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关键词
水稻
磷脂酶pld家族
生物信息学
基因表达
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Keywords
Rice(Oryza sativa L.)
Phospholipase D family
Bioinformatics
Gene expression
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分类号
S511
[农业科学—作物学]
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